KHDRBS3 - KHDRBS3

KHDRBS3
Қол жетімді құрылымдар
PDB	Ортологиялық іздеу: PDBe RCSB
PDB идентификатор кодтарының тізімі
	5ELR, 5ELS, 5EMO, 5ELT, 5EL3
Идентификаторлар
Бүркеншік аттар	KHDRBS3, Etle, SALP, SLM-2, SLM2, T-STAR, TSTAR, этоил, құрамында KH домені, РНҚ байланысы, сигналдың өткізгіштігі 3, KH РНҚ-ның байланыс саласы бар, сигналдың трансдукциясы байланысты 3
Сыртқы жеке куәліктер	OMIM: 610421 MGI: 1313312 HomoloGene: 4780 Ген-карталар: KHDRBS3
Геннің орналасуы (адам)
Хр.	8-хромосома (адам)
Соңы	135,656,722 bp
Геннің орналасуы (тышқан)
Хр.	15-хромосома (тышқан)
Соңы	69,101,211 bp
РНҚ экспрессиясы өрнек
	Қосымша сілтеме өрнегі туралы деректер
Гендік онтология
Молекулалық функция	• SH3 доменін байланыстыру; • GO: 0001948 ақуыздармен байланысуы; • РНҚ байланысы; • нуклеин қышқылымен байланысуы; • белоктық доменнің спецификалық байланысы; • бірдей ақуыздармен байланысуы;
Ұялы компонент	• жасуша ядросы; • нуклеоплазма;
Биологиялық процесс	• транскрипцияны реттеу, ДНҚ-шаблонмен; • транскрипция, ДНҚ-шаблонмен; • мРНҚ өңдеу; • сплитеосома арқылы mRNA қосылуын реттеу; • ақуыз олигомеризациясы;
	Дереккөздер:Амиго / QuickGO
Ортологтар
	10656
	13992
	ENSG00000131773
	ENSMUSG00000022332
	O75525
	Q9R226
	NM_006558
	NM_010158
	NP_006549
	NP_034288
	Уикидеректер
Адамды қарау / өңдеу	Тінтуірді қарау / өңдеу

KH домені бар, РНҚ-мен байланысатын, сигналды өткізуге байланысты ақуыз 3 Бұл ақуыз адамдарда кодталған KHDRBS3 ген.^[5]^[6]^[7]

Өзара әрекеттесу

KHDRBS3 көрсетілген өзара әрекеттесу бірге SIAH1.^[8]^[9]

KHDRBS3 сплайсингтік Sam68 және онкогенмен өзара әрекеттеседі метадерин простата қатерлі ісігі жасушаларында.^[10]

Клиникалық маңызы

KHDRBS3 (T-STAR) өрнегінің ұлғаюы көрсетілген простата обыры қоршаған жақсы тінмен салыстырғанда мата.^[10] KHDRBS3 өрнегі өзара байланысты mpMRI Likert ұпайымен өлшенген сигнал жүйесі ұқсас PI-RADS.^[10] Әлі де пікірталас кезінде mpMRI сигналы жоғары деңгеймен корреляцияланады Глисон бағасы және қосымша, ісік мөлшері гистопатологиялық клиникалық агрессивті простата обырымен байланысты ерекшеліктер.^[11]^[12]

Қуық асты безінің қатерлі ісігінде KHDRBS3 синтетикалық андрогенді қосқаннан кейін mRNA экспрессиясының төмендеуімен андроген реттелетін көрінеді. R1881 жасушаларға.^[10]

