TRIM31 - TRIM31

TRIM31
Қол жетімді құрылымдар
PDB	Ортологиялық іздеу: PDBe RCSB
PDB идентификатор кодтарының тізімі
	2YSJ, 2YSL
Идентификаторлар
Бүркеншік аттар	TRIM31, C6orf13, HCG1, HCGI, RNF, құрамында 31 бар үш жақты мотив
Сыртқы жеке куәліктер	OMIM: 609316 MGI: 2385051 HomoloGene: 17137 Ген-карталар: TRIM31
Геннің орналасуы (адам)
Хр.	6-хромосома (адам)
Соңы	30,113,090 bp
Геннің орналасуы (тышқан)
Хр.	17-хромосома (тышқан)
Соңы	36,910,214 bp
РНҚ экспрессиясы өрнек
	; ; ; ;
	Қосымша сілтеме өрнегі туралы деректер
Гендік онтология
Молекулалық функция	• мырыш ионымен байланыстыру; • GO: 0001948 ақуыздармен байланысуы; • металл ионымен байланыстыру; • трансфераза белсенділігі;
Ұялы компонент	• цитоплазма; • цитозол; • жасушаішілік; • митохондрия;
Биологиялық процесс	• ДНҚ байланыстыратын транскрипция факторы белсенділігінің реттілігі; • ақуыздың таралуы; • интерферон-гамма-дабыл сигнализациясы; • вирустық транскрипцияның теріс реттелуі; • туа біткен иммундық жүйе; • қабылдаушы жасушаға вирустық енудің теріс реттелуі; • қабылдаушы жасушадан вирустық бөлінуді реттеу;
	Дереккөздер:Амиго / QuickGO
Ортологтар
	11074
	224762
ENSG00000223531; ENSG00000137397; ENSG00000233573; ENSG00000224168; ENSG00000225130;
	ENSG00000226402; ENSG00000224542; ENSG00000204616
	ENSMUSG00000058063
	Q9BZY9; Q2L6J1
	Q8R0K2
	NM_007028
	NM_146077
	NP_008959; NP_008959.3
	NP_666189
	Уикидеректер
Адамды қарау / өңдеу	Тінтуірді қарау / өңдеу

Үш жақты мотивті қамтитын ақуыз 31 Бұл ақуыз адамдарда кодталған TRIM31 ген.^[5]^[6]

Бұл генмен кодталған ақуыз үш жақты мотив (TRIM) отбасының мүшесі болып табылады. TRIM мотивінде үш мырыш байланыстыратын домендер, RING, 1 типті B қорап және 2 типті қорап, және ширатылған катушкалар аймағы бар. Ақуыз цитоплазмаға да, ядроға да локализацияланады. Оның функциясы анықталған жоқ.^[6]

Өзара әрекеттесу

TRIM31 көрсетілген өзара әрекеттесу бірге TRIM23.^[5]

Пайдаланылған әдебиеттер

^ ^а ^б ^c ENSG00000137397, ENSG00000233573, ENSG00000224168, ENSG00000225130, ENSG00000226402, ENSG00000224542, ENSG00000204616 GRCh38: Ensembl релизі 89: ENSG00000223531, ENSG00000137397, ENSG00000233573, ENSG00000224168, ENSG00000225130, ENSG00000226402, ENSG00000224542, ENSG00000204616 - Ансамбль, Мамыр 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000058063 - Ансамбль, Мамыр 2017
^ «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
^ «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
^ ^а ^б Reymond A, Meroni G, Fantozzi A, Merla G, Cairo S, Luzi L, Riganelli D, Zanaria E, Messali S, Cainarca S, Guffanti A, Minucci S, Pelicci PG, Ballabio A (мамыр 2001). «Үштік мотивтер отбасы ұяшықтардың бөлімдерін анықтайды». EMBO J. 20 (9): 2140–51. дои:10.1093 / emboj / 20.9.2140. PMC 125245. PMID 11331580.
^ ^а ^б «Entrez Gene: TRIM31 үш жақты мотиві бар 31».

