Рестрикциялық ферменттерді кесуге арналған сайттардың тізімі: S - List of restriction enzyme cutting sites: S

Аңыз нуклеобазалар
КодНуклеотид ұсынылған
AАденин (A)
CЦитозин (C)
GГуанин (G)
ТТимин (T)
NA, C, G немесе T
МA немесе C
RA немесе G
WA немесе T
YC немесе T
SC немесе G
ҚG немесе T
HA, C немесе T
BC, G немесе T
VA, C немесе G
Д.A, G немесе T


Бұл мақалада атаулары S-ден басталатын ең көп зерттелген шектеу ферменттерінің тізімі бар, шамамен 130 ферменттер бар.

  • Фермент: Қабылданған атауы молекула, халықаралық деңгейде қабылданды номенклатура[1][2], және библиографиялық сілтемелер. (Қосымша оқу: «бөлімін қараңыз»Номенклатура «мақалада»Рестрикциялық фермент ".)
  • PDB коды: Ақуыздың құрылымын анықтау үшін қолданылатын код PDB ақуыз құрылымдарының мәліметтер базасы. Ақуыздың 3D атомдық құрылымы оның әсер ету механизмінің жақын бөлшектерін түсіну үшін өте құнды ақпарат береді[3][4].
  • Дереккөз: Ферментті табиғи түрде өндіретін организм.
  • Тану реттілігі: Ферментпен танылған және ол арнайы байланысатын ДНҚ тізбегі.
  • Кесу: Кесу орны және кесілген жердің ДНҚ өнімдері. The тану реттілігі және кесу орны әдетте сәйкес келеді, бірақ кейде кесу орны тану орнынан ондаған нуклеотидтерде болуы мүмкін[5][6].
  • Изосизизомерлер және неосхизомерлер: Ан изошизомер болып табылады фермент дәл сол сияқты кезектеседі. A неошизомер - бұл басқа тізбекті білетін, бірақ басқаша кесетін изохизомердің ерекше түрі. Әрбір фермент үшін ең көп таралған 8-10 изохизомердің ең көп саны көрсетілген, бірақ одан да көп болуы мүмкін. Неошизомерлер қою және жасыл түсті қаріппен көрсетілген (мысалы: BamHI). Қашан «Ешқандай қосылмаған күн«көрсетілген күні, бұл анықталған кесу орны бар мәліметтер базасында тіркелген изосизомер жоқ дегенді білдіреді. Ақ шрифтпен және сұр фонмен көрсетілген изосизомерлер ағымдағы тізімдерде жоқ ферменттерге сәйкес келеді:
тізімде жоқ ферменттегідей: EcoR70I 


Толық тізімді шарлау

Шектеу ферменттері

S

ФерментPDB кодыДереккөзТану реттілігіКесуИзосизомерлер
SacI [7]Streptomyces ахромогендері 5 'GAGCTC
3 'CTCGAG
5 '--- GAGCT   C --- 3 '
3 '--- С   TCGAG --- 5 '
SacIIStreptomyces ахромогендері 5 'CCGCGG
3 'GGCGCC
5 '--- CCGC   GG --- 3 '
3 '--- GG   CGCC --- 5 '
Cfr42I
SacNIStreptomyces ахромогендері N-J-H 5 'GRGCYC
3 'CYCGRG
5 '--- GRGCY   C --- 3 '
3 '--- С   YCGRG --- 5 '
Сәл [7]Streptomyces albus 5 'GTCGAC
3 'CAGCTG
5 '--- Г.   TCGAC --- 3 '
3 '--- CAGCT   G --- 5 '
SalPIStreptomyces albus 5 'CTGCAG
3 'GACGTC
5 '--- CTGCA   G --- 3 '
3 '--- Г.   ACGTC --- 5 '
ApiI, BspMAI, CstI, Ecl37kI, Ecl2zI, Psp23I, PstI, Srl5DI, YenI
SanDIСтрептомицес sp. 5 'GGGWCCC
3 'CCCWGGG
