QKI - QKI

QKI
Қол жетімді құрылымдар
PDB	Ортологиялық іздеу: PDBe RCSB
PDB идентификатор кодтарының тізімі
	4JVH
Идентификаторлар
Бүркеншік аттар	QKI, Hqk, QK, QK1, QK3, hqkI, KH домені бар, РНҚ байланысы, РНҚ байланысы бар KH домені
Сыртқы жеке куәліктер	OMIM: 609590 MGI: 97837 HomoloGene: 11059 Ген-карталар: QKI
Геннің орналасуы (адам)
Хр.	6-хромосома (адам)
Соңы	163,578,592 bp
Геннің орналасуы (тышқан)
Хр.	17-хромосома (тышқан)
Соңы	10,319,854 bp
РНҚ экспрессиясы өрнек
	; ; ; ;
	Қосымша сілтеме өрнегі туралы деректер
Гендік онтология
Молекулалық функция	• SH3 доменін байланыстыру; • GO: 0001948 ақуыздармен байланысуы; • нуклеин қышқылымен байланысуы; • мРНҚ байланысы; • РНҚ байланысы;
Ұялы компонент	• цитоплазма; • жасуша ядросы; • синапс;
Биологиялық процесс	• жасушалардың дифференциациясы; • mRNA тасымалдау; • мРНҚ өңдеу; • васкулогенез; • көп жасушалы организмнің дамуы; • аксондық аншиттеу; • бұлшықет жасушаларының дифференциациясы; • ген экспрессиясының оң реттелуі; • май тізбегінің биосинтетикалық процесі; • РНҚ қосылуы; • сперматидтердің дамуы; • миелинация; • 3'-UTR-делдалды мРНҚ тұрақсыздандыру; • аударманы реттеу; • көлік;
	Дереккөздер:Амиго / QuickGO
Ортологтар
	9444
	19317
	ENSG00000112531
	ENSMUSG00000062078
	Q96PU8
	Q9QYS9
	NM_001301085; NM_006775; NM_206853; NM_206854; NM_206855
	NM_001159516; NM_001159517; NM_021881
	NP_001288014; NP_006766; NP_996735; NP_996736; NP_996737
	NP_001152988; NP_001152989; NP_068681
	Уикидеректер
Адамды қарау / өңдеу	Тінтуірді қарау / өңдеу

Квактивті гомолог, KH доменінің РНҚ байланысы (тышқан), сондай-ақ QKI, Бұл ақуыз адамдарда кодталған QKI ген.^[5]^[6]

QKI STAR ақуыздары деп аталатын РНҚ-мен байланысатын ақуыздар тобына жатады Sотқа айналдыру Трандукция және Aбөлу RNA.^[7] Оларда бар HNRNPK GSG домені деп аталатын 200 аминқышқыл аймағына енгізілген гомология (KH) домені. Осы отбасының басқа мүшелеріне SAM68 (KHDRBS1 ) және SF1 .^[8] Тағы екі жаңа мүше KHDRBS3^[9] және KHDRBS2.^[10]

QKI гені шизофренияда маңызды болып табылады,^[11]^[12] және QKI олигодендроциттерге байланысты көптеген гендердің аудармаларын басқарады.

