Элефтерия терралары - Eleftheria terrae

Элефтерия терралары
Ғылыми классификация
Домен:
Филум:
Сынып:
Тұқым:
Элефтерия
Түрлер:
E. terrae
Биномдық атау
Элефтерия терралары
Линг және басқалар, 2015

Элефтерия терралары жақында табылған Грамоң бактерия.[1] E. terrae организмнің уақытша атауы, өйткені ол тек 2014 жылы ашылған және әлі күнге дейін ғылыми зерттеулерден өтуде. Бұрын белгісіз болатыны анықталды антибиотик аталған тейксобактин. Ашылуы E. terrae антибиотиктердің жаңа дәуірін көрсетуі мүмкін, өйткені теиксобактин - 1980 жылдардың синтетикалық дәуірінен бері табылған алғашқы жаңа антибиотик.[2] Алдын-ала жүргізілген зерттеулер басқа егілмейтін бактериялар ұнайтындығын көрсетті E. terrae жаңа микробқа қарсы агенттерді жасауда әлеуеті бар.[1]

Ашу

2015 жылғы жағдай бойынша бактериялардың 99% -ы мәдениеттенбеген және жетілдірілген құралдарды қажет етеді iChip, оқшаулану.[3] E. terrae осындай бірі бактерия пайда болған ғылыми әдістермен өсірілген ғалымдар «микробтық қара материя» деген сүйіспеншілікпен атады.[1] Л.Линг бастаған Новобиотикалық фармацевтика тобы ашты Элефтерия терралары 2014 жылдың күзінде бір салада Мэн бойынша әзірленген техниканы қолдана отырып Солтүстік-шығыс университеті iChip немесе оқшаулау чипі деп аталады.[4] IChip - бұл 192 саңылауларды қамтитын шағын пластикалық блок.[3] Саңылаулар қоректік ортамен толтырылады, содан кейін әр тесікке тек бір бактерия жинау үшін сұйылтылған топырақпен егіледі.[3] Бактерияны саңылауларға салғаннан кейін iChip екі жағынан а жартылай өткізгіш мембрана және түпнұсқа топырақтың қорабына салыңыз.[3] The өткізгіш мембраналар қоректік заттар мен өсу факторларының топырақтан таралуына мүмкіндік береді және тек біреуінің өсуіне мүмкіндік береді түрлері.[3] Линг және т.б. микробқа қарсы белсенділікке арналған iChip өсуінің шамамен 10,000 изоляттарын скринингтен өткізді және E. terrae үміт артқандай болды.[1] Бұл технологияның одан да көп нәрсені ашуға мүмкіндігі бар антибиотиктер зертханалардың бұрын «өсіруге болмайтын» өсуіне мүмкіндік беру микроорганизмдер.[5]

Жалпы сипаттамалар

E. terrae ан түзетін грамтеріс бактерия антибиотик тейксобактин. E. terrae әр түрлі өсу жағдайында бактерияға қарсы белсенділікті өсіреді және өндіреді, бірақ оңтайлы түрде R4 ашыту сорпасында. R4 ашыту сорпасы 10 г-нан тұрады глюкоза, 1г ашытқы сығындысы, 0,1г казамин қышқылдары, 3г пролин, 10г MgCl2· 6H2O, 4г CaCl2· 2H2O, 0,2г Қ2СО4, 5,6 г TES бос қышқылы литріне ионсыздандырылған H2O рН 7-де.[1] E. terrae'с метаболизм және экология әлі кең көлемде құжатталмаған.

Филогения

E. terrae бета-протеобактериялар класына жатады.[1] Секвенирленгеннен кейін организмнің геном деген қорытынды жасалды E. terrae бұрын белгісіз болған мүше болып табылады түр генетикалық құрамға жақын Аквактериялар оның негізінде 16S rRNA гендерінің секвенциясы және ДНҚ-ДНҚ будандастыру компьютерлік талдау арқылы жүзеге асырылады.[1] Тұқымдас ағзалар Аквабактериялар дейін антибиотиктер шығаратыны белгілі болған емес E. terraeОның ашылуы.[1]

