Генографиялық жоба - Genographic Project

Компьютерлік графика бизнесімен шатастыруға болмайды Гениграфика.
Генографиялық жоба
Бөлігі серия қосулы
Генетикалық шежіре
Түсініктер
Байланысты тақырыптар

The Генографиялық жоба, 2005 жылы 13 сәуірде іске қосылды Ұлттық географиялық қоғам, болды генетикалық антропологиялық зерттеу (сатылым 2019 жылдың 31 мамырында тоқтатылды), ол тарихи көші-қон заңдылықтарын жинау және талдау арқылы картаға түсіруге бағытталған ДНҚ үлгілер.[1] Жобаның қазіргі кезеңі - Geno 2.0 Next Generation.[2] 2019 жылғы жағдай бойынша 140-тан астам елдегі миллионға жуық қатысушы жобаға қосылды.[3]

Жоба тарихы

Митохондриялық ДНҚ гаплогруппаларының филогениясы

Басталуы

Жоба директоры құрды және басқарды Спенсер Уэллс 2005 жылы Генографиялық жоба - бұл жеке қаржыландырылатын, коммерциялық емес серіктестік Ұлттық географиялық қоғам және Waitt Foundation. Дүниежүзінің он бір аймақтық орталығындағы далалық зерттеушілер алдымен ДНҚ үлгілерін жинай бастады жергілікті популяциялар. 2015 жылдың күзінен бастап Жобаны Мигель Вилар басқарды.

2012 жылдың күзінде Генографиялық жоба жаңа генотиптік массивтің аяқталғанын хабарлады генетикалық антропология, GenoChip деп аталады. GenoChip антропологиялық тестілеуге арналған және оның құрамына кіреді SNPs бастап аутосомды ДНҚ, Х-хромосома ДНҚ, У-хромосома ДНҚ және митохондриялық ДНҚ (mtDNA). Жаңа чиптің дизайны Wells of National Geographic арасындағы бірлескен күш болды, Eran Elhaik туралы Джон Хопкинс, Отбасылық ағаш ДНҚ, және Иллюмина.[4]

2015 жылдың күзінде жаңа чип Вилар, қазіргі Генографиялық жетекші ғалым және отбасылық ағаш ДНҚ-ның бірлескен күші ретінде жасалды.

2019 жылдың көктемінде Geno жобасы аяқталды деп жарияланды, бірақ нәтижелер 2020 жылға дейін сақталады. 2020 жылдың шілдесінде сайт зейнетке шықты.

Geno 2.0

Уэллс пен Эльхайк әзірлеген автозомдық қоспаның талдауы олардың тоғыз аймаққа қатысты геномдық тектік үлестерін бағалау арқылы классификациялайды: Шығыс Азия, Жерорта теңізі, Оңтүстік Африка, Оңтүстік-Батыс Азия, Океания, Оңтүстік-Шығыс Азия, Солтүстік Еуропа, Сахараның оңтүстігі және Африка Американдық.[5]

ХалықЖерорта теңізіСолтүстік ЕуропаОңтүстік-Батыс АзияСахарадан оңтүстік АфрикаОңтүстік АфрикаШығыс азиялықОңтүстік-Шығыс АзияАмериканың байырғы тұрғыныМұхиттықБарлығы
Алтай2172253498
Американдық45348399
Бермудия1520748374100
Британдықтар335017100
Болгар4731202100
Қытай7228100
Дат30531699
Доминикан2911147111495
Шығыс үнді224350299
Египет65181497
Фин175717798
Грузин6173199
Неміс36461799
Грек54281799
Иберия48371398
Иран42842597
жапон7525100
Хойсан475299
Кинх5743100
Кувейт574278298
Ливан66526299
Лухя289899
Малагасия2574152098
Мексикалық28208423698
Моңғол612679498
Солтүстік Кавказ461633499
Солтүстік үнді6534262798
Мұхиттық1288100
Папуан5491100
Тау Перу229599
Перуліктер1510326898
Пуэрто-Рико312192521199
Румын4336192100
Орыстар255118498
Сардин6724899
Оңтүстік үнді42583599
Тәжікстан2222441098
Татар2140211698
Тунис6261019299
Тоскана54281799
Вануату4157897
Батыс үнді96582699
Йорубалықтар973100

Geno 2.0 Келесі буын

Еуропадағы негізгі Y-ДНК гаплотоптарының пайызы

2016 жылы жоба озық үлгілерді қолдана бастады[2] Спираль Geno 2.0 Next Generation үшін ДНҚ тізбегі,[2][6] Генографиялық жобаның қазіргі кезеңі. Тоғыз аймақтық серіктестікті қолданған алдыңғы кезеңдермен салыстырғанда, Geno 2.0 Next Generation 18 немесе 22 аймақтық аффиляцияларды қолдана отырып, әлемдегі қазіргі заманғы байырғы халықтарды талдайды.[7] ДНҚ-жинау жиынтығын қолдана отырып, Helix қатысушыдан сілекей сынамасын алады, содан кейін ол бұрын-соңды болмаған геномдық идентификаторларға талданады[2] адамның генетикалық шығу тегі туралы түсінік.[2] Содан кейін деректер Genographic Project DNA дерекқорына жүктеледі.[2]

