Адам геномындағы құрылымдық вариация - Википедия - Structural variation in the human genome

Құрылымдық вариация

Құрылымдық вариация ішінде адам геномы оперативті түрде геномдық өзгерістер ретінде анықталады, олар жеке адамдар арасында әр түрлі болады ДНҚ сегменттері негізі 1 килодан асатын (кб), болуы да мүмкін микроскопиялық немесе субмикроскопиялық.[1] Бұл анықтама оларды өлшемі 1 кб-тан аспайтын кішігірім нұсқалардан ажыратады, мысалы қысқа жою, кірістіру және жалғыз нуклеотид нұсқалары.

Адамдар өте күрделі және күрделі геномға ие, ол уақыт өте келе қалыптасып, өзгеріп отырды эволюция. Адам геномындағы ДНҚ-дәйектілігінің 99,9% -ы бүкіл әлемдегі адамдар арасында сақталған, бірақ кейбір вариациялары бар.[1] Бір нуклеотидті полиморфизмдер (SNPs) адамдарда генетикалық өзгеріске ең үлкен үлес қосушы болып саналады, өйткені олар өте көп және оңай анықталады.[2] Адамдар арасында кем дегенде 10 миллион SNP бар деп есептеледі, бірақ генетикалық варианттардың басқа да көптеген түрлері бар және олар әр түрлі масштабта кездеседі.[1] Адамдар популяциясындағы геномдар арасындағы вариация бір нуклеотидті полиморфизмдерден драмалық өзгерістерге дейін адамның кариотипі.[3]

Адамның генетикалық вариациясы адам популяциясындағы даралар арасындағы фенотиптік айырмашылықтарға жауап береді. Әр түрлі түрлері бар генетикалық вариация және оның маңызын жақсы түсіну үшін жан-жақты зерттеледі. Бұл зерттеулер генетикалық нұсқаларды белгілі бір деңгейге байланыстыратын ашылуларға әкеледі фенотиптер олардың салдары ауру. Алдымен, бұрын ДНҚ секвенциясы технологиялар, вариация тек микроскопиялық масштабта зерттеліп, бақыланды. Бұл ауқымда тек бақылаулар айырмашылықтар болды хромосома нөмірі және хромосома құрылымы. Бұл өлшемдер шамамен 3 Мб немесе одан үлкен нұсқалар микроскопиялық құрылымдық нұсқалар болып саналады.[1] Бұл шкала микроскоптың көмегімен бейнеленетін және оны қосатындай үлкен анеуплоидиялар, гетероморфизмдер және хромосомалық қайта құрылымдау.[1] ДНҚ секвенциясы енгізілгенде, ол SNP және минисателлиттерді қоса алғанда кішігірім және керемет реттік вариацияларды табуға есік ашты. Бұған өлшемі 1 кб-тан аспайтын кішігірім инверсиялар, көшірмелер, кірістіру және жою жатады.[1]Адам геномы жобасында адамның геномы сәтті дәйектелді, бұл генетикалық вариацияны салыстыру үшін анықтамалық адам геномын ұсынды. Секвенирлеу технологиялары мен анықтамалық геномды жетілдіре отырып, 1 кб-тан үлкен, бірақ микроскопиялық варианттардан кіші бірнеше әр түрлі өлшемдердің вариациялары көбірек табылды. Бұл өлшемдер шамамен 1 кб-тан 3 Мб-қа дейінгі нұсқалар субмикроскопиялық құрылымдық нұсқалар болып саналады.[1] Жақында ашылған құрылымдық нұсқалар фенотиптік әртүрлілік пен ауруға бейімділікте өте маңызды рөл атқарады деп саналады.

