COX4I2 - COX4I2

COX4I2
Идентификаторлар
Бүркеншік аттарCOX4I2, COX4, COX4-2, COX4B, COX4L2, COXIV-2, dJ857M17.2, цитохром с оксидаза 4I2 суббірлігі
Сыртқы жеке куәліктерOMIM: 607976 MGI: 2135755 HomoloGene: 13082 Ген-карталар: COX4I2
Геннің орналасуы (адам)
20-хромосома (адам)
Хр.20-хромосома (адам)[1]
20-хромосома (адам)
COX4I2 үшін геномдық орналасу
COX4I2 үшін геномдық орналасу
Топ20q11.21Бастау31,637,912 bp[1]
Соңы31,645,006 bp[1]
РНҚ экспрессиясы өрнек
PBB GE COX4I2 gnf1h00848 at fs.png
Қосымша сілтеме өрнегі туралы деректер
Ортологтар
ТүрлерАдамТышқан
Энтрез

84701

84682

Ансамбль

ENSG00000131055

ENSMUSG00000009876

UniProt

Q96KJ9

Q91W29

RefSeq (mRNA)

NM_032609

NM_053091

RefSeq (ақуыз)

NP_115998

NP_444321

Орналасқан жері (UCSC)Хр 20: 31.64 - 31.65 MbChr 2: 152.75 - 152.77 Mb
PubMed іздеу[3][4]
Уикидеректер
Адамды қарау / өңдеуТінтуірді қарау / өңдеу

Цитохром с оксидаза суббірлігі 4 изоформ 2, митохондрия болып табылады фермент адамдарда кодталған COX4I2 ген.[5][6] COX4I2 - бұл а ядролық - кодталған изоформасы туралы цитохром с оксидаза (COX) суббірлік 4. цитохром с оксидаза (кешен IV ) трансферді біріктіретін көп суббірлік ферменттер кешені электрондар бастап цитохром с молекулалық оттегі және үлес қосады протон электрохимиялық градиент арқылы ішкі митохондриялық мембрана, терминалдың ферменті ретінде әрекет етеді митохондриялық тыныс алу тізбегі. Мутациялар COX4I2 байланысты болды экзокриндік панкреатиялық жеткіліксіздік, дизеритропоэтикалық анемия, және кальваральды гиперостоз (EPIDACH).[7][8]

Құрылым

COX4I2 орналасқан q қол туралы 20-хромосома 11.21 позициясында және 6 бар экзондар.[7] The COX4I2 ген 20 кДа түзеді ақуыз 171 аминқышқылдары.[9][10] Кодталған ақуыз COX4I2 цитохром с оксидаза IV тұқымдасына жатады. COX4I2 бар транзиттік пептид домен және а дисульфидті байланыс аминқышқылының модификациясы.[11][12] A Желім 138 қалдық, бұл Glu136 қалдықына сәйкес келеді COX4I1, деп есептеледі өте сақталған және митохондриялық COX реакциясы үшін құрылымдық маңызды гипоксия.[8]

Функция

Цитохром с оксидаза (COX), терминал ферменті митохондриялық тыныс алу тізбегі, төмендетілгеннен электронды беруді катализдейді цитохром с дейін оттегі. Бұл гетеромерлі 3-тен тұратын кешен каталитикалық кодталған суббірліктер митохондриялық гендер және кодталған бірнеше құрылымдық бөлімшелер ядролық гендер. Митохондриялық кодталған суббірліктер электронды тасымалдау және кешенді реттеу мен құрастыруға ядролық кодталған суббірліктер қатысуы мүмкін. The COX4I2 ядролық ген IV суббірліктің 2 изоформасын кодтайды. IV бөлімнің Isoform 1 басқа генмен кодталған, дегенмен, екі ген ұқсас құрылымдық ұйымды көрсетеді. IV суббірлік - бұл COX-ті реттеуде шешуші рөл атқаратын ең үлкен ядролық кодталған суббірлік. Ол орналасқан ішкі митохондриялық мембрана үстінде матрица жағы. Өрнегі COX4I2 ең жоғары плацента және өкпе.[7][11][12] Сонымен қатар COX4I2, бірге COX4I1, оттегінің төмендеуімен, оттегінің деңгейімен реттелуі мүмкін COX4I2 өрнек және COX4I1 деградациясы. Бұл COX4I2-ді оңтайландырудағы рөлді ұсынады электрондар тізбегі әр түрлі жағдайда.[13]

