Шағын ядролы РНҚ SNORD47 - Small nucleolar RNA SNORD47

Шағын ядролы РНҚ SNORD47
RF00281.jpg
Идентификаторлар
ТаңбаSNORD47
Alt. РәміздерU47
РфамRF00281
Басқа деректер
РНҚ түріДжин; snRNA; snoRNA; C / D-қорап
Домен (дер)Эукариота
КЕТGO мерзімі GO басталуы керек: GO мерзімі GO басталуы керек:
СОSO: 0000593
PDB құрылымдарPDBe

SNORD47 (сонымен бірге U47) Бұл кодталмаған РНҚ (ncRNA) молекуласы, ол басқа модификацияда жұмыс істейді шағын ядролық РНҚ (snRNAs). Модификациялық РНҚ-ның бұл түрі әдетте орналасқан ядро snRNA биогенезінің негізгі орны болып табылатын эукариотты жасушадан. Ол а ретінде белгілі шағын нуклеолярлы РНҚ (snoRNA), сонымен қатар жиі жетекші РНҚ деп аталады.

snoRNA U57 тиесілі C / D қорабы С қорапшасы (UGAUGA) және D қорабы (CUGA) деп аталатын консервацияланған мотивтерді қамтитын snoRNA класс. C / D жанұясы мүшелерінің көпшілігі 2'-O- учаскесіне бағыттауда қызмет етеді.метилдену РНҚ субстратының.[1]

Бұл snoRNA бастапқыда клонданған болатын ХеЛа арқылы расталған ұяшықтар мен өрнек солтүстік өшіру.[2]2'O-рибозды метилденуді басқарады деп болжануда рибосомалық РНҚ (rRNA) 28S қалдықтарындағы C3866. Тышқанның ортологы да клондалған[3]

Бұл snoRNA U44, U74, U75, U76, U77, U78, U79, U80 және U81 басқа C / D қораптық snoRNAs гендер интрондарында кодталған.[4]

Әдебиеттер тізімі

  1. ^ Galardi S, Fatica A, Bachi A, Scaloni A, Presutti C, Bozzoni I (қазан 2002). «C / D тазартылған қорапшасы snoRNPs мақсатты РНҚ-ны in vitro жағдайында 2'-O-метилдендірілген учаскеге көбейтуге қабілетті». Молекулалық және жасушалық биология. 22 (19): 6663–8. дои:10.1128 / MCB.22.19.6663-6668.2002. PMC  134041. PMID  12215523.
  2. ^ Kiss-Lázzó Z, Henry Y, Bachellerie JP, Caizergues-Ferrer M, Kiss T (маусым 1996). «Прерибосомалық РНҚ-ның рибозды метилденуі: шағын нуклеолярлы РНҚ үшін жаңа функция». Ұяшық. 85 (7): 1077–88. дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 81308-2. PMID  8674114.
  3. ^ Hüttenhofer A, Kiefmann M, Meier-Ewert S, O'Brien J, Lehrach H, Bachellerie JP, Brosius J (маусым 2001). «RNomics: эксперименттік тәсіл, жаңа, кішкентай, тышқандардағы мессенджер емес РНҚ-ға 201 үміткерді анықтайды». EMBO журналы. 20 (11): 2943–53. дои:10.1093 / emboj / 20.11.2943 ж. PMC  125495. PMID  11387227.
  4. ^ Lestrade L, Weber MJ (қаңтар 2006). «snoRNA-LBME-db, адамның H / ACA және C / D қорапшаларының snoRNAs туралы толық мәліметтер қоры». Нуклеин қышқылдарын зерттеу. 34 (Деректер базасы мәселесі): D158-62. CiteSeerX  10.1.1.105.7552. дои:10.1093 / nar / gkj002. PMC  1347365. PMID  16381836.

Сыртқы сілтемелер