Әдебиеттер тізімі

^ ^а ^б ^c GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000131773 - Ансамбль, Мамыр 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000022332 - Ансамбль, Мамыр 2017
^ «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
^ «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
^ Venables JP, Vernet C, Chew SL, Elliott DJ, Cowmeadow RB, Wu J және т.б. (Маусым 1999). «T-STAR / ETOILE: сперматогенезге қатысатын РНҚ-байланыстыратын протеинмен өзара әрекеттесетін SAM68-нің жаңа туысы». Адам молекулалық генетикасы. 8 (6): 959–69. дои:10.1093 / hmg / 8.6.959. PMID 10332027.
^ Ли Дж, Бурр Дж.Г. (қараша 1999). «Сальпальфа және Сальпбета, өсімді тоқтататын гомологтар Sam68». Джин. 240 (1): 133–47. дои:10.1016 / S0378-1119 (99) 00421-7. PMID 10564820.
^ «Entrez Gene: KHDRBS3 KH домені бар, РНҚ байланыстыратын, сигналды 3 өткізетін».
^ Rual JF, Венкатесан К, Хао Т, Хирозане-Кишикава Т, Дрикот А, Ли Н және т.б. (Қазан 2005). «Адамның протеин-протеинмен өзара әрекеттесу желісінің протеома-масштабты картасына қарай». Табиғат. 437 (7062): 1173–8. Бибкод:2005 ж.437.1173R. дои:10.1038 / табиғат04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
^ Venables JP, Dalgliesh C, Paronetto MP, Skitt L, Thornton JK, Saunders PT және т.б. (Шілде 2004). «SIAH1 протеазоманың деградациясы үшін балама қосылу факторы T-STAR-ға бағытталған». Адам молекулалық генетикасы. 13 (14): 1525–34. дои:10.1093 / hmg / ddh165. PMID 15163637.
^ ^а ^б ^c ^г. Luxton HJ, Simpson BS, Mills IG, Brindle NR, Ahmed Z, Stavrinides V, et al. (Тамыз 2019). «Онкогенді метадерин спиртингтің белгілі белоктары YTHDC1, Sam68 және T-STAR-мен өзара әрекеттеседі және баламалы мРНҚ-ны қосуда жаңа рөл атқарады». Рак. 11 (9): 1233. дои:10.3390 / қатерлі ісік аурулары11091233. PMC 6770463. PMID 31450747.
^ Норрис Дж.М., Кармона Эчеверрия Л.М., Ботт С.Р., Браун LC, Бернс-Кокс Н, Даддеридж Т және т.б. (Мамыр 2020). «Мультипараметрлік магнитті-резонанстық томография арқылы қуық қатерлі ісігінің қандай түрі жүйелі түрде байқалмайды? PROMIS когортынан алынған талдау». Еуропалық урология. 78 (2): 163–170. дои:10.1016 / j.eururo.2020.04.029. PMC 7397509. PMID 32370911.
^ Норрис Дж.М., Кармона Эчеверрия Л.М., Симпсон Б.С., Аллен С, Балл Р, Фриман А және т.б. (Сәуір 2020). «Мультипараметрлік магнитті-резонанстық томография кезінде простата қатерлі ісігінің көрінуі: Глисонның жоғары дәрежесі және ісіктің көлемінің жоғарылауы жалғыз маңызды гистопатологиялық ерекшелік емес». BJU International. 126 (2): 237–239. дои:10.1111 / bju.15085. PMID 32319152.

