BOP1 - BOP1

Қол жетімді ақуыз құрылымдары:
Pfam	құрылымдар / ЭКОД
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	құрылымның қысқаша мазмұны

BOP1NT
Идентификаторлар
Таңба	BOP1NT
Pfam	PF08145
InterPro	IPR012953
Қол жетімді ақуыз құрылымдары:
Pfam	құрылымдар / ЭКОД
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	құрылымның қысқаша мазмұны

BOP1
Идентификаторлар
Бүркеншік аттар	BOP1, пролиферация блогы 1, BOP1 рибосомалық биогенез факторы
Сыртқы жеке куәліктер	OMIM: 610596 MGI: 1334460 HomoloGene: 6612 Ген-карталар: BOP1
Геннің орналасуы (адам)
Хр.	8-хромосома (адам)
Соңы	144,291,438 bp
Геннің орналасуы (тышқан)
Хр.	15-хромосома (тышқан)
Соңы	76,477,277 bp
РНҚ экспрессиясы өрнек
	; ;
	Қосымша сілтеме өрнегі туралы деректер
Гендік онтология
Молекулалық функция	• рибонуклеопротеидті кешенді байланыстыру; • GO: 0001948 ақуыздармен байланысуы; • РНҚ байланысы;
Ұялы компонент	• ядро; • жасуша ядросы; • PeBoW кешені; • нуклеоплазма; • прерибосома, үлкен суббірліктің ізашары; • рибонуклеопротеин;
Биологиялық процесс	• рибосомалық үлкен суббірлік биогенезі; • тритристронды рРНҚ транскриптінің 5.8S rRNA мен LSU-rRNA арасындағы ITS2-де бөлінуі (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA); • жасушалық пролиферация; • рибосома биогенезі; • жасуша циклін реттеу; • рРНҚ өңдеу; • трикистронды рРНҚ транскрипциясынан LSU-рРНҚ-ның жетілуі (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA); • рибосомалық үлкен суббірлік жиынтығы; • p53 класс медиаторының сигнал беруін реттеу; • трикистронды рРНҚ транскрипциясынан 5.8S рРНҚ-ның жетілуі (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA);
	Дереккөздер:Амиго / QuickGO
Ортологтар
	23246
	12181
	ENSG00000261236; ENSG00000285301
	ENSMUSG00000022557
	Q14137
	P97452
	NM_015201
	NM_013481
	NP_056016
	NP_038509
	Уикидеректер
Адамды қарау / өңдеу	Тінтуірді қарау / өңдеу

BOP1 рибосома биогенезі ақуызы Бұл ақуыз адамдарда кодталған BOP1 ген.^[5]^[6]

Функция

Бұл WD40 қайталау -қамту ядролы рРНҚ-ны өңдеуге қатысатын ақуыз, осылайша оларды басқарады ұяшық цикл.^[7] Ол 25S және 5.8S жетілуіне қажет рибосомалық РНҚ. Бұл маңызды фактор бола алады рибосома рРНҚ-ға дейінгі спейсер аймақтарын өңдеуді үйлестіретін түзіліс. Pes1-Bop1 күрделі бірнеше компоненттерден тұрады: BOP1, GRWD1, PES1, ORC6L, және RPL3 және рибосомаға қатысады биогенез және өзгертілген хромосомалардың бөлінуі. BOP1 шамадан тыс экспрессиясы пайыздық үлесін арттырады көпполярлы шпиндельдер жылы адамның жасушалары. BOP1 жолының реттелмеуі колоректальды тумоуригенезге ықпал етуі мүмкін адамдар.^[8] Bop1 деңгейінің жоғарылауы Bop1 / WDR12 және Bop1 / Pes1 субкомплекстерін тудырады және PeBoW кешенінің жиынтығы мен тұтастығы Bop1 ақуыз деңгейінің өзгеруіне өте сезімтал.^[9]

Nop7p-Erb1p -Ytm1p, ашытқының құрамында болуы мүмкін гомологиялық Pes1-Bop1-WDR12 кешені, өйткені ол рибосома биогенезін бақылауға қатысады S фазасы кіру. PeBoW кешенінің тұтастығы рибосома биогенезі мен жасушалардың көбеюі үшін қажет сүтқоректілер жасушалар.^[10] Giardia-да түрлері нақты цитоскелет ақуыз, бета-гиардин, өзара әрекеттеседі Bop1 көмегімен.^[7]

Құрылым

BOP1 құрамында консервіленген болады N-терминал домен, BOP1NT.

