PCBP2 - PCBP2

PCBP2
Қол жетімді құрылымдар
PDB	Ортологиялық іздеу: PDBe RCSB
PDB идентификатор кодтарының тізімі
	2AXY, 2JZX, 2P2R, 2PQU, 2PY9
Идентификаторлар
Бүркеншік аттар	PCBP2, HNRNPE2, HNRPE2, hnRNP-E2, поли (rC) байланыстырушы ақуыз 2
Сыртқы жеке куәліктер	OMIM: 601210 MGI: 108202 HomoloGene: 74536 Ген-карталар: PCBP2
Геннің орналасуы (адам)
Хр.	12-хромосома (адам)
Соңы	53,481,162 bp
Геннің орналасуы (тышқан)
Хр.	15-хромосома (тышқан)
Соңы	102,500,061 bp
РНҚ экспрессиясы өрнек
	; ; ; ;
	Қосымша сілтеме өрнегі туралы деректер
Гендік онтология
Молекулалық функция	• ДНҚ байланыстыру; • ферментті байланыстыру; • нуклеин қышқылымен байланысуы; • убивитин протеині лигазымен байланысуы; • GO: 0001948 ақуыздармен байланысуы; • РНҚ байланысы; • С-ге бай бір тізбекті ДНҚ-мен байланысуы;
Ұялы компонент	• жасушадан тыс экзома; • мембрана; • фокальды адгезия; • нуклеоплазма; • цитоплазма; • жасуша ядросы; • цитозол; • GO: 0097483, GO: 0097481 постсинаптикалық тығыздық;
Биологиялық процесс	• мРНҚ-ны бөлу, сплитеосома арқылы; • вирустың қорғаныс реакциясын теріс реттеу; • протеазомамен қозғалатын убивитинге тәуелді ақуыздың катаболикалық процесі; • вирустың қорғанысы; • mRNA метаболизм процесі; • I типті интерферон өндірісін теріс реттеу; • иммундық жүйенің процесі; • туа біткен иммундық жүйе; • вирустық РНҚ геномының репликациясы; • IRES-ке тәуелді вирустық трансляциялық инициация; • РНҚ метаболизм процесі;
	Дереккөздер:Амиго / QuickGO
Ортологтар
	5094
	18521
	ENSG00000197111
	ENSMUSG00000056851
	Q15366
	Q61990
NM_031989; NM_001098620; NM_001128911; NM_001128912; NM_001128913;
	NM_001128914; NM_005016
	NM_001103165; NM_001103166; NM_001174073; NM_011042
NP_001092090; NP_001122383; NP_001122384; NP_001122385; NP_001122386;
	NP_005007; NP_114366
	NP_001096635; NP_001096636; NP_001167544; NP_035172; NP_001361700
	Уикидеректер
Адамды қарау / өңдеу	Тінтуірді қарау / өңдеу

Поли (rC) байланыстыратын ақуыз 2 Бұл ақуыз адамдарда кодталған PCBP2 ген.^[5]

Функция

Осы генмен кодталған ақуыз көпфункционалды болып көрінеді. Ол PCBP-1 және hnRNPK-мен бірге негізгі жасушалық поли (rC) байланыстыратын ақуыздарға сәйкес келеді. Онда үшеу бар K-гомологты (KH) домендер РНҚ байланыстыруға қатысуы мүмкін. Бұл ПКБП-1-мен бірге кодталған ақуыз, сонымен қатар, IRES діңгек-цикл IV-мен өзара әрекеттесу арқылы полиовирус РНҚ-ның трансляциялық коактиваторлары ретінде жұмыс істейді және полиовирустың РНҚ репликациясын оның 5'-терминалды клевер жапырағының құрылымымен байланыстырады. Бұл сонымен қатар 15-липоксигеназа мРНҚ-ны, адамның 16 L2 mRNA типтегі папилломавирусын және А гепатиті вирусының РНҚ-ны трансляциялық бақылауға қатысты. Кодталған ақуызға альфа-глобиннің мРНҚ тұрақтылығымен байланысты реттік спецификалық альфа-глобин mRNP кешенін құруға қатысады деп ұсынылады. Бұл мультикехон құрылымдық мРНК-сы ұқсас функциялары бар PCBP-1 интронсыз генін генерациялайды деп қайта өзгертілген деп саналады. Бұл ген мен PCBP-1-де PCBP3 және PCBP4 параллогтары бар, олар бүкіл гендердің қайталану оқиғалары нәтижесінде пайда болды деп саналады. Онда PCBP2P1 және PCBP2P2 өңделген екі псевдогендер бар. Қазіргі уақытта осы ген үшін сипатталған екі балама транскрипт нұсқасы бар.^[6]