Әдебиеттер тізімі

^ ^а ^б ^c GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000112531 - Ансамбль, Мамыр 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000062078 - Ансамбль, Мамыр 2017
^ «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
^ «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
^ «Entrez Gene: QKI тітіркендіргіш гомологы, KH доменінің РНҚ байланысы (тышқан)».
^ Saccomanno L, Loushin C, Jan E, Punkay E, Artzt K, Goodwin EB (қазан 1999). «STAR ақуызы QKI-6 - бұл трансляциялық репрессор». Proc. Натл. Акад. Ғылыми. АҚШ. 96 (22): 12605–10. Бибкод:1999 PNAS ... 9612605S. дои:10.1073 / pnas.96.22.12605. PMC 23011. PMID 10535969.
^ Vernet C, Artzt K (желтоқсан 1997). «STAR, сигнал беру және РНҚ-ны белсендіруге қатысатын гендер отбасы». Трендтер генетикасы. 13 (12): 479–84. дои:10.1016 / S0168-9525 (97) 01269-9. PMID 9433137.
^ Чен Т, Ричард С (тамыз 1998). «Qk1 құрылымдық-функционалдық анализі: тышқанның тітіркенуіндегі өлім нүктесінің мутациясы гомодимеризацияны болдырмайды». Мол. Ұяшық. Биол. 18 (8): 4863–71. дои:10.1128 / MCB.18.8.4863. PMC 109071. PMID 9671495.
^ Venables JP, Vernet C, Chew SL, Elliott DJ, Cowmeadow RB, Wu J, Cooke HJ, Artzt K, Eperon IC (маусым 1999). «T-STAR / ETOILE: сперматогенезге қатысатын РНҚ-байланыстыратын протеинмен өзара әрекеттесетін SAM68-нің жаңа туысы». Хум. Мол. Генет. 8 (6): 959–69. дои:10.1093 / hmg / 8.6.959. PMID 10332027.
^ Ван L, Xu J, Zeng L, Ye X, Wu Q, Dai J, Ji C, Gu S, Zhao C, Xie Y, Mao Y (желтоқсан 2002). «КДНҚ KHDRBS2 бар адамның жаңа STAR доменін клондау және сипаттамасы». Мол. Биол. Rep. 29 (4): 369–75. дои:10.1023 / A: 1021246109101. PMID 12549823. S2CID 21864405.
^ Aberg K, Saetre P, Jareborg N, Jazin E (мамыр 2006). «Адам QKI, шизофренияға қатысатын адамның олигодендроциттерге байланысты гендерінің мРНК экспрессиясының әлеуетті реттеушісі». Proc. Натл. Акад. Ғылыми. АҚШ. 103 (19): 7482–7. Бибкод:2006 PNAS..103.7482A. дои:10.1073 / pnas.0601213103. PMC 1464365. PMID 16641098.
^ Haroutunian V, Katsel P, Dracheva S, Davis KL (қазан 2006). «Қатты дисмиелинизацияға әсер еткен QKI генінің адам гомологы» тінтуірдің фенотипін бұзады: шизофрения кезінде мидың бірнеше аймағында реттеледі «. Am J психиатриясы. 163 (10): 1834–7. дои:10.1176 / ajp.2006.163.10.1834. PMID 17012699.

