RFC5 - RFC5

RFC5
Қол жетімді құрылымдар
PDB	Ортологиялық іздеу: PDBe RCSB
PDB идентификатор кодтарының тізімі
	1LFS
Идентификаторлар
Бүркеншік аттар	RFC5, RFC36, репликация коэффициенті С суббірлік 5
Сыртқы жеке куәліктер	OMIM: 600407 MGI: 1919401 HomoloGene: 6730 Ген-карталар: RFC5
Геннің орналасуы (адам)
Хр.	12-хромосома (адам)
Соңы	118,033,130 bp
РНҚ экспрессиясы өрнек
	; ; ; ;
	Қосымша сілтеме өрнегі туралы деректер
Гендік онтология
Молекулалық функция	• нуклеотидті байланыстыру; • ДНҚ байланыстыру; • GO: 0043142 бір тізбекті ДНҚ-геликаза белсенділігі; • GO: 0001948 ақуыздармен байланысуы; • ATP байланысы; • ферментті байланыстыру; • ДНҚ қысқыш тиегіштің қызметі;
Ұялы компонент	• ДНҚ репликация коэффициенті кешені; • Ctf18 RFC тәрізді кешен; • нуклеоплазма; • жасуша ядросы;
Биологиялық процесс	• нуклеотид-эксцизияны қалпына келтіру, ДНҚ саңылауын толтыру; • қатесіз транслезия синтезі; • қателік тудыратын транслезия синтезі; • ДНҚ-бағытталған ДНҚ-полимераза белсенділігінің оң реттелуі; • транслезия синтезі; • транскрипциямен байланысқан нуклеотидті-эксцизияны қалпына келтіру; • нуклеотидті-эксизияны қалпына келтіру, ДНҚ-ны кесу; • ДНҚ зақымдану реакциясы, ДНҚ зақымдануын анықтау; • нуклеотид-экскизді қалпына келтіру, ДНҚ-ны кесу, 5'-ке дейін зақымдану; • ДНҚ репликациясы; • ДНҚ-ны қалпына келтіру; • жартылай консервативті репликация арқылы теломерлерге қызмет көрсету; • ДНҚ-ға тәуелді ДНҚ репликациясы; • p53 класс медиаторының сигнал беруін реттеу;
	Дереккөздер:Амиго / QuickGO
Ортологтар
	5985
	72151
	ENSG00000111445
	ENSMUSG00000029363
	P40937
	Q9D0F6
NM_001130112; NM_001130113; NM_001206801; NM_007370; NM_181578;
	NM_001346815
	NM_028128
NP_001123584; NP_001123585; NP_001193730; NP_001333744; NP_031396;
	NP_853556
	NP_082404
	Уикидеректер
Адамды қарау / өңдеу	Тінтуірді қарау / өңдеу

С репликация коэффициенті 5 Бұл ақуыз адамдарда кодталған RFC5 ген.^[4]^[5]

Функция

Ұзарту грунтталған ДНҚ шаблондары ДНҚ-полимераз дельта және ДНҚ-полимераза эпсилон қосымша ақуыздарды қажет етеді пролиферацияланатын жасушалық ядролық антиген (PCNA) және репликация коэффициенті C (RFC). RFC, сондай-ақ активатор 1 деп те аталады, 140, 40, 38, 37 және 36 кД бес бес суббірліктен тұратын ақуыздар кешені. Бұл ген 36 кД суббірлікті кодтайды. Бұл ішкі бөлім C-терминалы PCNA аймағы. Ол 38 және 40 кДа суббірліктерімен негізгі кешен құрайды. Негізгі кешен бар ДНҚ-ға тәуелді ATPase in vitro жүйеде PCNA арқылы ынталандырылатын белсенділік. Балама түрде біріктірілген Әр түрлі изоформаларды кодтайтын транскрипт нұсқалары туралы хабарланды.^[5]

Өзара әрекеттесу

RFC5 көрсетілген өзара әрекеттесу бірге:

BRD4,^[6]
CHTF18,^[7]
PCNA,^[8]^[9]^[10]
RFC2,^[8]^[11] және
RFC4.^[8]^[11]^[12]^[13]

