Ноктурнин - Википедия - Nocturnin

NOCT
Адам Ноктурнин (6MAL) .png
Қол жетімді құрылымдар
PDBОртологиялық іздеу: PDBe RCSB
Идентификаторлар
Бүркеншік аттарNOCT, CCR4L, Ccr4c, NOC, CCRN4L, ноцуртин
Сыртқы жеке куәліктерOMIM: 608468 MGI: 109382 HomoloGene: 7661 Ген-карталар: NOCT
Геннің орналасуы (адам)
4-хромосома (адам)
Хр.4-хромосома (адам)[1]
4-хромосома (адам)
NOCT үшін геномдық орналасу
NOCT үшін геномдық орналасу
Топ4q31.1Бастау139,015,781 bp[1]
Соңы139,045,939 bp[1]
Ортологтар
ТүрлерАдамТышқан
Энтрез
Ансамбль
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_012118

NM_009834

RefSeq (ақуыз)

NP_036250

NP_033964

Орналасқан жері (UCSC)Chr 4: 139.02 - 139.05 MbХр 3: 51.22 - 51.25 Мб
PubMed іздеу[3][4]
Уикидеректер
Адамды қарау / өңдеуТінтуірді қарау / өңдеу

Ноктурнин адам гидролаза метаболизмге қатысатын және оның экспрессиясы ырғақты басқарылатын фермент тәуліктік сағат. Ол 4-хромосомада орналасқан NOCT генімен кодталған. Ноктурнин құрамында c-терминалды құрылымдық домені бар Эндонуклеаза / экзонуклеаза / фосфатаза тұқымдасы. 2019 жылдың қаңтар айындағы зерттеу осыны көрсетті NADP + және NADPH Ноктурниннің тікелей мақсаты болып табылады.[5][6]

The Дрозофила меланогастері ортолог Ноктурнин бұйраланады. Нокауттар бұралған қанатқа бұралған қорғасын фенотип жеміс шыбындарында. Бұралған қанат фенотипін алғаш ашқан Томас Хант Морган 1915 ж.[7] Ноктурнин ортологы тышқандарда диета мен салмақтың өсуін бақылауға жауапты, нокаут тышқандары құрамында майлылығы жоғары диетаға отырғанда, құрамында ноктурнин бар тышқандармен салыстырғанда салмақ қосылмайды.[8] Тышқандарда, сонымен қатар, тышқандар толық қараңғылықта болған кезде де, Ноктурниннің өрнегі біздің дененің ішкі сағаты арқылы жүретіндігін көрсетіп, ырғақты түрде өрнектелетіндігі көрсетілген.[9]

Ұялы локализация

Ноктурниннің а Митохондриялық бағыттау реттілігі, ол ақуыздың n-терминалында орналасқан.[5][6]

Ферментативті белсенділік

Бұрын Ноктурнин туралы ойлаған деденилат мРНҚ метаболизм гендерінің,[10] бірақ 2018 жылы екі зерттеу Ноктурниннің тікелей иесі еместігін анықтады рибонуклеаза белсенділік.[11][12] 2019 жылдың қаңтарындағы зерттеу Ноктурниннің а фосфатаза 2 'фосфатты кетіру үшін тікелей NADP (H) әсер етеді.[5][6] Дрозофила ортологы, бұйраланған, сонымен қатар NADP (H) 2 'фосфатаза екендігі көрсетілді, бұл ферменттік белсенділіктің адамдардан жеміс шыбындарына дейін сақталатынын көрсетеді.[5][6]

Құрылым

Ноктурнин құрамында c-терминалының құрылымдық домені бар Эндонуклеаза / экзонуклеаза / фосфатаза тұқымдасы (EEP). Оның ақуыз қатпарына ұқсас DNase I, AP эндонуклеазы, INPP5B, Сфингомиелин фосфодиэстераза, TDP2, PDE12, және CNOT6L. EEP басқа мүшелеріндегі сияқты консервацияланған бес каталитикалық қалдық магний атомын үйлестіруге көмектеседі, өйткені Ноктурнин үшін екі валентті металл NADP (H) фосфатаза белсенділігіне қатысады. Ноктурниннің алғашқы құрылымдары 2017-2018 жылдары шешілді (6BT1[12], 6BT2[12], және 6MAL[11]). Үшеуі де Nturnurnin-мен байланысқан EEP с-терминалының доменінде болды кофактор магний. 2018 жылдың желтоқсанында Ноктурниннің табиғи субстратпен, NADPH-мен байланысқан алғашқы құрылымы анықталды, 6NF0.[5][6]