Клиникалық маңыздылығы

Мутациялар COX4I2 байланысты болды экзокриндік панкреатиялық жеткіліксіздік, дизеритропоитикалық анемия, және кальваральды гиперостоз (EPIDACH). Бұл аурудың сипаттамаларына ұйқы безінің жеткіліксіздігі, ішек жатады мальабсорбция, өркендей алмау, және анемия көп ұзамай туылғаннан кейін. Қосымша белгілер қосылды стеаторея, спленомегалия және гепатомегалия, ұйқы безі атрофия, жалпыланған бұлшықет гипотония, гиперостоз, сарғыш склера жеңіл жанама гипербилирубинемиямен байланысты, бұзылған коагуляция функциялар, жоғары LDH, аланин, және билирубин, және азайтылған Е дәрумені деңгейлер. A гомозиготалы мутация, E138K, азайтылғаны анықталды COX4I2 өрнек (25% дюйм) фибробласттар ) және құнсызданған жауап гипоксия. Функционалды COX4I2 қалыпты деңгейден 40% төмен өрнек болады деп болжануда жылдамдықты шектеу, E138K мутациясы а деп саналатын кезде пайда болады өте сақталған IV бөлімшенің қалдықтары.[11][12][8]

Өзара әрекеттесу

COX4I2 көрсетілген өзара әрекеттесу бірге Цитохром с (CYCS ).[14][15][16][17] Сонымен қатар, APP, COA3 және KRAS COX4I2-мен протеин-ақуыздың өзара әрекеттесуі анықталды.[18]

Әдебиеттер тізімі

  1. ^ а б c GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000131055 - Ансамбль, Мамыр 2017
  2. ^ а б c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000009876 - Ансамбль, Мамыр 2017
  3. ^ «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
  4. ^ «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
  5. ^ Хюттеманн М, Каденбах Б, Гроссман Л.И. (сәуір 2001). «Сүтқоректілердің IV суббірлігі цитохром с оксидазасының изоформалары». Джин. 267 (1): 111–23. дои:10.1016 / S0378-1119 (01) 00385-7. PMID  11311561.
  6. ^ Хюттеманн М, Ли I, Лю Дж, Гроссман Л.И (қараша 2007). «IV-2 сүтқоректілердің цитохромды с оксидазасының суббірлігі транскрипциясы жаңа консервіленген оттегіге жауап беретін элементпен бақыланады». FEBS журналы. 274 (21): 5737–48. дои:10.1111 / j.1742-4658.2007.06093.x. PMID  17937768. S2CID  46455551.
  7. ^ а б c «Entrez Gene: COX4I2 цитохромды с оксидаза суббірлігі IV изоформасы 2 (өкпе)». Бұл мақалада осы қайнар көздегі мәтін енгізілген қоғамдық домен.
  8. ^ а б c Штейер Е, Саада А, Шааг А, Аль-Хиджави Ф.А., Кидесс Р, Ревель-Вилк С, Элпелег О (наурыз 2009). «Ұйқы безінің экзокриндік жеткіліксіздігі, дизеритропеялы анемия және кальвариальды гиперостоз COX4I2 генінің мутациясынан туындайды». Американдық генетика журналы. 84 (3): 412–7. дои:10.1016 / j.ajhg.2009.02.006. PMC  2668012. PMID  19268275.
  9. ^ Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, Deng N, Kim AK, Choi JH, Zelaya I, Liem D, Meyer D, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss J , Дуан Х, Ухлен М, Йейтс JR, Апвейлер R, Ге Дж, Гермякоб Н, Пинг П (қазан 2013). «Жүрек протеомдарының биологиясы мен медицинасын мамандандырылған білім қорымен интеграциялау». Айналымды зерттеу. 113 (9): 1043–53. дои:10.1161 / CIRCRESAHA.113.301151. PMC  4076475. PMID  23965338.
  10. ^ Яо, Даниэль. «Атлас жүрек протеиндері туралы білім қоры (COPaKB) - ақуыздар туралы ақпарат». amino.heartproteome.org. Архивтелген түпнұсқа 2018-08-07. Алынған 2018-08-06.
  11. ^ а б c «COX4I2 - цитохром с оксидаза суббірлігі 4 изоформ 2, митохондриялық прекурсор - Homo sapiens (Адам) - COX4I2 гені және ақуыз». www.uniprot.org. Алынған 2018-08-06. Бұл мақалада қол жетімді мәтін бар CC BY 4.0 лицензия.
  12. ^ а б c «UniProt: ақуыздың әмбебап базасы». Нуклеин қышқылдарын зерттеу. 45 (D1): D158 – D169. 2017 жылғы қаңтар. дои:10.1093 / nar / gkw1099. PMC  5210571. PMID  27899622.
  13. ^ Fukuda R, Zhang H, Kim JW, Shimoda L, Dang CV, Semenza GL (сәуір 2007). «HIF-1 гипоксиялық жасушаларда тыныс алу тиімділігін оңтайландыру үшін цитохромоксидазаның суббірліктерін реттейді». Ұяшық. 129 (1): 111–22. дои:10.1016 / j.cell.2007.01.047. PMID  17418790. S2CID  2331820.
  14. ^ Michel B, Bosshard HR (тамыз 1984). «Цитохром с және цитохром с оксидаза арасындағы өзара әрекеттесудің спектроскопиялық анализі». Биологиялық химия журналы. 259 (16): 10085–91. PMID  6088481.
  15. ^ Wiedemann FR, Vielhaber S, Schröder R, Elger CE, Kunz WS (наурыз 2000). «Адамның қаңқа бұлшық еттерінің үлгілеріндегі митохондриялық тыныс алу тізбегі ферменттерінің белсенділігін анықтау әдістерін бағалау». Аналитикалық биохимия. 279 (1): 55–60. дои:10.1006 / abio.1999.4434. PMID  10683230.
  16. ^ Sampson V, Alleyne T (желтоқсан 2001). «Цитохром с / цитохром с оксидазаның өзара әрекеттесуі. Ферменттер айналымы кезіндегі конформациялық өзгерістерге тікелей құрылымдық дәлелдемелер». Еуропалық биохимия журналы. 268 (24): 6534–44. дои:10.1046 / j.0014-2956.2001.02608.x. PMID  11737208.
  17. ^ Lynch SR, Sherman D, Copeland RA (қаңтар 1992). «Цитохромды с байланыстыру цитохром с оксидазасындағы а цитохромының конформациясына әсер етеді». Биологиялық химия журналы. 267 (1): 298–302. PMID  1309738.
  18. ^ Зертхана, Майк Тайерс. «COX4I2 нәтижелерінің қысқаша мазмұны | BioGRID». thebiogrid.org. Алынған 2018-08-06.