Әдебиеттер тізімі

^ ^а ^б ^c GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000111445 - Ансамбль, Мамыр 2017
^ «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
^ «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
^ Окумура К, Ногами М, Тагучи Х, Дин Ф.Б, Чен М, Пан ЗQ, Хурвиц Дж, Ширатори А, Мураками Ю, Озава К (қаңтар 1995). «Адамның репликация коэффициенті С-ның 36,5-кДА (RFC5), 37-кДА (RFC4), 38-кДА (RFC3) және 40-кДА (RFC2) суббірлік гендерін 12q24.2-q24.3 хромосома жолақтарына тағайындау,» 3q27, 13q12.3-q13 және 7q11.23 «. Геномика. 25 (1): 274–8. дои:10.1016/0888-7543(95)80135-9. PMID 7774928.
^ ^а ^б «Entrez Gene: RFC5 репликация коэффициенті C (активатор 1) 5, 36,5кДа».
^ Маруяма Т, Фарина А, Дей А, Чеонг Дж, Бермудез В.П., Тамура Т, Скиортино С, Шуман Дж, Хурвиц Дж, Озато К (қыркүйек 2002). «Сүтқоректілердің бром-домен ақуызы, brd4, С репликация факторымен әрекеттеседі және S фазасына өтуді тежейді». Молекулалық және жасушалық биология. 22 (18): 6509–20. дои:10.1128 / mcb.22.18.6509-6520.2002. PMC 135621. PMID 12192049.
^ Bermudez VP, Maniwa Y, Tappin I, Ozato K, Yokomori K, Hurwitz J (қыркүйек 2003). «ДНК-ға көбейіп жатқан жасушалық ядролық антигенді сіңлілі хроматидтік когезия жүктемесіне қажет балама Ctf18-Dcc1-Ctf8-репликация коэффициенті кешені». Америка Құрама Штаттарының Ұлттық Ғылым Академиясының еңбектері. 100 (18): 10237–42. дои:10.1073 / pnas.1434308100. PMC 193545. PMID 12930902.
^ ^а ^б ^c Cai J, Gibbs E, Uhlmann F, Phillips B, Yao N, O'Donnell M, Hurwitz J (шілде 1997). «Адам репликация коэффициенті C p40, p37 және p36 суббірліктерінен тұратын кешен - бұл ДНҚ-ға тәуелді ATPase және холензимді құрастырудағы аралық». Биологиялық химия журналы. 272 (30): 18974–81. дои:10.1074 / jbc.272.30.18974. PMID 9228079.
^ Мосси Р, Джонссон З.О., Аллен Б.Л., Хардин Ш., Хюбшер У (қаңтар 1997). «С репликация коэффициенті көбейетін жасуша ядролық антигенінің С-терминалімен өзара әрекеттеседі». Биологиялық химия журналы. 272 (3): 1769–76. дои:10.1074 / jbc.272.3.1769. PMID 8999859.
^ Ohta S, Shiomi Y, Sugimoto K, Obuse C, Tsurimoto T (қазан 2002). «Адамның жасушалық лизаттарындағы пролиферацияланатын жасушалық ядролық антигенді (ПСНА) байланыстыратын ақуыздарды анықтауға арналған протеомикалық тәсіл. Адамның CHL12 / RFCs2-5 кешенін PCNA байланыстыратын жаңа протеин ретінде анықтау». Биологиялық химия журналы. 277 (43): 40362–7. дои:10.1074 / jbc.M206194200. PMID 12171929.
^ ^а ^б Cai J, Yao N, Gibbs E, Finkelstein J, Phillips B, O'Donnell M, Hurwitz J (қыркүйек 1998). «Адамның репликация коэффициентімен катализденетін ATP гидролизі көптеген суббірліктердің қатысуын қажет етеді». Америка Құрама Штаттарының Ұлттық Ғылым Академиясының еңбектері. 95 (20): 11607–12. дои:10.1073 / pnas.95.20.11607. PMC 21688. PMID 9751713.
^ Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Смоляр А, Босак С, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill Hill, Roth FP, Vidal M (қазан 2005). «Адамның протеин-протеинмен өзара әрекеттесу желісінің протеома-масштабты картасына қарай». Табиғат. 437 (7062): 1173–8. дои:10.1038 / табиғат04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
^ Эллисон V, Стиллман Б (наурыз 1998). «Адамның рекомбинантты репликация коэффициентін қалпына келтіру (RFC) және ДНҚ-ға тәуелді ATPase белсенділігіне ие RFC субкомплексін анықтау». Биологиялық химия журналы. 273 (10): 5979–87. дои:10.1074 / jbc.273.10.5979. PMID 9488738.