Әрі қарай оқу

Ди Фрусчио М, Чен Т, Ричард С (наурыз 1999). «Sam68 тәрізді сүтқоректілердің SLM-1 және SLM-2 ақуыздарының сипаттамасы: SLM-1 - митоз кезінде Src субстраты». Америка Құрама Штаттарының Ұлттық Ғылым Академиясының еңбектері. 96 (6): 2710–5. Бибкод:1999 PNAS ... 96.2710D. дои:10.1073 / pnas.96.6.2710. PMC 15834. PMID 10077576.
Venables JP, Elliott DJ, Макарова О.В., Макаров Е.М., Кук Х.Ж., Eperon IC (наурыз 2000). «RBMY, адамның сперматогенезінің ықтимал факторы және басқа hnRNP G ақуыздары Tra2beta-мен әрекеттеседі және сплайсингке әсер етеді». Адам молекулалық генетикасы. 9 (5): 685–94. дои:10.1093 / hmg / 9.5.685. PMID 10749975.
Stoss O, Olbrich M, Hartmann AM, Konig H, Memmott J, Andreadis A, Stamm S (наурыз 2001). «STAR / GSG отбасылық ақуызы rSLM-2 балама қосылатын жерлерді таңдауды реттейді». Биологиялық химия журналы. 276 (12): 8665–73. дои:10.1074 / jbc.M006851200. PMID 11118435.
Sugimoto Y, Morita R, Amano K, Shah PU, Pascual-Castroviejo I, Khan S және т.б. (Тамыз 2001). «T-STAR гені: 8q24-тегі эпилепсияға балалық шағының болмауына үміткер аймақтағы жақсы картографиялау және пациенттердегі мутациялық талдау». Эпилепсияны зерттеу. 46 (2): 139–44. дои:10.1016 / S0920-1211 (01) 00274-1. PMID 11463515. S2CID 28713407.
Kool J, van Zaane W, van der Eb AJ, Terleth C (қараша 2001). «SV40 арқылы өлместендірілгеннен кейін өсуді тежейтін ақуыз - T-STAR-ның регуляциясы». Жасушалардың өсуі және дифференциациясы. 12 (11): 535–41. PMID 11714634.
Reddy TR, Suhasini M, Xu W, Yeh LY, Yang JP, Wu J және т.б. (Ақпан 2002). «АИТВ репликациясының транскрипциядан кейінгі реттелуіндегі KH домен ақуыздарының рөлі (Sam68 тәрізді сүтқоректілердің ақуыздары және тітіркенетін белоктар). Биологиялық химия журналы. 277 (8): 5778–84. дои:10.1074 / jbc.M106836200. PMID 11741900.
Côté J, Boisvert FM, Boulanger MC, Bedford MT, Richard S (қаңтар 2003). «Sam68 РНҚ байланыстыратын ақуыз - бұл аргинин N-метилтрансфераза 1 үшін in vivo субстрат». Жасушаның молекулалық биологиясы. 14 (1): 274–87. дои:10.1091 / mbc.E02-08-0484. PMC 140244. PMID 12529443.
Venables JP, Dalgliesh C, Paronetto MP, Skitt L, Thornton JK, Saunders PT және т.б. (Шілде 2004). «SIAH1 протеазоманың деградациясы үшін балама қосылу факторы T-STAR-ға бағытталған». Адам молекулалық генетикасы. 13 (14): 1525–34. дои:10.1093 / hmg / ddh165. PMID 15163637.
Коэн CD, Доран П.П., Блаттнер С.М., Меркл М, Ванг Г.Г., Шмид Н, және т.б. (Шілде 2005). «Сандық дифференциалды дисплеймен анықталған, подациттермен көрсетілген Sam68 тәрізді сүтқоректілердің 2 ақуызы протеинурияда индукцияланады және қан тамырлары эндотелийінің өсу факторын бөлуге қатысады». Американдық нефрология қоғамының журналы. 16 (7): 1958–65. дои:10.1681 / ASN.2005020204. PMID 15901763.
Rual JF, Венкатесан К, Хао Т, Хирозане-Кишикава Т, Дрикот А, Ли Н және т.б. (Қазан 2005). «Адамның протеин-протеинмен өзара әрекеттесу желісінің протеома-масштабты картасына қарай». Табиғат. 437 (7062): 1173–8. Бибкод:2005 ж.437.1173R. дои:10.1038 / табиғат04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Zhang L, Guo L, Peng Y, Chen B (шілде 2006). «T-STAR генінің экспрессиясы HCT-116 адамның ішек рагы жасушаларының желісіндегі теломераза белсенділігінің реттелуімен байланысты». Дүниежүзілік гастроэнтерология журналы. 12 (25): 4056–60. дои:10.3748 / wjg.v12.i25.4056. PMC 4087721. PMID 16810759.
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (қараша 2006). «Сигналды желілердегі ғаламдық, in vivo және нақты фосфорлану динамикасы». Ұяшық. 127 (3): 635–48. дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983. S2CID 7827573.