Әдебиеттер тізімі

  1. ^ а б в GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000151014 - Ансамбль, Мамыр 2017
  2. ^ а б в GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000023087 - Ансамбль, Мамыр 2017
  3. ^ «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
  4. ^ «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
  5. ^ а б в г. e Estrella MA, Du J, Chen L, Rath S, Prangley E, Chitrakar A, Aoki T, Schedl P, Rabinowitz J, Korennykh A (2019). «NADP + және NADPH метаболиттері - бұл циркадиандық ақуыз Ноктурниннің мақсаты (бұйраланған)». bioRxiv. дои:10.1101/534560.
  6. ^ а б в г. e Estrella MA, Du J, Chen L, Rath S, Prangley E, Chitrakar A, Aoki T, Schedl P, Rabinowitz J, Korennykh A (мамыр 2019). «NADP + және NADPH метаболиттері - бұл циркадтық Nocturnin (Curled) ақуызының нысаны». Табиғат байланысы. 10 (1): 2367. Бибкод:2019NatCo..10.2367E. дои:10.1038 / s41467-019-10125-z. PMC  6542800. PMID  31147539. ТүйіндемеScience Daily.
  7. ^ Gronke S, Bickmeyer I, Wunderlich R, Jackle H, Kuhnlein RP (2009). «омыртқалы циркадиан деаденилаза ноцурниннің дрозофила гомологын ширатады». Генетика. 183 (1): 219–232. дои:10.1534 / генетика.109.105601. PMC  2746146. PMID  19581445.
  8. ^ Жасыл CB, Douris N, Kojima S, Strayer CA, Fogerty J, Lourim D, Keller SR, Besharse JC (2007). «Ноктурниннің, циркадиандік деденилазаның жоғалуы бауырдың стеатозына және диетаның әсерінен семіздікке төзімділік береді». PNAS. 104 (23): 9, 888–93. дои:10.1073 / pnas.0702448104. PMC  1871564. PMID  17517647.
  9. ^ Ванг Й, Остербур Д.Л., Мегав П.Л., Тосини Г, Фукухара С, Грин КБ, Бешарсе JC (2001). «Тінтуірдің бірнеше тіндеріндегі ноктурнин мРНҚ-ның ырғақты экспрессиясы». BMC Даму Биологиясы. 1 (9): 9. дои:10.1186 / 1471-213X-1-9. PMC  32249. PMID  11394964.
  10. ^ Бэггз Дж., Жасыл CB (2003). «Ноктурнин, Ксенопус лаевис Ретинасындағы Deadenylase». Қазіргі биология. 13 (3): 189–198. дои:10.1016 / S0960-9822 (03) 00014-9. PMID  12573214. S2CID  16337386.
  11. ^ а б Estrella MA, Du J, Korennykh A (2018). «Адамның ноуртиннің каталитикалық доменінің кристалдық құрылымы». Ғылыми баяндамалар. 8 (1): 16294. Бибкод:2018 Натрия ... 816294E. дои:10.1038 / s41598-018-34615-0. PMC  6214945. PMID  30389976.
  12. ^ а б в Abshire ET, Chasseur J, Bohn JA, Del Rizzo PA, Freddolino PL, Goldstrohm AC, Trievel RC (2018). «Ноктурниннің құрылымында мақсатты транскрипт транскрипциясын және жасушалардағы молшылықты басатын консервіленген рибонуклеаза домені анықталады». Нуклеин қышқылдарын зерттеу. 46 (12): 6257–6270. дои:10.1093 / nar / gky412. PMC  6158716. PMID  29860338.

Сыртқы сілтемелер

  • Сайтында қол жетімді барлық құрылымдық ақпаратқа шолу PDB үшін UniProt: Q9UK39 (Ноктурнин) PDBe-KB.