NDUFA10 - NDUFA10

NDUFA10
Идентификаторлар
Бүркеншік аттарNDUFA10, CI-42KD, CI-42k, NADH: убикиноноксидоредуктаза суббірлігі A10, MC1DN22
Сыртқы жеке куәліктерOMIM: 603835 MGI: 1914523 HomoloGene: 15342 Ген-карталар: NDUFA10
Геннің орналасуы (адам)
2-хромосома (адам)
Хр.2-хромосома (адам)[1]
2-хромосома (адам)
NDUFA10 үшін геномдық орналасу
NDUFA10 үшін геномдық орналасу
Топ2q37.3Бастау239,892,450 bp[1]
Соңы240,025,345 bp[1]
РНҚ экспрессиясы өрнек
PBB GE NDUFA10 217860 at fs.png
Қосымша сілтеме өрнегі туралы деректер
Ортологтар
ТүрлерАдамТышқан
Энтрез

4705

67273

Ансамбль

ENSG00000130414

ENSMUSG00000026260

UniProt

O95299

Q99LC3

RefSeq (mRNA)

NM_004544
NM_001322019
NM_001322020

NM_024197

RefSeq (ақуыз)

NP_001308948
NP_001308949
NP_004535

NP_077159

Орналасқан жері (UCSC)Хр 2: 239.89 - 240.03 Мбжоқ
PubMed іздеу[2][3]
Уикидеректер
Адамды қарау / өңдеуТінтуірді қарау / өңдеу

NADH дегидрогеназа [убихинон] 1 альфа субкомплексінің 10-бөлімі болып табылады фермент адамдарда кодталған NDUFA10 ген.[4][5] NDUFA10 ақуызы суббірлік болып табылады NADH дегидрогеназа (убихинон), орналасқан митохондриялық ішкі мембрана және бес кешеннің ішіндегі ең ірісі болып табылады электронды тасымалдау тізбегі.[6][7] NADH дегидрогеназаның суббірліктеріндегі мутациялар (убикинон), олар сондай-ақ белгілі I кешен, сияқты күрделі нейродегенеративті ауруларға жиі әкеледі Лей синдромы.[4] Сонымен қатар, NDUFA10 өрнегінің деңгейлері төмендеді FOXM1 - бағытталған гиперметилдену адаммен байланысты қабыршақты карцинома және қатерлі ісіктің басқа түрлерімен байланысты болуы мүмкін.[8]

Құрылым

NDUFA10 гені q қолында орналасқан 2-хромосома 37.3 позициясында және 68 031 базалық жұптарды құрайды.[4] Ген 355-тен тұратын 41 кДа ақуызын шығарады аминқышқылдары.[9][10] NDUFA10 - ферменттің суббірлігі NADH дегидрогеназа (убихинон), тыныс алу кешендерінің ішіндегі ең ірісі. Құрылымы L-тәрізді ұзын, гидрофобты трансмембраналық домен және а гидрофильді барлық белгілі тотығу-тотықсыздану орталықтары мен NADH байланысу орнын қамтитын перифериялық қолға арналған домен.[6] Деп атап өтті N-терминал гидрофобты доменнің ан-ға жиналуға мүмкіндігі бар альфа-спираль ішкі жағын қамтиды митохондриялық мембрана а C-терминалы І комплекстің глобулалық бөлімшелерімен өзара әрекеттесетін гидрофильді домен сақталған екі доменді құрылым бұл қасиеттің ақуыз функциясы үшін өте маңызды екенін және гидрофобты домен NADH дегидрогеназа (убихинон) ішкі митохондриялық мембранада күрделі. NDUFA10 - бұл I комплекстің трансмембраналық аймағын құрайтын 31-ге жуық гидрофобты суббірліктің бірі, бірақ бұл катализге қатыспайды деп есептелетін қосалқы суббірлік.[11] Болжалды екінші құрылым ең алдымен альфа-спираль болып табылады, бірақ белоктың карбокси-терминалының жартысы ширатылған катушканы қабылдауға үлкен әлеуетке ие. Амино-терминал бөлігі гидрофобты амин қышқылдарына бай болжамды бета парағын қамтиды, олар митохондриялық импорт сигналы бола алады.[4][7][12]