Әдебиеттер тізімі

^ ^а ^б ^c ENSG00000285301 GRCh38: Ensembl шығарылымы 89: ENSG00000261236, ENSG00000285301 - Ансамбль, Мамыр 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000022557 - Ансамбль, Мамыр 2017
^ «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
^ «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
^ Nagase T, Seki N, Tanaka A, Ishikawa K, Nomura N (наурыз 1996). «Адамның анықталмаған гендерінің кодтау ретін болжау. IV. КГ-1 адамның жасуша сызығынан кДНК клондарының анализі арқылы шығарылған 40 жаңа геннің (KIAA0121-KIAA0160) кодтық тізбектері». DNA Res. 2 (4): 167–74, 199–210. дои:10.1093 / dnares / 2.4.167. PMID 8590280.
^ «Entrez Gene: BOP1 таралу блогы 1».
^ ^а ^б Ким Дж, Гу СЖ, Чун Хдж, Янг ХВ, Ён Т.С., Ли ХХ, Парк СЖ (қаңтар 2006). «Бета-лямдиннің Giardia lamblia-дағы Bop1 ақуызымен өзара әрекеттесуі». Паразитол. Res. 98 (2): 138–44. дои:10.1007 / s00436-005-0040-8. PMID 16362343. S2CID 24519868.
^ Killian A, Sarafan-Vasseur N, Sesboüé R, Le Pessot F, Blanchard F, Lamy A, Laurent M, Flaman JM, Frébourg T (қыркүйек 2006). «8q24-те орналасқан BOP1 генінің колоректальды ісік тубергенезіне қосқан үлесі». Хромосомалар гендерінің қатерлі ісігі. 45 (9): 874–81. дои:10.1002 / gcc.20351. PMID 16804918. S2CID 38299400.
^ Rohrmoser M, Hölzel M, Grimm T, Malamoussi A, Harasim T, Orban M, Pfisterer I, Gruber-Eber A, Kremmer E, Eick D (мамыр 2007). «Pes1, Bop1 және WDR12 өзара тәуелділігі 60S рибосомалық суббірліктің жетілуіне қажет PeBoW кешенінің нуклеолярлық оқшаулауын және жиналуын бақылайды». Мол. Ұяшық. Биол. 27 (10): 3682–94. дои:10.1128 / MCB.00172-07. PMC 1899993. PMID 17353269.
^ Hölzel M, Rohrmoser M, Schlee M, Grimm T, Harasim T, Malamoussi A, Gruber-Eber A, Kremmer E, Hiddemann W, Bornkamm GW, Eick D (тамыз 2005). «Сүтқоректілердің WDR12 - Pes1-Bop1 кешенінің жаңа мүшесі және рибосома биогенезі мен жасушалардың көбеюі үшін қажет». Дж. Жасуша Биол. 170 (3): 367–78. дои:10.1083 / jcb.200501141. PMC 2171466. PMID 16043514.

Сыртқы сілтемелер

Адам BOP1 геномның орналасуы және BOP1 геннің егжей-тегжейлі беті UCSC Genome Browser.