Құрылымдық варианттардың түрлері

Құрылымдық вариация фенотиптік әртүрлілікке ықпал ететін адамның генетикалық вариациясының маңызды түрі болып табылады.[2] Микроскопиялық және субмикроскопиялық құрылымдық нұсқалары бар, олар жою, қайталану және көшірме санының үлкен нұсқаларын, сонымен қатар кірістіру, инверсия және транслокацияны қамтиды.[1] Бұл адам геномындағы құрылымдық варианттардың әр түрлі типтері және олар бір-бірінен айтарлықтай ерекшеленеді. Транслокация - бұл а хромосомалық қайта құру, хромосоманың бір бөлігі позициясын өзгертетін, бірақ бүкіл ДНҚ құрамындағы өзгеріссіз, хромосомалар аралық немесе ішілік деңгейде.[1] ДНҚ-ның 1 кб-тан үлкен және гаплоидты геномға екі немесе одан да көп даналарда кездесетін бөлімі, әр түрлі көшірмелері бірдей дәйектіліктің 90% -дан көп бөліседі, сегменттік қайталанулар немесе төмен көшірмелі қайталаулар деп саналады.[1] Бұл адам геномында белгілі құрылымдық варианттардың бірнеше түрінің тек бірнешеуі. Басқа сияқты құрылымдық варианттардың осы әртүрлі формаларын бейнелейтін кесте 1 суретте көрсетілген.

Инверсия - бұл анықтамалық геноммен салыстырғанда бағыты бойынша кері болатын хромосомадағы ДНҚ бөлімі.[1] Инверсияны анықтайтын көптеген зерттеулер болды, өйткені олар көптеген ауруларда үлкен рөл атқаратындығы анықталды. Зерттеу көрсеткендей, оның қырық пайызы гемофилия А пациенттерде белгілі бір аймақтың өлшемі төрт жүз кб болатын 8 факторлы ген инверсиясы болды.[4] Инверсияның үзіліс нүктесі сегменттік қайталанудың айналасында болды, бұл көптеген басқа инверсиялық оқиғаларда байқалады.[4]

Әрбір құрылымдық нұсқа қалай жасалатынын толығымен түсіну қиын. Хромосомада қайталанатын тізбектер аллельді емес гомологиялық рекомбинация ықтималдығын арттыратыны бұрын белгілі болған.[5] Бұл қайталанатын дәйектілік хромосомалардың жойылуын, қосарлануын, инверсиясын және инверсиялы қайталануын тудыруы мүмкін. Бұл механизмнің жүйелілік қайталануынан пайда болатын өнімі 2-суретте көрсетілген. Бұл бойынша зерттеу жүргізілді иіс сезу рецепторы гендік кластерлер, егер олар 8р қалыпты қайта құру және қайталанған инверттелген дәйектіліктің арасында байланыс бар ма деп сұрады. Зерттеушілер хромосомалардың қайта құрылуы шын мәнінде 8р-қайталаулардағы гомологиялық рекомбинацияның әсерінен болғанын байқады. Сондықтан олар хромосомалық деңгейдегі қайта құрылымдау үшін қолданылатын субстрат иіс сезу рецепторларының гендері болып табылады деген қорытындыға келді.[5] Бұл жаңалық инверттелген телнұсқалардың құрылымдық нұсқалардың дамуына әсер ететін рөлін ашты. Генетикалық варианттардың осы түрінің дамуын жақсы түсіну үшін құрылымдық нұсқалардың жасалу механизмдері мен тәсілдері маңызды.

Құрылымдық вариация механизмі

Көшірме нөмірінің өзгеруі

Көшірме санының нұсқалары анықтамалық геноммен салыстыру кезінде ауыспалы көшірме санында болатын және мөлшері 1 кб-тан асатын ДНҚ бөлімдері ретінде анықталады.[1] Бұл анықтама кең, ол жою, қайталану және көшірме нөмірінің үлкен нұсқаларын қамтиды. Егер көшірме санының нұсқасы халықтың 1% немесе одан көп бөлігінде болса, онда ол көшірме-сандық полиморфизм болып саналады.[1] Адам геномындағы көшірме санының ғаламдық өзгеруі туралы зерттеу жүргізілді, ол адам геномындағы көшірме санының нұсқаларының сипаттамаларына күмән келтірді. Адам геномындағы көшірмелер санының өзгеруі маңызды екендігі белгілі болды, бірақ осы уақытта ол әлі толық зерттелмеген болатын. Адам геномының вариациясының өзі әр түрлі, өйткені көптеген түрлері бар, оның ішінде инверсия, қайталану, SNP және басқа формалар бар. Олар SNP массивтері сияқты технологиялармен көшірмелер санының варианттарын алуан түрлі популяциялардан 270 адамның геномын зерттеді.[6] Олардың нәтижелері көрсеткендей, көшірме нөмірлерінің көптеген нұсқаларында байланыстың тепе-теңдігінің нақты орналасуы бар, бұл әр түрлі популяцияларда көшірме нөмірінің өзгеруін анықтады.[6] Зерттеу нәтижесінде геномның он екі пайызында CNVR бар деген қорытындыға келді. Олардың әрбір геномдағы ДНҚ-ның бір нуклеотидті полиморфизмге қарағанда көбірек қатысатындығы анықталды.[6] Бұл керемет жаңалық болды, өйткені адам геномындағы жалғыз нуклеотидті полиморфизм саны жағынан ең көп екендігі белгілі болды. Көлемі бойынша, бірақ құрылымдық нұсқалардың бұл түрі адам геномында үлкенірек болатындығы анықталды.