5 '--- GG   GWCCC --- 3 '
3 '--- CCCWG   GG --- 5 '
SapIСахарополиспора sp. 5 'GCTCTTC
3 'CGAGAAG
5 '--- GCTCTTCN   NNN --- 3 '
3 '--- CGAGAAGNNNN   --- 5'
SarIStreptomyces aureomonopodiales 5 'AGGCCT
3 'TCCGGA
5 '--- AGG   КАЖ --- 3 '
3 '--- СТК   GGA --- 5 '
AatI, AspMI, Eco147I, GdiI, PceI, Pme55I, Sru30DI, SseBI, SteI, StuI
SatIStaphylococcus arlettae RFL832 5 'GCNGC
3 'CGNCG
5 '--- МК   NGC --- 3 '
3 '--- CGN   CG --- 5 '
SauIStreptomyces aureofaciens IKA 18/4 5 'CCTNAGG
3 'GGANTCC
5 '--- CC   TNAGG --- 3 '
3 '--- GGANT   CC --- 5 '
AocI, BliHKI, BspR7I, CvnI, Lmu60I, OxaNI, SauI, SshAI
Sau96IАлтын стафилококк PS96 5 'GGNCC
3 'CCNGG
5 '--- Г.   GNCC --- 3 '
3 '--- CCNG   G --- 5 '
AsuI, Bal228I, Bce22I, BsiZI, BspF4I, Cfr13I, Nsp7121I, UnbI
Сау3239IStreptomyces aureofaciens 5 'CTCGAG
3 'GAGCTC
5 '--- С   TCGAG --- 3 '
3 '--- GAGCT   C --- 5 '
BspAAI, BstVI, MlaAI, PaeR7I, Sbi68I, Sfr274I, SlaI, XpaI
Sau3AI2REUАлтын стафилококк 5 'GATC
3 'CTAG
5' ---   GATC --- 3 '
3 '--- CTAG   --- 5'
Bce243I, Bsp143I, BspJI, BstMBI, CviAI, Kzo9I, NdeII, Sth368I
СауБМКИStreptomyces aureofaciens БМ-К 5 'GCCGGC
3 'CGGCCG
5 '--- GCC   GGC --- 3 '
3 '--- CGG   CCG --- 5 '
SauHPIStreptomyces aureofaciens R8 / 26 5 'GCCGGC
3 'CGGCCG
5 '--- GCC   GGC --- 3 '
3 '--- CGG   CCG --- 5 '
СауЛПИStreptomyces aureofaciens B-96 5 'GCCGGC
3 'CGGCCG
5 '--- GCC   GGC --- 3 '
3 '--- CGG   CCG --- 5 '
SauLPIIStreptomyces aureofaciens B-96 5 'CTCGAG
3 'GAGCTC
5 '--- С   TCGAG --- 3 '
3 '--- GAGCT   C --- 5 '
BspAAI, MavI, MlaAI, PaeR7I, Sbi68I, Sfr274I, SlaI, XpaI
SauMIАлтын стафилококк М 5 'GATC
3 'CTAG
5' ---   GATC --- 3 '
3 '--- CTAG   --- 5'
BscFI, BspAI, БстКТИ, Ха, HacI, MkrAI, RalF40I, SsiAI
SauNIStreptomyces aureofaciens НМУ 5 'GCCGGC
3 'CGGCCG
5 '--- GCC   GGC --- 3 '
3 '--- CGG   CCG --- 5 '
SauSIStreptomyces aureofaciens 16 5 'GCCGGC
3 'CGGCCG
5 '--- GCC   GGC --- 3 '
3 '--- CGG   CCG --- 5 '
SbfIСтрептомицес sp. BF-61 5 'CCTGCAGG
3 'GGACGTCC
5 '--- CCTGCA   GG --- 3 '
3 '--- GG   ACGTCC --- 5 '
Sbi68IStreptomyces bikiniensis JAM68 5 'CTCGAG
3 'GAGCTC
5 '--- С   TCGAG --- 3 '
3 '--- GAGCT   C --- 5 '
BspAAI, MavI, MlaAI, PaeR7I, Sbi68I, Sol10179I, StrI, XpaI
Sbo13IShigella boydii 13 5 'TCGCGA
3 'AGCGCT
5 '--- TCG   CGA --- 3 '
3 '--- AGC   GCT --- 5 '
SbvIStreptococcus bovis II / 1 5 'GGCC
3 'CCGG
5 '--- GG   CC --- 3 '
3 '--- CC   GG --- 5 '
ScaI [7]Streptomyces Caespitosus 5 'БАЙЛАНЫС
3 'TCATGA
5 '--- AGT   ACT --- 3 '
3 '--- TCA   TGA --- 5 '
Acc113I, AssI, BmcAI, Bpa34I, 
DpaI, Eco255I, RflFII, ZrmI
SceIIISaccharomyces cerevisiae 5 'GCCGGC
3 'CGGCCG
5 '--- Г.   CCGGC --- 3 '
3 '--- CGGCC   G --- 5 '