Әрі қарай оқу

Чжан Ю, Коушик С, Дай Р, Мивечи Н.Ф. (1999). «Муриннің жылу шокының транскрипциясы фактор-1 генін құрылымдық ұйымдастыру және промоутерлік талдау». Дж.Биол. Хим. 273 (49): 32514–21. дои:10.1074 / jbc.273.49.32514. PMID 9829985.
Nakatsura T, Senju S, Yamada K, Jotsuka T, Ogawa M, Nishimura Y (2001). «Ұйқы безі қатерлі ісігінде шамадан тыс әсер ететін иммуногендік антигендердің гендік клондануы». Биохимия. Биофиз. Res. Коммун. 281 (4): 936–44. дои:10.1006 / bbrc.2001.4377. PMID 11237751.
Пестов Д.Г., Стрезоска З, Лау Л.Ф. (2001). «Рибосома биогенезі мен жасуша циклі арасындағы р53-тәуелді айқасудың дәлелі: Bop1 ядролық ақуызының G (1) / S ауысуына әсері». Мол. Ұяшық. Биол. 21 (13): 4246–55. дои:10.1128 / MCB.21.13.4246-4255.2001. PMC 87085. PMID 11390653.
Пестов Д.Г., Стокельман М.Г., Стрезоска З, Лау Л.Ф. (2001). «ERB1, сүтқоректілердің Bop1 ашытқы гомологы, 25S және 5.8S рибосомалық РНҚ-ның жетілуіне қажет маңызды ген». Нуклеин қышқылдары. 29 (17): 3621–30. дои:10.1093 / нар / 29.17.3621. PMC 55883. PMID 11522832.
Андерсен Дж.С., Лион СЕ, Фокс АХ, Леунг АК, Лам Ю.В., Стин Х, Манн М, Лаймонд А.И. (2002). «Адамның ядроларын бағытталған протеомиялық талдау». Curr. Биол. 12 (1): 1–11. дои:10.1016 / S0960-9822 (01) 00650-9. PMID 11790298. S2CID 14132033.
Стрезоска З, Пестов Д.Г., Лау Л.Ф. (2002). «Bop1 тінтуірдің нуклеолярлық ақуызының функционалды инактивациясы рРНҚ-ға дейінгі өңдеудің бірнеше сатысын тежейді және жасуша циклінің прогрессиясын блоктайды». Дж.Биол. Хим. 277 (33): 29617–25. дои:10.1074 / jbc.M204381200. PMID 12048210.
Scherl A, Couté Y, Deon C, Callé A, Kindbeiter K, Sanchez JC, Greco A, Hochstrasser D, Diaz JJ (2003). «Адамның ядроларын функционалды протеомиялық талдау». Мол. Биол. Ұяшық. 13 (11): 4100–9. дои:10.1091 / mbc.E02-05-0271. PMC 133617. PMID 12429849.
Лапик Ю.Р., Фернандес К.Ж., Лау Л.Ф., Пестов Д.Г. (2004). «Сүтқоректілердің рибосома биогенезіндегі Pes1 және Bop1 арасындағы физикалық және функционалды өзара әрекеттесу». Мол. Ұяшық. 15 (1): 17–29. дои:10.1016 / j.molcel.2004.05.020. PMID 15225545.
Андерсен Дж.С., Лам Ю.В., Леунг АК, Онг SE, Лион CE, Лаймонд А.И., Манн М (2005). «Ядролық протеом динамикасы». Табиғат. 433 (7021): 77–83. дои:10.1038 / табиғат03207. PMID 15635413. S2CID 4344740.
Nousiainen M, Silljé HH, Sauer G, Nigg EA, Körner R (2006). «Адамның митоздық шпиндельін фосфопротемиялық талдау». Proc. Натл. Акад. Ғылыми. АҚШ. 103 (14): 5391–6. дои:10.1073 / pnas.0507066103. PMC 1459365. PMID 16565220.
Beausoleil SA, Villén J, Gerber SA, Rush J, Gygi SP (2006). «Ақуыздың фосфорлануының анализі және учаскені оқшаулаудың ықтималдыққа негізделген тәсілі». Нат. Биотехнол. 24 (10): 1285–92. дои:10.1038 / nbt1240. PMID 16964243. S2CID 14294292.
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (2006). «Сигналды желілердегі ғаламдық, in vivo және нақты фосфорлану динамикасы». Ұяшық. 127 (3): 635–48. дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983. S2CID 7827573.
Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Робинсон MD, О'Коннор L, Ли М, Тейлор R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Mur L, Zhang S, Орнатский О, Бухман Ю.В., Этиер М, Шенг Ю, Василеску Дж, Абу-Фарха М, Ламберт Дж.П., Дуэлл Х.С., Стюарт II, Куэхл Б, Хогю К, Колвилл К, Гладвиш К, Мускат Б, Кинач Р, Адамс SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). «Масс-спектрометрия әдісімен адамның ақуыз-ақуыздың өзара әрекеттесуінің ауқымды картасы». Мол. Сист. Биол. 3 (1): 89. дои:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.

