RprA РНҚ - RprA RNA

RprA РНҚ
RF00034.jpg
Идентификаторлар
ТаңбаRprA
РфамRF00034
Басқа деректер
РНҚ түріДжин; сРНҚ
Домен (дер)Бактериялар
СОSO: 0000387
PDB құрылымдарPDBe

The RprA РНҚ ген 106 кодтайды нуклеотид нормативтік кодталмаған РНҚ. Стационарлық фазалық сигма факторы RpoS трансляциялық реттелуі екі тізбекті РНҚ түзуімен жүзеге асады діңгек ағынды аймағындағы құрылым rpoS аударма басталатын сайтты қамтитын хабаршы РНҚ.[1][2]

RprA (RpoS реттегіші RNA A) бар клондар RpoS трансляциясын арттырды. Сияқты ДсрА, RprA үш діңгек ілмектер түзеді деп болжануда. Осылайша, RpoS трансляциясының оң реттелуіне кем дегенде екі кішігірім РНҚ, DsrA және RprA қатысады. RprA RpoS көшбасшысымен байланысатын сияқты.[3] RprA маңызды емес.[4] Вассерман т.б. осы РНҚ-ның байланысты екенін көрсетті Hfq ақуызы.[5] Hfq-мен байланысу RprA конформациясын өзгертеді.[6] Hfq болған кезде RprA тұрақтылығына әсер етеді осмолярлық ұяшықтың, бұл тәуелді эндорибонуклеаз RNase E.[7]

RprA деп аталатын ақуыздарды кодтайтын гендерді реттейтіні көрсетілген csgD, бұл ақуыз қозғалмайтын фаза индукциясын кодтайды биофильм реттеуші және ydaM, ол csgD транскрипциясын белсендіруге қатысатын дигуанилатциклазаны кодтайды. Бұл екі мақсатты гендер қуғын-сүргінге ұшырады нәтижесінде пайда болатын RprA биофильм қалыптастыру.[8]

Әдебиеттер тізімі

  1. ^ Updegrove T, Wilf N, Sun X, Wartell RM (2008). «Hfq-дің RprA-rpoS mRNA жұптасуына әсері: Hfq-РНҚ байланысы және 5 ′ rpoS mRNA лидері аймағының әсері». Биохимия. 47 (43): 11184–11195. дои:10.1021 / bi800479б. PMID  18826256.
  2. ^ Джонс А.М., Гудвилл А, Эллиотт Т (2006). «Salmonella enterica ішіндегі rpoS реттеуіндегі DsrA және RprA реттеуші РНҚ-ның шектеулі рөлі». J бактериол. 188 (14): 5077–5088. дои:10.1128 / JB.00206-06. PMC  1539969. PMID  16816180.
  3. ^ Маждалани, Н; Эрнандес Д; Готтесман С (2002). «RpoS трансляциясының екінші кішігірім РНҚ активаторының әрекеті, режимі және RprA». Мол микробиол. 46 (3): 813–826. дои:10.1046 / j.1365-2958.2002.03203.x. PMID  12410838.
  4. ^ Маждалани, Н; Чен С; Murrow J; Сент Джон К; Готтесман С (2001). «RpoS-ті жаңа шағын РНҚ-мен реттеу: RprA сипаттамасы». Мол микробиол. 39 (5): 1382–1394. дои:10.1111 / j.1365-2958.2001.02329.x. PMID  11251852.
  5. ^ Wassarman KM, Repoila F, Rosenow C, Storz G, Gottesman S (2001). «Салыстырмалы геномика мен микроараларды қолдана отырып, жаңа шағын РНҚ-ны анықтау». Genes Dev. 15 (13): 1637–1651. дои:10.1101 / gad.901001. PMC  312727. PMID  11445539.
  6. ^ Хендерсон, Калифорния, Винсент Х.А., Касаменто А, Стоун CM, Филлипс Дж.О., Кэри П.Д., Соботт Ф, Гауэрс Д.М., Тейлор Дж.Е., Каллаган А.Ж. (тамыз 2013). «Hfq байланысы rpoS риборегуляциясына қатысатын Escherichia coli ұсақ кодталмаған РНҚ OxyS және RprA құрылымын өзгертеді». РНҚ. 19 (8): 1089–1104. дои:10.1261 / rna.034595.112. PMC  3708529. PMID  23804244.
  7. ^ Madhugiri R, Basineni SR, Klug G (2010). «E.coli ішіндегі кішкентай кодталмаған РНҚ RprA-ның аударылуына осмолярлық әсер етеді». Mol Genet Genomics. 284 (4): 307–318. дои:10.1007 / s00438-010-0568-x. PMID  20717695.
  8. ^ Mika F, Busse S, Possling A, Berkholz J, Tschowri N, Sommerfeldt N, Pruteanu M, Hengge R (2012). «CsgD-ді кішігірім реттеуші РНҚ RprA стационарлық фазасымен, биофильмнің түзілуімен және ішек таяқшасындағы жасуша қабығының стрессімен байланыстыру». Мол микробиол. 84 (1): 51–65. дои:10.1111 / j.1365-2958.2012.08002.x. PMC  3465796. PMID  22356413.

Сыртқы сілтемелер