SchIStaphylococcus cohnii Лки 19-320 5 'GAGTC
3 'CTCAG
5 '--- GAGTCN4N   --- 3'
3 '--- CTCAGN4N   --- 5'
SchZIStreptomyces chusanensis ZS-2 5 'CCGCGG
3 'GGCGCC
5 '--- CCGC   GG --- 3 '
3 '--- GG   CGCC --- 5 '
Ғылыми жұмысStreptoverticillium cinnamoneum 5 'CTCGAG
3 'GAGCTC
5 '--- CTC   GAG --- 3 '
3 '--- GAG   CTC --- 5 '
BspAAI, BstVI, MlaAI, PaeR7I, SauLPII, SlaI, Sol10179I, XhoI
SciNIСпироплазма цитрийі ASP2 5 'GCGC
3 'CGCG
5 '--- Г.   CGC --- 3 '
3 '--- CGC   G --- 5 '
BspLAI, BstHHI, CfoI, FnuDIII, Хха, Hin6I, HinP1I, HsoI, HspAI
ScrFIStreptococcus cremoris F 5 'CCNGG
3 'GGNCC
5 '--- CC   NGG --- 3 '
3 '--- GGN   CC --- 5 '
SdaI2IXSStreptomyces diastaticus Ng7-324 5 'CCTGCAGG
3 'GGACGTCC
5 '--- CCTGCA   GG --- 3 '
3 '--- GG   ACGTCC --- 5 '
SdiIStreptomyces diastaticus 5 'GGCCN5GGCC
3 'CCGGN5CCGG
5 '--- GGCCNNNN   NGGCC --- 3 '
3 '--- CCGGN   NNNNCCGG --- 5 '
SduIStreptococcus durans RFL3 5 'GDGCHC
3 'CHCGDG
5 '--- GDGCH   C --- 3 '
3 '--- С   HCGDG --- 5 '
AocII, BmyI, BsoCI, Bsp1286I, BspLS2I, MhlI, NspII
SecIСинехокистис sp. 6701 5 'CCNNGG
3 'GGNNCC
5 '--- С   CNNGG --- 3 '
3 '--- GGNNC   C --- 5 '
СелИSynechococcus elongatus 5 'CGCG
3 'GCGC
5' ---   CGCG --- 3 '
3 '--- GCGC   --- 5'
AccII, Bsh1236I, Bsp123I, Bsp50I, BstFNI, BstUI, БткИ, Csp68KVI
SenPT16ISalmonella enteritidis PT16 5 'CGGCCG
3 'GCCGGC
5 '--- С   GGCCG --- 3 '
3 '--- GCCGG   C --- 5 '
AaaI, BseX3I, BstZI, EagI, EclXI, Eco52I, XmaIII
SenPT14bISalmonella enteritidis PT14b 5 'CCGCGG
3 'GGCGCC
5 '--- CCGC   GG --- 3 '
3 '--- GG   CGCC --- 5 '
SepIStaphylococcus epidermidis 5 'ATGCAT
3 'TACGTA
5 '--- ATGCA   T --- 3 '
3 '--- Т   ACGTA --- 5 '
BfrBI, Csp68KIII, Mph1103I, NsiI, PinBI, Ppu10I, SspD5II, Zsp2I
SexAIStreptomyces exfoliatus 5 'ACCWGGT
3 'TGGWCCA
5 '--- A   CCWGGT --- 3 '
3 '--- TGGWCC   A --- 5 '
SexBIStreptomyces exfoliatus 5 'CCGCGG
3 'GGCGCC
5 '--- CCGC   GG --- 3 '
3 '--- GG   CGCC --- 5 '
SexCIStreptomyces exfoliatus 5 'CCGCGG
3 'GGCGCC
5 '--- CCGC   GG --- 3 '
3 '--- GG   CGCC --- 5 '
SfaIStreptococcus faecalis зимогендер 5 'GGCC
3 'CCGG
5 '--- GG   CC --- 3 '
3 '--- CC   GG --- 5 '
SfaNIStreptococcus faecalis ND547 5 'GCATC
3 'CGTAG
5 '--- GCATCN4N   NNNN --- 3 '
3 '--- CGTAGN4NNNNN   --- 5'
SfcIStreptococcus faecium 5 'CTRYAG
3 'GAYRTC
5 '--- С   TRYAG --- 3 '
3 '--- GAYRT   C --- 5 '
SfeIStreptococcus faecalis 5 'CTRYAG
3 'GAYRTC
5 '--- С   TRYAG --- 3 '
3 '--- GAYRT   C --- 5 '
SfiI2F03Streptomyces fimbriatus 5 'GGCCN5GGCC
3 'CCGGN5CCGG
5 '--- GGCCNNNN   NGGCC --- 3 '
3 '--- CCGGN   NNNNCCGG --- 5 '
SflIStreptoverticillium flavopersicum 5 'CTGCAG
3 'GACGTC
5 '--- CTGCA   G --- 3 '
3 '--- Г.   ACGTC --- 5 '
