SMARCC2 - SMARCC2

SMARCC2
Идентификаторлар
Бүркеншік аттар	SMARCC2, BAF170, CRACC2, Rsc8, SWI / SNF байланысты, матрицамен байланысқан, хроматинді субфамилия c мүшесінің 2, CSS8 актинге тәуелді реттегіші
Сыртқы жеке куәліктер	OMIM: 601734 MGI: 1915344 HomoloGene: 2312 Ген-карталар: SMARCC2
Геннің орналасуы (адам)
Хр.	12-хромосома (адам)
Соңы	56,189,567 bp
Геннің орналасуы (тышқан)
Хр.	10-хромосома (тышқан)
Соңы	128,490,482 bp
РНҚ экспрессиясы өрнек
	; ;
	Қосымша сілтеме өрнегі туралы деректер
Гендік онтология
Молекулалық функция	• GO: 0000980 РНҚ-полимераза II цис-реттеуші аймақ реттілігінің спецификалық ДНҚ-мен байланысы; • ДНҚ байланыстыру; • GO: 0001105 транскрипция коактиваторының қызметі; • GO: 0001948 ақуыздармен байланысуы; • нуклеосомалық ДНҚ-мен байланысуы; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 ДНҚ-мен байланысатын транскрипция факторының белсенділігі, II-РНҚ-полимераза; • гистонды байланыстыру;
Ұялы компонент	• транскрипциялық репрессорлық кешен; • нуклеоплазма; • ядролық хроматин; • жасуша ядросы; • SWI / SNF кешені; • npBAF кешені; • nBAF кешені; • макромолекулалық кешен;
Биологиялық процесс	• транскрипцияны реттеу, ДНҚ-шаблонмен; • транскрипция, ДНҚ-шаблонмен; • жүйке жүйесінің дамуы; • АТФ-ге тәуелді хроматинді қайта құру; • транскрипцияның оң реттелуі, ДНҚ-шаблонмен; • нуклеосоманы бөлшектеу; • ковалентті хроматин модификациясы; • транскрипцияның теріс реттелуі, ДНҚ-шаблонмен; • хроматинді қайта құру; • РНҚ-полимераза II промоторынан транскрипцияны реттеу; • хроматинді ұйымдастыру;
	Дереккөздер:Амиго / QuickGO
Ортологтар
	6601
	68094
	ENSG00000139613
	ENSMUSG00000025369
	Q8TAQ2
	Q6PDG5
	NM_001130420; NM_003075; NM_139067; NM_001330288
	NM_001114096; NM_001114097; NM_198160; NM_001372395
	NP_001123892; NP_001317217; NP_003066; NP_620706
	NP_001107568; NP_001107569; NP_937803; NP_001359324
	Уикидеректер
Адамды қарау / өңдеу	Тінтуірді қарау / өңдеу

SWI / SNF кешенді SMARCC2 суббірлігі Бұл ақуыз адамдарда кодталған SMARCC2 ген.^[5]^[6]^[7]

Функция

Бұл генмен кодталған ақуыз SWI / SNF ақуыздар тобының мүшесі болып табылады, оны мүшелер көрсетеді геликаза және ATPase және белгілі бір гендердің транскрипциясын реттейді деп саналатын әрекеттер хроматин құрылымы сол гендердің айналасында. Кодталған ақуыз үлкен АТФ-тәуелділіктің бөлігі болып табылады хроматинді қайта құру кешенді SNF / SWI және болжамды қамтиды лейцинді найзағай көптеген транскрипция факторларына тән мотив. Екі транскрипт нұсқалары әр түрлі кодтау изоформалар осы ген үшін табылған.^[7]

Өзара әрекеттесу

SMARCC2 көрсетілді өзара әрекеттесу бірге BAZ1B^[8] және SMARCA4.^[9]^[10]^[11]

