USP13 - USP13

USP13
Қол жетімді құрылымдар
PDB	Ортологиялық іздеу: PDBe RCSB
PDB идентификатор кодтарының тізімі
	2L80, 2LBC
Идентификаторлар
Бүркеншік аттар	USP13, ISOT3, IsoT-3, убиквитинге тән пептидаза 13 (изопептидаза Т-3), убикуитинге тән пептидаза 13
Сыртқы жеке куәліктер	OMIM: 603591 MGI: 1919857 HomoloGene: 68372 Ген-карталар: USP13
Геннің орналасуы (адам)
Хр.	3-хромосома (адам)
Соңы	179,789,401 bp
Геннің орналасуы (тышқан)
Хр.	3-хромосома (тышқан)
Соңы	32,938,071 bp
РНҚ экспрессиясы өрнек
	Қосымша сілтеме өрнегі туралы деректер
Гендік онтология
Молекулалық функция	• цистеин типіндегі пептидаза белсенділігі; • шаперонды байланыстыру; • мырыш ионымен байланыстыру; • BAT3 кешенді байланыстыру; • металл ионымен байланыстыру; • GO: 1904454, GO: 1904455 убиквитин тәрізді ақуызға тән протеаза белсенділігі; • протеазомамен байланысуы; • пептидаза белсенділігі; • убивитинмен байланыстыру; • GO: 0001948 ақуыздармен байланысуы; • убивитин тәрізді протеин лигазасымен байланысуы; • гидролаза белсенділігі; • убивитин протеині лигазымен байланысуы; • тиолға тәуелді убивитинге тән протеаза белсенділігі; • цистеин типті эндопептидаза белсенділігі;
Ұялы компонент	• нуклеоплазма; • цитозол;
Биологиялық процесс	• транскрипцияны реттеу, ДНҚ-шаблонмен; • Убиквитинге тәуелді ақуыздың катаболикалық процесі; • ERAD жолының оң реттелуі; • протеолиз; • аутофагия; • аутофагияны реттеу; • ақуыз K63-пен байланысты дезубиквитинация; • ERAD жолына қатысатын қатпаған ақуызға қызмет көрсету; • жасушалық пролиферация; • меланоциттердің дифференциациясы; • ақуызды декубикутациялау; • ақуыз K29-мен байланысты дезубиквитинация; • ақуыз K6-мен байланысты дезубиквитинация; • ақуызды тұрақтандыру;
	Дереккөздер:Амиго / QuickGO
Ортологтар
	8975
	72607
	ENSG00000058056
	ENSMUSG00000056900
	Q92995
	Q5BKP2
	NM_003940
	NM_001013024
	NP_003931
	NP_001013042
	Уикидеректер
Адамды қарау / өңдеу	Тінтуірді қарау / өңдеу

Убикуитин карбоксил-терминалы гидролаза 13 болып табылады фермент адамдарда кодталған USP13 ген.^[5]^[6]

Пайдаланылған әдебиеттер

^ ^а ^б ^c GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000058056 - Ансамбль, Мамыр 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000056900 - Ансамбль, Мамыр 2017
^ «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
^ «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
^ Puente XS, Sanchez LM, жалпы CM, Lopez-Otin C (шілде 2003). «Адам және тышқан протеаздары: салыстырмалы геномдық тәсіл». Nat Rev Genet. 4 (7): 544–58. дои:10.1038 / nrg1111. PMID 12838346. S2CID 2856065.
^ «Entrez Gene: USP13 ubiquitin спецификалық пептидаза 13 (изопептидаза T-3)».

Әрі қарай оқу

D'Andrea A, Pellman D (1999). «Дубиквитинирлеуші ферменттер: биологиялық реттегіштердің жаңа класы». Крит. Аян Биохим. Мол. Биол. 33 (5): 337–52. дои:10.1080/10409239891204251. PMID 9827704.
Тиммс К.М., Ансари-Лари М.А., Моррис В, және басқалар. (1998). «Изопептидазаның геномдық ұйымы Т-3 (ISOT-3), убикуитинге тән протеаза отбасының (UBP) жаңа мүшесі». Джин. 217 (1–2): 101–6. дои:10.1016 / S0378-1119 (98) 00341-2. PMID 9841226.
Хартли JL, Temple GF, Brasch MA (2001). «In vitro сайтқа тән рекомбинацияны қолдану арқылы ДНҚ-ны клондау». Genome Res. 10 (11): 1788–95. дои:10.1101 / гр.143000. PMC 310948. PMID 11076863.
McElhinny AS, Kakinum K, Sorimachi H және т.б. (2002). «Бұлшықетке тән RING саусақ-1 титинмен өзара әрекеттесіп, саркомериялық М-сызық пен жіптің қалың құрылымын реттейді және глюкокортикоидтық модуляторлық элементпен байланыстыратын ядролық функцияларға ие болуы мүмкін». Дж. Жасуша Биол. 157 (1): 125–36. дои:10.1083 / jcb.200108089. PMC 2173255. PMID 11927605.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH және т.б. (2003). «Адам мен тышқанның 15000-нан астам толық ұзындықтағы кДНҚ тізбектерінің генерациясы және алғашқы талдауы». Proc. Натл. Акад. Ғылыми. АҚШ. 99 (26): 16899–903. дои:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Colland F, Jacq X, Trouplin V және т.б. (2004). «Адамның сигналдық жолының функционалды протеомикасын картографиялау». Genome Res. 14 (7): 1324–32. дои:10.1101 / гр.2334104. PMC 442148. PMID 15231748.
Wiemann S, Arlt D, Huber W және т.б. (2004). «ORFeome-ден биологияға: функционалды геномика құбыры». Genome Res. 14 (10B): 2136–44. дои:10.1101 / гр.2576704. PMC 528930. PMID 15489336.
Stelzl U, Worm U, Lalowski M және т.б. (2005). «Адамның ақуыз бен ақуыздың өзара әрекеттесу желісі: протеомды аннотациялауға арналған қор». Ұяшық. 122 (6): 957–68. дои:10.1016 / j.cell.2005.08.029. hdl:11858 / 00-001M-0000-0010-8592-0. PMID 16169070. S2CID 8235923.
Мехрле А, Розенфелдер Н, Шупп I және т.б. (2006). «LIFEdb дерекқоры 2006 ж.». Нуклеин қышқылдары. 34 (Деректер базасы мәселесі): D415–8. дои:10.1093 / nar / gkj139. PMC 1347501. PMID 16381901.

Бұл мақала а ген қосулы адамның хромосомасы 3 Бұл бұта. Сіз Уикипедияға көмектесе аласыз оны кеңейту.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000058056 - Ансамбль, Мамыр 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000056900 - Ансамбль, Мамыр 2017

[3] «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.

[4] «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.

[pmid12838346-5] Puente XS, Sanchez LM, жалпы CM, Lopez-Otin C (шілде 2003). «Адам және тышқан протеаздары: салыстырмалы геномдық тәсіл». Nat Rev Genet. 4 (7): 544–58. дои:10.1038 / nrg1111. PMID 12838346. S2CID 2856065.

[entrez-6] «Entrez Gene: USP13 ubiquitin спецификалық пептидаза 13 (изопептидаза T-3)».

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]