ВИОЛИН вакцина туралы мәліметтер базасы - VIOLIN vaccine database

The Вакциналарды зерттеу және OnLine ақпараттық желісі (ВОЛИН) ең ірі веб-негізделген вакцина мәліметтер базасы және талдау жүйесі.[1][2] Қазіргі уақытта VIOLIN құрамында 3000-нан астам вакцина немесе 190-нан астам вакцинаға үміткер бар патогендер. Деректер қорындағы вакцина туралы ақпарат 1600-ден астам рецензияланған құжаттардан қолмен емдеу арқылы жиналады. Вакцинаның қолданыстағы мәліметтер базасынан ерекшеленетін VIOLIN вакцинаны зерттеу туралы мәліметтерге назар аударады. Вакцинаның атауы, лицензия мәртебесі, қолданылатын антигендер, вакцинаның адъюванттары, вакцина векторлары, вакцинация процедурасы, иммундық жауап, шақыру процедурасы, вакцинаның тиімділігі, жағымсыз құбылыстар және басқалары бар ақпараттың әр түрлі түрлері жасалады. дәйексөз сілтемелерімен қолдау тапты. Куратор жасаған мәліметтер вакцина саласының сарапшысы мұқият қарап, мақұлдағаннан кейін ғана жарияланады.

Сонымен қатар, VIOLIN құрамында вакциналарды талдаудың көптеген бағдарламалары бар. Мысалы, VIOLIN құрамына Vaxign (http://www.violinet.org/vaxign ), кері вакцинология стратегиясына негізделген вакциналарды жобалаудың алғашқы веб-бағдарламасы.[3] Vaxign әртүрлі патогендік модельдерде, соның ішінде уропатогенді E. coli және Brucella spp-де сыналды.

VIOLIN сонымен қатар қауымдастыққа негізделген вакцина онтологиясын (VO) дамытудың ресми веб-парағын жүргізеді (http://www.violinet.org/vaccineontology ). VO - бұл вакцина мен вакцинация саласындағы ресми биомедициналық онтология. VO вакцина мәліметтерін стандарттау мен интеграциялауға және қолдауға бағытталған автоматтандырылған пайымдау. VO вакцина әдебиетін өндіруді күшейтетіні көрсетілген.[4]

Әдебиеттер тізімі

  1. ^ Xiang Z, Todd T, Ku KP, Kovacic BL, Larson CB, Chen F, Hodges AP, Tian Y, Olenzek EA, Zhao B, Colby LA, Rush HG, Gilsdorf JR, Jourdian GW, He Y (қаңтар 2008). «VIOLIN: вакциналарды зерттеу және онлайн-ақпараттық желі». Нуклеин қышқылдары. 36 (Деректер базасы мәселесі): D923 – D928. дои:10.1093 / nar / gkm1039. PMC  2238972. PMID  18025042.
  2. ^ He, Racz R, Sayers S, Lin Y, Todd T, Hur J, Li X, Patel M, Zhao B, Chung M, Ostrow J, Sylora A, Dungarani P, Ulysse G, Kochhar K, Vidri B, Strait K , Jourdian GW, Xiang Z (қаңтар 2014). «Виолинге қарсы вакциналар базасы мен талдау жүйесінің веб-жаңартулары». Нуклеин қышқылдары. 42 (D1): D1124 – D1132. дои:10.1093 / nar / gkt1133. PMC  3964998. PMID  24259431.
  3. ^ Ол Y, Xiang Z, Mobley HL (шілде 2010). «Vaxign: кері вакцинологияға арналған вакциналарды жобалаудың алғашқы веб-бағдарламасы және вакцинаны әзірлеуге арналған қосымшалар». J Biomed Biotechnol. 2010 (2010): 297505. дои:10.1155/2010/297505. PMC  2910479. PMID  20671958.
  4. ^ Озгюр А, Сян З, Радев Д.Р., Хе Й (мамыр 2011). «Вакцина онтологиясын қолдана отырып вакцинамен байланысты IFN-γ генінің өзара әрекеттесу желілерін өндіру». J Biomed семантикасы. 2: Қосымша 2: S8. дои:10.1186 / 2041-1480-2-S2-S8. PMC  3102897. PMID  21624163.

Сыртқы сілтемелер