Әдебиеттер тізімі

^ ^а ^б ^c GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000139613 - Ансамбль, Мамыр 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000025369 - Ансамбль, Мамыр 2017
^ «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
^ «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
^ Ван В, Сюэ Ю, Чжоу С, Куо А, Кэрнс BR, Crabtree GR (қараша 1996). «Сүтқоректілердің SWI / SNF кешендерінің әртүрлілігі және мамандануы». Genes Dev. 10 (17): 2117–30. дои:10.1101 / gad.10.17.2117. PMID 8804307.
^ Ring HZ, Vameghi-Meyers V, Wang W, Crabtree GR, Francke U (қыркүйек 1998). «Адам геномында SWI / SNF-пен байланысты, матрицамен байланысты, хроматин (SMARC) гендерінің актинге тәуелді реттеушісі бес дисперсті». Геномика. 51 (1): 140–3. дои:10.1006 / geno.1998.5343. PMID 9693044.
^ ^а ^б «Entrez Gene: SMARCC2 SWI / SNF-ге байланысты, матрицаға байланысты, хроматиннің актинге тәуелді реттегіші, c-отбасы, 2 мүшесі».
^ Китагава Х, Фуджики Р, Йошимура К, Мезаки Ю, Уэмацу Ю, Мацуи Д, Огава С, Унно К, Окубо М, Токита А, Накагава Т, Ито Т, Ишими Ю, Нагасава Х, Мацумото Т, Янагисава Дж, Като С. (Маусым 2003). «WINAC хроматинді қайта құру кешені ядролық рецепторды промоторларға бағыттайды және Уильямс синдромында нашарлайды». Ұяшық. 113 (7): 905–17. дои:10.1016 / S0092-8674 (03) 00436-7. PMID 12837248.
^ Ванг В, Котэ Дж, Сюэ Ю, Чжоу С, Хавари П.А., Биггар СР, Мучардт С, Калпана Г.В., Гофф СП, Янив М, Workman JL, Crabtree GR (қазан 1996). «Сүтқоректілердің SWI-SNF кешенін тазарту және биохимиялық гетерогендігі». EMBO J. 15 (19): 5370–82. дои:10.1002 / j.1460-2075.1996.tb00921.x. PMC 452280. PMID 8895581.
^ Otsuki T, Furukawa Y, Ikeda K, Endo H, Yamashita T, Shinohara A, Iwamatsu A, Ozawa K, Liu JM (қараша 2001). «Fanconi анемия ақуызы, FANCA, адамның SWI / SNF кешенінің компоненті BRG1-мен байланысады». Хум. Мол. Генет. Англия. 10 (23): 2651–60. дои:10.1093 / hmg / 10.23.2651. ISSN 0964-6906. PMID 11726552.
^ Чжао К, Ванг В, Рандо ОЖ, Сюэ Ю, Свидерек К, Куо А, Crabtree GR (қараша 1998). «SWI / SNF тәрізді BAF кешенінің T және лимфоциттер рецепторларының сигналынан кейін хроматинмен жылдам және фосфоинозитолға тәуелділігі». Ұяшық. 95 (5): 625–36. дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 81633-5. PMID 9845365. S2CID 3184211.

