Баррель - Pt-barrel

Orf2 тәрізді Пренилтрансфераза
Orf2 anim1X.gif
PT-баррель ақуызының кристалдық құрылымы.
Идентификаторлар
ТаңбаPTase_Orf2
PfamPF11468
InterProIPR020965
SCOP21zb6 / Ауқымы / SUPFAM

The PT-баррель, деп табылған жаңа протеин қатпарлары кристалдық құрылым Пренилтрансферазаның, Orf2 Streptomyces sp. CL190 штаммы.[1]

Құрылым

PT баррель он антипараллельден тұратын жабық β парағынан тұрады β-жіптер сақинамен қоршалған орталық β баррель ядросының айналасында орналасқан α-спиралдар бөшкенің сыртқы, еріткіш ашық бетін қалыптастыру.

Екінші қосылыс шамамен (ααββ) сәйкес келеді5 жіктеу, бірақ (ααββ) көмегімен нақтырақ сипатталған4- (αββ) −α номенклатурасы, мұнда кристалдық тордағы ақуыз аралық байланыстарға қатысатын 6 және 8 спиральдар спираль тәріздес «ирек» көрсетеді. PT-баррелінің ең гидрофобты бөлімі болып цилиндрлік β-баррельдің сыртқы беті мен қоршаған α-спиральдардың белдеуі арасында орналасқан аймақ табылады. Сонымен қатар, баррельдің ішінде орналасқан бірқатар гидрофобты қалдықтар Геранил-диФосфат (GPP) және GSPP молекулаларының пренилді құйрығын орналастырады, ал дифосфат немесе субстрат аналогтарының тиосифат бас топтары сәйкесінше «жоғарғы жағына» бағытталады. ”, Баррельдің Mg болатын полярлық ұшы2+ ион үйлестірілген. Соңында, бөшкенің төменгі жағын қысқа C-терминал спиралы (α11) жабады.

Әдебиеттер тізімі

  1. ^ Кузуяма Т, Ноэль Дж.П., Ричард С.Б (маусым 2005). «Хош иісті табиғи өнімдердің прекурсорлы биосинтетикалық пренилдеуінің құрылымдық негіздері». Табиғат. 435 (7044): 983–7. дои:10.1038 / табиғат03668. PMC  2874460. PMID  15959519.
  • Koehl P (шілде 2005). «Хош иісті пренилтрансферазалардағы бос ерекшелік». Нат. Хим. Биол. 1 (2): 71–2. дои:10.1038 / nchembio0705-71. PMID  16408001.
  • Botta B, Delle Monache G, Menendez P, Boffi A (желтоқсан 2005). «Фенонтренферальды ферменттер флавоноидты пренилдеу құралы ретінде». Фармаколдың тенденциясы. Ғылыми. 26 (12): 606–8. дои:10.1016 / j.tips.2005.09.012. PMID  16229901.

Баспасөз хабарламалары

Роман ферментінің құрылымына ие каталитикалық белсенділік, 2005 ж., 15 маусым
SSRL Science Highlight шілде 2005 ж
LightSource.org баспасөз релизі: PR-SSRL-05-3