Көшірме нөмірінің нұсқаларын зерттеу жалғасуда, өйткені бірнеше зерттеулер олардың болу тереңдігі мен олардың маңыздылығын анықтай берді. Көшірме санының нұсқаларын ұйымдастырудың рөліне күмән келтірген және олардың қайталану түрі қандай екендігі туралы зерттеу жүргізілді. Көшірме санының өзгеруі адамның көптеген ауруларында үлкен рөл атқаратыны белгілі болды, бірақ сол кезде бұл қайталануларды кең ауқымды зерттеу жүргізілмеген болатын. Олар бүкіл геномдық секвенцияны және келесі буынның секвенциясын жасай отырып, 119 белгілі CNV-ді қамтыған 112 адамнан 130 үзіліс нүктелерін дәйектеу туралы шешім қабылдады.[7] Тандемдік қайталанулар CNV-дің 83% құрайды, ал 8,4% - үш рет, 4,2% - іргелес қайталанулар, 2,5% - инерционалды транслокациялар, ал 1,7% - басқа күрделі қайта құрулар.[7] Көшірме санының нұсқалары негізінен тандемдік қайталанулар болды, бұл оны адам геномындағы көшірме нөмірінің ең кең таралған түріне айналдырды, бұл популяцияны зерттеу нәтижелері бойынша, құрылымдық нұсқалардың қалыптасуының механикалық жағында көбірек қажет болды. Өте қызықты және сирек кездесетін механизмдерге бағытталған зерттеу болды патогенді нөмірдің нұсқаларын көшіру. Зерттеушілер көшірме санының өзгеруі геномның құрылымдық вариациясында маңызды екенін және адамның генетикалық ауруына ықпал ететіндігін білді, бірақ көптеген жаңа және бірнеше патогендік нұсқалардың нақты механизмдері белгілі болған жоқ. Олар сирек кездесетін патогендік көшірмелер санының көптеген нұсқаларының үзілу аймақтарын ретке келтіру үшін секвенирлеу технологияларын қолданды, бұл көшірме нөмірлері нұсқаларының ең үлкен және терең талдауы болды. Олар геномдық архитектуралық ерекшеліктердің адам геномында өте маңызды екенін және олар тоқтау нүктелерінің сексен бір пайызымен байланысты екенін көрді.[8] Олар сирек кездесетін және патогенді болатын тандемдік дупликациялар мен микродезелсиялар адам геномында кездейсоқ пайда болмайды деген қорытындыға келді. Керісінше, олар әртүрлі геномдық архитектуралық ерекшеліктерден туындайды.[8] Бұл өте қызықты нәтиже болды, бұл геномның белгілі бір архитектуралық ерекшеліктері физикалық тұрғыдан сирек кездесетін және патогенді құрылымдық нұсқаларын жасауға мүмкіндік берді.

