UFM1 - UFM1
Уиквитинді бүктейтін модификатор 1, сондай-ақ UFM1, Бұл ақуыз адамдарда кодталған UFM1 ген.[5][6]
UFM1 - а убивитин - E1 тәрізді активтендіргіш ферменттің мақсатты белоктарымен біріктірілген ақуыз тәрізді UBA5 және E2 тәрізді конъюгациялаушы фермент UFC1.[6] Бұл процесс көбінесе UFMylation деп аталады.[7]
Функция
UFM1 бірнеше ортақ қасиеттерді бөліседі убивитин (Ub) және басқалары убивитин тәрізді ақуыздар (UBL). Ufm1 ұқсас үшінші құрылым Ub-ге, бірақ айқын көрінбейді дәйектілік ұқсастығы. Ол консервіленген глициннен тыс 2 қосымша аминқышқылдары бар белсенді емес прекурсор түрінде синтезделеді (про-Ufm1). Ufm1 механизмі конъюгация убивитиндікіне ұқсас. Жетілген Ufm1 экспозициясы бар C-терминалы глицин бұл оның туыстық E1 ақуызымен (Uba5) кейінгі активтенуі үшін өте маңызды. Бұл белсендіру қадамы АТФ қатысуымен жоғары энергиялы тиолестер байланысының пайда болуына әкеледі. Ufm1 кейіннен ұқсас E2 тәрізді ферментіне (Ufc1) ауысады. тиоэстер байланыстыру цистеин E2 белсенді сайтында. Ufm1 әртүрлі мақсатты ақуыздармен біріктіріліп, әлі анықталмаған ақуыздармен кешендер құрайды. Осылайша, Ufm1 конъюгациясының соңғы сатысын тиісті мақсаттарға орындау үшін E3 лигаттары бар (бүгінгі күнге дейін анықталған жоқ). Ufm1 бар ақуыздардың модификациясы да қайтымды. Екі роман цистеин протеазалары бүгінгі күнге дейін анықталған (UFSP1 және UFSP2 ) Ufm1-пептидті C-терминалды термоядроларды бөліп, сонымен қатар Ufm1-ді жасуша ішілік конъюгаттардан шығарады. Бұл протеазалардың убиквитинді деконьюгациялаушы ферменттерге қатысты айқын гомологиясы жоқ. Ufm1 конъюгациясы үшін ақуыздар (Uba5, Ufc1 және Ufm1) жануарлар мен өсімдіктерде сақталады (бірақ ашытқы емес) көп жасушалы организмдерде маңызды рөл атқарады. Ufm1 модификациясының нақты рөлі in vivo әлі белгісіз[8], бірақ негізгі мақсат болып көрінеді uL24 / RPL26 адам жасушаларында.[7]
Әдебиеттер тізімі
- ^ а б c GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000120686 - Ансамбль, Мамыр 2017
- ^ а б c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000027746 - Ансамбль, Мамыр 2017
- ^ «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
- ^ «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
- ^ «Entrez Gene: UFM1 барлық жерде өзгертілетін 1 модификаторы».
- ^ а б Komatsu M, Chiba T, Tatsumi K, Iemura S, Tanida I, Okazaki N, Ueno T, Kominami E, Natsume T, Tanaka K (мамыр 2004). «Ufm1-ге арналған протеин-конъюгацияның жаңа жүйесі, барлық жерде бүктелетін модификатор». EMBO J. 23 (9): 1977–86. дои:10.1038 / sj.emboj.7600205. PMC 404325. PMID 15071506.
- ^ а б Вальчак, Кристофер П .; Лето, Дара Е .; Чжан, Личао; Риепе, Селесте; Мюллер, Райан Ю .; ДаРоза, Пол А .; Инголия, Николас Т .; Элиас, Джошуа Е .; Копито, Рон Р. (2019-01-09). «Рибосомалық ақуыз RPL26 - UFMylation-тің негізгі мақсаты». Ұлттық ғылым академиясының материалдары. Ұлттық ғылым академиясының материалдары. 116 (4): 1299–1308. дои:10.1073 / pnas.1816202116. ISSN 0027-8424.
- ^ «Boston Biochem UFM1 шолуы». Архивтелген түпнұсқа 15 қазан 2007 ж. Алынған 2008-05-21.
Әрі қарай оқу
- Чжан QH, Ye M, Ву XY және т.б. (2001). «CD34 + гемопоэтический бағанында / тұқымдас жасушаларында көрсетілген 300 бұрын анықталмаған гендер үшін ашық оқудың рамалары бар кДНҚ-ны клондау және функционалдық талдау». Genome Res. 10 (10): 1546–60. дои:10.1101 / гр.140200. PMC 310934. PMID 11042152.
- Ю Ю, Чжан С, Чжоу Г және т.б. (2001). «Адамның ұрық бауырындағы гендердің экспрессиясын профильдеу және компиляцияланған экспрессия профильдері мен толық ұзындықты кДНҚ-ны тиімді клондау арқылы тіндердің және дамудың кезеңіне тән гендердің идентификациясы». Genome Res. 11 (8): 1392–403. дои:10.1101 / гр.175501. PMC 311073. PMID 11483580.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH және т.б. (2003). «Адам мен тышқанның 15000-нан астам толық ұзындықтағы кДНҚ тізбектерінің генерациясы және алғашқы талдауы». Proc. Натл. Акад. Ғылыми. АҚШ. 99 (26): 16899–903. дои:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
- Ота Т, Сузуки Ю, Нишикава Т және т.б. (2004). «Адамның 21,243 толық ұзындықтағы кДНҚ-ның толық тізбегі және сипаттамасы». Нат. Генет. 36 (1): 40–5. дои:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
- Dunham A, Matthews LH, Burton J және т.б. (2004). «ДНҚ тізбегі және адамның 13-хромосомасын талдау». Табиғат. 428 (6982): 522–8. дои:10.1038 / табиғат02379. PMC 2665288. PMID 15057823.
- Комацу М, Чиба Т, Тацуми К және т.б. (2005). «Ufm1-ге арналған протеин-конъюгацияның жаңа жүйесі, барлық жерде бүктелетін модификатор». EMBO J. 23 (9): 1977–86. дои:10.1038 / sj.emboj.7600205. PMC 404325. PMID 15071506.
- Герхард Д.С., Вагнер Л, Фейнголд Е.А. және т.б. (2004). «NIH толық ұзындықтағы cDNA жобасының мәртебесі, сапасы және кеңеюі: Сүтқоректілердің гендер коллекциясы (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121-7. дои:10.1101 / гр.2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
- Сасакава Х, Саката Е, Ямагучи Ю және т.б. (2006). «Ufm1 шешімі құрылымы және динамикасы, барлық жерде бүктелетін модификатор 1». Биохимия. Биофиз. Res. Коммун. 343 (1): 21–6. дои:10.1016 / j.bbrc.2006.02.107. PMID 16527251.
- Ewing RM, Chu P, Elisma F және т.б. (2007). «Масс-спектрометрия әдісімен адамның ақуыз-ақуыздың өзара әрекеттесуінің ауқымды картасы». Мол. Сист. Биол. 3 (1): 89. дои:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.
Сыртқы сілтемелер
- Сайтында қол жетімді барлық құрылымдық ақпаратқа шолу PDB үшін UniProt: P61960 (Ubiquitin-адам бүктелген модификаторы 1) at PDBe-KB.
PDB галереясы | |
|---|---|
|
 | Бұл мақала а ген қосулы адамның хромосомасы 13 Бұл бұта. Сіз Уикипедияға көмектесе аласыз оны кеңейту. |