TRIM45 - TRIM45

TRIM45
Қол жетімді құрылымдар
PDBОртологиялық іздеу: PDBe RCSB
Идентификаторлар
Бүркеншік аттарTRIM45, RNF99, 45 бар үш жақты мотив
Сыртқы жеке куәліктерOMIM: 609318 MGI: 1918187 HomoloGene: 11865 Ген-карталар: TRIM45
Геннің орналасуы (адам)
1-хромосома (адам)
Хр.1-хромосома (адам)[1]
1-хромосома (адам)
TRIM45 үшін геномдық орналасу
TRIM45 үшін геномдық орналасу
Топ1p13.1Бастау117,111,060 bp[1]
Соңы117,122,587 bp[1]
Ортологтар
ТүрлерАдамТышқан
Энтрез
Ансамбль
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_001145635
NM_025188

NM_001165952
NM_001165953
NM_194343

RefSeq (ақуыз)

NP_001139107
NP_079464

NP_001159424
NP_001159425
NP_919324

Орналасқан жері (UCSC)Chr 1: 117.11 - 117.12 MbChr 3: 100.92 - 100.94 Mb
PubMed іздеу[3][4]
Уикидеректер
Адамды қарау / өңдеуТінтуірді қарау / өңдеу

45 бар үш жақты мотив, TRIM45 деп те аталады, ол адам ген.[5]

Бұл ген. Мүшесін кодтайды үш жақты мотивтер отбасы. Кодталған ақуыз [транскрипциялық репрессор ретінде жұмыс істей алады митогенмен белсендірілген протеинкиназа жол. Балама түрде транскрипт нұсқалары сипатталған.[5]

Үлгілі организмдер

Үлгілі организмдер TRIM45 функциясын зерттеу кезінде қолданылған. Шартты тінтуір сызық, деп аталады 45tm1a (KOMP) Wtsi[11][12] бөлігі ретінде құрылды Халықаралық нокаутты тышқан консорциумы бағдарлама - қызығушылық танытқан ғалымдарға аурудың жануарлар моделін құру және тарату бойынша жоғары өнімді мутагенез жобасы.[13][14][15]

Еркек пен аналық жануарлар стандартталған түрде өтті фенотиптік экран жоюдың әсерін анықтау.[9][16] Жиырма алты сынақ өткізілді мутант тышқандар және үш маңызды ауытқулар байқалды.[9] Жоқ гомозиготалы мутант эмбриондар жүктілік кезінде анықталды, сондықтан ешқайсысы тірі қалмады емшектен шығару. Қалған сынақтар өткізілді гетерозиготалы мутантты ересек тышқандар; еркектерде айналымдағы магний деңгейі жоғарылаған, ал екі жыныстағы жануарлардың сүйек күші жоғарылаған.[9]

Әдебиеттер тізімі

  1. ^ а б c GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000134253 - Ансамбль, Мамыр 2017
  2. ^ а б c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000033233 - Ансамбль, Мамыр 2017
  3. ^ «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
  4. ^ «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
  5. ^ а б «Entrez Gene: 45-тен тұратын үш жақты мотив». Алынған 2011-08-30.
  6. ^ «Trim45 үшін клиникалық химия деректері». Wellcome Trust Sanger институты.
  7. ^ "Сальмонелла Trim45 инфекциясы туралы ақпарат «. Wellcome Trust Sanger институты.
  8. ^ "Цитробактер Trim45 инфекциясы туралы ақпарат «. Wellcome Trust Sanger институты.
  9. ^ а б c г. Гердин А.К. (2010). «Sanger Mouse генетикасы бағдарламасы: нокаут тышқандарының жоғары сипаттамасы». Acta Ophthalmologica. 88: 925–7. дои:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x.
  10. ^ Тышқанның ресурстар порталы, Wellcome Trust Sanger институты.
  11. ^ «Халықаралық нокаутты тышқан консорциумы».
  12. ^ «Тышқан геномының информатикасы».
  13. ^ Skarnes WC, Rosen B, West AP, Koutsourakis M, Bushell W, Iyer V, Mujica AO, Thomas M, Harrow J, Cox T, Jackson D, Severin J, Biggs P, Fu J, Nefedov M, de Jong PJ, Стюарт AF, Bradley A (маусым 2011). «Тышқанның генінің қызметін геномды зерттеу үшін шартты нокаут ресурсы». Табиғат. 474 (7351): 337–42. дои:10.1038 / табиғат10163. PMC  3572410. PMID  21677750.
  14. ^ Dolgin E (маусым 2011). «Тышқан кітапханасы нокаутқа айналды». Табиғат. 474 (7351): 262–3. дои:10.1038 / 474262a. PMID  21677718.
  15. ^ Коллинз Ф.С., Россант Дж, Вурст В (қаңтар 2007). «Барлық себептер бойынша тышқан». Ұяшық. 128 (1): 9–13. дои:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID  17218247.
  16. ^ Ван дер Вейден Л, Уайт Дж., Адамс Ди-джей, Логан DW (2011). «Тышқанның генетикасына арналған құрал: функциясы мен механизмін анықтау». Геном биологиясы. 12 (6): 224. дои:10.1186 / gb-2011-12-6-224. PMC  3218837. PMID  21722353.

Әрі қарай оқу