Құрылымдық вариацияны эволюцияға бейімделу үшін геномды модификациялау жолы ретінде қарастыруға болады. Ата-баба рационына және адамның амилаза генінің көшірмесі эволюциясына зерттеу жүргізілді. Крахмал тұтыну ауылшаруашылық қоғамдарының дамуымен бірге адам диетасының үлкен құрамдас бөлігі болды. Амилаза - бұл крахмалды ыдырататын фермент және оның көшірме саны әр түрлі.[9] Бұл бақылаулар әр түрлі популяциялар арасындағы крахмалды тұтынудағы айырмашылықтар амилаза ферментіне табиғи сұрыптау қысымын тудырды ма, жоқ па деген сұраққа алып келді. Олар әр түрлі популяциялардан шыққан сілекейдегі амилаза протеинінің экспрессиясының айырмашылықтарын тексеріп, олардың экспрессиясын тиісті геномдарындағы көшірме санымен салыстырды.[9] Содан кейін олар әр түрлі популяциялардың крахмал тұтынуын олардың амилаза генінің көшірме санымен салыстырды. Олар геномында амилазаның көшірмелік нөмірі жоғары адамдардан шыққан сілекейде амилаза протеинінің көбірек экспрессиясы бар екенін, сонымен қатар крахмал диетасы жоғары адамдар мен амилаза гендерінің көшірмесі үлкен адамдар тобы арасында байланыс бар екенін анықтады.[9] Бұл зерттеу қызықты нәтижелерге әкелді, өйткені құрылымдық вариация уақыт өте келе оның амилаз көшірмесін көбейту арқылы адам популяциясының эволюциясына қатысуын дәлелдеді.

1000 геном жобасы адам геномының ДНҚ тізбегін сәтті шығара алды. Олар талдау үшін көптеген популяциялардың дәйектілік деректерін, сондай-ақ салыстыру және болашақ зерттеулер үшін адамның геномын ұсынды. Бір зерттеу осы геномның барлық геномдар тізбегінің деректерінен геномдардың құрылымдық вариациялық айырмашылықтарына күмән келтіру үшін пайдаланды. Адамдардың аурулары қайталану мен жоюдан зардап шегетіні және көшірме нөмірлерін талдау жиі кездесетіні белгілі болды, бірақ көшірмелер санының көп мультикальді нұсқалары (mCNV) жақсы зерттелмеген. Зерттеушілер өз деректерін 1000 геном жобасынан алды және үлкен mCNV табу үшін тізбектелген популяциялардың 849 әр түрлі геномдарын талдады.[10] Олардың талдауларынан олар mCNV гендік дозада басқа құрылымдық нұсқалармен салыстырғанда генетикалық әртүрлілікті тудыратындығын және гендердің экспрессиясының өзгеруі mCNV-дер құрған гендердің дозалық әртүрлілігімен жасалатынын анықтады.[10] Зерттеу құрылымдық варианттардың, әсіресе mCNV-дің гендердің дозалануында үлкен маңызы бар екенін атап өтті, бұл гендердің өзгермелі экспрессиясына және халықтың фенотиптік әртүрлілігіне әкеледі.

Аурудың салдары

Шарко-Мари тісі (CMT) ауруы

Адам геномында байқалған, бірақ ешқандай айқын фенотиптік әсерге әкеп соқтырмаған бірнеше құрылымдық нұсқалар бар.[1] Гендік дозада белгілі бір рөл атқаратын кейбіреулер бар, олар генетикалық ауруларға немесе нақты фенотиптерге әкелуі мүмкін. Құрылымдық нұсқалар геннің экспрессиясына тікелей әсер етуі мүмкін, мысалы, көшірме нөмірінің нұсқаларында немесе жанама түрде позиция эффектілері арқылы.[1] Бұл әсерлер ауруға бейімділікке айтарлықтай әсер етуі мүмкін. ДНҚ-ны тұқым қуалайтын қайта құрудың аутосомды-доминантты ауруы болып саналған алғашқы гендік дозалау әсері Шарко-Мари тісі (CMT) ауруы болды. CMT-мен табылған ассоциациялардың көпшілігі PMP22 генінде 17p11.2-p12-де 1,5 Mb тандемнің қайталануымен болды.[11] Құрылымдық вариацияның ұсынылған механизмі 2-суретте көрсетілген. Жеке адамда қалыпты геннің үш көшірмесі болған кезде аурудың фенотипі пайда болады.[11] Егер жеке адамда PMP22 генінің тек бір данасы болса, екінші жағынан, нәтиже клиникалық тұрғыдан әртүрлі тұқым қуалаушылық нейропатиямен басталды, параличке жауап берді.[11] Гендердің дозасындағы айырмашылықтар әртүрлі фенотиптерді тудырды, бұл құрылымдық вариацияның фенотипке және ауруға бейімділігінде маңызды рөлін ашты.