ApiI, BspMAI, BsuBI, CfrA4I, Psp23I, PstI, Sag23I, Srl5DI, YenI
SfoISerratia fonticola 5 'GGCGCC
3 'CCGCGG
5 '--- GGC   GCC --- 3 '
3 '--- CCG   CGG --- 5 '
Sfr274IStreptomyces fradiae 274 5 'CTCGAG
3 'GAGCTC
5 '--- С   TCGAG --- 3 '
3 '--- GAGCT   C --- 5 '
AbrI, BluI, BssHI, MavI, Sau3239I, Sol10179I, StrI, TliI
Sfr303IStreptomyces fradiae 303 5 'CCGCGG
3 'GGCGCC
5 '--- CCGC   GG --- 3 '
3 '--- GG   CGCC --- 5 '
SfuIStreptomyces fulvissimus 5 'TTCGAA
3 'AAGCTT
5 '--- ТТ   CGAA --- 3 '
3 '--- AAGC   TT --- 5 '
АсуII, BimI, Bsp119I, CbiI, Csp68KII, PlaII, Ssp1I, SviI
SgfIStreptomyces griseoruber 5 'GCGATCGC
3 'CGCTAGCG
5 '--- GCGAT   CGC --- 3 '
3 '--- CGC   TAGCG --- 5 '
AsiSI, RgaI, SfaAI 
SgrAI3DPG 3N7B 3N78 3MGY 3MG6Streptomyces griseus 5 'CRCCGGYG
3 'GYGGCCRC
5 '--- CR   CCGGYG --- 3 '
3 '--- GYGGCC   RC --- 5 '
SgrBIStreptomyces griseus 5 'CCGCGG
3 'GGCGCC
5 '--- CCGC   GG --- 3 '
3 '--- GG   CGCC --- 5 '
SimIStaphylococcus intermedius 6H 5 'GGGTC
3 'CCCAG
5 '--- GG   GTC --- 3 '
3 '--- CCCAG   --- 5'
SinISalmonella infantis 5 'GGWCC
3 'CCWGG
5 '--- Г.   GWCC --- 3 '
3 '--- CCWG   G --- 5 '
Bme216I, CauI, EagMI, FdiI, HgiBI, HgiHIII, Psp03I, VpaK11BI
SlaIStreptomyces lavendulae 5 'CTCGAG
3 'GAGCTC
5 '--- С   TCGAG --- 3 '
3 '--- GAGCT   C --- 5 '
AbrI, BluI, BssHI, MavI, Sau3239I, Sfr274I, TliI, XhoI
SleISynechococcus leopoliensis 5 'CCWGG
3 'GGWCC
5' ---   CCWGG --- 3 '
3 '--- GGWCC   --- 5'
AeuI, AglI, АпаОРИ, BspNI, Bst2I, EcoRII, SniI, SslI, SspAI, ZanI
Slu1777IStreptomyces lusitanus 1777 5 'GCCGGC
3 'CGGCCG
5 '--- GCC   GGC --- 3 '
3 '--- CGG   CCG --- 5 '
SmaISerratia marcescens Sb 5 'CCCGGG
3 'GGGCCC
5 '--- CCC   GGG --- 3 '
3 '--- GGG   CCC --- 5 '
AhyI, CfrJ4I, EaeAI, EclRI, Pac25I, PspAI, TspMI, XcyI, XmaI, XmaCI
SmiIStreptococcus milleri S 5 'ATTTAAAT
3 'TAAATTTA
5 '--- ATTT   AAAT --- 3 '
3 '--- ТААА   TTTA --- 5 '
SmiMISphingobacterium mizutae М 5 'CAYN4RTG
3 'GTRN4YAC
5 '--- CAYNN   NNRTG --- 3 '
3 '--- GTRNN   NNYAC --- 5 '
SmlIСтенотрофомоназ мальтофилиясы 5 'CTYRAG
3 'GARYTC
5 '--- С   ТЫРАГ --- 3 '
3 '--- ГАРЫТ   C --- 5 '
SmuISphingobacterium multivorum RFL21 5 'CCCGC
3 'GGGCG
5 '--- CCCGCNNNN   NN --- 3 '
3 '--- GGGCGNNNNNN   --- 5'
SmuEIStreptococcus mutans E 5 'GGWCC
3 'CCWGG
5 '--- Г.   GWCC --- 3 '
3 '--- CCWG   G --- 5 '
Bme216I, CauI, EagMI, FdiI, HgiBI, HgiHIII, Psp03I, VpaK11BI
SnaBISphaerotilus natans 5 'TACGTA
3 'ATGCAT
5 '--- TAC   GTA --- 3 '
3 '--- ATG   CAT --- 5 '
SniIStreptomyces niveus 5 'CCWGG
3 'GGWCC
5 '--- CC   WGG --- 3 '
3 '--- GGW   CC --- 5 '
АпаORI, BseBI, BshGI, BstNI, BstOI, Bst2UI, BthEI, MvaI, SspAI
SnoIStreptomyces novocastria 5 'GTGCAC