Адамдарда PCBP2 гені қабаттасады TUC338, транскрипцияланған ультра сақталған элемент қатысты Гепатоцеллюлярлы карцинома.^[7]

Өзара әрекеттесу

PCBP2 көрсетілген өзара әрекеттесу бірге ХНРПК,^[8] PTBP1,^[8] және HNRNPL.^[8]

Әдебиеттер тізімі

^ ^а ^б ^c GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000197111 - Ансамбль, Мамыр 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000056851 - Ансамбль, Мамыр 2017
^ «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
^ «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
^ Tommerup N, Leffers H (мамыр 1997). «Орнында будандастыру жолымен адамның құрамында KH-қорабы бар гендерді тағайындау: HNRNPK 9q21.32-q21.33, PCBP1-ден 2p12-p13-ке дейін және PCBP2-ден 12q13.12-q13.13-ке дейін, FRA12A-ге дейін кескінделеді». Геномика. 32 (2): 297–8. дои:10.1006 / geno.1996.0121. PMID 8833161.
^ «Entrez Gene: PCBP2 поли (rC) байланыстырушы ақуыз 2».
^ Braconi C, Valeri N, Kogure T, Gasparini P, Huang N, Nuovo GJ, Terracciano L, Croce CM, Patel T (2011-01-11). «Гепатоцеллюлярлы карциномадағы ультраконсервирленген элементі бар транскрипцияланған кодталмаған РНҚ экспрессиясы және функционалды рөлі». Америка Құрама Штаттарының Ұлттық Ғылым Академиясының еңбектері. 108 (2): 786–91. дои:10.1073 / pnas.1011098108. PMC 3021052. PMID 21187392.
^ ^а ^б ^c Kim JH, Hahm B, Kim YK, Choi M, Jang SK (мамыр 2000). «Ядролар мен цитоплазма арасындағы шелектегі hnRNPs арасындағы ақуыз-ақуыздың өзара әрекеттесуі». Дж.Мол. Биол. 298 (3): 395–405. дои:10.1006 / jmbi.2000.3687. PMID 10772858.