Бұл мақалада көпшілікке арналған мәтін енгізілген Pfam және InterPro: IPR012953

Бұл мақала а ген қосулы адамның хромосомасы 8 Бұл бұта. Сіз Уикипедияға көмектесе аласыз оны кеңейту.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ENSG00000285301 GRCh38: Ensembl шығарылымы 89: ENSG00000261236, ENSG00000285301 - Ансамбль, Мамыр 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000022557 - Ансамбль, Мамыр 2017

[3] «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.

[4] «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.

[pmid8590280-5] Nagase T, Seki N, Tanaka A, Ishikawa K, Nomura N (наурыз 1996). «Адамның анықталмаған гендерінің кодтау ретін болжау. IV. КГ-1 адамның жасуша сызығынан кДНК клондарының анализі арқылы шығарылған 40 жаңа геннің (KIAA0121-KIAA0160) кодтық тізбектері». DNA Res. 2 (4): 167–74, 199–210. дои:10.1093 / dnares / 2.4.167. PMID 8590280.

[entrez-6] «Entrez Gene: BOP1 таралу блогы 1».

[pmid16362343-7] а ^б Ким Дж, Гу СЖ, Чун Хдж, Янг ХВ, Ён Т.С., Ли ХХ, Парк СЖ (қаңтар 2006). «Бета-лямдиннің Giardia lamblia-дағы Bop1 ақуызымен өзара әрекеттесуі». Паразитол. Res. 98 (2): 138–44. дои:10.1007 / s00436-005-0040-8. PMID 16362343. S2CID 24519868.

[pmid16804918-8] Killian A, Sarafan-Vasseur N, Sesboüé R, Le Pessot F, Blanchard F, Lamy A, Laurent M, Flaman JM, Frébourg T (қыркүйек 2006). «8q24-те орналасқан BOP1 генінің колоректальды ісік тубергенезіне қосқан үлесі». Хромосомалар гендерінің қатерлі ісігі. 45 (9): 874–81. дои:10.1002 / gcc.20351. PMID 16804918. S2CID 38299400.

[pmid17353269-9] Rohrmoser M, Hölzel M, Grimm T, Malamoussi A, Harasim T, Orban M, Pfisterer I, Gruber-Eber A, Kremmer E, Eick D (мамыр 2007). «Pes1, Bop1 және WDR12 өзара тәуелділігі 60S рибосомалық суббірліктің жетілуіне қажет PeBoW кешенінің нуклеолярлық оқшаулауын және жиналуын бақылайды». Мол. Ұяшық. Биол. 27 (10): 3682–94. дои:10.1128 / MCB.00172-07. PMC 1899993. PMID 17353269.

[pmid16043514-10] Hölzel M, Rohrmoser M, Schlee M, Grimm T, Harasim T, Malamoussi A, Gruber-Eber A, Kremmer E, Hiddemann W, Bornkamm GW, Eick D (тамыз 2005). «Сүтқоректілердің WDR12 - Pes1-Bop1 кешенінің жаңа мүшесі және рибосома биогенезі мен жасушалардың көбеюі үшін қажет». Дж. Жасуша Биол. 170 (3): 367–78. дои:10.1083 / jcb.200501141. PMC 2171466. PMID 16043514.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]