АИТВ-ға бейімділік

Құрылымдық вариациялық зерттеулер олардың геномында мүмкін болатын рөлдері мен әсерлерін анықтауға байланысты барған сайын танымал бола бастады. Көшірме сандарының вариациясы құрылымдық вариацияның өте маңызды түрі болып табылады және жан-жақты зерттелген. CCL3L1 генінің әсері туралы зерттеу АҚТҚ -1/ЖИТС CCL3L1 генінің көшірме нөмірі адамның ВИЧ-1 / ЖИТС-ке бейімділігіне әсер еткен болса, сезімталдығы тексерілді. Олар CCL3L1 көшірмесінің нөмірі бойынша бірнеше әр түрлі адамдар мен популяциялардан іріктеме алып, оны ВИЧ-ке шалдығу қаупімен салыстырды. Олар CCL3L1 көшірмесінің жоғары мөлшері мен АИТВ-ға және ЖҚТБ-ға бейімділіктің арасында байланыс бар екенін анықтады, өйткені АҚТҚ-ға бейім адамдарда CCL3L1 көшірмесінің саны төмен болды.[12] Көшірме санындағы бұл айырмашылық осы бірлестікке байланысты АИТВ-ға бейімділікте маңызды рөл атқаратыны көрсетілген. NPY4R генінің құрылымдық ауытқуы семіздік кезінде маңызды болғанын тексерген адамның семіздік патогенезіне бағытталған тағы бір зерттеу. Зерттеулер бұған дейін 10q11.22 CNV-дің семіздікпен байланысы бар екенін және бірнеше көшірме нөмірінің семіздікпен байланысты екенін көрсетті. Олардың CNV анализі NPY4R генінің пациент популяциясында 10q11.22 CNV жоғалту жиілігінің әлдеқайда жоғары екенін анықтады.[13] Екінші жағынан, бақыланатын халық сол аймақта CNV-ден көбірек пайда көрді. Бұл зерттеушілерді NPY4R гені оның семіздік патогенезінде оның көшірме санының өзгеруіне байланысты маңызды рөл атқарды деген қорытындыға келді.[13] Көшірме санының өзгеруіне және басқа құрылымдық нұсқаларына қатысты зерттеулер құрылымдық нұсқалардың адам геномында атқаратын маңызды рөлдеріне жаңа түсініктер әкелді.

Шизофрения

Шизофренияның дамуына ықпал ететін факторлар жан-жақты зерттелген. Шизофренияның дамуына жауап беретін механизм мен гендер туралы жақында зерттеу жүргізілді. Бұрын MHC локусындағы вариация шизофренияның дамуымен байланысты екендігі көрсетілген болатын. Бұл зерттеу ассоциацияның ішінара комплемент компоненті 4 (С4) гендерінен туындайтынын, сондықтан С4 гендерінің аллельді нұсқалары шизофренияның дамуына ықпал ететіндігін анықтады.[14] Байланыстың тепе-теңдігі зерттеушілерге SNP гаплотиптеріне қарап жеке тұлғаның қандай C4 құрылымдық нұсқасын анықтауға көмектесті. SNP гаплотиптері мен С4 аллельдері бір-бірімен байланысты болды, сондықтан олар өзара тепе-теңдікте болды, яғни олар бірге бөлінді.[14] Бір құрылымдық C4 нұсқасы көптеген әр түрлі SNP гаплотиптерімен байланысты болды, бірақ әр түрлі SNP гаплотиптерімен, тек бір C4 құрылымдық нұсқасымен байланысты болды.[14] Бұл зерттеушілерге SNP гаплотипіне қарап, C4 құрылымдық нұсқасын оңай анықтауға мүмкіндік беретін байланыстың тепе-теңсіздігіне байланысты болды. Олардың деректері мұны ұсынды, өйткені нәтижелер көрсеткендей, C4 құрылымдық нұсқалары C4A ақуызын әр түрлі деңгейде көрсетеді және жоғары C4A ақуыз өрнектеріндегі бұл айырмашылық шизофрения дамуының жоғарылауымен байланысты болды.[14] Бір геннің әртүрлі құрылымдық вариантты аллельдерінің әртүрлі фенотиптері мен ауруға бейімділігі көрсетілген. Бұл зерттеулер құрылымдық вариацияның адам геномына қатысуы мен маңыздылығын көрсетеді. Оның маңыздылығы фенотиптік әртүрлілікке және ауруға бейімділікке қосқан үлесімен көрінеді.

