RBMX - RBMX

RBMX
Қол жетімді құрылымдар
PDBОртологиялық іздеу: PDBe RCSB
Идентификаторлар
Бүркеншік аттарRBMX, HNRNPG, HNRPG, RBMXP1, RBMXRT, RNMX, hnRNP-G, MRXS11, РНҚ байланыстырушы мотивтік ақуыз, X-байланысты, РНҚ-мен байланысқан мотивтік ақуыз X-байланысты
Сыртқы жеке куәліктерOMIM: 300199 MGI: 1343044 HomoloGene: 20494 Ген-карталар: RBMX
Геннің орналасуы (адам)
Х хромосома (адам)
Хр.Х хромосома (адам)[1]
Х хромосома (адам)
RBMX үшін геномдық орналасу
RBMX үшін геномдық орналасу
ТопXq26.3Бастау136,848,004 bp[1]
Соңы136,880,764 bp[1]
Ортологтар
ТүрлерАдамТышқан
Энтрез
Ансамбль
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_001164803
NM_002139

NM_001166623
NM_011252

RefSeq (ақуыз)

NP_001158275
NP_002130

NP_001160095
NP_035382

Орналасқан жері (UCSC)Chr X: 136.85 - 136.88 Mbжоқ
PubMed іздеу[2][3]
Уикидеректер
Адамды қарау / өңдеуТінтуірді қарау / өңдеу

Гетерогенді ядролық рибонуклеопротеин Г. Бұл ақуыз адамдарда кодталған RBMX ген.[4][5][6]

Функция

Бұл ген R кандидаты хромосоманың сперматогенез гендерін қамтитын RBMY гендер тобына жатады. Бұл ген, Y хромосома RBMY генінің белсенді X хромосома гомологы, кеңінен көрініс тапты, ал RBMY гені сперматогенезде еркектерге тән функцияны дамытты. 1, 4, 9, 11 және 6 хромосомаларында кездесетін осы геннің псевдогендері, мүмкін, бастапқы геннен ретротранспозиция арқылы алынған. Әр түрлі изоформаларды кодтайтын балама транскрипт нұсқалары анықталды, бірақ олардың биологиялық табиғаты анықталмады.[6]

Өзара әрекеттесу

RBMX көрсетілген өзара әрекеттесу бірге SFRS10[7] және CDC5L.[8]

Үлгілі организмдер

Үлгілі организмдер RBMX функциясын зерттеу кезінде қолданылған. Шартты тінтуір желі деп аталады Rbmxtm2b (KOMP) Wtsi кезінде құрылды Wellcome Trust Sanger институты.[9] Еркек пен аналық жануарлар стандартталған түрде өтті фенотиптік экран[10] жоюдың әсерін анықтау.[11][12][13][14] Қосымша экрандар орындалды: - терең иммунологиялық фенотиптеу[15]

Әдебиеттер тізімі

  1. ^ а б c GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000147274 - Ансамбль, Мамыр 2017
  2. ^ «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
  3. ^ «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
  4. ^ Delbridge ML, Lingenfelter PA, Disteche CM, Graves JA (шілде 1999). «RBMY сперматогенез генінің кандидаты адамның Х хромосомасында гомологқа ие». Табиғат генетикасы. 22 (3): 223–4. дои:10.1038/10279. PMID  10391206.
  5. ^ Mazeyrat S, Saut N, Mattei MG, Mitchell MJ (шілде 1999). «RBMY барлық жерде транскрипцияланған X-Y бірдей геннен Y хромосомасында дамыды». Табиғат генетикасы. 22 (3): 224–6. дои:10.1038/10282. PMID  10391207.
  6. ^ а б «Entrez Gene: RBMX RNA байланыстыратын мотивті ақуыз, X-байланысқан».
  7. ^ Hofmann Y, Wirth B (тамыз 2002). «hnRNP-G Htra2-beta1-мен тікелей әрекеттесу арқылы экзон-7 тірі қозғалтқыш нейронын (SMN) қосуға ықпал етеді». Адам молекулалық генетикасы. 11 (17): 2037–49. дои:10.1093 / hmg / 11.17.2037. PMID  12165565.
  8. ^ Ajuh P, Kuster B, Panov K, Zomerdijk JC, Mann M, Lamond AI (желтоқсан 2000). «Адамның CDC5L кешенін функционалды талдау және оның компоненттерін масс-спектрометрия әдісімен анықтау». EMBO журналы. 19 (23): 6569–81. дои:10.1093 / emboj / 19.23.6569. PMC  305846. PMID  11101529.
  9. ^ Гердин А.К. (2010). «Sanger Mouse Genetics бағдарламасы: нокаут тышқандарының жоғары сипаттамасы». Acta Ophthalmologica. 88: 925–7. дои:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x.
  10. ^ а б «Халықаралық тышқан фенотиптеу консорциумы».
  11. ^ Skarnes WC, Rosen B, West AP, Koutsourakis M, Bushell W, Iyer V, Mujica AO, Thomas M, Harrow J, Cox T, Jackson D, Severin J, Biggs P, Fu J, Nefedov M, de Jong PJ, Стюарт AF, Bradley A (маусым 2011). «Тышқанның генінің қызметін геном бойынша зерттеу үшін шартты нокаут ресурсы». Табиғат. 474 (7351): 337–42. дои:10.1038 / табиғат10163. PMC  3572410. PMID  21677750.
  12. ^ Dolgin E (маусым 2011). «Тышқан кітапханасы нокаутқа айналды». Табиғат. 474 (7351): 262–3. дои:10.1038 / 474262a. PMID  21677718.
  13. ^ Коллинз Ф.С., Россант Дж, Вурст В (қаңтар 2007). «Барлық себептер бойынша тышқан». Ұяшық. 128 (1): 9–13. дои:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID  17218247.
  14. ^ White JK, Gerdin AK, Karp NA, Ryder E, Buljan M, Bussell JN, Salisbury J, Clare S, Ingham NJ, Podrini C, Houghton R, Estabel J, Bottomley JR, Melvin DG, Sunter D, Adams NC, Tannahill D , Logan DW, Macarthur DG, Flint J, Mahajan VB, Tsang SH, Smyth I, Watt FM, Skarnes WC, Dougan G, Adams DJ, Ramirez-Solis R, Bradley A, Steel KP (шілде 2013). «Нокаут тышқандарын жалпы геномдық генерациялау және жүйелі фенотиптеу көптеген гендердің жаңа рөлдерін ашады». Ұяшық. 154 (2): 452–64. дои:10.1016 / j.cell.2013.06.022. PMC  3717207. PMID  23870131.
  15. ^ а б «Инфекция және иммунитетті иммунофенотиптеу (3i) консорциумы».

Әрі қарай оқу