Әрі қарай оқу

Ванг В, Котэ Дж, Сюэ Ю, Чжоу С, Хавари П.А., Биггар СР, Мучардт С, Калпана Г.В., Гофф СП, Янив М, Workman JL, Crabtree GR (1996). «Сүтқоректілердің SWI-SNF кешенін тазарту және биохимиялық гетерогендігі». EMBO J. 15 (19): 5370–82. дои:10.1002 / j.1460-2075.1996.tb00921.x. PMC 452280. PMID 8895581.
Ван В, Чи Т, Сюэ Ю, Чжоу С, Куо А, Crabtree GR (1998). «Сүтқоректілердің SWI / SNF байланысты кешендерінде жоғары қозғалғыштық / кинезин тәрізді суббірлікпен ДНҚ-ны байланыстыру». Proc. Натл. Акад. Ғылыми. АҚШ. 95 (2): 492–8. Бибкод:1998 PNAS ... 95..492W. дои:10.1073 / pnas.95.2.492. PMC 18447. PMID 9435219.
Cho H, Orphanides G, Sun X, Yang XJ, Ogryzko V, Lees E, Nakatani Y, Reinberg D (1998). «Хроматин құрылымын өзгертетін факторлардан тұратын адамның РНК-полимераза II кешені». Мол. Ұяшық. Биол. 18 (9): 5355–63. дои:10.1128 / MCB.18.9.5355. PMC 109120. PMID 9710619.
Phelan ML, Sif S, Narlikar GJ, Kingston RE (1999). «SWI / SNF суббірліктерінен хроматинді қайта құрудың негізгі кешенін қалпына келтіру». Мол. Ұяшық. 3 (2): 247–53. дои:10.1016 / S1097-2765 (00) 80315-9. PMID 10078207.
Bochar DA, Wang L, Beniya H, Kinev A, Xue Y, Lane WS, Wang W, Kashanchi F, Shiekhattar R (2000). «BRCA1 адамның SWI / SNF-ке қатысты кешенімен байланысты: хроматинді қайта құруды сүт безі қатерлі ісігіне байланыстыру». Ұяшық. 102 (2): 257–65. дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 00030-1. PMID 10943845. S2CID 6500100.
Кадам S, McAlpine GS, Phelan ML, Kingston RE, Jones KA, Emerson BM (2000). «Рекомбинантты сүтқоректілердің SWI / SNF суббірліктерінің функционалды селективтілігі». Genes Dev. 14 (19): 2441–51. дои:10.1101 / gad.828000. PMC 316972. PMID 11018012.
Xue Y, Canman JC, Lee CS, Nie Z, Yang D, Moreno GT, Young MK, Salmon ED, Wang W (2001). «Адамның SWI / SNF-B хроматинді қайта құру кешені Rsc ашытқысына байланысты және митоздық хромосомалардың кинетохорларында орналасады». Proc. Натл. Акад. Ғылыми. АҚШ. 97 (24): 13015–20. Бибкод:2000PNAS ... 9713015X. дои:10.1073 / pnas.240208597. PMC 27170. PMID 11078522.
Sif S, Saurin AJ, Imbalzano AN, Kingston RE (2001). «Құрамында mSin3A бар Brg1 және hBrm хроматинді қайта құру кешендерін тазарту және сипаттамасы». Genes Dev. 15 (5): 603–18. дои:10.1101 / gad.872801. PMC 312641. PMID 11238380.
Като Х, Тьернберг А, Чжан В, Крутчинский А.Н., Ан В, Такэути Т, Охцуки Ю, Сугано С, де Брюйн Д.Р., Чаит Б.Т., Роедер РГ (2002). «SYT адамның SNF / SWI кешендерімен байланысады және оның синхрондық серіктесі SSX1-нің C-терминалы аймағын гистонға бағыттайды». Дж.Биол. Хим. 277 (7): 5498–505. дои:10.1074 / jbc.M108702200. PMID 11734557.
Баттаглиоли Е, Андрес М.Е., Роуз Д.В., Ченоуэт Дж.Г., Розенфельд М.Г., Андерсон М.Е., Мандел Г (2002). «Нейрондық гендердің REST репрессиясы hSWI.SNF кешенінің компоненттерін қажет етеді». Дж.Биол. Хим. 277 (43): 41038–45. дои:10.1074 / jbc.M205691200. PMID 12192000.
Olave I, Wang W, Xue Y, Kuo A, Crabtree GR (2002). «Полиморфты, нейронға тән хроматинді қайта құру кешенін анықтау». Genes Dev. 16 (19): 2509–17. дои:10.1101 / gad.992102. PMC 187451. PMID 12368262.
Nie Z, Yan Z, Chen EH, Sechi S, Ling C, Zhou S, Xue Y, Yang D, Murray D, Kanakubo E, Cleary ML, Wang W (2003). «SWI / SNF хроматинді қайта құрудың жаңа кешендерінің құрамында лейкемия хромосомалық транслокацияның аралас тектес серіктесі бар». Мол. Ұяшық. Биол. 23 (8): 2942–52. дои:10.1128 / MCB.23.8.2942-2952.2003. PMC 152562. PMID 12665591.
Китагава Х, Фуджики Р, Йошимура К, Мезаки Ю, Уэмацу Ю, Мацуи Д, Огава С, Унно К, Окубо М, Токита А, Накагава Т, Ито Т, Ишими Ю, Нагасава Х, Мацумото Т, Янагисава Дж, Като С. (2003). «WINAC хроматинді қайта құру кешені ядролық рецепторды промоторларға бағыттайды және Уильямс синдромында нашарлайды». Ұяшық. 113 (7): 905–17. дои:10.1016 / S0092-8674 (03) 00436-7. PMID 12837248.
Hsiao PW, Fryer CJ, Trotter KW, Wang W, Archer TK (2003). «BAF60a ядролық рецепторлар мен транзактивацияға арналған BRG1 хроматинді қайта құру кешені арасындағы сыни өзара әрекеттесуге көмектеседі». Мол. Ұяшық. Биол. 23 (17): 6210–20. дои:10.1128 / MCB.23.17.6210-6220.2003 ж. PMC 180928. PMID 12917342.
Bouwmeester T, Bauch A, Ruffner H, Angrand PO, Bergamini G, Croughton K, Cruciat C, Eberhard D, Gagneur J, Ghidelli S, Hopf C, Huhse B, Mangano R, Michon AM, Schirle M, Schlegl J, Schwab M , Stein MA, Bauer A, Casari G, Drewes G, Gavin AC, Jackson DB, Jobery G, Neubauer G, Rick J, Kuster B, Superti-Furga G (2004). «Адамның TNF-альфа / NF-kappa B сигналын беру жолының физикалық-функционалдық картасы». Нат. Жасуша Биол. 6 (2): 97–105. дои:10.1038 / ncb1086. PMID 14743216. S2CID 11683986.
Кувабара Т, Хсие Дж, Накашима К, Тайра К, Гейдж Ф.Х (2004). «Кішкентай модуляциялық дсРНҚ ересек жүйке дің жасушаларының тағдырын анықтайды». Ұяшық. 116 (6): 779–93. дои:10.1016 / S0092-8674 (04) 00248-X. PMID 15035981. S2CID 12656737.
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, Elias JE, Villén J, Li J, Cohn MA, Cantley LC, Gygi SP (2004). «HeLa жасушаларының ядролық фосфопротеидтерінің ауқымды сипаттамасы». Proc. Натл. Акад. Ғылыми. АҚШ. 101 (33): 12130–5. Бибкод:2004PNAS..10112130B. дои:10.1073 / pnas.0404720101. PMC 514446. PMID 15302935.

