YKT6 - YKT6

YKT6
Идентификаторлар
Бүркеншік аттар	YKT6, YKT6 v-SNARE гомологы
Сыртқы жеке куәліктер	OMIM: 606209 MGI: 1927550 HomoloGene: 4778 Ген-карталар: YKT6
Геннің орналасуы (адам)
Хр.	7-хромосома (адам)
Соңы	44,214,294 bp
Геннің орналасуы (тышқан)
Хр.	11-хромосома (тышқан)
Соңы	5,967,780 bp
РНҚ экспрессиясы өрнек
	; ;
	Қосымша сілтеме өрнегі туралы деректер
Гендік онтология
Молекулалық функция	• белок-цистеин S-палмитойилтрансфераза белсенділігі; • трансфераза белсенділігі; • SNAP рецепторларының белсенділігі; • SNARE байланыстыру; • кадеринді байланыстыру; • GO: 0001948 ақуыздармен байланысуы;
Ұялы компонент	• цитоплазма; • мембрананың ажырамас компоненті; • эндосома; • Гольджи аппараты; • мембрана; • Гольджи қабығы; • плазмалық мембрананың ажырамас компоненті; • базиляр дендрит; • көлік көпіршігі; • нейрондық жасуша денесі; • SNARE кешені; • эндоплазмалық тор; • митохондрия; • цитоплазмалық көпіршік қабығы; • эндоплазмалық тор - Гольджи аралық бөлім мембрана; • цитоплазмалық көпіршік; • апикальды дендрит; • цитозол;
Биологиялық процесс	• көпіршіктерге бағытталған; • экзоцитозға қатысатын везикуланы қондыру; • Golgi көпіршіктері арқылы тасымалданатын ER; • ретроградтық көлік, эндосом Гольджи; • ақуызды тасымалдау; • көпіршіктердің бірігуі; • везикуламен қозғалатын тасымалдау; • Липидті екі қабатты біріктіру;
	Дереккөздер:Амиго / QuickGO
Ортологтар
	10652
	56418
	ENSG00000106636
	ENSMUSG00000002741
	O15498
	Q9CQW1
	NM_006555; NM_001363678
	NM_019661
	NP_006546; NP_001350607; NP_006546.1
	NP_062635
	Уикидеректер
Адамды қарау / өңдеу	Тінтуірді қарау / өңдеу

Синаптобревин гомологы YKT6 Бұл ақуыз адамдарда кодталған YKT6 ген.^[5]^[6]^[7]

Функция

Бұл ген өнімі - бұл секреторлық бөлімдер арасындағы везикулярлы тасымалдауға қатысатын SNARE тану молекулаларының бірі. Бұл эндоплазмалық ретикулум-Гольджи тасымалдау сатысында қызмет ететін изопренилденген ақуыз. Бұл ақуыз ашытқыдан адамға өте жақсы сақталады және ашытқы бөлетін жолдағы ашытқы гомологының жоғалуын функционалды түрде толықтыра алады.^[7]

Өзара әрекеттесу

YKT6 көрсетілді өзара әрекеттесу бірге BET1L.^[8]^[9]

Әдебиеттер тізімі

^ ^а ^б ^c GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000106636 - Ансамбль, Мамыр 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000002741 - Ансамбль, Мамыр 2017
^ «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
^ «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
^ Veit M (желтоқсан 2004). «Адамның SNARE ақуызы Ykt6 С-терминалды цистеин қалдықтарында өзіндік пальмитоиляцияға қатысады». Биохимиялық журнал. 384 (Pt 2): 233-7. дои:10.1042 / BJ20041474. PMC 1134105. PMID 15479160.
^ Rossi V, Banfield DK, Vacca M, Dietrich LE, Ungermann C, D'Esposito M, Galli T, Filippini F (желтоқсан 2004). «Лонгиндер және олардың лонгиндік домендері: реттелетін SNARE және көп функционалды SNARE реттегіштері». Биохимия ғылымдарының тенденциялары. 29 (12): 682–8. дои:10.1016 / j.tibs.2004.10.002. PMID 15544955.
^ ^а ^б «Entrez Gene: YKT6 YKT6 v-SNARE гомологы (S. cerevisiae)».
^ Қысқа J, Сақал М.Б, Симанн J, Dirac-Svejstrup AB, Уоррен G (сәуір 2002). «Голгингтерді дәйекті байланыстыру және p115 везикуланы байланыстыратын протеинмен SNAREpin жиынтығының катализі». Жасуша биологиясының журналы. 157 (1): 45–62. дои:10.1083 / jcb.200112127. PMC 2173270. PMID 11927603.
^ Xu Y, Martin S, James DE, Hong W (қазан 2002). «GS15 синтаксин 5, GS28 және Ykt6 бар SNARE кешенін құрайды және Гольджи аппараттарының ерте цистерналарында трафикке қатысады» (PDF). Жасушаның молекулалық биологиясы. 13 (10): 3493–507. дои:10.1091 / mbc.E02-01-0004. PMC 129961. PMID 12388752.