Әрі қарай оқу

Робертсон Н.Г., Хетарпал У, Гутиерес-Эспелета Г.А. және т.б. (1995). «Субтрактивті будандастыру және дифференциалды скринингті қолдану арқылы адамның ұрықтың кохлеарлы кДНҚ кітапханасынан жаңа және белгілі гендерді оқшаулау». Геномика. 23 (1): 42–50. дои:10.1006 / geno.1994.1457. PMID 7829101.
Саккоманно Л, Лоушин С, Ян Е және т.б. (1999). «STAR ақуызы QKI-6 - бұл трансляциялық репрессор». Proc. Натл. Акад. Ғылыми. АҚШ. 96 (22): 12605–10. Бибкод:1999 PNAS ... 9612605S. дои:10.1073 / pnas.96.22.12605. PMC 23011. PMID 10535969.
Ли З.З., Кондо Т, Мурата Т және т.б. (2002). «Адамның глиомасында KH РНҚ байланыстыратын ақуызды кодтайтын Hqk экспрессиясы өзгереді». Jpn. J. қатерлі ісігі. 93 (2): 167–77. дои:10.1111 / j.1349-7006.2002.tb01255.x. PMC 5926958. PMID 11856480.
Wu JI, Reed RB, Grabowski PJ, Artzt K (2002). «Миелинизациядағы жер сілкінісінің қызметі: балама қосылуды реттеу». Proc. Натл. Акад. Ғылыми. АҚШ. 99 (7): 4233–8. Бибкод:2002 PNAS ... 99.4233W. дои:10.1073 / pnas.072090399. PMC 123631. PMID 11917126.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH және т.б. (2003). «Адам мен тышқанның 15000-нан астам толық ұзындықтағы кДНҚ тізбектерінің генерациясы және алғашқы талдауы». Proc. Натл. Акад. Ғылыми. АҚШ. 99 (26): 16899–903. Бибкод:2002 PNAS ... 9916899M. дои:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Мур Ф.Л., Ярузельска Дж, Фокс МС және т.б. (2003). «Адам Пумилио-2 эмбриондық бағаналық жасушаларда және жыныс жасушаларында көрінеді және DAZ (Delete in AZoospermia) және DAZ тәрізді ақуыздармен өзара әрекеттеседі». Proc. Натл. Акад. Ғылыми. АҚШ. 100 (2): 538–43. Бибкод:2003PNAS..100..538M. дои:10.1073 / pnas.0234478100. PMC 141031. PMID 12511597.
Côté J, Boisvert FM, Boulanger MC және т.б. (2003). «Sam68 РНҚ байланыстыратын ақуыз - бұл аргинин N-метилтрансфераза 1 үшін in vivo субстрат». Мол. Биол. Ұяшық. 14 (1): 274–87. дои:10.1091 / mbc.E02-08-0484. PMC 140244. PMID 12529443.
Mungall AJ, Palmer SA, Sims SK, және т.б. (2003). «ДНҚ тізбегі және адамның 6-хромосомасын талдау». Табиғат. 425 (6960): 805–11. Бибкод:2003 ж.45..805M. дои:10.1038 / табиғат02055. PMID 14574404.
Ота Т, Сузуки Ю, Нишикава Т және т.б. (2004). «Адамның 21,243 толық ұзындықтағы кДНҚ-ның толық тізбегі және сипаттамасы». Нат. Генет. 36 (1): 40–5. дои:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Герхард Д.С., Вагнер Л, Фейнголд Е.А. және т.б. (2004). «NIH толық ұзындықтағы cDNA жобасының мәртебесі, сапасы және кеңеюі: Сүтқоректілер гендерінің коллекциясы (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121-7. дои:10.1101 / гр.2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Rual JF, Венкатесан К, Хао Т және т.б. (2005). «Адамның протеин-протеинмен өзара әрекеттесу желісінің протеома-масштабты картасына қарай». Табиғат. 437 (7062): 1173–8. Бибкод:2005 ж.437.1173R. дои:10.1038 / табиғат04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Ichimura K, Mungall AJ, Fiegler H және т.б. (2006). «Адамның астроцитикалық ісіктеріндегі 6q26 бойынша қабаттасудың жойылуының кішігірім аймақтары, хромосома 6 тақтайшалар жолының массиві-CGH көмегімен анықталды». Онкоген. 25 (8): 1261–71. дои:10.1038 / sj.onc.1209156. PMC 2760128. PMID 16205629.
Aberg K, Saetre P, Lindholm E және т.б. (2006). «Адам QKI, миелинацияға қатысатын шизофренияға жаңа кандидат-ген». Am. Дж. Мед. Генет. B Нейропсихиатр. Генет. 141 (1): 84–90. дои:10.1002 / ajmg.b.30243. PMID 16342280. S2CID 11733591.
Aberg K, Saetre P, Jareborg N, Jazin E (2006). «Адам QKI, шизофренияға қатысатын адамның олигодендроциттерге байланысты гендерінің мРНК экспрессиясының әлеуетті реттеушісі». Proc. Натл. Акад. Ғылыми. АҚШ. 103 (19): 7482–7. Бибкод:2006 PNAS..103.7482A. дои:10.1073 / pnas.0601213103. PMC 1464365. PMID 16641098.
Лим Дж, Хао Т, Шоу С және т.б. (2006). «Адамның тұқым қуалайтын атаксиялары мен Пуркинье жасушаларының деградациясының бұзылыстары үшін ақуыз-ақуыздың өзара әрекеттесуі». Ұяшық. 125 (4): 801–14. дои:10.1016 / j.cell.2006.03.032. PMID 16713569. S2CID 13709685.
Haroutunian V, Katsel P, Dracheva S, Davis KL (2006). «Қатты дисмиелинизацияға әсер еткен QKI генінің адам гомологы» тінтуірдің фенотипін бұзады: шизофрения кезінде мидың бірнеше аймағында реттеледі «. Американдық психиатрия журналы. 163 (10): 1834–7. дои:10.1176 / ajp.2006.163.10.1834. PMID 17012699.
Чжао Л, Тянь Д, Ся М, және басқалар. (2006). «QKV дисмиелинизациясын селективті РНҚ байланыстыратын QKI ақуызының бір изоформасымен құтқару». Дж.Нейросчи. 26 (44): 11278–86. дои:10.1523 / JNEUROSCI.2677-06.2006. PMC 6674528. PMID 17079655.