3 'CACGTG
5 '--- Г.   TGCAC --- 3 '
3 '--- CACGT   G --- 5 '
Alw44I, ApaLI, VneI
СолИStreptoverticillium olivoverticillatum 5 'GGATCC
3 'CCTAGG
5 '--- Г.   GATCC --- 3 '
3 '--- CCTAG   G --- 5 '
AccEBI, AliI, ApaCI, BamHI, Bce751I, CelI, OkrAI, SolI, SurI
Sol10179IStreptomyces olivochromogenes ST10179 5 'CTCGAG
3 'GAGCTC
5 '--- С   TCGAG --- 3 '
3 '--- GAGCT   C --- 5 '
BspAAI, MavI, MlaAI, PaeR7I, Sbi68I, Sol10179I, StrI, XpaI
SpaHISynechococus parietina 5 'GCATGC
3 'CGTACG
5 '--- GCATG   C --- 3 '
3 '--- С   GTACG --- 5 '
SpeISphaerotilus natans 5 'ACTAGT
3 'TGATCA
5 '--- A   CTAGT --- 3 '
3 '--- TGATC   A --- 5 '
AhII, AclNI, BcuI
СфИ [7]Streptomyces phaeochromogenes 5 'GCATGC
3 'CGTACG
5 '--- GCATG   C --- 3 '
3 '--- С   GTACG --- 5 '
SplISpirulina platensis 5 'CGTACG
3 'GCATGC
5 '--- С   GTACG --- 3 '
3 '--- GCATG   C --- 5 '
SpmISphingobacterium multivorum RFL21 5 'ATCGAT
3 'TAGCTA
5 '--- AT   CGAT --- 3 '
3 '--- TAGC   TA --- 5 '
BanIII, BbvAII, BdiI, BscI, Bsa29I, BspJI, ClaI, LcaI, PgaI, Ssp27144I
SpoIПотсдам сальмонелла 5 'TCGCGA
3 'AGCGCT
5 '--- TCG   CGA --- 3 '
3 '--- AGC   GCT --- 5 '
SpuIStreptomyces pulveraceus 5 'CCGCGG
3 'GGCGCC
5 '--- CCGC   GG --- 3 '
3 '--- GG   CGCC --- 5 '
SrfIСтрептомицес sp. 5 'GCCCGGGC
3 'CGGGCCCG
5 '--- GCCC   GGGC --- 3 '
3 '--- CGGG   CCCG --- 5 '
SrlISelenomonas ruminantium lactilytica 84 5 'GCCGGC
3 'CGGCCG
5 '--- Г.   CCGGC --- 3 '
3 '--- CGGCC   G --- 5 '
Srl5DISelenomonas ruminantium 5 5 'CTGCAG
3 'GACGTC
5 '--- CTGCA   G --- 3 '
3 '--- Г.   ACGTC --- 5 '
AliAJI, Asp713I, BspMAI, BsuBI, CfrA4I, Pfl21I, PstI, SflI, Srl5DI
Srl32DIISelenomonas ruminantium 32 5 'GAATTC
3 'CTTAAG
5 '--- Г.   AATTC --- 3 '
3 '--- CTTAA   G --- 5 '
Srl55DISelenomonas ruminantium lactilytica 55 5 'GAATTC
3 'CTTAAG
5 '--- Г.   AATTC --- 3 '
3 '--- CTTAA   G --- 5 '
Srl56DISelenomonas ruminantium 56 5 'CTRYAG
3 'GAYRTC
5 '--- С   TRYAG --- 3 '
3 '--- GAYRT   C --- 5 '
SruISelenomonas ruminantium 18D 5 'TTTAAA
3 'AAATTT
5 '--- ТТТ   AAA --- 3 '
3 '--- ААА   ТТТ --- 5 '
AhaIII, DraI, PauAII
Sru4DISelenomonas ruminantium 5 'ATTAAT
3 'ТААТТА
5 '--- AT   TAAT --- 3 '
3 '--- TAAT   TA --- 5 '
AseI, AsnI, BpoAI, PshBI, VspI
Sru30DISelenomonas ruminantium 30 5 'AGGCCT
3 'TCCGGA
5 '--- AGG   КАЖ --- 3 '
3 '--- СТК   GGA --- 5 '
AatI, AspMI, Eco147I, GdiI, PceI, Pme55I, SarI, SseBI, SteI, StuI
SsbIСтрептомицес қотыры 5 'AAGCTT
3 'TTCGAA
5 '--- A   AGCTT --- 3 '
3 '--- TTCGA   A --- 5 '
SscL1IСтафилококк sp. L1 5 'GANTC
3 'CTNAG
5 '--- Г.   ANTC --- 3 '
3 '--- CTNA   G --- 5 '
Sse9IСпоросарцина sp. 9 5 'AATT
3 'TTAA
5' ---   AATT --- 3 '
3 '--- TTAA   --- 5'