Сыртқы сілтемелер

FactorBook BAF170

Бұл мақала а ген қосулы адамның хромосомасы 12 Бұл бұта. Сіз Уикипедияға көмектесе аласыз оны кеңейту.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000139613 - Ансамбль, Мамыр 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000025369 - Ансамбль, Мамыр 2017

[3] «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.

[4] «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.

[pmid8804307-5] Ван В, Сюэ Ю, Чжоу С, Куо А, Кэрнс BR, Crabtree GR (қараша 1996). «Сүтқоректілердің SWI / SNF кешендерінің әртүрлілігі және мамандануы». Genes Dev. 10 (17): 2117–30. дои:10.1101 / gad.10.17.2117. PMID 8804307.

[pmid9693044-6] Ring HZ, Vameghi-Meyers V, Wang W, Crabtree GR, Francke U (қыркүйек 1998). «Адам геномында SWI / SNF-пен байланысты, матрицамен байланысты, хроматин (SMARC) гендерінің актинге тәуелді реттеушісі бес дисперсті». Геномика. 51 (1): 140–3. дои:10.1006 / geno.1998.5343. PMID 9693044.

[entrez-7] а ^б «Entrez Gene: SMARCC2 SWI / SNF-ге байланысты, матрицаға байланысты, хроматиннің актинге тәуелді реттегіші, c-отбасы, 2 мүшесі».

[pmid12837248-8] Китагава Х, Фуджики Р, Йошимура К, Мезаки Ю, Уэмацу Ю, Мацуи Д, Огава С, Унно К, Окубо М, Токита А, Накагава Т, Ито Т, Ишими Ю, Нагасава Х, Мацумото Т, Янагисава Дж, Като С. (Маусым 2003). «WINAC хроматинді қайта құру кешені ядролық рецепторды промоторларға бағыттайды және Уильямс синдромында нашарлайды». Ұяшық. 113 (7): 905–17. дои:10.1016 / S0092-8674 (03) 00436-7. PMID 12837248.

[pmid8895581-9] Ванг В, Котэ Дж, Сюэ Ю, Чжоу С, Хавари П.А., Биггар СР, Мучардт С, Калпана Г.В., Гофф СП, Янив М, Workman JL, Crabtree GR (қазан 1996). «Сүтқоректілердің SWI-SNF кешенін тазарту және биохимиялық гетерогендігі». EMBO J. 15 (19): 5370–82. дои:10.1002 / j.1460-2075.1996.tb00921.x. PMC 452280. PMID 8895581.

[pmid11726552-10] Otsuki T, Furukawa Y, Ikeda K, Endo H, Yamashita T, Shinohara A, Iwamatsu A, Ozawa K, Liu JM (қараша 2001). «Fanconi анемия ақуызы, FANCA, адамның SWI / SNF кешенінің компоненті BRG1-мен байланысады». Хум. Мол. Генет. Англия. 10 (23): 2651–60. дои:10.1093 / hmg / 10.23.2651. ISSN 0964-6906. PMID 11726552.

[pmid9845365-11] Чжао К, Ванг В, Рандо ОЖ, Сюэ Ю, Свидерек К, Куо А, Crabtree GR (қараша 1998). «SWI / SNF тәрізді BAF кешенінің T және лимфоциттер рецепторларының сигналынан кейін хроматинмен жылдам және фосфоинозитолға тәуелділігі». Ұяшық. 95 (5): 625–36. дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 81633-5. PMID 9845365. S2CID 3184211.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]