SRCAP - SRCAP

SRCAP

Идентификаторлар

Бүркеншік аттар

SRCAP, DOMO1, EAF1, FLHS, SWR1, Snf2-мен байланысты CREBBP активаторы, Snf2-мен байланысты CREBBP активаторы протеині

Сыртқы жеке куәліктер

OMIM: 611421 MGI: 2444036 HomoloGene: 38213 Ген-карталар: SRCAP

Геннің орналасуы (адам)

Хр.	16-хромосома (адам)^[1]

Топ	16p11.2	Бастау	30,698,209 bp^[1]
Топ	16p11.2	Соңы	30,741,409 bp^[1]

Геннің орналасуы (тышқан)

Хр.	7-хромосома (тышқан)^[2]

Топ	7 \| 7 F3	Бастау	127,511,983 bp^[2]
Топ	7 \| 7 F3	Соңы	127,561,219 bp^[2]

Гендік онтология
Молекулалық функция	• ДНҚ байланыстыру • GO: 0001105 транскрипция коактиваторының қызметі • нуклеотидті байланыстыру • GO: 0001948 ақуыздармен байланысуы • ATP байланысы • гидролаза белсенділігі • GO: 0008026 геликаза белсенділігі • гистон ацетилтрансфераза белсенділігі • ATPase белсенділігі • гистонды байланыстыру
Ұялы компонент	• цитоплазманың перинуклеарлы аймағы • Гольджи аппараты • жасуша ядросы • нуклеоплазма • ядролық дене • макромолекулалық кешен • Swr1 кешені
Биологиялық процесс	• РНҚ-полимераза II промоторынан транскрипцияны реттеу • GO: 0022415 вирустық процесс • транскрипцияны реттеу, ДНҚ шаблонымен • транскрипция, ДНҚ-шаблонмен • гистон ацетилдеуі • хроматинді ұйымдастыру • нуклеин қышқылымен қалыпталған транскрипцияның оң реттелуі • хроматинді қайта құру • гендердің тынышталуы • АТФ-ге тәуелді хроматинді қайта құру • гистон алмасу
Дереккөздер:Амиго / QuickGO

Ортологтар

Түрлер

Адам

Тышқан


10847


100043597

Ансамбль


ENSG00000080603


ENSMUSG00000053877


Q6ZRS2


жоқ

RefSeq (mRNA)


NM_006662


NM_001033881 NM_001304266 NM_175144 NM_178800

RefSeq (ақуыз)


NP_006653


жоқ

Орналасқан жері (UCSC)

Хр 16: 30.7 - 30.74 Мб

Chr 7: 127.51 - 127.56 Mb

PubMed іздеу

^[3]

^[4]

Уикидеректер

Адамды қарау / өңдеу

Тінтуірді қарау / өңдеу

Helicase SRCAP болып табылады фермент адамдарда кодталған SRCAP ген.^[5]^[6]^[7]

Әдебиеттер тізімі

^ ^а ^б ^c GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000080603 - Ансамбль, Мамыр 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000053877 - Ансамбль, Мамыр 2017
^ «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
^ «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
^ Джонстон Х, Кнеер Дж, Чакалапарампил I, Яцюк П, Чривия Дж (шілде 1999). «CREB-байланыстыратын ақуызбен әрекеттесетін SNF2 / SWI2 ақуыздар тобының, SRCAP жаңа идентификациясы». J Biol Chem. 274 (23): 16370–6. дои:10.1074 / jbc.274.23.16370. PMID 10347196.
^ Нагасе Т, Исикава К, Накаджима Д, Охира М, Секи Н, Миядзима Н, Танака А, Котани Х, Номура Н, Охара О (қыркүйек 1997). «Адамның анықталмаған гендерінің кодтау ретін болжау. VII. Ірі протеиндерді in vitro кодтай алатын мидағы 100 жаңа кДНК клондарының толық тізбегі». DNA Res. 4 (2): 141–50. дои:10.1093 / dnares / 4.2.141. PMID 9205841.
^ «Entrez Gene: SRCAP Snf2-ге байланысты CBP активаторының протеині».

