HNRNPK - HNRNPK

HNRNPK
Ақуыз HNRPK PDB 1j5k.png
Қол жетімді құрылымдар
PDBОртологиялық іздеу: PDBe RCSB
Идентификаторлар
Бүркеншік аттарHNRNPK, CSBP, HNRPK, TUNP, AUKS, гетерогенді ядролық рибонуклеопротеин K
Сыртқы жеке куәліктерOMIM: 600712 MGI: 99894 HomoloGene: 81909 Ген-карталар: HNRNPK
Геннің орналасуы (адам)
9-хромосома (адам)
Хр.9-хромосома (адам)[1]
9-хромосома (адам)
HNRNPK үшін геномдық орналасу
HNRNPK үшін геномдық орналасу
Топ9q21.32Бастау83,968,083 bp[1]
Соңы83,980,616 bp[1]
РНҚ экспрессиясы өрнек
Fs.png-де PBB GE HNRPK 200775 с
Қосымша сілтеме өрнегі туралы деректер
Ортологтар
ТүрлерАдамТышқан
Энтрез
Ансамбль
UniProt
RefSeq (mRNA)
RefSeq (ақуыз)
Орналасқан жері (UCSC)Chr 9: 83.97 - 83.98 MbХр 13: 58.39 - 58.4 Мб
PubMed іздеу[3][4]
Уикидеректер
Адамды қарау / өңдеуТінтуірді қарау / өңдеу

Гетерогенді ядролық рибонуклеопротеин Қ (сонымен қатар ақуыз K) Бұл ақуыз адамдарда кодталған HNRNPK ген.[5] Ол табылған жасуша ядросы алдын ала байланыстырадыхабаршы РНҚ компоненті ретінде (mRNA) гетерогенді рибонуклеопротеин бөлшектері. The симиан гомолог ретінде белгілі ақуыз H16. Екі ақуыз да бір тізбекті байланысады ДНҚ сияқты РНҚ және белсенділігін ынталандыруы мүмкін РНҚ-полимераза II, көпшілігіне жауапты ақуыз ген транскрипциясы. ДНҚ мен РНҚ-ға қатысты ақуыздардың салыстырмалы жақындығы ерітінді жағдайына байланысты өзгереді және керісінше өзара байланысты, сондықтан күшті ДНҚ-ны байланыстыратын жағдайлар әлсіз РНҚ-мен байланысады.[6]

Басқа ақуыздардағы РНҚ байланыстыратын ақуыздың домендері К протеинінің РНҚ-мен байланысатын аймағына ұқсас деп аталады K-гомология немесе KH домендер.

К протеині зерттеу тақырыбы болды тік ішек рагы, онда ан РНҚ-ны редакциялау себеп болатын оқиға өрнек туралы изоформасы құрамында а нүктелік мутация қатерлі ісік жасушаларына тән екендігі анықталды.[7]

Функция

Бұл ген барлық жерде көрсетілген эксфамилияға жатады гетерогенді ядролық рибонуклеопротеидтер (hnRNPs). HnRNP болып табылады РНҚ-мен байланысатын ақуыздар және олар күрделі гетерогенді ядролық РНҚ (hnRNA). Бұл белоктар байланысты алдын-ала мРНҚ ядрода болады және мРНҚ-ға дейінгі өңдеуге және басқа аспектілерге әсер етеді мРНҚ метаболизм және көлік. HnRNP-нің барлығы ядрода болғанымен, кейбіреулері ядро ​​мен цитоплазма арасында шаттл тәрізді.

HnRNP ақуыздарының нақты нуклеин қышқылымен байланысу қасиеттері бар. Осы генмен кодталған ақуыз нуклеоплазма және үш қайталануы бар KH домендері РНҚ-мен байланысады. Ол басқа hnRNP ақуыздарының арасында байланыстырушылық талғамымен ерекшеленеді; ол поли (C) -мен берік байланысады. Бұл ақуыз жасуша циклінің прогрессиясы кезінде де маңызды рөл атқарады деп саналады. Бұл ген үшін балама түрде бірнеше транскрипт нұсқалары сипатталған, бірақ тек үш нұсқасы толық сипатталған.[8]

