Өкілдік тізбектер - Representative sequences

Өкілдік тізбектер ішіндегі қысқа аймақтар белоктар тізбегі жуықтау үшін қолдануға болатын эволюциялық қатынастар сол белоктардың немесе олар шыққан организмдердің. Репрезентативті дәйектіліктер - бұл сабақтас редукциялар (әдетте 300 қалдықтар ) бастап барлық жерде, әрқайсысы сияқты консервіленген ақуыздар ортологиялық жалғыз алынған репрезентациялардың отбасы а қашықтық матрицасы консенсус матрицасымен тығыз келісім бойынша.[1]

Пайдаланыңыз

Ақуыздар тізбегі туралы мәліметтер бере алады биологиялық функция және эволюция ақуыздар мен белоктық домендер. Белоктар тізбегін топтастыру және өзара байланыстыру адамның биологиялық процестері туралы да, жердегі биологиялық процестердің эволюциялық дамуы туралы да ақпарат бере алады; осындай тізбектелген кластерлер реттілік кеңістігін тиімді қамтуға мүмкіндік береді. Тізбектелген кластерлер дәйектіліктің үлкен мәліметтер қорын кішірек жиынтыққа дейін азайта алады реттіліктің өкілдері, олардың әрқайсысы өз кластерін дәйектілік деңгейінде көрсетуі керек. Тізбектегі өкілдер бастапқы дерекқорды аз дәйектілікпен тиімді қамтуға мүмкіндік береді. Кезектілік өкілдерінің мәліметтер базасы деп аталады артық емес, ұқсас (немесе артық) тізбектер белгілі бір ұқсастық шегінде жойылғандықтан.

Әдебиеттер тізімі

  1. ^ Берн, Маршалл; Голдберг, Дэвид (2004 ж. 2 қараша). «Бактериялық филогенияға арналған өкілдік ақуыздарды автоматты түрде таңдау». BMC эволюциялық биологиясы. 5 (34): 34. дои:10.1186/1471-2148-5-34. PMC  1175084. PMID  15927057.