Функция

Адамның бөлімшесіне арналған NDUFA10 гендік кодтары I кешен туралы тыныс алу тізбегі, ол электрондарды ауыстырады НАДХ дейін убихинон.[4] НАДХ I комплексімен байланысады және екі электронды -ге ауыстырады изоаллоксазин сақинасы туралы флавин мононуклеотиді (FMN) протезді қолмен FMNH түзеді2. Электрондар тізбегі арқылы беріледі темір-күкірт (Fe-S) кластерлері протезді қолында және соңында коэнзим Q10 Дейін төмендейді (CoQ) убихинол (CoQH2). Электрондар ағыны ақуыздың тотығу-тотықсыздану күйін өзгертеді, нәтижесінде конформациялық өзгеріс пайда болады және рҚ төрт сутек ионын сорып шығаратын иондалатын бүйір тізбектің жылжуы митохондриялық матрица.[6]

Клиникалық маңызы

NDUFA10 адамдағы мРНҚ-ның экспрессия деңгейінің айтарлықтай төмендегенін көрсетті қабыршақты карцинома, байланысты FOXM1 - гиперметилдену. FOXM1 - бұл барлық онкологиялық ауруларға қатысы бар онкоген. Ол ингибирлеу арқылы жұмыс істейді ісік супрессоры басқа механизмдермен қатар промоторлы гиперметилдеу арқылы гендер.[8] Мутациялар NDUFA10 байланысты болды Лей ауруы күрделі I жетіспеушілігінен туындайды.[13]

Өзара әрекеттесу

NDUFA10-да 56 екілік бар екендігі көрсетілген ақуыз-ақуыздың өзара әрекеттесуі оның ішінде 55 бірлескен өзара әрекеттесу. NDUFA10 өзара әрекеттесетін көрінеді RAB8A.[14]