Sse232IСтрептомицес sp. RH232 5 'CGCCGGCG
3 'GCGGCCGC
5 '--- CG   CCGGCG --- 3 '
3 '--- GCGGCC   GC --- 5 '
Sse1825IСтрептомицес sp. 5 'GGGWCCC
3 'CCCWGGG
5 '--- GG   GWCCC --- 3 '
3 '--- CCCWG   GG --- 5 '
Sse8387IСтрептомицес sp. 8387 5 'CCTGCAGG
3 'GGACGTCC
5 '--- CCTGCA   GG --- 3 '
3 '--- GG   ACGTCC --- 5 '
Sse8647IСтрептомицес sp. 5 'AGGWCCT
3 'TCCWGGA
5 '--- AG   GWCCT --- 3 '
3 '--- TCCWG   GA --- 5 '
SseAIСтрептомицес sp. 5 'GGCGCC
3 'CCGCGG
5 '--- GG   CGCC --- 3 '
3 '--- CCGC   GG --- 5 '
SseBIСтрептомицес sp. 5 'AGGCCT
3 'TCCGGA
5 '--- AGG   КАЖ --- 3 '
3 '--- СТК   GGA --- 5 '
AatI, AspMI, Eco147I, GdiI, PceI, Pme55I, SarI, Sru30DI, SteI, StuI
SshAIСальмонелла шикмонах 5 'CCTNAGG
3 'GGANTCC
5 '--- CC   TNAGG --- 3 '
3 '--- GGANT   CC --- 5 '
AocI, BliHKI, BspR7I, CvnI, Lmu60I, OxaNI, SauI, SshAI
SsiIStaphylococcus sciuri RFL1 5 'CCGC
3 'GGCG
5 '--- С   CGC --- 3 '
3 '--- GGC   G --- 5 '
AciI
SsiAIСтафилококк sp. A 5 'GATC
3 'CTAG
5' ---   GATC --- 3 '
3 '--- CTAG   --- 5'
BscFI, BspAI, БстКТИ, CpfI, HacI, MkrAI, RalF40I, SauMI
SsiBIСтафилококк sp. B 5 'GATC
3 'CTAG
5' ---   GATC --- 3 '
3 '--- CTAG   --- 5'
BscFI, BspFI, БстКТИ, CpfI, HacI, MkrAI, RalF40I, SauMI
SslIStreptococcus salivarius thermophilus 5 'CCWGG
3 'GGWCC
5 '--- CC   WGG --- 3 '
3 '--- GGW   CC --- 5 '
ApaORI, BseBI, BshGI, BstNI, BstOI, Bst2UI, BthEI, EcoRII, MvaI
SsoIShigella sonnei 47 5 'GAATTC
3 'CTTAAG
5 '--- Г.   AATTC --- 3 '
3 '--- CTTAA   G --- 5 '
SsoIIShigella sonnei 47 5 'CCNGG
3 'GGNCC
5' ---   CCNGG --- 3 '
3 '--- GGNCC   --- 5'
SspIСферотилус sp. 5 'AATATT
3 'TTATAA
5 '--- AAT   ATT --- 3 '
3 '--- ТТА   TAA --- 5 '
Ssp1IСтрептомицес sp. RFL1 5 'TTCGAA
3 'AAGCTT
5 '--- ТТ   CGAA --- 3 '
3 '--- AAGC   TT --- 5 '
АсуII, BimI, Bsp119I, CbiI, MlaI, PlaII, SfuI, SspRFI, SviI
Ssp4800IСтрептомицес sp. BMTU 4800 5 'TGTACA
3 'ACATGT
5 '--- Т   GTACA --- 3 '
3 '--- ACATG   T --- 5 '
AauI, BsmRI, Bsp1407I,
BsrGI, BstAUI, SspBI
Ssp5230IСтрептомицес sp. 5230 5 'GACGTC
3 'CTGCAG
5 '--- GACGT   C --- 3 '
3 '--- С   TGCAG --- 5 '
AatII, ZraI
Ssp27144IСинехококк sp. 5 'ATCGAT
3 'TAGCTA
5 '--- AT   CGAT --- 3 '
3 '--- TAGC   TA --- 5 '
BanIII, BavCI, BbvAII, BscI, BspJI, BspOVII, BstNZ169I, ClaI, LcaI
SspAIСинехококк sp. 5 'CCWGG
3 'GGWCC
5' ---   CCWGG --- 3 '
3 '--- GGWCC   --- 5'
AeuI, AorI, Bse17I, BspNI, Bst2I, EcoRII, SniI, SslI, SspAI, ZanI
SspBIСтрептомицес sp. 5 'TGTACA
3 'ACATGT
5 '--- Т   GTACA --- 3 '
3 '--- ACATG   T --- 5 '
AauI, BsmRI, Bsp1407I,
BsrGI, BstAUI, Ssp4800I
SspCIСтрептомицес sp. 5 'GCCGGC
3 'CGGCCG
5 '--- GCC   GGC --- 3 '
3 '--- CGG   CCG --- 5 '
SspD5IСтафилококк sp. D5 5 'GGTGA
3 'CCACT