Әрі қарай оқу

O'Donnell M, Onrust R, Dean FB, Chen M, Hurwitz J (қаңтар 1993). «Репликативті полимераздың аксессуарлы ақуыздарындағы гомология - адамдарға арналған E. coli». Нуклеин қышқылдарын зерттеу. 21 (1): 1–3. дои:10.1093 / нар / 21.1.1. PMC 309057. PMID 8441605.
Uhlmann F, Cai J, Flores-Rozas H, Dean FB, Finkelstein J, O'Donnell M, Hurwitz J (маусым 1996). «Адамның репликация коэффициентін оның бес суббірліктен in vitro қалпына келтіру». Америка Құрама Штаттарының Ұлттық Ғылым Академиясының еңбектері. 93 (13): 6521–6. дои:10.1073 / pnas.93.13.6521. PMC 39056. PMID 8692848.
Мосси Р, Джонссон З.О., Аллен Б.Л., Хардин Ш., Хюбшер У (қаңтар 1997). «С репликация коэффициенті көбейетін жасуша ядролық антигенінің С-терминалімен өзара әрекеттеседі». Биологиялық химия журналы. 272 (3): 1769–76. дои:10.1074 / jbc.272.3.1769. PMID 8999859.
Cujec TP, Cho H, Maldonado E, Meyer J, Reinberg D, Peterlin BM (сәуір 1997). «Адамның иммун тапшылығы вирусының трансактиваторы РНҚ полимераза II холензимімен әрекеттеседі». Молекулалық және жасушалық биология. 17 (4): 1817–23. дои:10.1128 / mcb.17.4.1817. PMC 232028. PMID 9121429.
Cai J, Gibbs E, Uhlmann F, Phillips B, Yao N, O'Donnell M, Hurwitz J (шілде 1997). «Адам репликация коэффициенті C p40, p37 және p36 суббірліктерінен тұратын кешен - бұл ДНҚ-ға тәуелді ATPase және холензимді құрастырудағы аралық». Биологиялық химия журналы. 272 (30): 18974–81. дои:10.1074 / jbc.272.30.18974. PMID 9228079.
Loor G, Zhang SJ, Zhang P, Toomey NL, Lee MY (желтоқсан 1997). «ДНҚ репликациясын және ПКНА-мен әрекеттесетін жасушалық циклдің ақуыздарын анықтау». Нуклеин қышқылдарын зерттеу. 25 (24): 5041–6. дои:10.1093 / нар / 25.24.5041. PMC 147130. PMID 9396813.
Эллисон V, Стиллман Б (наурыз 1998). «Адамның рекомбинантты репликация коэффициентін қалпына келтіру (RFC) және ДНҚ-ға тәуелді ATPase белсенділігіне ие RFC субкомплексін анықтау» (PDF). Биологиялық химия журналы. 273 (10): 5979–87. дои:10.1074 / jbc.273.10.5979. PMID 9488738. S2CID 17647091.
Cai J, Yao N, Gibbs E, Finkelstein J, Phillips B, O'Donnell M, Hurwitz J (қыркүйек 1998). «Адамның репликация коэффициентімен катализденетін ATP гидролизі көптеген суббірліктердің қатысуын қажет етеді». Америка Құрама Штаттарының Ұлттық Ғылым Академиясының еңбектері. 95 (20): 11607–12. дои:10.1073 / pnas.95.20.11607. PMC 21688. PMID 9751713.
Чжан Г, Гиббс Е, Келман З, О'Доннелл М, Хурвит Дж (наурыз 1999). «Адамның репликация коэффициенті С мен адамның көбеюін жасушалық ядролық антигеннің өзара әрекеттесуі туралы зерттеулер». Америка Құрама Штаттарының Ұлттық Ғылым Академиясының еңбектері. 96 (5): 1869–74. дои:10.1073 / pnas.96.5.1869. PMC 26703. PMID 10051561.