Әрі қарай оқу

Маруяма К, Сугано С (қаңтар 1994). «Олиго-жабу: эукариоттық мРНҚ-ның қақпақ құрылымын олигорибонуклеотидтермен ауыстырудың қарапайым әдісі». Джин. 138 (1–2): 171–4. дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
McNew JA, Sogaard M, Lampen NM, Machida S, Ye RR, Lacomis L, Tempst P, Rothman JE, Söllner TH (шілде 1997). «Ykt6p, эндоплазмалық ретикулум-Гольджи тасымалы үшін маңызды пренилденген SNARE». Биологиялық химия журналы. 272 (28): 17776–83. дои:10.1074 / jbc.272.28.17776. PMID 9211930.
Сузуки Ю, Йошитомо-Накагава К, Маруяма К, Суяма А, Сугано С (қазан 1997). «Толық көлемде байытылған және 5-деңгеймен байытылған cDNA кітапханасының құрылысы және сипаттамасы». Джин. 200 (1–2): 149–56. дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Tochio H, Tsui MM, Banfield DK, Zhang M (шілде 2001). «Ykt6p құрылымымен анықталған синтинаксинді емес SNARE ақуыздарының аутоингибиторлық механизмі». Ғылым. 293 (5530): 698–702. дои:10.1126 / ғылым.1062950. PMID 11474112. S2CID 13618305.
Honer WG, Falkai P, Bayer TA, Xie J, Hu L, Li HY, Arango V, Mann JJ, Dwork AJ, Trimble WS (сәуір 2002). «Ауыр психикалық ауру кезінде алдыңғы фронтал кортексіндегі SNARE механизмі ақуыздарының ауытқулары». Ми қыртысы. 12 (4): 349–56. дои:10.1093 / cercor / 12.4.349. PMID 11884350.
Қысқа J, Сақал М.Б, Симанн J, Dirac-Svejstrup AB, Уоррен G (сәуір 2002). «Голгингтерді дәйекті байланыстыру және p115 везикуланы байланыстыратын протеинмен SNAREpin жиынтығының катализі». Жасуша биологиясының журналы. 157 (1): 45–62. дои:10.1083 / jcb.200112127. PMC 2173270. PMID 11927603.
Xu Y, Martin S, James DE, Hong W (қазан 2002). «GS15 синтаксин 5, GS28 және Ykt6 бар SNARE кешенін құрайды және Гольджи аппараттарының ерте цистерналарында трафикке қатысады» (PDF). Жасушаның молекулалық биологиясы. 13 (10): 3493–507. дои:10.1091 / mbc.E02-01-0004. PMC 129961. PMID 12388752.
Puri N, Kruhlak MJ, Whiteheart SW, Roche PA (қараша 2003). «Маст клеткаларын дегрануляциялау үшін N-этилмалеимидке сезімтал фактор-SNARE арқылы бөлшектеу қажет». Иммунология журналы. 171 (10): 5345–52. дои:10.4049 / jimmunol.171.10.5345. PMID 14607937.
Фукасава М, Варламов О, Энг WS, Söllner TH, Rothman JE (сәуір 2004). «SNARE Ykt6 локализациясы және белсенділігі оның реттеуші доменімен және пальмитоиляциямен анықталады». Америка Құрама Штаттарының Ұлттық Ғылым Академиясының еңбектері. 101 (14): 4815–20. дои:10.1073 / pnas.0401183101. PMC 387331. PMID 15044687.
Tai G, Lu L, Wang TL, Tang BL, Goud B, Johannes L, Hong W (қыркүйек 2004). «Синтаксин 5 / Ykt6 / GS28 / GS15 SNARE кешенінің ерте / қайта өңделетін эндосомадан транс-Гольджи желісіне тасымалдаудағы қатысуы». Жасушаның молекулалық биологиясы. 15 (9): 4011–22. дои:10.1091 / mbc.E03-12-0876. PMC 515336. PMID 15215310.
Кимура К, Вакамацу А, Сузуки Ю, Ота Т, Нишикава Т, Ямашита Р, Ямамото Дж, Секине М, Цуритани К, Вакагури Х, Ишии С, Сугияма Т, Сайто К, Исоно Ю, Ири Р, Кушида Н, Йонеяма Т , Otsuka R, Kanda K, Yokoi T, Kondo H, Wagatsuma M, Murakawa K, Ishida S, Ishibashi T, Takahashi-Fujii A, Tanase T, Nagai K, Kikuchi H, Nakai K, Isogai T, Sugano S (қаңтар 2006 ). «Транскрипциялық модуляцияны әртараптандыру: ауқымды идентификация және адам гендерінің болжамды альтернативті промоторларының сипаттамасы». Геномды зерттеу. 16 (1): 55–65. дои:10.1101 / гр.4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.
Окумура АЖ, Хацузава К, Тамура Т, Нагая Х, Саеки К, Окумура Ф, Нагао К, Нишикава М, Йошимура А, Вада I (ақпан 2006). «Эндомембраналық жүйенің сапасын бақылауға Q-SNARE, D12 романының қатысуы». Биологиялық химия журналы. 281 (7): 4495–506. дои:10.1074 / jbc.M509715200. PMID 16354670.
Ooe A, Kato K, Noguchi S (наурыз 2007). «Адамның сүт безі қатерлі ісіктеріндегі доцетакселге төзімділігінде р53-мутацияланған ісіктерде жоғары реттелген CCT5, RGS3 және YKT6 гендерінің қатысуы мүмкін». Сүт безі қатерлі ісігін зерттеу және емдеу. 101 (3): 305–15. дои:10.1007 / s10549-006-9293-x. PMID 16821082. S2CID 2398124.