5 '--- GGTGAN7N   --- 3'
3 '--- CCACTN7N   --- 5'
AsuHPI, HphI
SspD5IIСтафилококк sp. D5 5 'ATGCAT
3 'TACGTA
5 '--- ATGCA   T --- 3 '
3 '--- Т   ACGTA --- 5 '
Csp68KIII, EcoT22I, Mph1103I, NsiI, PinBI, Ppu10I, SepI, Zsp2I
SspRFIСинехококк sp. РФ-1 5 'TTCGAA
3 'AAGCTT
5 '--- ТТ   CGAA --- 3 '
3 '--- AAGC   TT --- 5 '
АсуII, BimI, Bsp119I, CbiI, MlaI, PpaAI, SfuI, Ssp1I, SviI
SSRIStaphylococcus saprophyticus B6 5 'GTTAAC
3 'CAATTG
5 '--- GTT   AAC --- 3 '
3 '--- CAA   TTG --- 5 '
SstIStreptomyces stanford 5 'GAGCTC
3 'CTCGAG
5 '--- GAGCT   C --- 3 '
3 '--- С   TCGAG --- 5 '
SstIIStreptomyces stanford 5 'CCGCGG
3 'GGCGCC
5 '--- CCGC   GG --- 3 '
3 '--- GG   CGCC --- 5 '
Sst12IСтрептомицес sp. СТ-12 5 'CTGCAG
3 'GACGTC
5 '--- CTGCA   G --- 3 '
3 '--- Г.   ACGTC --- 5 '
Asp713I, BloHII, BspMAI, BsuBI, CfuII, Psp23I, PstI, SflI, Srl5DI
SteIStreptomyces tendae 5 'AGGCCT
3 'TCCGGA
5 '--- AGG   КАЖ --- 3 '
3 '--- СТК   GGA --- 5 '
AatI, AspMI, Eco147I, GdiI, PceI, Pme55I, SarI, Sru30DI, SseBI, StuI
SthIСалмонелла томпсоны YY356 5 'GGTACC
3 'CCATGG
5 '--- Г.   GTACC --- 3 '
3 '--- CCATG   G --- 5 '
Acc65I, AhaB8I, Asp718I, KpnI,
Sth117IStreptococcus thermophilus ST117 5 'CCWGG
3 'GGWCC
5 '--- CC   WGG --- 3 '
3 '--- GGW   CC --- 5 '
АпаORI, BseBI, BsiLI, BstNI, BstOI, Bst2UI, EcoRII, MvaI, SspAI
Sth132IStreptococcus thermophilus 5 'CCCG
3 'GGGC
5 '--- CCCGNNNN   NNNN --- 3 '
3 '--- GGGCNNNNNNNNN   --- 5'
Sth134IStreptococcus thermophilus 134 5 'CCGG
3 'GGCC
5 '--- С   CGG --- 3 '
3 '--- GGC   C --- 5 '
Sth368IStreptococcus thermophilus CNRZ368 5 'GATC
3 'CTAG
5' ---   GATC --- 3 '
3 '--- CTAG   --- 5'
BscFI, BspFI, БстКТИ, CpfI, HacI, MkrAI, RalF40I, SauMI
StrIStreptomyces thermodiastaticus 5 'CTCGAG
3 'GAGCTC
5 '--- С   TCGAG --- 3 '
3 '--- GAGCT   C --- 5 '
AbrI, BluI, BssHI, MavI, Sau3239I, Sfr274I, TliI, XhoI
StsIStreptococcus sanguis 54 5 'GGATG
3 'CCTAC
5 '--- GGATGN8NN   NNNN --- 3 '
3 '--- CCTACN8NNNNNN   --- 5'
StuI [8]Streptomyces tubercidicus 5 'AGGCCT
3 'TCCGGA
5 '--- AGG   КАЖ --- 3 '
3 '--- СТК   GGA --- 5 '
AatI, AspMI, Eco147I, GdiI, PceI, SarI, Sru30DI, SseBI, SteI
StyISalmonella typhi 5 'CCWWGG
3 'GGWWCC
5 '--- С   CWWGG --- 3 '
3 '--- GGWWC   C --- 5 '
StyD4ISalmonella typhi D4 5 'CCNGG
3 'GGNCC
5' ---   CCNGG --- 3 '
3 '--- GGNCC   --- 5'
СуаSulfolobus acidocaldarius 5 'GGCC
3 'CCGG
5 '--- GG   CC --- 3 '
3 '--- CC   GG --- 5 '
SuiISulfolobus islandicus REN2HI 5 'GCWGC
3 'CGWCG
5 '--- Г.   CWGC --- 3 '
3 '--- CGWC   G --- 5 '
AceI, ApeKI, Taq52I, TseI
SunISynechococcus uniformis 5 'CGTACG
3 'GCATGC
5 '--- С   GTACG --- 3 '
3 '--- GCATG   C --- 5 '
СурИSporosarcina ureae 2 5 'GGATCC
3 'CCTAGG