Әдебиеттер тізімі

  1. ^ а б c GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000130414 - Ансамбль, Мамыр 2017
  2. ^ «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
  3. ^ «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
  4. ^ а б c г. e «Entrez Gene: NDUFA10 NADH дегидрогеназа (убикинон) 1 альфа субкомплексі, 10».
  5. ^ Loeffen JL, Triepels RH, van den Heuvel LP, Schuelke M, Buskens CA, Smeets RJ, Trijbels JM, Smeitink JA (желтоқсан 1998). «NADH сегіз ядролық кодталған суббірліктерінің кДНҚ-сы: убикиноноксидоредуктаза: I cDNA адамның кешенін сипаттау аяқталды». Биохимиялық және биофизикалық зерттеулер. 253 (2): 415–22. дои:10.1006 / bbrc.1998.9786. PMID  9878551.
  6. ^ а б c Дауыскер Д., Дауыс JG, Pratt CW (2013). «18-тарау». Биохимия негіздері: молекулалық деңгейдегі өмір (4-ші басылым). Хобокен, НЖ: Вили. 581-620 бб. ISBN  978-0-470-54784-7.
  7. ^ а б Emahazion T, Beskow A, Gyllensten U, Brooks AJ (қараша 1998). «Адамның электронды тасымалдау тізбегінің I кешенді 15 генінің интронды негізделген радиациялық гибридтік картасы». Цитогенетика және жасуша генетикасы. 82 (1–2): 115–9. дои:10.1159/000015082. PMID  9763677. S2CID  46818955.
  8. ^ а б Teh MT, Gemenetzidis E, Patel D, Tariq R, Nadir A, Bahta AW, Waseem A, Hutchison IL (2012). «FOXM1 бас пен мойынның қабыршақты жасушалы рак эпигеномын имитациялайтын ғаламдық метилдену қолтаңбасын тудырады». PLOS ONE. 7 (3): e34329. дои:10.1371 / journal.pone.0034329. PMC  3312909. PMID  22461910.
  9. ^ Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, Deng N, Kim AK, Choi JH, Zelaya I, Liem D, Meyer D, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss J , Дуан Х, Ухлен М, Йейтс JR, Апвейлер R, Ге Дж, Гермякоб Н, Пинг П (қазан 2013). «Жүрек протеомдарының биологиясы мен медицинасын мамандандырылған білім қорымен интеграциялау». Айналымды зерттеу. 113 (9): 1043–53. дои:10.1161 / CIRCRESAHA.113.301151. PMC  4076475. PMID  23965338.
  10. ^ «NDUFA10 - NADH дегидрогеназа [убикинон] 1 альфа субкомплексті суббірлік 10». Атлас жүрек ақуыздары туралы білім қоры (COPaKB).
  11. ^ «NDUFA10 - NADH дегидрогеназа [убикинон] 1 альфа субкомплексті суббірлік 10». UniProt.org. UniProt консорциумы.
  12. ^ Тон С, Хван Д.М., Демпси А.А., Liew CC (желтоқсан 1997). «Адамның бес NADH-убихиноноксидоредуктаза суббірліктерін анықтау және бастапқы құрылымы». Биохимиялық және биофизикалық зерттеулер. 241 (2): 589–94. дои:10.1006 / bbrc.1997.7707. PMID  9425316.
  13. ^ Hoefs SJ, van Spronsen FJ, Lenssen EW, Nijtmans LG, Rodenburg RJ, Smeitink JA, van den Heuvel LP (наурыз 2011). «NDUFA10 мутациясы Лей ауруы бар науқаста I комплекстің жетіспеушілігін тудырады». Еуропалық адам генетикасы журналы. 19 (3): 270–4. дои:10.1038 / ejhg.2010.204. PMC  3061993. PMID  21150889.
  14. ^ «NDUFA10 іздеу термині үшін 56 екілік өзара әрекеттесу табылды». IntAct молекулалық өзара әрекеттесу дерекқоры. EMBL-EBI. Алынған 2018-08-25.

Әрі қарай оқу

  • Смейтинк Дж, ван ден Хевель Л (маусым 1999). «Денсаулық пен аурудағы I митохондриялық кешен». Американдық генетика журналы. 64 (6): 1505–10. дои:10.1086/302432. PMC  1377894. PMID  10330338.
  • Ma J, Dempsey AA, Stamatiou D, Marshall KW, Liew CC (наурыз 2007). «Адамдардағы плазмадағы липид деңгейімен байланысты лейкоциттердің гендік экспрессиясының заңдылықтарын анықтау». Атеросклероз. 191 (1): 63–72. дои:10.1016 / ж.атеросклероз.2006.05.032. PMID  16806233.
  • Gevaert K, Goethals M, Martens L, Van Damme J, Staes A, Thomas GR, Vandekerckhove J (мамыр 2003). «Протеомдарды зерттеу және сұрыпталған N-терминал пептидтерін масс-спектрометриялық идентификациялау арқылы ақуызды өңдеуді талдау». Табиғи биотехнология. 21 (5): 566–9. дои:10.1038 / nbt810. PMID  12665801. S2CID  23783563.
  • Baens M, Chaffanet M, Aerssens J, Cassiman JJ, Marynen P (мамыр 1994). «Адамда көбейетін жасуша P120 (NOL1) жасуша нуклеолярлық ақуызының генін тағайындау 12p13 хромосомасына флуоресценциялы in situ будандастыру және соматикалық жасуша гибридтерімен полимеразды тізбек реакциясы». Геномика. 21 (1): 296–7. дои:10.1006 / geno.1994.1267. PMID  8088812.

Бұл мақалада Америка Құрама Штаттарының Ұлттық медицина кітапханасы, ол қоғамдық домен.