Ostreococcus tauri - Ostreococcus tauri

Ostreococcus tauri
Аноның электронды микрографиясы O. tauri ұяшық
Ғылыми классификация өңдеу
Филум:Хлорофиталар
Сынып:Мамиелофиттер
Тапсырыс:Мамиелалес
Отбасы:Bathycoccaceae
Тұқым:Остреококк
Түрлер:
O. tauri
Биномдық атау
Ostreococcus tauri
C. курстар және M.-J. Кретьенно-Динет (1995)

Ostreococcus tauri Бұл біржасушалы түрлері туралы теңіз жасыл балдыр шамамен 0,8 микрометрлер (мкм) диаметрі бойынша, ең аз еркін өмірсимбиотикалық ) эукариот әлі сипатталған. Бұл өте қарапайым ультрақұрылым және ықшам геном.

Жалпыға ортақ мұхиттық мүше ретінде пикопланктон популяциялар, бұл организм маңызды рөл атқарады көміртегі айналымы көптеген салаларда. Жақында, O. tauri қолдану тақырыбы болды салыстырмалы геномика және функционалды геномика,[1][2][3][4] өйткені ол ықшам геномы мен жасыл тегіне байланысты зерттеушілерді қызықтырады.

Тарих

Ostreococcus tauri 1994 жылы ашылды Тау лагуна, Франция, бір жыл бойы лагунаның пикопланктон популяциясын зерттеуде ағындық цитометрия. O. tauri лагунадағы пикопланктон популяциясының негізгі компоненті болып табылды және жасушалардың суреттері өндірілді электронды микроскопия ең кішкентай, бірақ сипатталған еркін тіршілік ететін эукариотты жасушаларды анықтады.[5] O. tauri дереу сыныпқа орналастырылды Празинофиттер сипаттаманың болуына негізделген хлорофилл пигменттер және Хлорофиттер -байланысты каротиноидтар,[5] және бұл классификация одан әрі жүргізілген жұмыстармен расталды.[6][7]

Анатомия

Жасушалар шамамен сфералық (коккоид ), орташа ұзындығы 1 мкм, ені 0,7 мкм. Жасушаның ультрақұрылымы өте қарапайым, а жасуша қабырғасы және а-дан тұрады ядро, жалғыз митохондрия, жалғыз хлоропласт және жалғыз Гольджи аппараты.[5] Жасушалар да жетіспейді флагелла.

Бастапқыда құрамында 14 хромосома бар деп сипатталған,[7] қазір ядро ​​құрамында 20 хромосома бар екендігі белгілі болды[дәйексөз қажет ], барлығы 33 фг ДНҚ.[5]

Экология

Ostreococcus tauri - бұл Францияның оңтүстігіндегі Тау Лагунында жасушалардың көптігі басым балдырлар түрі. Бұл үстемдікке әкеледі деп ойлайтын жағдайлар, біріншіден, Лагунды моллюсканы интенсивті өсіру үшін қолданады, екіншіден, Лагунадағы мыс деңгейінің жоғары болуы. Бірінші қарастыру кішірек ұяшықтарды таңдайды (пикопланктон ); балдырлардың үлкен эукариоттық түрлерін және ұсақ балдырлардың көптеген жыртқыштарын моллюскалар жақсырақ тұтынады, олар фильтрлі қоректендіргіштер. Екінші қарастыру қарсы деп таңдайды цианобактериялар, сияқты O. tauri «қолайсыз жағдайлармен» жақсы күреседі деп ойлайды. Лагунадағы артық мыс қоршаған ортада қолданылатын ауылшаруашылық химикаттарынан шыққан деп болжануда жүзімдіктер.[8]

Модельді организм ретінде қолданыңыз

1998 жылдың өзінде O. tauri «жақсы үміткер ретінде анықталды биологиялық модельдер мысалы, жасушалардың бөлінуі және / немесе геномдардың реттілігін зерттеу ».[7]

Геномика

2006 жылы O. tauri геномның дәйектілігі Дерелла болды т.б..[1] 20 хромосомада ұйымдастырылған 12.56 Mb геномы гендердің экстремалды тығыздығын көрсетті және аз интрон - құрамында гендер. Шеткі сипаттамалары бар екі хромосома (құрамында G + C, интрон құрылымы) анықталды, яғни 2-хромосома және 19-хромосома. Басқа түрлердің реттілігі Мамиелалес ұқсас шеткі хромосомалардың басқа түрлерде пайда болуыO. lucimarinus,[2] Микромоналар pusilla [9] & B. празинос[10]).