Геномика

Линг және оның командасы тізбекті геном туралы E. terrae және TUCF Genomics компаниясының ішкі құбырын пайдаланып, оның ұзындығы 6,6 Мб / м деп бағалады.[1] Жоба геномын құрастырғаннан кейін, олар тығыз байланысты тізбектер үшін тексерілді адениляция домендері.[1] Контиг Teixobactin биосинтетикалық жолдарының коды табылған қолмен өңделіп, ретімен орналастырылды.[1] Бұл бөлек құрастырылған басқа конигтерді біріктіруге мүмкіндік берді.[1] Геномда қалған барлық кемшіліктер ПТР және Sanger тізбегі.[1] Саңылаулар күшейту кезінде қолданылған бірдей праймердің көмегімен жабылды.[1]

Антибиотиктер өндірісі

E. terrae'Тейксобактин өндірісі маңызды болып табылады, өйткені соңғы зерттеулер тестексобактиннің әдеттегідей қолданылатын антибиотиктерге қарағанда басқаша байланысатындығын анықтады, бұл шабуылға ұшыраған бактериялардың қарсылықты дамуын қиындатады.[1] Линг және басқалар жүргізген тәжірибелер. Teixobactin липидті прекурсорлармен байланысуға қабілетті екенін көрсетті пептидогликан бактериялық жасуша қабырғаларының бір бөлігін құрайды.[1] Нәтижелер зерттелген организмдерде, оның ішінде теиксобактинге ешқандай төзімділік көрсеткен жоқ Алтын стафилококк және Туберкулез микобактериясы.[1] Бұл зерттеулер теиксобактиннің мақсатты бөлігі ақуыз емес екенін көрсетеді, бұл теиксобактинге бактериялық төзімділіктің дамуы әлдеқайда аз деген сенімге әкеледі.[1] Бұл эксперименттер теиксбактиннің ұқсас әсер ету механизмін ұстанатындығын көрсетті антибиотик ванкомицин байланыстыратын липид II пептидогликан прекурсорларындағы молекула, бірақ ванкомициннен айырмашылығы, тейксобактин ванкомицинге төзімді бактериялардан табылған өзгертілген липидті II молекулаларымен байланысуға қабілетті.[1] Тейксобактиннің пептидогликанды тежеуі синтез одан әрі Лингтің ундекапренил-N-ацетилмурамикалық қышқыл-пентапептидтің жинақталуын анықтауы, бұл маңызды қадам биосинтез пептидогликанның[1] Лингтің сынақтарына сәйкес, тейксобактин пептидогликан синтезін I липид I, II липид және ундекапренил пирофосфаты.[1] Тейксобактин бұғаттаудан гөрі пептидогликан прекурсорларымен ерекше байланысқан сияқты фермент белсенділік.[1]

Әдебиеттер тізімі

  1. ^ а б c г. e f ж сағ мен j к л м n o б q р с т сен v Ling LL, Schneider T, People AJ, Spoering AL, Engels I, Conlon BP, Mueller A, Schäberle TF, Hughes DE, Epstein S, Jones M, Lazarides L, Steadman VA, Cohen DR, Felix CR, Fetterman KA, Millett WP. , Nitti AG, Zullo AM, Chen C, Lewis K (7 қаңтар 2015). «Жаңа антибиотик патогендерді анықталатын қарсылықсыз жояды». Табиғат. 517 (7535): 455–459. дои:10.1038 / табиғат14098. PMC  7414797. PMID  25561178.
  2. ^ Райт, Жерар (7 қаңтар 2015). «Антибиотиктер: таптырмас жаңадан келген адам». Табиғат. 517 (7535): 442–444. дои:10.1038 / табиғат 14193. PMID  25561172.
  3. ^ а б c г. e Николс, Д .; Кахун, Н .; Трахтенберг, Э.М .; Фам, Л .; Мехта, А .; Белангер, А .; Каниган, Т .; Льюис, К .; Эпштейн, S. S. (19 ақпан 2010). «Микробтардың өсіруге жарамсыз түрлерін» өсіру үшін жердегі өнімділігі жоғары Ичипті қолдану «. Қолданбалы және қоршаған орта микробиологиясы. 76 (8): 2445–2450. дои:10.1128 / AEM.01754-09. PMC  2849220. PMID  20173072.
  4. ^ Сервик, Келли (7 қаңтар 2015). «Шөпті алқапта кездесетін микробтың құрамында күшті антибиотик бар». Ғылым. дои:10.1126 / science.aaa6305.
  5. ^ Ледфорд, Хайди (7 қаңтар 2015). «Микробтық қара заттардан табылған перспективалы антибиотик'". Табиғат. дои:10.1038 / табиғат.2015.16675.