Әрі қарай оқу

Киледжиан М, Ванг Х, Либхабер С.А. (1995). «Альфа-глобин mRNP тұрақтылық кешеніндегі екі KH домен ақуызын анықтау». EMBO J. 14 (17): 4357–64. дои:10.1002 / j.1460-2075.1995.tb00110.x. PMC 394520. PMID 7556077.
Leffers H, Dejgaard K, Celis JE (1995). «Екі негізгі жасушалық поли (rC) байланыстыратын адам ақуыздарының сипаттамасы, олардың әрқайсысында үш K-гомологты (KH) домендер бар». EUR. Дж. Биохим. 230 (2): 447–53. дои:10.1111 / j.1432-1033.1995.tb20581.x. PMID 7607214.
Маруяма К, Сугано С (1994). «Олиго-жабу: эукариоттық мРНҚ-ның қақпақ құрылымын олигорибонуклеотидтермен ауыстырудың қарапайым әдісі». Джин. 138 (1–2): 171–4. дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Blyn LB, Swiderek KM, Richards O, Stahl DC, Semler BL, Ehrenfeld E (1996). «Поли (rC) байланыстыратын ақуыз 2 полиовирустың РНҚ 5 'кодталмайтын аймағының IV діңгек циклымен байланысады: автоматтандырылған сұйық хроматография-тандемді масс-спектрометрия арқылы идентификациялау». Proc. Натл. Акад. Ғылыми. АҚШ. 93 (20): 11115–20. дои:10.1073 / pnas.93.20.11115. PMC 38293. PMID 8855318.
Funke B, Zuleger B, Benavente R, Schuster T, Goller M, Stévenin J, Horak I (1996). «Тышқан поли (С) байланыстыратын ақуыз бірнеше изоформада болады және РНҚ-мен байланысатын бірнеше белоктармен өзара әрекеттеседі». Нуклеин қышқылдары. 24 (19): 3821–8. дои:10.1093 / нар / 24.19.3821. PMC 146158. PMID 8871564.
Blyn LB, Towner JS, Semler BL, Ehrenfeld E (1997). «Полиовирустық РНҚ-ны аудару үшін поли (rC) байланыстыратын ақуыздың 2 талабы». Дж. Вирол. 71 (8): 6243–6. дои:10.1128 / JVI.71.8.6243-6246.1997. PMC 191892. PMID 9223526.
Kiledjian M, DeMaria CT, Brewer G, Novick K (1997). «AUF1 (гетерогенді ядролық рибонуклеопротеин D) альфа-глобин мРНҚ тұрақтылық кешенінің компоненті ретінде сәйкестендіру». Мол. Ұяшық. Биол. 17 (8): 4870–6. дои:10.1128 / MCB.17.8.4870. PMC 232339. PMID 9234743.
Сузуки Ю, Йошитомо-Накагава К, Маруяма К, Суяма А, Сугано С (1997). «Толық көлемде байытылған және 5-деңгеймен байытылған cDNA кітапханасының құрылысы және сипаттамасы». Джин. 200 (1–2): 149–56. дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Чызык-Крзеска МФ, Бендиксен AC (1999). «Эритропоэтиндік хабарлаушы РНҚ-ның 3 'аударылмаған аймағымен байланысты кешендегі поли (С) байланыстыратын ақуызды анықтау». Қан. 93 (6): 2111–20. дои:10.1182 / қан.V93.6.2111.406k24_2111_2120. PMID 10068686.
Wang Z, Day N, Trifillis P, Kiledjian M (1999). «MRNA тұрақтылық кешені mRNA-ны in vitro тұрақтандыру үшін поли (А) байланыстыратын протеинмен жұмыс істейді». Мол. Ұяшық. Биол. 19 (7): 4552–60. дои:10.1128 / MCB.19.7.4552. PMC 84253. PMID 10373504.
Макеев А.В., Чхейдзе А.Н., Либхабер С.А. (1999). «MRNA тұрақтандыруға қатысы бар жоғары консервіленген РНҚ-байланыстыратын ақуыздар жиынтығы, альфаСП-1 және альфаЦП-2 интронсыз геннен және оның құрамындағы интронды параллельден экспрессияланады». Дж.Биол. Хим. 274 (35): 24849–57. дои:10.1074 / jbc.274.35.24849. PMID 10455157.
Kim JH, Hahm B, Kim YK, Choi M, Jang SK (2000). «Ядролар мен цитоплазма арасындағы шелектегі hnRNPs арасындағы ақуыз-ақуыздың өзара әрекеттесуі». Дж.Мол. Биол. 298 (3): 395–405. дои:10.1006 / jmbi.2000.3687. PMID 10772858.
Макеев А.В., Либхабер С.А. (2000). «Сүтқоректілердің екі жаңа генін сәйкестендіру KH-доменінің РНҚ-мен байланысатын ақуыздарының субфамилиясын құрайды». Геномика. 67 (3): 301–16. дои:10.1006 / geno.2000.6244. PMID 10936052.
Чанг Дж.Дж., Лух ХВ, Ванг Ш., Лин Х.Ж., Ли СК, Ху СТ (2002). «Гетерогенді ядролық рибонуклеопротеин K (hnRNP K) денге вирусының негізгі ақуызымен әрекеттеседі». ДНҚ жасушасы биол. 20 (9): 569–77. дои:10.1089/104454901317094981. PMID 11747608.
Yeap BB, Voon DC, Vivian JP, McCulloch RK, Thomson AM, Giles KM, Czyzyk-Krzeska MF, Furneaux H, Wilce MC, Wilce JA, Leedman PJ (2002). «HuR және поли (C) байланыстыратын ақуызды андрогенді рецепторлық хабарлаушы РНҚ-ның 3'-аударылмаған аймағындағы UC-ге бай мотивпен байланыстыру». Дж.Биол. Хим. 277 (30): 27183–92. дои:10.1074 / jbc.M202883200. PMID 12011088.
Уолтер Б.Л., Ақжелкен Т.Б., Эренфельд Е, Семлер Б.Л. (2002). «Полиовирустық трансляция инициациясы және вирустық РНҚ репликациясы үшін KH доменін анықтайтын поли (rC) байланыстыратын ақуыз». Дж. Вирол. 76 (23): 12008–22. дои:10.1128 / JVI.76.23.12008-12022.2002. PMC 136902. PMID 12414943.
Абрахам Р.С., Гейер С.М., Прайс-Троска Т.Л., Аллмер С, Кайл РА, Герц М.А., Фонсека Р (2003). «Иммуноглобулиннің жеңіл тізбекті айнымалы (V) аймағының гендері жеңіл тізбекпен байланысты амилоидоздың (AL) клиникалық көрінісі мен нәтижесіне әсер етеді». Қан. 101 (10): 3801–8. дои:10.1182 / қан-2002-09-2707. PMID 12515719.
Pickering BM, Mitchell SA, Evans JR, Willis AE (2003). «Полипиримидинді жолмен байланыстыратын ақуыз және поли р (С) байланыстыратын ақуыз 1 BAG-1 IRES-пен әрекеттеседі және оның in vitro және in vivo белсенділігін ынталандырады». Нуклеин қышқылдары. 31 (2): 639–46. дои:10.1093 / nar / gkg146. PMC 140511. PMID 12527772.