Екі данадағы мутациялар HNRNPK тышқандарда эмбриональды өлімге әкеледі. Геннің екі көшірмесі бар тышқандар 14-ші күнге дейін өледі эмбрионның дамуы.[9]

Клиникалық маңызы

Окамото синдромы

Мутациялар HNRNPK себеп Окамото синдромы, Ау-Клайн синдромы деп те аталады.[10]

Қан қатерлі ісіктері

Аймақтағы жоюды қамтиды HNRNPK жасушаларында табылған жедел миелоидты лейкоз шамамен 2% жағдайда. Сонымен қатар, олардың біреуі болған тышқандардың көпшілігі HNRNPK гендер жасанды нокаут дамыған миелоидты қатерлі ісік, үшінші дамумен лимфоидты қатерлі ісіктер және 4% дамуда гепатоцеллюлярлы карциномалар. Тышқандар да кішірек, мүшелері дамымаған және өлімнен кейінгі өлім-жітім жоғары болған (30%). Тышқандардың тіршілік етуінің орташа ұзақтығы жабайы типтегі тышқандардың өмірінің 50% -дан аз болды. HNRNPK-дегі кемшіліктер p42 деңгейлерін төмендететін көрінеді изоформасы туралы CEBPA, бұл а транскрипция коэффициенті белгілі бір дифференциацияға қатысады қан жасушалары, Сонымен қатар 21-бет (циклинге тәуелді киназа тежегіші 1), ол жасушаның дамуын тоқтатуға қатысады ДНҚ-ны қалпына келтіру.[11]

HNRNPK Шамадан тыс экспрессия басқа қатерлі ісік ауруларына ықпал ететін сияқты аударма гөрі транскрипция.[11]

Өзара әрекеттесу

HNRPK көрсетілді өзара әрекеттесу бірге:

Құрамында KH домені бар адам ақуыздары

AKAP1; ANKHD1; ANKRD17; ASCC1; BICC1; DDX43; DDX53; DPPA5;FMR1; FUBP1; FUBP3; FXR1; FXR2; HDLBP; ХНРПК; IGF2BP1;IGF2BP2; IGF2BP3; KHDRBS1; KHDRBS2; KHDRBS3; KHSRP; KRR1; MEX3A;MEX3B; MEX3C; MEX3D; NOVA1; NOVA2; PCBP1; PCBP2; PCBP3;PCBP4; PNO1; PNPT1; QKI; SF1; ТДРХ;