Линдси-Больц Л.А., Бермудез В.П., Хурвиц Дж, Санкар А (қыркүйек 2001). «Адамның ДНҚ зақымдануын бақылау нүктесінің Рад кешендерін тазарту және сипаттамасы». Америка Құрама Штаттарының Ұлттық Ғылым Академиясының еңбектері. 98 (20): 11236–41. дои:10.1073 / pnas.201373498. PMC 58713. PMID 11572977.
Гриффит Дж.Д., Линдси-Больц Л.А., Санкар А (мамыр 2002). «Глицеринді шашыратумен / төмен вольтты микроскопия арқылы бейнелейтін адамның Rad17-репликация коэффициенті және бақылау нүктесі Рад 9-1-1 кешендерінің құрылымдары». Биологиялық химия журналы. 277 (18): 15233–6. дои:10.1074 / jbc.C200129200. PMID 11907025.
Ohta S, Shiomi Y, Sugimoto K, Obuse C, Tsurimoto T (қазан 2002). «Адамның жасушалық лизаттарындағы пролиферацияланатын жасушалық ядролық антигенді (ПСНА) байланыстыратын ақуыздарды анықтауға арналған протеомикалық тәсіл. Адамның CHL12 / RFCs2-5 кешенін PCNA байланыстыратын жаңа протеин ретінде анықтау». Биологиялық химия журналы. 277 (43): 40362–7. дои:10.1074 / jbc.M206194200. PMID 12171929.
Маруяма Т, Фарина А, Дей А, Чеонг Дж, Бермудез В.П., Тамура Т, Скиортино С, Шуман Дж, Хурвиц Дж, Озато К (қыркүйек 2002). «Сүтқоректілердің бром-домен ақуызы, brd4, С репликация факторымен әрекеттеседі және S фазасына өтуді тежейді». Молекулалық және жасушалық биология. 22 (18): 6509–20. дои:10.1128 / MCB.22.18.6509-6520.2002 ж. PMC 135621. PMID 12192049.
Венчловас С, Колвин М.Е., Телен МП (қазан 2002). «Молекулалық модельдеу негізінде АӨҚ тәуелді қысқыш жүктеу процесінде өзара әрекеттесуді талдау». Ақуыздар туралы ғылым. 11 (10): 2403–16. дои:10.1110 / ps.0214302. PMC 2373712. PMID 12237462.
Merkle CJ, Karnitz LM, Henry-Sánchez JT, Chen J (тамыз 2003). «HCTF18, hCTF8 және hDCC1 клондау және сипаттамалары. Сакаромицес церевисия кешенінің адам гомологтары, қарындастық хроматидтік когезияны құруға қатысады». Биологиялық химия журналы. 278 (32): 30051–6. дои:10.1074 / jbc.M211591200. PMID 12766176.
Bermudez VP, Maniwa Y, Tappin I, Ozato K, Yokomori K, Hurwitz J (қыркүйек 2003). «ДНК-ға көбейіп жатқан жасушалық ядролық антигенді сіңлілі хроматидтік когезия жүктемесіне қажет балама Ctf18-Dcc1-Ctf8-репликация коэффициенті кешені». Америка Құрама Штаттарының Ұлттық Ғылым Академиясының еңбектері. 100 (18): 10237–42. дои:10.1073 / pnas.1434308100. PMC 193545. PMID 12930902.
Zou L, Liu D, Elledge SJ (қараша 2003). «Ред17 комплекстерінің репликациясы бойынша протеинді А-медиацияға алу және белсендіру». Америка Құрама Штаттарының Ұлттық Ғылым Академиясының еңбектері. 100 (24): 13827–32. дои:10.1073 / pnas.2336100100. PMC 283506. PMID 14605214.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000111445 - Ансамбль, Мамыр 2017

