WDR75 - WDR75

WDR75 бұл WDR75 генімен кодталған адамның ақуызы[1] құрамында WD40 супер-отбасылық домені бар.[2] WD40 домені көптеген адамдарда кездеседі эукариотты жасуша сияқты ұялы реттеуші функцияларға қатысатыны белгілі алдын-ала мРНҚ өңдеу және цитоскелетті құрастыру.[3] WDR75 ақуызының функциясы -мен анықталмаған ғылыми қауымдастық.

Қосылу сандарыОрналасқан жеріИдентификаторларМ.В.pI
NM_032186, NP_115544.12q32.2FLJ12519, DKFZp781N2144[1]94,5 кДа5.56

Ақуыздар тізбегі

The аминқышқылдарының бірізділігі ұзындығы 830 қалдық және құрамында қышқыл құйрық бар.[4]

1 MVEEENIRVV RCGGSELNFR RAVFSADSKY IFCVSGDFVK VYSTVTEECV HILHGHRNLV 61 TGIQLNPNNH LQLYSCSLDG TIKLWDYIDG ILIKTFIVGC KLHALFTLAQ AEDSVFVIVN 121 KEKPDIFQLV SVKLPKSSSQ EVEAKELSFV LDYINQSPKC IAFGNEGVYV AAVREFYLSV 181 YFFKKKTTSR FTLSSSRNKK HAKNNFTCVA CHPTEDCIAS GHMDGKIRLW RNFYDDKKYT 241 YTCLHWHHDM VMDLAFSVTG TSLLSGGRES VLVEWRDATE KNKEFLPRLG ​​ATIEHISVSP 301 AGDLFCTSHS DNKIIIIHRN LEASAVIQGL VKDRSIFTGL MIDPRTKALV LNGKPGHLQF 361 YSLQSDKQLY NLDIIQQEYI NDYGLIQIEL TKAAFGCFGN WLATVEQRQE KETELELQMK 421 LWMYNKKTQG FILNTKINMP HEDCITALCF CNAEKSEQPT LVTASKDGYF KVWILTDDSD 481 IYKKAVGWTC DFVGSYHKYQ ATNCCFSEDG SLLAVSFEEI VTIWDSVTWE LKCTFCQRAG 541 KIRHLCFGRL TCSKYLLGAT ENGILCCWNL LSCALEWNAK LNVRVMEPDP NSENIAAISQ 601 SSVGSDLFVF KPSEPRPLYI QKGISREKVQ WGVFVPRDVP ESFTSEAYQW LNRSQFYFLT 661 KSQSLLTFST KSPEEKLTPT SKQLLAEESL PTTPFYFILG KHRQQQDEKL NETLENELVQ 721 LPLTENIPAI SELLHTPAHV LPSAAFLCSM FVNSLLLSKE TKSAKEIPED VDMEEEKESE 781 DSDEENDFTE KVQDTSNTGL GEDIIHQLSK SEEKELRKFR KIDYSWIAAL

Екінші құрылым

The екінші құрылым болжалды[4] құрамында альфа-спиральдар мен бета тізбектерінің ауыспалы жиынтығы болуы керек. Жоқ спираль-бұрылыс-спираль (HTH) аймақтар болжалды.

Гомология

Үшін белгілі паралогтар жоқ Адам гені. WDR75-тің сиыр, тышқан немесе егеуқұйрықтар бойынша орологтарына паралогтар табылған жоқ.[5] Сүтқоректілер ортологтарының арасында адамның геніне консервация күшті болды, ал ортологтардың ең төменгі сәйкестігі 76% құрады. Төмендегі кестеде омыртқалы және омыртқасыздардың ортологтары келтірілген. Ерекшелігін сақтау аминқышқылдары 340-390, 430- 450 және 515-530 позицияларынан барлығы болжамды альфа-спиральдармен өзара байланысты.[4]

ОрганизмҚосылу нөміріАдам геніне сәйкестілік
Bos TaurusNP_001095532.1[6]91.7
Бұлшықет бұлшықетіNP_082875.1[7]84.9
ПантроглодиттерXP_001164827.1[8]99.5
Rattus norvegicusNP_001041354.1[9]84.3
Канис танысXP_545565[10]90.7
Ксенопус ЛаевисNP_001086564.1[11]61.0
Gallus gallusXP_001233408.1[12]60.8
Шизосахаромицес помбыNP_594798[13]19.9
Anopheles gambiaeXP_317524[14]22.7

Пайдаланылған әдебиеттер

  1. ^ а б «Entrez Gene: WDR75 WD қайталанатын домені 75». Алынған 3 мамыр 2009.
  2. ^ «БЛАСТ». Алынған 6 мамыр 2009.
  3. ^ «CDD: консервіленген домендер және ақуыздар классификациясы туралы мәліметтер базасы».
  4. ^ а б c SDSC Biology Workbench 2.0
  5. ^ «BLAT іздеу геномы». Алынған 7 мамыр 2009.
  6. ^ «Құрамында WD бар қайталанатын ақуыз 75 [Bos taurus] - Протеин - NCBI».
  7. ^ «Құрамында WD бар қайталанатын ақуыз 75 [Mus musculus] - Протеин - NCBI».
  8. ^ «Құрамында WD бар қайталанатын ақуыз 75 [Пан троглодиттері] - Ақуыз - NCBI».
  9. ^ «Құрамында WD бар қайталанатын ақуыз 75 [Rattus norvegicus] - ақуыз - NCBI».
  10. ^ «Құрамында WD бар қайталанатын ақуыз 75 [Canis lupus tanishis] - Протеин - NCBI».
  11. ^ «Құрамында WD бар қайталанатын ақуыз 75 [Xenopus laevis] - Протеин - NCBI».
  12. ^ «БАҒАЛАНДЫРЫЛҒАН: Құрамында WD қайталанатын ақуыз 75 [Gallus gallus] - Протеин - NCBI».
  13. ^ «U3 snoRNP-мен байланысты ақуыз Nan1 [Schizosaccharomyces pombe 972h-] - ақуыз - NCBI».
  14. ^ «AGAP007948-PA, ішінара [Anopheles gambiae STR. PEST] - Протеин - NCBI».