Бұл мақала а ген қосулы адамның хромосомасы 6 Бұл бұта. Сіз Уикипедияға көмектесе аласыз оны кеңейту.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000112531 - Ансамбль, Мамыр 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000062078 - Ансамбль, Мамыр 2017

[3] «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.

[4] «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.

[entrez-5] «Entrez Gene: QKI тітіркендіргіш гомологы, KH доменінің РНҚ байланысы (тышқан)».

[pmid10535969-6] Saccomanno L, Loushin C, Jan E, Punkay E, Artzt K, Goodwin EB (қазан 1999). «STAR ақуызы QKI-6 - бұл трансляциялық репрессор». Proc. Натл. Акад. Ғылыми. АҚШ. 96 (22): 12605–10. Бибкод:1999 PNAS ... 9612605S. дои:10.1073 / pnas.96.22.12605. PMC 23011. PMID 10535969.

[pmid9433137-7] Vernet C, Artzt K (желтоқсан 1997). «STAR, сигнал беру және РНҚ-ны белсендіруге қатысатын гендер отбасы». Трендтер генетикасы. 13 (12): 479–84. дои:10.1016 / S0168-9525 (97) 01269-9. PMID 9433137.

[pmid9671495-8] Чен Т, Ричард С (тамыз 1998). «Qk1 құрылымдық-функционалдық анализі: тышқанның тітіркенуіндегі өлім нүктесінің мутациясы гомодимеризацияны болдырмайды». Мол. Ұяшық. Биол. 18 (8): 4863–71. дои:10.1128 / MCB.18.8.4863. PMC 109071. PMID 9671495.

[pmid10332027-9] Venables JP, Vernet C, Chew SL, Elliott DJ, Cowmeadow RB, Wu J, Cooke HJ, Artzt K, Eperon IC (маусым 1999). «T-STAR / ETOILE: сперматогенезге қатысатын РНҚ-байланыстыратын протеинмен өзара әрекеттесетін SAM68-нің жаңа туысы». Хум. Мол. Генет. 8 (6): 959–69. дои:10.1093 / hmg / 8.6.959. PMID 10332027.

[pmid12549823-10] Ван L, Xu J, Zeng L, Ye X, Wu Q, Dai J, Ji C, Gu S, Zhao C, Xie Y, Mao Y (желтоқсан 2002). «КДНҚ KHDRBS2 бар адамның жаңа STAR доменін клондау және сипаттамасы». Мол. Биол. Rep. 29 (4): 369–75. дои:10.1023 / A: 1021246109101. PMID 12549823. S2CID 21864405.

[11] Aberg K, Saetre P, Jareborg N, Jazin E (мамыр 2006). «Адам QKI, шизофренияға қатысатын адамның олигодендроциттерге байланысты гендерінің мРНК экспрессиясының әлеуетті реттеушісі». Proc. Натл. Акад. Ғылыми. АҚШ. 103 (19): 7482–7. Бибкод:2006 PNAS..103.7482A. дои:10.1073 / pnas.0601213103. PMC 1464365. PMID 16641098.

[12] Haroutunian V, Katsel P, Dracheva S, Davis KL (қазан 2006). «Қатты дисмиелинизацияға әсер еткен QKI генінің адам гомологы» тінтуірдің фенотипін бұзады: шизофрения кезінде мидың бірнеше аймағында реттеледі «. Am J психиатриясы. 163 (10): 1834–7. дои:10.1176 / ajp.2006.163.10.1834. PMID 17012699.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]