Еріктілердің қатысуы

Географиялық жоба

2005 жылдан 2019 жылға дейін генографиялық еріктілер тартылды (далалық жұмыстарда және ДНҚ үлгілерін ұсынуда) және азаматтық ғылым жобалар. Осы уақыт ішінде Ұлттық Географиялық Қоғам жобаға «азамат ғалымдар» ретінде қатысқысы келетін жалпы қоғам өкілдеріне коммерциялық емес өзін-өзі сынау жиынтықтарын сатты. Сияқты зерттеулерге қоғамның қатысуы үшін осындай түсіндіру жұмыстарын осындай ұйымдар көтермелеген Халықаралық генетикалық генеалогия қоғамы (ISOGG), ол ғылыми зерттеулерден пайда табуға ұмтылады.[8][9][10] Бұған қолдау, ұйымдастыру және тарату кіреді жеке ДНҚ (генетикалық) тестілеу.

ISOGG азаматтардың генетикалық зерттеулерге қатысуын қолдайды,[11] және мұндай еріктілер кәсіби ғылыми қоғамдастыққа құнды ақпарат пен зерттеулер ұсынды деп санайды.[12]

2013 жылы Оңтүстік Калифорния шежірелік қоғамында сөйлеген сөзінде, Уэллс оны ғалым ғалымдарды мадақтауды талқылады:

2005 жылдан бастап Генографиялық жоба адамзат тарихы туралы білімімізді кеңейту үшін ең жаңа генетикалық технологияны қолданды және зерттеушілікке қоғамды тарту және тарту үшін ДНҚ-тестілеудің алғашқы қолданылуы жаңа тұқымды құруға көмектесті »азамат ғалым. «Geno 2.0 қуаттылықты қолдана отырып, азаматтық ғылымның аясын кеңейтеді тобыр адамзат тарихының жаңа бөлшектерін табу.[13]

Сын

Сондай-ақ оқыңыз: Американың археологиясы және Жаңа әлемге қоныс аудару модельдері

2005 жылдың сәуірінде жоба жарияланғаннан кейін көп ұзамай Биоколониализм бойынша жергілікті халықтар кеңесі (IPCB), Невадада орналасқан, жобаны сынға алған мәлімдеме жариялады: сөз сөйлеушілер оның даулы мәселелермен байланысын атап өтті (мысалы, кейбір тайпалардың генетикалық адам көші-қон зерттеулерінің нәтижелері мынаны көрсетуі мүмкін деген алаңдаушылық сияқты) Таза американдықтар көтерген. Солтүстік Америкаға байырғы емес) Адам геномының әртүрлілігі жобасы, жеке қаржыландырылатын Генографиялық жобадан айырмашылығы, үкіметтің шолуы болды. IPCB қатысушы жергілікті халыққа қарсы ұсыныс жасады.[14] Сондай-ақ, байырғы тұрғындарға IBM-ге бойкот жариялау ұсынылды, Gateway Computers, және сол уақытта Генографиялық жобамен ынтымақтастықта болған National Geographic.

2006 жылы мамырда кейбір жергілікті өкілдер барды Біріккен Ұлттар Ұйымының жергілікті мәселелер жөніндегі тұрақты форумы (UNPFII) генетикалық тестілеуге қатысуға конкурс өткізу. Ресми өкіл:

«Генографиялық жоба эксплуатациялық және этикаға сәйкес келмейді, өйткені ол байырғы халықтарды ғылыми қызығушылықтың субъектілері ретінде пайдаланады, олар байырғы халықтарға пайда әкелмейді, бірақ оларды елеулі тәуекелге ұшыратады. Зерттеушілер қан немесе басқа дене тіндерінің сынамаларын өз мақсаттары үшін пайдаланады адамзат тарихының өзіндік алыпсатарлық теорияларын алға жылжыту ».[1]

UNPFII Генографиялық жобаның мақсаттары бойынша зерттеулер жүргізіп, жоба «жобаланғандықтан және тиісті кеңес берусіз немесе оның субъектілері үшін қауіптерді ескермей басталғандықтан, байырғы халықтармен» деген қорытындыға келді, Жауапты генетика жөніндегі кеңес: Жергілікті халық өкілдері дұрыс және Жоба тоқтатыла тұруы керек ».[1]

2006 жылдың мамырында ЮНФФИ National Geographic пен басқа демеушілерге жобаны тоқтата тұруға кеңес берді.[15][16] Зерттеулерден алынған білім байырғы халықтардың ежелден қалыптасқан наным-сенімдерімен қақтығысып, олардың мәдениеттеріне қауіп төндіруі мүмкін деген алаңдаушылық туғызды. Сондай-ақ, жер құқығы мен басқа ресурстарға қатысты жергілікті талаптарға қауіп төнуі мүмкін деген алаңдаушылық болды.

