OnlineHPC - OnlineHPC

OnlineHPC
OnlineHPC жұмыс процесінің дизайнері
OnlineHPC жұмыс процесінің дизайнері
ӘзірлеушілерOnlineHPC
Соңғы шығарылым
1.0 / 2012 жылғы 24 қыркүйек (2012-09-24)
ЖазылғанJava
Операциялық жүйеLinux, Mac OS X, Microsoft Windows
ЛицензияМеншіктік EULA
Веб-сайтonlinehpc.com

The OnlineHPC құралдармен қамтамасыз ететін ақысыз жалпыға қол жетімді веб-қызмет болды өнімділігі жоғары компьютерлер және желіде жұмыс процесі редактор. OnlineHPC пайдаланушыларға онлайн-жұмыс ағыны дизайнерін қолдана отырып, жұмыс ағындарын жобалауға және орындауға және өнімділігі жоғары компьютерлермен - кластерлер мен бұлттармен жұмыс істеуге мүмкіндік берді. Өнімділіктің жоғары ресурстарына жұмыс процесінің компоненттері сияқты сервистің интерфейсінен тікелей қол жетімді болды. Таверна дәстүрлі түрде қолданылады ғылыми жұмыс процесі сияқты домендерде орындау биоинформатика,[1][2] химинформатика,[3] дәрі, астрономия,[4] әлеуметтік ғылымдар, музыка, және сандық сақтау.[5]

Тарих

OnlineHPC басталды Ақпаратты тарату проблемалары институты 2012 жылы жұмысына қол жеткізуді қажет ететін институт зерттеушілері үшін жоба ретінде компьютерлік кластерлер және кәсіби бағдарламашылар емес.

Жобаның мотиві - зерттеушінің дағдылары мен біліктілік деңгейі арасында алшақтық бар жоғары өнімді есептеу. HPC жолында кем дегенде үш кедергі бар:

  • Зерттеушіге қол жетімді болу үшін HPC провайдерін тауып, лақтыру процедуралары қажет;
  • Зерттеушіге көптеген төмен деңгейлі бағдарламалық жасақтамаларды орнату және конфигурациялау, әрі қарай жалғастыру үшін сандық сертификаттармен жұмыс жасау қажет;
  • Зерттеушіге осындай технологиялармен және құралдармен танысу қажет MPI, топтық тапсырмалар менеджерлері немесе тіпті веб-қызметтер.

Соңғы талап алғашқы екі деңгейден өткен ең мықты зерттеушілердің көпшілігін тоқтатады. Сервис компьютерлік кластерлермен жұмыс істеу үшін қажетті алдын-ала конфигурацияланған құралдардың толық жиынтығын қамтамасыз ету арқылы кедергілерді азайтуға бағытталған: браузердегі терминал эмуляторы, файлдар жүйесінің браузері, тіркелгі деректері менеджері және массивтік тапсырма құралы.

Біраз уақыттан кейін инженерлік және ғылыми тапсырмалар зерттеушілерге жұмыс ағындарын - жұмыс ағындарын орындауға мүмкіндік беретін аса күрделі құрал-жабдықты қажет ететіндігі айқын болды. Егер бірқатар ғылыми жұмыс процестері болмаса, олардың барлығы дерлік жұмыс үстелі қосымшалары болып табылады, осылайша олардың мақсаты қарапайымдылық пен пайдаланушының тәжірибесін жақсартуға бағытталған онлайн-ортаны құру болды.

Жоба биоинформатикада қолданылды,[6][7] адам денсаулығы,[8] телекоммуникация және басқа домендер.

2016-05 жылғы жағдай бойынша, http://onlinehpc.com/ қол жетімді болмады.

Мүмкіндіктер

OnlineHPC жұмыс ағынының дизайнерінің скриншоты

OnlineHPC жұмыс үстелі дизайнеріне жұмыс үстелдері мен планшеттердегі негізгі браузерлерді (Firefox, Chrome және Internet Explorer) қолдана отырып қол жетімді болатын.

OnlineHPC ішіндегі жұмыс ағындары:

  • Компьютерлік кластерлерде массивтік есептеулер жүргізу
  • Сабын /WSDL және Демалыс Веб-қызметтер, үшін арнайы компонент BioMart веб-қызмет.
  • R статистикалық қызмет
  • Бұршақ қабығы сценарий (Java сценарий тілі сияқты)
  • Қашықтағы машиналардағы сыртқы құралдар (арқылы сш )
  • XPath xml деректерін шығару
  • Деректерді импорттау Microsoft Excel электрондық кестелер

Сервисте сонымен қатар кластерлерде массивтік есептеулерді дайындауға және іске асыруға арналған негізгі құралдар болды - браузердегі терминал эмуляторы, файлдық жүйенің шолушысы және кластердің күйін қарау құралы. Пайдаланушылар қолданыстағы аппараттық кластерді басқаруды немесе бұлтта жаңа кластер данасын теңшеуді бастауы мүмкін.

Сондай-ақ қараңыз

Сыртқы сілтемелер

Әдебиеттер тізімі

  1. ^ Стивенс, Р.; Робинсон, Дж .; Гобл, C. А. (2003). «MyGrid: ақпараттық тордағы дараландырылған биоинформатика». Биоинформатика. 19: i302 – i304. дои:10.1093 / биоинформатика / btg1041. PMID  12855473.
  2. ^ Стивенс, Р.; Типни, Х. Дж .; Вру, Дж .; Оинн Т.М .; Сенгер М .; Лорд, P. W .; Гобл, C. А.; Жез, А.; Тассабехжи, М. (2004). «MyGrid көмегімен Уильямс-Бурен синдромын зерттеу». Биоинформатика. 20: i303 – i310. дои:10.1093 / биоинформатика / bth944. PMID  15262813.
  3. ^ Трушковский, А .; Джаяселан, К .; Нейман, С .; Виллигаген, Э.Л .; Зиелесный, А .; Steinbeck, C. (2011). «CDK-Taverna ашық жұмыс ағыны ортасында химиялық информатика бойынша жаңа әзірлемелер». Химинформатика журналы. 3: 54. дои:10.1186/1758-2946-3-54. PMC  3292505. PMID  22166170.
  4. ^ Хук, Р. Н .; Романиелло, М .; Ульгрин, М .; Ярвелайнен, П .; Майсала, С .; Ойтинен, Т .; Саволайнен, V .; Солин, О .; Тайнеля, Дж .; Перон, М .; Изцо, С .; Лича, Т. (2008). «ESO рефлексі: рецептерді басқаруға арналған графикалық жұмыс ағыны». 2007 ESO аспаптарын калибрлеу бойынша семинар. ESO Astrophysics Symposia Еуропалық Оңтүстік обсерваториясы. б. 169. дои:10.1007/978-3-540-76963-7_23. ISBN  978-3-540-76962-0.
  5. ^ Радитч М .; Шларб, С .; Молдруп-Далум, П .; Medjkoune, L. (2012). «Эксперименттік орындалуға арналған веб-мазмұнның орындалатын жұмыс процестері» (PDF).
  6. ^ Taverna Online - метагеномдық мысалдармен, ISMB-де технологиялық трек әңгімесі Кэти Волстенкрофт, дүйсенбі 22 шілде.
  7. ^ Taverna Online - метагеномдық мысалдармен, Алан Уильямс, Манчестер университеті, Ұлыбритания
  8. ^ VPH-Share жобасының жол картасы, VPH-Share Жетінші рамалық бағдарлама Еуропалық Одақ жобасы