RDBP - RDBP

NELFE
Қол жетімді құрылымдар
PDB	Ортологиялық іздеу: PDBe RCSB
PDB идентификатор кодтарының тізімі
	1X5P, 2BZ2, 2JX2
Идентификаторлар
Бүркеншік аттар	NELFE, D6S45, NELF-E, RD, RDBP, RDP, теріс созылу коэффициенті кешенінің мүшесі E
Сыртқы жеке куәліктер	OMIM: 154040 MGI: 102744 HomoloGene: 134736 Ген-карталар: NELFE
Геннің орналасуы (адам)
Хр.	6-хромосома (адам)
Соңы	31,959,038 bp
Геннің орналасуы (тышқан)
Хр.	17-хромосома (тышқан)
Соңы	34,856,372 bp
РНҚ экспрессиясы өрнек
	Қосымша сілтеме өрнегі туралы деректер
Гендік онтология
Молекулалық функция	• нуклеин қышқылымен байланысуы; • GO: 0001948 ақуыздармен байланысуы; • хроматинді байланыстыру; • РНҚ байланысы;
Ұялы компонент	• жасуша ядросы; • нуклеоплазма; • NELF кешені; • жасуша қабығы; • ядролық дене;
Биологиялық процесс	• РНҚ-полимераза II промоторынан транскрипцияның созылуын теріс реттеу; • ERK1 және ERK2 каскадының оң реттелуі; • вирустық транскрипцияның оң реттелуі; • РНҚ полимераза II промоторынан транскрипция; • транскрипцияны реттеу, ДНҚ-шаблонмен; • РНҚ-полимераза II промоторынан транскрипцияның оң реттелуі; • гистонның H3-K4 метилденуінің оң реттелуі; • РНҚ полимераза II промоторынан транскрипцияның теріс реттелуі; • мРНҚ полиаденилденуінің теріс реттелуі; • РНҚ-полимераза II промоторынан транскрипцияның созылуы; • транскрипция, ДНҚ-шаблонмен;
	Дереккөздер:Амиго / QuickGO
Ортологтар
	7936
	27632
ENSG00000229363; ENSG00000206357; ENSG00000231044; ENSG00000204356; ENSG00000206268;
	ENSG00000233801
	ENSMUSG00000024369
	P18615
	P19426
	NM_002904
	NM_001045863; NM_001045864; NM_138580
	NP_002895
	NP_001039328; NP_001039329; NP_613046
	Уикидеректер
Адамды қарау / өңдеу	Тінтуірді қарау / өңдеу

Теріс созылу коэффициенті Е Бұл ақуыз адамдарда кодталған RDBP ген.^[5]

Функция

Осы генмен кодталған ақуыз - күрделі терминнің бөлігі ұзарту коэффициенті (NELF) қуғын-сүргін РНҚ-полимераза II транскрипт ұзарту. Бұл ақуыздың ядролық РНҚ-мен байланысатын ақуыздарға ұқсастығы бар; дегенмен, бұл ақуыздың РНҚ-ны байланыстыратыны дәлелденбеген. Ақуыз құрамында ауыспалы негізді және қышқылдық қалдықтар, негізінен аргинин (R) және аспарагин қышқылы (D) бар. Ген негізгі гистосәйкестік кешеніне локализацияланған (MHC III класы ) 6-хромосома бойынша аймақ.^[5]

Өзара әрекеттесу

RDBP көрсетілген өзара әрекеттесу бірге:

Әдебиеттер тізімі

^ ^а ^б ^c ENSG00000206357, ENSG00000231044, ENSG00000204356, ENSG00000206268, ENSG00000233801 GRCh38: Ensembl шығарылымы 89: ENSG00000229363, ENSG00000206357, ENSG00000231044, ENSG0000020435, ENGG0000020435, - Ансамбль, Мамыр 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000024369 - Ансамбль, Мамыр 2017
^ «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
^ «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
^ ^а ^б «Entrez Gene: RDBP RD РНҚ байланыстыратын ақуыз».
^ ^а ^б ^c Нарита Т, Ямагучи Ю, Яно К, Сугимото С, Чанарат С, Вада Т, Ким Д.К., Хасегава Дж, Омори М, Инукай Н, Эндох М, Ямада Т, Ханда Н (наурыз 2003). «NELF адамның транскрипциясын созу факторы: жаңа суббірліктерді анықтау және функционалды белсенді кешенді қалпына келтіру». Молекулалық және жасушалық биология. 23 (6): 1863–73. дои:10.1128 / mcb.23.6.1863-1873.2003. PMC 149481. PMID 12612062.
^ Lehner B, Semple JI, Brown SE, Counsell D, Campbell RD, Sanderson CM (қаңтар 2004). «Жоғары гнибридті ашытқыны талдау және оны адамның MHC III класы аймағында кодталған жасушаішілік ақуыздардың қызметін болжау үшін қолдану». Геномика. 83 (1): 153–67. дои:10.1016 / s0888-7543 (03) 00235-0. PMID 14667819.
^ Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Робинсон MD, О'Коннор L, Ли М, Тейлор R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Mur L, Zhang S, Орнатский О, Бухман Ю.В., Этиер М, Шенг Ю, Василеску Дж, Абу-Фарха М, Ламберт Дж.П., Дуэлл Х.С., Стюарт II, Куэхл Б, Хогю К, Колвилл К, Гладвиш К, Мускат Б, Кинач Р, Адамс SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). «Масс-спектрометрия әдісімен адамның ақуыз-ақуыздың өзара әрекеттесуінің ауқымды картасы». Молекулалық жүйелер биологиясы. 3: 89. дои:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.