Әрі қарай оқу

Боналдо М.Ф., Леннон Г, Соареш М.Б (1997). «Нормалдау және азайту: гендердің ашылуын жеңілдетудің екі тәсілі». Genome Res. 6 (9): 791–806. дои:10.1101 / гр.6.9.791. PMID 8889548.
Ghosh AK, Majumder M, Steele R және т.б. (2000). «Гепатит С вирусы NS5A ақуызы транскрипцияны жаңа жасушалық транскрипция факторы SRCAP арқылы модуляциялайды». Дж.Биол. Хим. 275 (10): 7184–8. дои:10.1074 / jbc.275.10.7184. PMID 10702287.
Xu X, Chackalaparampil I, Monroy MA және т.б. (2001). «Аденовируспен байланысатын ДНҚ ақуызы SNF2-ге байланысты CBP активаторы протеинімен (SrCap) өзара әрекеттеседі және SrCap-транскрипциясын тежейді». Дж. Вирол. 75 (21): 10033–40. дои:10.1128 / JVI.75.21.10033-10040.2001. PMC 114578. PMID 11581372.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH және т.б. (2003). «Адам мен тышқанның 15000-нан астам толық ұзындықтағы кДНҚ тізбектерінің генерациясы және алғашқы талдауы». Proc. Натл. Акад. Ғылыми. АҚШ. 99 (26): 16899–903. дои:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Монрой М.А., Шотт Н.М., Кокс Л және т.б. (2004). «SNF2-ге байланысты CBP активаторының ақуызы (SRCAP) CARM-1 және GRIP-1-мен синергетикалық өзара әрекеттесу арқылы стероидты рецепторлармен жүретін транскрипцияның коактиваторы ретінде жұмыс істейді». Мол. Эндокринол. 17 (12): 2519–28. дои:10.1210 / ме.2003-0208. PMID 14500758.
Ота Т, Сузуки Ю, Нишикава Т және т.б. (2004). «Адамның 21,243 толық ұзындықтағы кДНҚ-ның толық тізбегі және сипаттамасы». Нат. Генет. 36 (1): 40–5. дои:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Cai Y, Jin J, Florens L және т.б. (2005). «Сүтқоректілердің YL1 ақуызы TRRAP / TIP60 гистон ацетилтрансфераза және SRCAP кешендерінің ортақ суббірлігі болып табылады». Дж.Биол. Хим. 280 (14): 13665–70. дои:10.1074 / jbc.M500001200. PMID 15647280.
Eissenberg JC, Wong M, Chrivia JC (2005). «Адамның SRCAP және Drosophila melanogaster DOM - бұл сигналдық жолда жұмыс істейтін гомологтар». Мол. Ұяшық. Биол. 25 (15): 6559–69. дои:10.1128 / MCB.25.15.6559-6569.2005. PMC 1190335. PMID 16024792.
Кимура К, Вакамацу А, Сузуки Ю және т.б. (2006). «Транскрипциялық модуляцияны әртараптандыру: ауқымды идентификация және адам гендерінің болжамды альтернативті промоторларының сипаттамасы». Genome Res. 16 (1): 55–65. дои:10.1101 / гр.4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.
Руль Д.Д., Джин Дж, Цай Ю және т.б. (2006). «H2A.Z гистонды вариантын нуклеосомаларға қосу арқылы хроматинді қайта құратын адамның SRCAP кешенін тазарту». Биохимия. 45 (17): 5671–7. дои:10.1021 / bi060043d. PMID 16634648.
Cai Y, Jin J, Gottschalk AJ және т.б. (2007). «Адамның INO80 және SRCAP хроматинді қайта құру кешендерін тазарту және талдау». Әдістер. 40 (4): 312–7. дои:10.1016 / j.ymeth.2006.06.023. PMC 3092633. PMID 17101442.
Вонг ММ, Кокс Л.К., Chrivia JC (2007). «SRCAP хроматинді қайта құратын протеиндерде гистонды H2A.Z вариантын тұндыру үшін өте маңызды». Дж.Биол. Хим. 282 (36): 26132–9. дои:10.1074 / jbc.M703418200. PMID 17617668.

Сыртқы сілтемелер

Floating-Harbor синдромы және SRCAP бойынша OMIM жазбасы

Бұл мақала а ген қосулы адамның хромосомасы 16 Бұл бұта. Сіз Уикипедияға көмектесе аласыз оны кеңейту.