SMIM11A - Википедия - SMIM11A

SMIM11A, немесе шағын интегралды мембраналық ақуыз 11А, а ақуыз адамдарда кодталған C21orf51 ген.[1][2][3]

Джин

Локус

SMIM11A 21 х22.11-де 21 хромосоманың плюс тізбегінде орналасқан және 4-ке ие экзондар.[3] SMIM11A қосулы сезімталдық және 34 375 450-ден 34 402 777-ге дейін созылады.

Адам тіндерінің үлгілеріндегі SMIM11A экспрессиясы

Өрнек

Өрнегі SMIM11A ең жоғары ми, Қалқанша безі, және асқазан дегенмен, ол көптеген басқа тіндерде де көрінеді.[3]

мРНҚ

SMIM11A транскриптінің белгілі нұсқалары немесе изоформалары жоқ.[4]

Ақуыз

SMIM11A ақуызының ұзындығы 58 амин қышқылынан тұрады. Теориялық молекулалық массасы бұл ақуыздың мөлшері 6кДа және теориялық pI 9.[5] Ақуыз цитоплазмада және митохондрияда, сондай-ақ жасушалар арасындағы фокалды адгезия нүктелерінде локализацияланған.[6][7]

Домендер, мотивтер және Аудармадан кейінгі модификация

SMIM11A құрамында трансмембраналық домен бар.[8]. Ақуыз сонымен қатар дилуцин мотивін ұстайды. Аудармадан кейінгі модификацияға мыналар жатады екі жақтылық сайт, сондай-ақ екі фосфорланған сайттар, біреуі треонинде, біреуі серинде[9][10]

Екінші құрылым және Үшінші құрылым

Ақуыз негізінен альфа-спиралдардан тұрады.[11] SMIM11A-нің N-терминалы жасушадан тыс матрицаға жабысады, ал C-терминалы ұяшықтың цитоплазмасында орналасқан.[12]

SMIM11A-ның үшінші құрылымы

Төрттік құрылым және ақуыздардың өзара әрекеттесуі

SMIM11A үшін тәжірибе жүзінде анықталған ақуыздың өзара әрекеттесуі әлі анықталған жоқ. .[13]

SMIM11A контентуалды аудармасы

Гомология және эволюция

Паралогтар

SMIM11A үшін паралогтар немесе параллельді домендер жоқ

Ортологтар

SMIM11A-да көптеген ортологтар бар. Бұл ортологтар басқа сүтқоректілерден бастап құстарға, бауырымен жорғалаушыларға, қосмекенділерге және сүйекті балықтарға дейін бар.[14]

SMIM11A Ортологиялық кестесі

Әдебиеттер тізімі

  1. ^ «SMIM11A - Кішкентай интегралды мембраналық ақуыз 11A - Homo sapiens (Адам) - SMIM11A гені және ақуызы». www.uniprot.org. UniProt. Алынған 2019-05-20.
  2. ^ «RCSB PDB - Gene View - SMIM11A - шағын интегралды мембраналық ақуыз 11A». www.rcsb.org. Ақуыздар туралы мәліметтер банкі. Алынған 2019-05-20.
  3. ^ а б в «SMIM11A 11A интегралды мембраналық ақуыз [Homo sapiens (адам)]». ncbi.nlm.nih.gov. Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ ұлттық медицина кітапханасы.
  4. ^ «SMIM11A ақуызды кодтау». genecards.org.
  5. ^ «Есептеу pI / Mw құралдарының экспозициясы». expasy.org.
  6. ^ «PSORT II сервері». psort.hgc.jp.
  7. ^ «SMIM11A иммуногистохимиясы: Адамның ақуыздық атласы». proteinatlas.org.
  8. ^ «Homo sapiens шағын интегралды мембраналық ақуыз 11A (SMIM11A), mRNA». ncbi.nlm.nih.gov. NCBI (Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы).
  9. ^ «P58511 (SMIM11A) үшін iPTMnet есебі». зерттеу.биоинформатика.udel.edu.
  10. ^ «NetPhos 3.1 сервері». cbs.dtu.dk.
  11. ^ «Phyre2 нәтижелері». sbg.bio.ic.ac.uk.
  12. ^ «TMHHM сервері». cbs.dtu.dk.
  13. ^ «STRING FAM165B». string-db.org.
  14. ^ «NCBI ақуызды жарылысы». blast.ncbi.nlm.nih.gov.