2006 жылғы желтоқсандағы жағдай бойынша, кейбір федералды мойындалған тайпалар АҚШ-та зерттеуге қатысудан бас тартты. «Ғалымдардың дәлелдеуге тырысатыны - біздің сол сияқты екендігіміз Қажылар қоспағанда біз келдік бірнеше мың жыл бұрын », - деді Морис Фокс, Массачусетс комиссиясының Үндістан істері жөніндегі төрағасы және мүшесі Машпи Wampanoag. «Неге біз бұны ашық түрде беруіміз керек?»[15] Барлық адамдар оның ұстанымымен келісе бермейді; 2012 жылғы желтоқсандағы жағдай бойынша, Америка, Африка, Азия, Еуропа және Океаниядан 70000-нан астам жергілікті қатысушылар жобаға қосылды.[7]

Сондай-ақ қараңыз

Әдебиеттер тізімі

  1. ^ а б в «Мұрағатталған көшірме». Архивтелген түпнұсқа 16 мамыр 2008 ж. Алынған 16 мамыр 2015.CS1 maint: тақырып ретінде мұрағатталған көшірме (сілтеме)
  2. ^ а б в г. e f Geno 2.0 Келесі буын ұлттық географиялық. 28 маусым 2018. Алынған 28 маусым 2018 жыл.
  3. ^ Еріктілердің географиялық қатысушылары ұлттық географиялық. 8 қаңтар 2018 ж., 28.06.2018 шығарылды.
  4. ^ GenoChip: Генетикалық антропологияның жаңа құралы Оксфорд журналдары. 9 мамыр 2013. Алынған 28.06.2018 ж.
  5. ^ Мен кіммін: Аймақтарға шолу
  6. ^ Helix ДНҚ тізбегі және Geno 2.0 Спираль. 26 қаңтар 2018 ж., 28.06.2018 шығарылды.
  7. ^ а б Келесі ұрпақтың анықтамалық популяциясы ұлттық географиялық. 23 ақпан 2018. Тексерілді 28.06.2018 ж.
  8. ^ Bonney, R. және LaBranche, M. (2004). «Азаматтық ғылым: көпшілікті ғылыми зерттеулерге тарту» ASTC өлшемдері, Мамыр / маусым, 2004 ж. 13.
  9. ^ Баретто, С., Фастовский, Д. және Шихан, П. (2003). «Қоғамды ғылыми зерттеулерге қосудың моделі» Геология ғылымдарының журналы, 50 (1). 71-75 бет.
  10. ^ Маккаффри, Р.Е. (2005). «Азаматтық ғылымды қалалық құстарды зерттеуде қолдану» Қалалық мекендеу орындары, 3 (1). 70–86 бет.
  11. ^ Король, Тури Е .; Джоблинг, Марк А. (2009). «Атау дегеніміз не? Y хромосомалары, тегі және генетикалық генеалогиялық революция». Генетика тенденциялары. 25 (8): 351–60. дои:10.1016 / j.tig.2009.06.003. hdl:2381/8106. PMID  19665817. Халықаралық генетикалық генеалогия қоғамы (www.isogg.org) генетиканы генеалогиялық зерттеу құралы ретінде қолдануды қолдайды және генетикалық генеалогтардың қолдау желісін ұсынады. Мұнда үнемі жаңарып отыратын қасиеті бар ISOGG Y-haplogroup ағашы орналасқан.
  12. ^ Мендекс және т.б., Фернандо (28 ақпан 2013). «Африкандық американдық әулет тегі адамға өте ежелгі тамыр қосады Y хромосома филогенетикалық ағаш». Американдық генетика қоғамы. 454–459 бет. Алынған 10 шілде 2013.
  13. ^ Уэллс, Спенсер (2013). «Генографиялық жоба және азаматтар туралы ғылымның өсуі». Оңтүстік Калифорния шежірелік қоғамы (SCGS). Архивтелген түпнұсқа 2013 жылғы 10 шілдеде. Алынған 10 шілде, 2013.
  14. ^ Гарри, Дебра және Лея Малия Канехе. «Генетикалық зерттеулер: мәдениетті сақтау үшін қан жинау?» Мәдени тіршілік, 29.4 (2005 жылғы қыс). 4 ақпан 2014 қол жеткізді.
  15. ^ а б Гармон, Эми (10 желтоқсан 2006). «ДНҚ-ны жинайтындар снагті ұрады: тайпалар оларға сенбейді». The New York Times.
  16. ^ «Біріккен Ұлттар Ұйымы Генографиялық жобаға үзіліс жасауды ұсынады». ipcb.

Сыртқы сілтемелер

Ресми сайттар

Жаңалықтар

Бейнелер