Бұл мақала а ген қосулы адамның хромосомасы 12 Бұл бұта. Сіз Уикипедияға көмектесе аласыз оны кеңейту.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000197111 - Ансамбль, Мамыр 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000056851 - Ансамбль, Мамыр 2017

[3] «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.

[4] «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.

[pmid8833161-5] Tommerup N, Leffers H (мамыр 1997). «Орнында будандастыру жолымен адамның құрамында KH-қорабы бар гендерді тағайындау: HNRNPK 9q21.32-q21.33, PCBP1-ден 2p12-p13-ке дейін және PCBP2-ден 12q13.12-q13.13-ке дейін, FRA12A-ге дейін кескінделеді». Геномика. 32 (2): 297–8. дои:10.1006 / geno.1996.0121. PMID 8833161.

[entrez-6] «Entrez Gene: PCBP2 поли (rC) байланыстырушы ақуыз 2».

[Bra11-7] Braconi C, Valeri N, Kogure T, Gasparini P, Huang N, Nuovo GJ, Terracciano L, Croce CM, Patel T (2011-01-11). «Гепатоцеллюлярлы карциномадағы ультраконсервирленген элементі бар транскрипцияланған кодталмаған РНҚ экспрессиясы және функционалды рөлі». Америка Құрама Штаттарының Ұлттық Ғылым Академиясының еңбектері. 108 (2): 786–91. дои:10.1073 / pnas.1011098108. PMC 3021052. PMID 21187392.

[pmid10772858-8] а ^б ^c Kim JH, Hahm B, Kim YK, Choi M, Jang SK (мамыр 2000). «Ядролар мен цитоплазма арасындағы шелектегі hnRNPs арасындағы ақуыз-ақуыздың өзара әрекеттесуі». Дж.Мол. Биол. 298 (3): 395–405. дои:10.1006 / jmbi.2000.3687. PMID 10772858.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]