5 '--- Г.   GATCC --- 3 '
3 '--- CCTAG   G --- 5 '
AccEBI, AliI, ApaCI, AsiI, BamHI, Bce751I, OkrAI, RspLKII, SolI
SviIСтрептомиоздар виолохромогендер 5 'TTCGAA
3 'AAGCTT
5 '--- ТТ   CGAA --- 3 '
3 '--- AAGC   TT --- 5 '
АсуII, Bpu14I, Bsp119I, CbiI, MlaI, PpaAI, SfuI, Ssp1I
SwaIСтафилококк ескертушісі 5 'ATTTAAAT
3 'TAAATTTA
5 '--- ATTT   AAAT --- 3 '
3 '--- ТААА   TTTA --- 5 '

Ескертулер

  1. ^ Smith HO, Nathans D (желтоқсан 1973). «Хат: Бактериялардың иелерін модификациялау және рестрикциялау жүйелері мен олардың ферменттеріне арналған ұсынылған номенклатура». Дж.Мол. Биол. 81 (3): 419–23. дои:10.1016/0022-2836(73)90152-6. PMID  4588280.
  2. ^ Робертс Р.Ж., Белфорт М, Бестор Т, Багват А.С., Бикл ТА, Битинайт Дж, Блументал Р.М., Дегтярев С.К., Драйден Д.Т., Дибвиг К, Фирман К, Громова Э.С., Гумпорт Р.И., Халлфорд С.Е., Хаттман С, Хейтман Дж, Хорнби Д.П. , Janulaitis A, Jeltsch A, Josephsen J, Kiss A, Klaenhammer TR, Kobayashi I, Kong H, Krüger DH, S жетіспейтін, Marinus MG, Miyahara M, Morgan RD, Murray NE, Nagaraja V, Piekarowicz, Pingoud A, Raleigh E, Rao DN, Reich N, Repin VE, Selker EU, Shaw PC, Stein DC, Stoddard BL, Szybalski W, Trautner TA, Van Etten JL, Vitor JM, Wilson GG, Xu SY (сәуір, 2003). «Рестриктикалық ферменттер, ДНҚ метилтрансферазалар, гоминг эндонуклеазалар және олардың гендері үшін номенклатура». Нуклеин қышқылдары. 31 (7): 1805–12. дои:10.1093 / nar / gkg274. PMC  152790. PMID  12654995.
  3. ^ Джереми М.Б., Джон Л.Т., Люберт С (2002). «3. Ақуыздың құрылымы және қызметі». Биохимия. Сан-Франциско: В. Х. Фриман. ISBN  0-7167-4684-0.
  4. ^ Анфинсен С.Б. (1973). «Протеин тізбектерінің бүктелуін басқаратын принциптер». Ғылым. 181 (4096): 223–30. дои:10.1126 / ғылым.181.4096.223. PMID  4124164.
  5. ^ Kessler C, Manta V (тамыз 1990). «Шектеу эндонуклеазаларының және ДНҚ модификациясының метилтрансферазаларының ерекшеліктері (шолу 3)». Джин. 92 (1–2): 1–248. дои:10.1016 / 0378-1119 (90) 90486-B. PMID  2172084.
  6. ^ Pingoud A, Jeltsch A (қыркүйек 2001). «II типті рестрикциялық эндонуклеаздардың құрылымы және қызметі». Нуклеин қышқылдары. 29 (18): 3705–27. дои:10.1093 / нар / 29.18.3705. PMC  55916. PMID  11557805.
  7. ^ а б c г. Монти Кригер; Мэттью П Скотт; Мацудайра, Пол Т .; Лодиш, Харви Ф .; Дарнелл, Джеймс Э .; Лоуренс Зипурский; Кайзер, Крис; Арнольд Берк (2004). Молекулалық жасуша биологиясы (5-ші басылым). Нью-Йорк: W.H. Фриман және компания. ISBN  0-7167-4366-3.
  8. ^ Шимоцу Н, Такахаши Х, Сайто Н (қараша 1980). «StuI жаңа эндонуклеаза сайтына арналған Streptomyces tubercidicus". Джин. 11 (3–4): 219–25. дои:10.1016/0378-1119(80)90062-1. PMID  6260571.