Бұл мақала а ген қосулы адамның хромосомасы 8 Бұл бұта. Сіз Уикипедияға көмектесе аласыз оны кеңейту.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000131773 - Ансамбль, Мамыр 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000022332 - Ансамбль, Мамыр 2017

[3] «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.

[4] «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.

[pmid10332027-5] Venables JP, Vernet C, Chew SL, Elliott DJ, Cowmeadow RB, Wu J және т.б. (Маусым 1999). «T-STAR / ETOILE: сперматогенезге қатысатын РНҚ-байланыстыратын протеинмен өзара әрекеттесетін SAM68-нің жаңа туысы». Адам молекулалық генетикасы. 8 (6): 959–69. дои:10.1093 / hmg / 8.6.959. PMID 10332027.

[pmid10564820-6] Ли Дж, Бурр Дж.Г. (қараша 1999). «Сальпальфа және Сальпбета, өсімді тоқтататын гомологтар Sam68». Джин. 240 (1): 133–47. дои:10.1016 / S0378-1119 (99) 00421-7. PMID 10564820.

[entrez-7] «Entrez Gene: KHDRBS3 KH домені бар, РНҚ байланыстыратын, сигналды 3 өткізетін».

[pmid16189514-8] Rual JF, Венкатесан К, Хао Т, Хирозане-Кишикава Т, Дрикот А, Ли Н және т.б. (Қазан 2005). «Адамның протеин-протеинмен өзара әрекеттесу желісінің протеома-масштабты картасына қарай». Табиғат. 437 (7062): 1173–8. Бибкод:2005 ж.437.1173R. дои:10.1038 / табиғат04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.

[pmid15163637-9] Venables JP, Dalgliesh C, Paronetto MP, Skitt L, Thornton JK, Saunders PT және т.б. (Шілде 2004). «SIAH1 протеазоманың деградациясы үшін балама қосылу факторы T-STAR-ға бағытталған». Адам молекулалық генетикасы. 13 (14): 1525–34. дои:10.1093 / hmg / ddh165. PMID 15163637.

[:0-10] а ^б ^c ^г. Luxton HJ, Simpson BS, Mills IG, Brindle NR, Ahmed Z, Stavrinides V, et al. (Тамыз 2019). «Онкогенді метадерин спиртингтің белгілі белоктары YTHDC1, Sam68 және T-STAR-мен өзара әрекеттеседі және баламалы мРНҚ-ны қосуда жаңа рөл атқарады». Рак. 11 (9): 1233. дои:10.3390 / қатерлі ісік аурулары11091233. PMC 6770463. PMID 31450747.

[11] Норрис Дж.М., Кармона Эчеверрия Л.М., Ботт С.Р., Браун LC, Бернс-Кокс Н, Даддеридж Т және т.б. (Мамыр 2020). «Мультипараметрлік магнитті-резонанстық томография арқылы қуық қатерлі ісігінің қандай түрі жүйелі түрде байқалмайды? PROMIS когортынан алынған талдау». Еуропалық урология. 78 (2): 163–170. дои:10.1016 / j.eururo.2020.04.029. PMC 7397509. PMID 32370911.

[12] Норрис Дж.М., Кармона Эчеверрия Л.М., Симпсон Б.С., Аллен С, Балл Р, Фриман А және т.б. (Сәуір 2020). «Мультипараметрлік магнитті-резонанстық томография кезінде простата қатерлі ісігінің көрінуі: Глисонның жоғары дәрежесі және ісіктің көлемінің жоғарылауы жалғыз маңызды гистопатологиялық ерекшелік емес». BJU International. 126 (2): 237–239. дои:10.1111 / bju.15085. PMID 32319152.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]