Әдебиеттер тізімі

  1. ^ а б в GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000165119 - Ансамбль, Мамыр 2017
  2. ^ а б в GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000021546 - Ансамбль, Мамыр 2017
  3. ^ «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
  4. ^ «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
  5. ^ Dejgaard K, Leffers H, Rasmussen HH, Madsen P, Kruse TA, Gesser B және т.б. (Ақпан 1994). «Баламалы сплайсинг нәтижесінде алынған, реттелген hnRNP-K ақуыздарының өзгеру тобын анықтау, молекулярлық клондау, экспрессия және хромосомалық картографиялау». Молекулалық биология журналы. 236 (1): 33–48. дои:10.1006 / jmbi.1994.1116. PMID  8107114.
  6. ^ Gaillard C, Cabannes E, Strauss F (қазан 1994). «HnRNP бөлшектерінің РНҚ-байланыстыратын ақуызының H16 ақуызымен, тізбектілікке тән бір тізбекті ДНҚ-байланыстырушы ақуыздың сәйкестігі. Нуклеин қышқылдарын зерттеу. 22 (20): 4183–6. дои:10.1093 / нар / 22.20.4183. PMC  331915. PMID  7524036.
  7. ^ Климек-Томчак К, Микула М, Джвонек А, Пазиевска А, Карчмарски Дж, Хенниг Е және т.б. (Ақпан 2006). «HnRNP K протеині мРНҚ-ны колоректальды аденокарциномада және оның айналасындағы шырышты қабатта өңдеу». Британдық қатерлі ісік журналы. 94 (4): 586–92. дои:10.1038 / sj.bjc.6602938. PMC  2361188. PMID  16404425.
  8. ^ «Entrez Gene: HNRPK гетерогенді ядролық рибонуклеопротеин K».
  9. ^ Gallardo M, Lee HJ, Zhang X, Bueso-Ramos C, Pageon LR, McArthur M және т.б. (Қазан 2015). «hnRNP K - бұл гематологиялық қатерлі ісіктердегі таралуы мен дифференциалдау бағдарламаларын реттейтін гаплоинфекциялық ісікті басатын құрал». Қатерлі ісік жасушасы. 28 (4): 486–499. дои:10.1016 / j.ccell.2015.09.001. PMC  4652598. PMID  26412324.
  10. ^ Анықтама, генетика үйі. «Ау-Клайн синдромы». Генетика туралы анықтама. Алынған 2019-11-30.
  11. ^ а б Gallardo M, Lee HJ, Zhang X, Bueso-Ramos C, Pageon LR, McArthur M және т.б. (Қазан 2015). «hnRNP K - бұл гематологиялық қатерлі ісіктердегі таралуы мен дифференциалдау бағдарламаларын реттейтін гаплоинфекциялық ісікті басатын құрал». Қатерлі ісік жасушасы. 28 (4): 486–499. дои:10.1016 / j.ccell.2015.09.001. PMC  4652598. PMID  26412324.
  12. ^ Ostareck-Lederer A, Ostareck DH, Cans C, Neubauer G, Bomsztyk K, Superti-Furga G, Hentze MW (шілде 2002). «hnRNP K фосфорлануының c-Src-делдалдығы арнайы тынышталған мРНҚ-ның трансляциялық активациясын қозғаады». Молекулалық және жасушалық биология. 22 (13): 4535–43. дои:10.1128 / mcb.22.13.4535-4543.2002. PMC  133888. PMID  12052863.
  13. ^ Чен Х.С., Лин ВК, Цай Ю.Г., Ли СК, Чанг Дж.Дж. (қазан 2002). «Поли (А) РНҚ-мен және гетерогенді ядролық рибонуклеопротеинмен өзара әрекеттесетін РНҚ геликаза, DDX1». Биологиялық химия журналы. 277 (43): 40403–9. дои:10.1074 / jbc.M206981200. PMID  12183465.
  14. ^ а б в Kim JH, Hahm B, Kim YK, Choi M, Jang SK (мамыр 2000). «Ядролар мен цитоплазма арасындағы шелектегі hnRNPs арасындағы ақуыз-ақуыздың өзара әрекеттесуі». Молекулалық биология журналы. 298 (3): 395–405. дои:10.1006 / jmbi.2000.3687. PMID  10772858.
  15. ^ Yang JP, Reddy TR, Truong KT, Suhasini M, Wong-Staal F (қазан 2002). «Sam68 және гетерогенді ядролық рибонуклеопротеиннің функционалды әрекеттесуі». Онкоген. 21 (47): 7187–94. дои:10.1038 / sj.onc.1205759. PMID  12370808.
  16. ^ Côté J, Boisvert FM, Boulanger MC, Bedford MT, Richard S (қаңтар 2003). «Sam68 РНҚ байланыстыратын ақуыз - бұл аргинин N-метилтрансфераза 1 үшін in vivo субстрат». Жасушаның молекулалық биологиясы. 14 (1): 274–87. дои:10.1091 / mbc.E02-08-0484. PMC  140244. PMID  12529443.
  17. ^ Вада К, Иноуэ К, Хагивара М (тамыз 2002). «Аргинин N-метилтрансфераза 1, PRMT1 ақуызымен метилирленген ақуыздарды анықтау, жаңа экспрессияны клондау стратегиясымен». Biochimica et Biofhysica Acta (BBA) - молекулалық жасушаларды зерттеу. 1591 (1–3): 1–10. дои:10.1016 / s0167-4889 (02) 00202-1. PMID  12183049.

Әрі қарай оқу

Сыртқы сілтемелер

  • Сайтында қол жетімді барлық құрылымдық ақпаратқа шолу PDB үшін UniProt: P61978 (Адамның біртекті емес ядролық рибонуклеопротеині K (HNRPK)) PDBe-KB.