[2] «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.

[3] «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.

[pmid7774928-4] Окумура К, Ногами М, Тагучи Х, Дин Ф.Б, Чен М, Пан ЗQ, Хурвиц Дж, Ширатори А, Мураками Ю, Озава К (қаңтар 1995). «Адамның репликация коэффициенті С-ның 36,5-кДА (RFC5), 37-кДА (RFC4), 38-кДА (RFC3) және 40-кДА (RFC2) суббірлік гендерін 12q24.2-q24.3 хромосома жолақтарына тағайындау,» 3q27, 13q12.3-q13 және 7q11.23 «. Геномика. 25 (1): 274–8. дои:10.1016/0888-7543(95)80135-9. PMID 7774928.

[entrez-5] а ^б «Entrez Gene: RFC5 репликация коэффициенті C (активатор 1) 5, 36,5кДа».

[pmid12192049-6] Маруяма Т, Фарина А, Дей А, Чеонг Дж, Бермудез В.П., Тамура Т, Скиортино С, Шуман Дж, Хурвиц Дж, Озато К (қыркүйек 2002). «Сүтқоректілердің бром-домен ақуызы, brd4, С репликация факторымен әрекеттеседі және S фазасына өтуді тежейді». Молекулалық және жасушалық биология. 22 (18): 6509–20. дои:10.1128 / mcb.22.18.6509-6520.2002. PMC 135621. PMID 12192049.

[pmid12930902-7] Bermudez VP, Maniwa Y, Tappin I, Ozato K, Yokomori K, Hurwitz J (қыркүйек 2003). «ДНК-ға көбейіп жатқан жасушалық ядролық антигенді сіңлілі хроматидтік когезия жүктемесіне қажет балама Ctf18-Dcc1-Ctf8-репликация коэффициенті кешені». Америка Құрама Штаттарының Ұлттық Ғылым Академиясының еңбектері. 100 (18): 10237–42. дои:10.1073 / pnas.1434308100. PMC 193545. PMID 12930902.

[pmid9228079-8] а ^б ^c Cai J, Gibbs E, Uhlmann F, Phillips B, Yao N, O'Donnell M, Hurwitz J (шілде 1997). «Адам репликация коэффициенті C p40, p37 және p36 суббірліктерінен тұратын кешен - бұл ДНҚ-ға тәуелді ATPase және холензимді құрастырудағы аралық». Биологиялық химия журналы. 272 (30): 18974–81. дои:10.1074 / jbc.272.30.18974. PMID 9228079.

[pmid8999859-9] Мосси Р, Джонссон З.О., Аллен Б.Л., Хардин Ш., Хюбшер У (қаңтар 1997). «С репликация коэффициенті көбейетін жасуша ядролық антигенінің С-терминалімен өзара әрекеттеседі». Биологиялық химия журналы. 272 (3): 1769–76. дои:10.1074 / jbc.272.3.1769. PMID 8999859.

[pmid12171929-10] Ohta S, Shiomi Y, Sugimoto K, Obuse C, Tsurimoto T (қазан 2002). «Адамның жасушалық лизаттарындағы пролиферацияланатын жасушалық ядролық антигенді (ПСНА) байланыстыратын ақуыздарды анықтауға арналған протеомикалық тәсіл. Адамның CHL12 / RFCs2-5 кешенін PCNA байланыстыратын жаңа протеин ретінде анықтау». Биологиялық химия журналы. 277 (43): 40362–7. дои:10.1074 / jbc.M206194200. PMID 12171929.

[pmid9751713-11] а ^б Cai J, Yao N, Gibbs E, Finkelstein J, Phillips B, O'Donnell M, Hurwitz J (қыркүйек 1998). «Адамның репликация коэффициентімен катализденетін ATP гидролизі көптеген суббірліктердің қатысуын қажет етеді». Америка Құрама Штаттарының Ұлттық Ғылым Академиясының еңбектері. 95 (20): 11607–12. дои:10.1073 / pnas.95.20.11607. PMC 21688. PMID 9751713.

[pmid16189514-12] Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Смоляр А, Босак С, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill Hill, Roth FP, Vidal M (қазан 2005). «Адамның протеин-протеинмен өзара әрекеттесу желісінің протеома-масштабты картасына қарай». Табиғат. 437 (7062): 1173–8. дои:10.1038 / табиғат04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.

[pmid9488738-13] Эллисон V, Стиллман Б (наурыз 1998). «Адамның рекомбинантты репликация коэффициентін қалпына келтіру (RFC) және ДНҚ-ға тәуелді ATPase белсенділігіне ие RFC субкомплексін анықтау». Биологиялық химия журналы. 273 (10): 5979–87. дои:10.1074 / jbc.273.10.5979. PMID 9488738.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]