Әрі қарай оқу

Маруяма К, Сугано С (1994). «Олиго-жабу: эукариоттық мРНҚ-ның қақпақ құрылымын олигорибонуклеотидтермен ауыстырудың қарапайым әдісі». Джин. 138 (1–2): 171–4. дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
el Kahloun A, Chauvel B, Mauvieux V және т.б. (1993). «HLA-A локусы айналасындағы жеті геннің локализациясы». Хум. Мол. Генет. 2 (1): 55–60. дои:10.1093 / hmg / 2.1.55. PMID 8490624.
Сузуки Ю, Йошитомо-Накагава К, Маруяма К және т.б. (1997). «Толық көлемде байытылған және 5-деңгеймен байытылған cDNA кітапханасының құрылысы және сипаттамасы». Джин. 200 (1–2): 149–56. дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH және т.б. (2003). «Адам мен тышқанның 15000-нан астам толық ұзындықтағы кДНҚ тізбектерінің генерациясы және алғашқы талдауы». Proc. Натл. Акад. Ғылыми. АҚШ. 99 (26): 16899–903. дои:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Mungall AJ, Palmer SA, Sims SK, және т.б. (2003). «ДНҚ тізбегі және адамның 6-хромосомасын талдау». Табиғат. 425 (6960): 805–11. Бибкод:2003 ж.45..805M. дои:10.1038 / табиғат02055. PMID 14574404.
Hillman RT, Green RE, Brenner SE (2005). «РНҚ қадағалауының бағаланбаған рөлі». Геном Биол. 5 (2): R8. дои:10.1186 / gb-2004-5-2-r8. PMC 395752. PMID 14759258.
Герхард Д.С., Вагнер Л, Фейнголд Е.А. және т.б. (2004). «NIH толық ұзындықтағы cDNA жобасының мәртебесі, сапасы және кеңеюі: Сүтқоректілер гендерінің коллекциясы (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121-7. дои:10.1101 / гр.2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Rual JF, Венкатесан К, Хао Т және т.б. (2005). «Адамның протеин-протеинмен өзара әрекеттесу желісінің протеома-масштабты картасына қарай». Табиғат. 437 (7062): 1173–8. Бибкод:2005 ж.437.1173R. дои:10.1038 / табиғат04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Ох Дж.Х., Янг Дж.О., Хан Ю, және т.б. (2006). «Адамның асқазан қатерлі ісігін транскриптоматикалық талдау». Мамм. Геном. 16 (12): 942–54. дои:10.1007 / s00335-005-0075-2. PMID 16341674. S2CID 69278.
Шиина Т, Ота М, Шимизу С және т.б. (2006). «Приматтардағы негізгі гистосәйкестік кешенінің І класс гендерінің жылдам эволюциясы автокөлікпен жүрудің әртүрлілігі арқылы адамдарда жаңа аллельдер тудырады». Генетика. 173 (3): 1555–70. дои:10.1534 / генетика.106.057034. PMC 1526686. PMID 16702430.

Бұл ақуыз - қатысты мақала а бұта. Сіз Уикипедияға көмектесе аласыз оны кеңейту.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ENSG00000137397, ENSG00000233573, ENSG00000224168, ENSG00000225130, ENSG00000226402, ENSG00000224542, ENSG00000204616 GRCh38: Ensembl релизі 89: ENSG00000223531, ENSG00000137397, ENSG00000233573, ENSG00000224168, ENSG00000225130, ENSG00000226402, ENSG00000224542, ENSG00000204616 - Ансамбль, Мамыр 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000058063 - Ансамбль, Мамыр 2017

[3] «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.

[4] «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.

[pmid11331580-5] а ^б Reymond A, Meroni G, Fantozzi A, Merla G, Cairo S, Luzi L, Riganelli D, Zanaria E, Messali S, Cainarca S, Guffanti A, Minucci S, Pelicci PG, Ballabio A (мамыр 2001). «Үштік мотивтер отбасы ұяшықтардың бөлімдерін анықтайды». EMBO J. 20 (9): 2140–51. дои:10.1093 / emboj / 20.9.2140. PMC 125245. PMID 11331580.

[entrez-6] а ^б «Entrez Gene: TRIM31 үш жақты мотиві бар 31».

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]