Әдебиеттер тізімі

  1. ^ а б Derelle, E., Ferraz, C., Rombauts, S., Rouzé, P., Worden, A. Z., Robbens, S.,… Moreau, H. (2006). Ең кішкентай тірі эукариот Ostreococcus tauri геномын талдау көптеген ерекше ерекшеліктерді ашады. Америка Құрама Штаттарының Ұлттық ғылым академиясының еңбектері, 103 (31), 11647–52. http://doi.org/10.1073/pnas.0604795103
  2. ^ а б Паленик, Б., Гримвуд, Дж., Аертс, А., Рузе, П., Саламов, А., Путнам, Н.,… Григорьев, И. В. (2007). Кішкентай эукариот Остреококк планктонның спецификациясының парадоксы туралы геномдық түсінік береді. Америка Құрама Штаттарының Ұлттық ғылым академиясының еңбектері, 104 (18), 7705–10. http://doi.org/10.1073/pnas.0611046104
  3. ^ Бланк-Матье, Р., Верхелст, Б., Дерелле, Э., Ромбаутс, С., Бугет, Ф.-Ю., Карре, И.,… Пигано, Г. (2014). Ostreococcus tauri моделінің жетілдірілген геномы Illumina de novo жиынтықтарын бағалау арқылы өрбіді. BMC Genomics, 15 (1), 1103. http://doi.org/10.1186/1471-2164-15-1103
  4. ^ Krumholz, E. W., Yang, H., Weisenhorn, P., Henry, C. S., & Libourel, I. G. L. (2012). Picoalga Ostreococcus жалпы геномдық метаболикалық желіні қалпына келтіру. Тәжірибелік ботаника журналы, 63 (6), 2353–2362. http://doi.org/10.1093/jxb/err407
  5. ^ а б c г. Курстар, C. т.б. (1994). Ең кішкентай эукариотты организм. Табиғат 370: 255.
  6. ^ Курстар, C. т.б. (1995). Жаңа теңіз пикоеукариоты - Ostreococcus tauri Gen et Sp-NOV (Chlorophyta, Prasinophyceae). Фикология 34 (4): 285-292
  7. ^ а б c Курстар, C. т.б. (1998). «Филогенетикалық анализ және геном мөлшері Ostreococcus tauri (Chlorophyta, Prasinophyceae) « Дж.Фикол. 34 (5): 844-849.
  8. ^ Vaquer, A. т.б. (1996). Тау Лагунындағы пикофитопланктонның тұрақты қоры және динамикасы (Жерорта теңізінің солтүстік-батысы). Лимнология және океанография 41 (8): 1821-1828
  9. ^ Уорден, А.З., Ли, Дж.Х., Мок, Т., Рузе, П., Симмонс, М. П., Аертс, А. Л.,… Григорьев, И. В. (2009). Микромоналар теңіз пикоеукариоттарының геномдары анықтаған жасыл эволюция және динамикалық бейімделулер. Ғылым, 324 (5924), 268-272. http://doi.org/10.1126/science.1167222
  10. ^ Моро, Х., Верхелст, Б., Кулу, А., Дерелле, Э., Ромбаутс, С., Гримсли, Н.,… Вандепоэле, К. (2012). Bathycoccus prasinos-тағы гендік функциялар мен геном құрылымы жасыл тұқымның негізінде жасушалық мамандандыруды көрсетеді. Геном биологиясы, 13 (8), R74. http://doi.org/10.1186/gb-2012-13-8-r74