Пептид-N4- (N-ацетил-бета-глюкозаминил) аспарагин амидаза - Википедия - Peptide-N4-(N-acetyl-beta-glucosaminyl)asparagine amidase

пептид-N4- (N-ацетил-бета-глюкозаминил) аспарагин амидаза
Ақуыз NGLY1 PDB 2ccq.png
Негізінде көрсету PDB: 2ccq
Идентификаторлар
EC нөмірі3.5.1.52
CAS нөмірі83534-39-8
Мәліметтер базасы
IntEnzIntEnz көрінісі
БРЕНДАBRENDA жазбасы
ExPASyNiceZyme көрінісі
KEGGKEGG кірісі
MetaCycметаболизм жолы
PRIAMпрофиль
PDB құрылымдарRCSB PDB PDBe PDBsum
Ген онтологиясыAmiGO / QuickGO

Жылы энзимология, а пептид-N4- (N-ацетил-бета-глюкозаминил) аспарагин амидаза (EC 3.5.1.52 ) болып табылады фермент бұл катализдейді а химиялық реакция бұл N4- (ацетил-бета-D-глюкозаминил )аспарагин глюкозамин қалдықтары болуы мүмкін қалдық гликозилденген, (ауыстырылған) N-ацетил-бета-D-глюкозаминиламин және құрамында пептид бар аспартат қалдық. Бұл фермент тұқымдасына жатады гидролазалар, атап айтқанда, сызықтық амидтердегі пептидтік байланыстардан басқа көміртегі-азотты байланыстарға әсер ететіндер.

The NGLY1 ген адамда осы ферменттің ортологын кодтайды.

Номенклатура

The жүйелік атауы осы ферменттер класына жатады N-байланысқан-гликопептид- (N-ацетил-бета-D-глюкозаминил) -L-аспарагин амидогидролаза. Жалпы қолданыстағы басқа атауларға мыналар жатады:

  • гликопептид N-гликозидаза,
  • гликопептидаза,
  • N-олигосахарид гликопептидаза,
  • N-гликаназа,
  • Джек-бұршақ гликопептидаза,
  • PNG негізі,[1] және
  • PNGase F

Құрылымдық зерттеулер

Фермент а каталитикалық триада цистеин-гистидин-аспартат белсенді сайт гидролизі үшін ковалентті катализ.[2] Осындай функционалдығы бар пептидті 2014 жылы Қытайдың Шанхай қаласындағы Фудан университетінің тобы тапқан. Бұл пептид альфа-1,3 байланысын үзеді және PNGase F-II деп аталды.[3]

Әдебиеттер тізімі

  1. ^ Altmann F, Paschinger K, Dalik T, Vorauer K (ақпан 1998). «Пептид-N4- (N-ацетил-бета-глюкозаминил) аспарагин амидаза А мен оның N-гликандарының сипаттамасы». Еуропалық биохимия журналы / FEBS. 252 (1): 118–23. дои:10.1046 / j.1432-1327.1998.2520118.x. PMID  9523720.
  2. ^ Аллен MD, Бухбергер А, Bycroft M (қыркүйек 2006). «PUB домені адамның N-гликаназ пептидінде p97 байланыстырушы модулі ретінде жұмыс істейді». Биологиялық химия журналы. 281 (35): 25502–8. дои:10.1074 / jbc.M601173200. PMID  16807242.
  3. ^ Sun G, Yu X, Bao C, Wang L, Li M, Gan J, Qu D, Ma J, Chen L (наурыз 2015). «Жаңа прокариоттық пептидтің идентификациясы және сипаттамасы: Elizabethkingia meningoseptica-дан N-гликозидаза». Биологиялық химия журналы. 290 (12): 7452–62. дои:10.1074 / jbc.M114.605493. PMC  4367255. PMID  25614628.

Әрі қарай оқу

  • Plummer TH, Tarentino AL (қазан 1981). «Гликопептидтерден күрделі олигосахаридтердің бадам эмульсин пептидімен беттік бөлінуі: N-гликозидаза». Биологиялық химия журналы. 256 (20): 10243–6. PMID  7287707.
  • Такахаси Н (маусым 1977). «Гликопептидтерге әсер ететін жаңа амидазаны көрсету». Биохимиялық және биофизикалық зерттеулер. 76 (4): 1194–201. дои:10.1016 / 0006-291X (77) 90982-2. PMID  901470.
  • Такахаси Н, Нишибе Н (желтоқсан 1978). «Аспартилгликозиламин байланыстарына әсер ететін жаңа гликопептидазаның кейбір сипаттамалары». Биохимия журналы. 84 (6): 1467–73. дои:10.1093 / oxfordjournals.jbchem.a132270. PMID  738997.
  • Тарентино АЛ, Гомес СМ, Плуммер TH (тамыз 1985). «Аспарагинмен байланысқан гликандардың пептидпен дегликозилденуі: N-гликозидаза F». Биохимия. 24 (17): 4665–71. дои:10.1021 / bi00338a028. PMID  4063349.