Әрі қарай оқу

Ю CY (1999). «Адамның MHC комплемент ген кластерінің молекулалық генетикасы». Эксперименттік және клиникалық иммуногенетика. 15 (4): 213–30. дои:10.1159/000019075. PMID 10072631. S2CID 25061446.
Стивенс М, Де Клерк Э, Балзарини Дж (қыркүйек 2006). «АИТВ-1 транскрипциясын реттеу: химиотерапиялық араласудың молекулалық мақсаттары». Медициналық зерттеулерге шолу. 26 (5): 595–625. дои:10.1002 / мед.20081. PMC 7168390. PMID 16838299.
Surowy CS, Hoganson G, Gosink J, Strunk K, Spritz RA (маусым 1990). «Адамның RD ақуызы ядролық РНҚ-мен байланысатын ақуыздармен тығыз байланысты және жоғары деңгейде сақталған». Джин. 90 (2): 299–302. дои:10.1016 / 0378-1119 (90) 90194-V. PMID 2119325.
Speiser PW, White PC (желтоқсан 1989). «Адамның RD генінің құрылымы: негізгі гистос сыйысымдылық кешенінің III класты аймағында жоғары консервіленген ген». ДНҚ. 8 (10): 745–51. дои:10.1089 / дна.1989.8.745. PMID 2612324.
Леви-Стросс М, Кэрролл MC, Штайнметц М, Мео Т (сәуір 1988). «Ерекше мерзімді құрылымы бар бұрын анықталмаған MHC гені». Ғылым. 240 (4849): 201–4. дои:10.1126 / ғылым.3353717. PMID 3353717.
Cheng J, Macon KJ, Volanakis JE (қыркүйек 1993). «cDNA клондау және RD-мен кодталған ақуыздың сипаттамасы, адамның негізгі гистос сыйысымдылық кешенінің III класында орналасқан ген». Биохимиялық журнал. 294 (2): 589–93. дои:10.1042 / bj2940589. PMC 1134496. PMID 8373374.
Lee SG, Song K (маусым 1997). «III класс MHC кешенінде RD мен RP1 аралығында орналасқан адамның DDX13 генінің геномдық ұйымы». Молекулалар мен жасушалар. 7 (3): 414–8. PMID 9264031.
Büssow K, Cahill D, Nietfeld W, Bancroft D, Sherzinger E, Lehrach H, Walter G (қараша 1998). «Массивтік cDNA кітапханасының жоғары тығыздықтағы сүзгілерінде глобалды протеин экспрессиясы және антиденелерді скрининг әдісі. Нуклеин қышқылдарын зерттеу. 26 (21): 5007–8. дои:10.1093 / нар / 26.21.5007. PMC 147919. PMID 9776767.
Yang Z, Shen L, Dangel AW, Wu LC, Yu CY (қараша 1998). «HLA-ның III класты аймағында B және C4 факторларының комплемент компоненттері арасында RD (D6S45) -SKI2W (SKIV2L) -DOM3Z-RP1 (D6S60E) бар барлық жерде көрсетілген гендер бар». Геномика. 53 (3): 338–47. дои:10.1006 / geno.1998.5499. PMID 9799600.
Ямагучи Ю, Такаги Т, Вада Т, Яно К, Фуруя А, Сугимото С, Хасегава Дж, Ханда Х (сәуір 1999). «NELF, құрамында РД бар мультисубиттік кешен DSIF-пен РНҚ полимеразаның II созылуын басу үшін ынтымақтастық жасайды». Ұяшық. 97 (1): 41–51. дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80713-8. PMID 10199401. S2CID 16855257.
Ping YH, Rana TM (сәуір 2001). «DSIF және NELF РНҚ-полимеразаның II созылу кешенімен өзара әрекеттеседі және ВИЧ-1 Тат транскрипция ұзару кезінде РНҚ-полимераза II және DSIF-тің P-TEFb-фосфорлануын ынталандырады». Биологиялық химия журналы. 276 (16): 12951–8. дои:10.1074 / jbc.M006130200. PMID 11112772.
Ямагучи Ю, Инукай Н, Нарита Т, Вада Т, Ханда Х (мамыр 2002). «Теріс созылу коэффициенті транскрипцияның созылуын DRB сезімталдықты индукциялайтын фактормен / РНҚ полимераза II комплексімен және РНҚ-мен байланысу арқылы басады деген дәлел». Молекулалық және жасушалық биология. 22 (9): 2918–27. дои:10.1128 / MCB.22.9.2918-2927.2002 ж. PMC 133766. PMID 11940650.
Нарита Т, Ямагучи Ю, Яно К, Сугимото С, Чанарат С, Вада Т, Ким Д.К., Хасегава Дж, Омори М, Инукай Н, Эндох М, Ямада Т, Ханда Н (наурыз 2003). «NELF адамның транскрипциясын созу факторы: жаңа суббірліктерді анықтау және функционалды белсенді кешенді қалпына келтіру». Молекулалық және жасушалық биология. 23 (6): 1863–73. дои:10.1128 / MCB.23.6.1863-1873.2003 ж. PMC 149481. PMID 12612062.
Xie T, Rowen L, Aguado B, Ahearn ME, Madan A, Qin S, Campbell RD, Hood L (желтоқсан 2003). «Гендердің тығыздығының негізгі гистосәйкестік кешенінің III класының аймағын талдау және оны тышқанмен салыстыру». Геномды зерттеу. 13 (12): 2621–36. дои:10.1101 / гр.1736803. PMC 403804. PMID 14656967.
Lehner B, Semple JI, Brown SE, Counsell D, Campbell RD, Sanderson CM (қаңтар 2004). «Жоғары гнибридті ашытқыны талдау және оны адамның MHC III класы аймағында кодталған жасушаішілік ақуыздардың қызметін болжау үшін қолдану». Геномика. 83 (1): 153–67. дои:10.1016 / S0888-7543 (03) 00235-0. PMID 14667819.
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, Elias JE, Villén J, Li J, Cohn MA, Cantley LC, Gygi SP (тамыз 2004). «HeLa жасушаларының ядролық фосфопротеидтерінің ауқымды сипаттамасы». Америка Құрама Штаттарының Ұлттық Ғылым Академиясының еңбектері. 101 (33): 12130–5. дои:10.1073 / pnas.0404720101. PMC 514446. PMID 15302935.
Aiyar SE, Sun JL, Blair AL, Moskaluk CA, Lu YZ, Ye QN, Yamaguchi Y, Mukherjee A, Ren DM, Handa H, Li R (қыркүйек 2004). «Эстроген рецепторларының альфа-медиацияланған транскрипциясын эстрогенмен ынталандырылған теріс созылу факторын жалдау арқылы әлсірету». Гендер және даму. 18 (17): 2134–46. дои:10.1101 / gad.1214104. PMC 515291. PMID 15342491.