Сыртқы сілтемелер

Әрі қарай оқу

  • Гарбер Э.А., Марголиаш Е (1990 ж. Ақпан). «Цитохромның цитохром с оксидазамен өзара әрекеттесуі: жоғары аффиниттіліктің жоғарыдан аффинизмге ауысуын түсіну». Biochimica et Biofhysica Acta (BBA) - Биоэнергетика. 1015 (2): 279–87. дои:10.1016 / 0005-2728 (90) 90032-Y. PMID  2153405.
  • Bolli R, Nalecz KA, Azzi A (қаңтар 1985). «Ірі қара мимерлі және димерлі цитохром с оксидазасы арасындағы өзара конверсия». Биохимия. 67 (1): 119–28. дои:10.1016 / S0300-9084 (85) 80237-6. PMID  2986725.
  • Michel B, Bosshard HR (тамыз 1984). «Цитохром с және цитохром с оксидаза арасындағы өзара әрекеттесудің спектроскопиялық анализі». Биологиялық химия журналы. 259 (16): 10085–91. PMID  6088481.
  • Харе Дж.Ф., Чинг Э, Атарди Г (мамыр 1980). «Адамның цитохром с оксидазасының оқшаулануы, суббірлік құрамы және синтез орны». Биохимия. 19 (10): 2023–30. дои:10.1021 / bi00551a003. PMID  6246917.
  • Papadopoulou LC, Tsiftsoglou AS (қыркүйек 1996). «Геминнің апоптозға әсері, цитохром с оксидаза генінің экспрессиясын басу және доксорубицинмен (адриамицин) индукцияланған сүйек-кемік уыттылығына». Биохимиялық фармакология. 52 (5): 713–22. дои:10.1016/0006-2952(96)00349-8. PMID  8765469.
  • Визирианакис IS, Паппас IS, Tsiftoglou AS (наурыз 2002). «Мурин эритролейкемиясы (MEL) жасушаларында c-myc, B22, COX II және COX IV гендерінің дифференциацияға тәуелді репрессиясы». Биохимиялық фармакология. 63 (5): 1009–17. дои:10.1016 / S0006-2952 (01) 00937-6. PMID  11911854.

Бұл мақалада Америка Құрама Штаттарының Ұлттық медицина кітапханасы, ол қоғамдық домен.