Болашақ бағыттар

Адам геномының құрылымдық вариациясын жақсы түсіну үшін көптеген зерттеулер жүргізілді. Зерттеу барысында үлкен жетістіктер болды, бірақ оның мәні әлі күнге дейін толық түсінілмеген. Осы тақырыпты әрі қарай зерттеуді сұрайтын бірнеше сұрақтар әлі жауапсыз қалды. Ағымдағы зерттеулер, әдетте, геномның «бірегей» бағыттарына бағытталған, бірақ құрылымдық нұсқалардың фенотиптік әсерін өте қайталанатын, қайталанатын және күрделі геномдық аудандарда анықтай алмайды.[15] Мұны бүгінгі күннің геномдық технологиясымен зерттеу өте қиын, бірақ бұл жүйелеу технологиясының болашақ дамуына байланысты өзгеруі мүмкін. Құрылымдық нұсқалардың фенотиптік әсерін жақсы түсіну үшін нақты ассоциацияларды құру үшін генотиптер мен фенотиптердің жеке мәліметтер базасы жасалуы керек. Даму бұзылыстарын ашу, UK10K және цитогеномдық массивтердің халықаралық стандарттары консорциумы сияқты үлкен жобалар зерттеушілерге осы зерттеулерді жеңілдетіп жүргізу үшін мәліметтер базасын құруға жол ашты.[15]

Сонымен қатар, белгілі бір аурулары бар индукцияланған плурипотентті дің жасушаларын жасау технологиясында өсу мен даму болды. Бұл транслокация, қайталану және инверсия сияқты құрылымдық нұсқаларды тудыратын ауруды қалпына келтіруге арналған тиісті модель жүйелерін ұсынады.[15] Болашақта технологиялар саласындағы жетістіктер мен мәліметтер базасының үлкен күш-жігері сапалы зерттеулер жүргізуге және адам геномының құрылымдық өзгеруін анағұрлым жақсы түсінуге көмектеседі.