Сыртқы сілтемелер

FactorBook NELFe

Бұл мақала а ген қосулы адамның хромосомасы 6 Бұл бұта. Сіз Уикипедияға көмектесе аласыз оны кеңейту.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ENSG00000206357, ENSG00000231044, ENSG00000204356, ENSG00000206268, ENSG00000233801 GRCh38: Ensembl шығарылымы 89: ENSG00000229363, ENSG00000206357, ENSG00000231044, ENSG0000020435, ENGG0000020435, - Ансамбль, Мамыр 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000024369 - Ансамбль, Мамыр 2017

[3] «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.

[4] «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.

[entrez-5] а ^б «Entrez Gene: RDBP RD РНҚ байланыстыратын ақуыз».

[pmid12612062-6] а ^б ^c Нарита Т, Ямагучи Ю, Яно К, Сугимото С, Чанарат С, Вада Т, Ким Д.К., Хасегава Дж, Омори М, Инукай Н, Эндох М, Ямада Т, Ханда Н (наурыз 2003). «NELF адамның транскрипциясын созу факторы: жаңа суббірліктерді анықтау және функционалды белсенді кешенді қалпына келтіру». Молекулалық және жасушалық биология. 23 (6): 1863–73. дои:10.1128 / mcb.23.6.1863-1873.2003. PMC 149481. PMID 12612062.

[pmid14667819-7] Lehner B, Semple JI, Brown SE, Counsell D, Campbell RD, Sanderson CM (қаңтар 2004). «Жоғары гнибридті ашытқыны талдау және оны адамның MHC III класы аймағында кодталған жасушаішілік ақуыздардың қызметін болжау үшін қолдану». Геномика. 83 (1): 153–67. дои:10.1016 / s0888-7543 (03) 00235-0. PMID 14667819.

[pmid17353931-8] Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Робинсон MD, О'Коннор L, Ли М, Тейлор R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Mur L, Zhang S, Орнатский О, Бухман Ю.В., Этиер М, Шенг Ю, Василеску Дж, Абу-Фарха М, Ламберт Дж.П., Дуэлл Х.С., Стюарт II, Куэхл Б, Хогю К, Колвилл К, Гладвиш К, Мускат Б, Кинач Р, Адамс SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). «Масс-спектрометрия әдісімен адамның ақуыз-ақуыздың өзара әрекеттесуінің ауқымды картасы». Молекулалық жүйелер биологиясы. 3: 89. дои:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]