Бұл мақала а ген қосулы адамның хромосомасы 7 Бұл бұта. Сіз Уикипедияға көмектесе аласыз оны кеңейту.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000106636 - Ансамбль, Мамыр 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000002741 - Ансамбль, Мамыр 2017

[3] «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.

[4] «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.

[pmid15479160-5] Veit M (желтоқсан 2004). «Адамның SNARE ақуызы Ykt6 С-терминалды цистеин қалдықтарында өзіндік пальмитоиляцияға қатысады». Биохимиялық журнал. 384 (Pt 2): 233-7. дои:10.1042 / BJ20041474. PMC 1134105. PMID 15479160.

[pmid15544955-6] Rossi V, Banfield DK, Vacca M, Dietrich LE, Ungermann C, D'Esposito M, Galli T, Filippini F (желтоқсан 2004). «Лонгиндер және олардың лонгиндік домендері: реттелетін SNARE және көп функционалды SNARE реттегіштері». Биохимия ғылымдарының тенденциялары. 29 (12): 682–8. дои:10.1016 / j.tibs.2004.10.002. PMID 15544955.

[entrez-7] а ^б «Entrez Gene: YKT6 YKT6 v-SNARE гомологы (S. cerevisiae)».

[pmid11927603-8] Қысқа J, Сақал М.Б, Симанн J, Dirac-Svejstrup AB, Уоррен G (сәуір 2002). «Голгингтерді дәйекті байланыстыру және p115 везикуланы байланыстыратын протеинмен SNAREpin жиынтығының катализі». Жасуша биологиясының журналы. 157 (1): 45–62. дои:10.1083 / jcb.200112127. PMC 2173270. PMID 11927603.

[pmid12388752-9] Xu Y, Martin S, James DE, Hong W (қазан 2002). «GS15 синтаксин 5, GS28 және Ykt6 бар SNARE кешенін құрайды және Гольджи аппараттарының ерте цистерналарында трафикке қатысады» (PDF). Жасушаның молекулалық биологиясы. 13 (10): 3493–507. дои:10.1091 / mbc.E02-01-0004. PMC 129961. PMID 12388752.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]