Әдебиеттер тізімі

  1. ^ а б в г. e f ж сағ мен j к л м n o Фейк, Л .; Карсон, А.Р .; Schere, S.W. (2006). «Адам геномындағы құрылымдық вариация». Табиғи шолулар Генетика. 7 (2): 85–97. дои:10.1038 / nrg1767. PMID  16418744.
  2. ^ а б Нгуен, Д.Қ .; Уэббер, С .; Понтинг, C.P. (2006). «Адамның көшірмелік-сандық нұсқалары бойынша іріктеу қателігі». PLOS генетикасы. 2: e20. CiteSeerX  10.1.1.276.7715. дои:10.1371 / journal.pgen.0020020.
  3. ^ Кидд, Дж .; Купер, Г.М .; Донахью, В.Ф .; Хейден, Х.С .; Сампас, Н .; Грэйвс Т .; Хансен, Н .; Шой, Б .; Алкан, С .; Антоначчи, Ф .; Хауген, Э .; Зерр, Т ​​.; Ямада, Н.А .; Цанг, П .; Ньюман, Т.Л .; Тузун, Е .; Ченг, З .; Эблинг, Х.М .; Туснеем, Н .; Дэвид, Р .; Джилетт, В .; Фелпс, К.А .; Уивер, М .; Саранга, Д .; Бренд, А .; Дао, В .; Густафсон, Е .; МакКернан, К .; Чен, Л .; Малиг М .; Смит, Дж .; Корн, Дж.М .; Маккарролл, С.А .; Альтшулер, Д.А .; Пейфер, Д.А .; Доршнер, М .; Стаматояннопулос, Дж.; Шварц, Д .; Никерсон, Д.А .; Мулликин, Дж .; Уилсон, Р.К .; Брюн, Л .; Олсон, М.В .; Кауль, Р .; Смит, Д.Р .; Эйхлер, Э.Е. (2008). «Адамның сегіз геномынан құрылымдық вариацияның картаға түсуі және реттілігі». Табиғат. 453 (7191): 56–64. дои:10.1038 / табиғат06862. PMC  2424287. PMID  18451855.
  4. ^ а б Лакич, Д .; Kazazian, H.H .; Антонаракис, С.Е .; Gitschier, J. (1993). «VIII фактор генін бұзатын инверсиялар ауыр гемофилияның А себебі болып табылады». Нат. Генет. 5 (3): 236–241. дои:10.1038 / ng1193-236. PMID  8275087.
  5. ^ а б Джилио, С .; Броман, К.В .; Мацумото, Н .; Кальвари, V .; Джимелли, Г .; Нейман, Т .; Охаси, Х .; Вуллер, Л .; Ларица, Д .; Джорда, Р .; Вебер, Дж .; Ледбеттер, Д.Х .; Zuffardi, O. (2001). «Иіс сезу рецепторлары-гендер кластері, геномды-инверсиялық полиморфизмдер және хромосомалардың кең таралуы». Американдық генетика журналы. 68 (4): 874–83. дои:10.1086/319506. PMC  1275641. PMID  11231899.
  6. ^ а б в Редон, Р .; Исикава, С .; Фитч, К.Р .; Фейк, Л .; Перри, Г.Х .; Эндрюс, Т.Д .; Фиглер, Х .; Шаперо, М.Х .; Карсон, А.Р .; Чен, В .; Чо, Э.К .; Даллер, С .; Фриман, Дж .; Гонсалес, Дж .; Гратакос М .; Хуанг Дж .; Калайцопулос, Д .; Комура, Д .; Макдональд, Дж .; Маршалл, К.Р .; Мэй, Р .; Монтгомери, Л .; Нишимура, К .; Окамура, К .; Шен, Ф .; Сомервилл, МДж .; Тчинда, Дж .; Вальсезия, А .; Вудворк, С .; Янг, Ф .; Чжан, Дж .; Зерджал, Т .; Чжан, Дж .; Арменгол, Л .; Конрад, Д.Ф .; Эстивилл, Х .; Тайлер-Смит, С .; Картер, Н.П .; Абуратани, Х .; Ли, С .; Джонс, К.В .; Schere, S.W .; Hurles, ME (2006). «Адам геномындағы көшірме санының ғаламдық вариациясы». Табиғат. 444 (7118): 444–454. дои:10.1038 / табиғат05329. PMC  2669898. PMID  17122850.
  7. ^ а б Ньюман, С .; Герметц, К.Е .; Вексельблатт, Б .; Радд, М.К. (2015). «CNV-дің қайталануының келесі буындық тізбегі көпшілігінің тандем екенін, ал кейбіреулері үзіліс нүктелерінде синтез гендерін тудыратынын анықтайды». Американдық генетика журналы. 96 (2): 208–220. дои:10.1016 / j.ajhg.2014.12.017. PMC  4320257. PMID  25640679.
  8. ^ а б Виссерс, Л.Е .; Бхатт, С.С .; Янсен, И.М .; Ся, З .; Лалани, С.Р .; Пфундт, Р .; Дервинска, К .; де Фриз, Б.Б .; Гилиссен, С .; Хойшен, А .; Нестерук, М .; Висниовицка-Ковальник, Б .; Смык М .; Бруннер, Х.Г .; Чеунг, С.В .; ван Кессель, А.Г .; Вельтман, Дж .; Станкевич, П. (2009). «Сирек патогендік микродеелсиялар және тандемнің қайталануы микромомологияның көмегімен жүзеге асырылады және жергілікті геномдық архитектурамен ынталандырылады». Адам молекулалық генетикасы. 18 (19): 3579–3593. дои:10.1093 / hmg / ddp306. PMID  19578123.
  9. ^ а б в Перри, Г.Х .; Домини, Н.Ж .; Claw, KG .; Ли, С .; Фиглер, Х .; Редон, Р .; Вернер, Дж .; Вилланеа, Ф.А .; Маунтин, Дж .; Мисра, Р .; Картер, Н.П .; Ли, С .; Stone, AC (2007). «Диета және адамның амилаза гендерінің көшірмесі санының өзгеруі эволюциясы». Табиғат генетикасы. 39 (10): 1256–60. дои:10.1038 / ng2123. PMC  2377015. PMID  17828263.
  10. ^ а б Handsaker, R.E .; Ван Дорен, V .; Берман, Дж .; Дженовезе, Г .; Кашин, С .; Боеттгер, Л.М .; Маккарролл, SA (2015). «Адамдардағы мультиэлликалық көшірмелердің үлкен вариациялары» (PDF). Табиғат генетикасы. 47 (3): 296–303. дои:10.1038 / нг.300. PMC  4405206. PMID  25621458.
  11. ^ а б в Лупски, Дж .; де Ока-Луна, Р.М .; Slaugenhaupt, S; Пентао, Л .; Гуззетта, V .; Траск, Б.Дж .; Саукедо-Карденас, О .; Баркер, Д.Ф .; Киллиан, Дж.М .; Гарсия, Калифорния .; Чакраварти, А .; Пател, П.И. (1991). «Шарко-Мари-Тіс ауруының 1А типіне байланысты ДНҚ-ның қайталануы». Ұяшық. 66 (2): 219–232. дои:10.1016/0092-8674(91)90613-4.
  12. ^ Гонсалес, Е .; Кулкарни, Х .; Боливар, Х .; Мангано, А .; Санчес, Р .; Катано, Г .; Ниббс, Р.Дж .; Фридман, Б.И .; Хинонес, М.П .; Бамшад, МДж .; Мерти, К.К .; Ровин, Б.Х.; Брэдли, В .; Кларк, Р.А .; Андерсон, С.А .; О'Коннелл, Дж .; Аган, Б.К .; Ахуджа, С.С.; Болонья, Р .; Сен, Л .; Долан, МДж .; Ахуджа, С.К. (2005). «CCL3L1 генінің құрамындағы сегменттік қайталанулардың АИТВ-1 / ЖИТС сезімталдығына әсері». Ғылым. 307 (5714): 1434–40. дои:10.1126 / ғылым.1101160. PMID  15637236.
  13. ^ а б Аертс, Е .; Беккер С .; Зегерс, Д .; Ван Хоренбек, К .; Масса, Г .; Веррикен, А .; Верхулст, С.Л .; Ван Гал, Л.Ф .; Ван Хул, В. (2016). «CNV анализі және мутациялық скрининг NPY4R генінің адамның семіздігіндегі маңызды рөлін көрсетеді». Семіздік. 24 (4): 970–6. дои:10.1002 / oby.21435.
  14. ^ а б в г. Секар, А .; Биалас, А.Р .; де Ривера, Х .; Дэвис, А .; Хаммонд, Т.Р .; Камитаки, Н .; Тулей, К .; Пресуми, Дж .; Баум, М .; Ван Дорен, V .; Дженовезе, Г .; Роуз, С.А .; Handsaker, R.E .; Дэйли, Дж .; Кэрролл, МС .; Стивенс, Б .; Маккарролл, SA (2016). «Комплемент 4 компонентінің күрделі өзгеруінен болатын шизофрения қаупі». Табиғат. 530 (7589): 177–83. дои:10.1038 / табиғат16549. PMC  4752392. PMID  26814963.
  15. ^ а б в Вейшенфельдт, Дж .; Симмонс, О .; Шпиц, Ф .; Корбел, Дж. (2013). «Геномдық құрылымдық вариацияның фенотиптік әсері: адам ауруы туралы түсінік». Табиғи шолулар Генетика. 14 (2): 125–138. дои:10.1038 / nrg3373. PMID  23329113.