Метавирус - Википедия - Metavirus

Метавирус
Вирустардың жіктелуі e
(ішілмеген):Вирус
Патшалық:Рибовирия
Корольдігі:Парарнавира
Филум:Artverviricota
Сынып:Revtraviricetes
Тапсырыс:Ortervirales
Отбасы:Метавирида
Тұқым:Метавирус

Метавирус тұқымдасы вирустар отбасында Метавирида. Олар ретротранспозондар эукариоттық иесінің геномына енетін және вирус хостқа жұқтырғаннан кейін ғана қайталана алады.[1] Бұл генетикалық элементтер өз иесінің геномына жұқтыру және көбейту үшін өмір сүреді және олардың иесімен байланыссыз тектік элементтерден алынған. Метавирус таралуы үшін бірнеше әр түрлі иелерді қолдана алады және кейбір өсімдіктердің жұмыртқалары мен тозаңдары арқылы жұғатындығы анықталды.[2]

Метавирус құрамында бес отбасы бар Ty3 / сыған бір немесе екеуі бар элемент ашық оқуға арналған рамкалар; бұл отбасылар mdg1, mdg3, бластопия, 412, және микропия.[3] Бес отбасының әрқайсысында бір немесе екі ашық оқуға арналған кадрлар бар, gag3 және / немесе pol3.[4] Геном элементтерінің құрамында аминқышқылдарының жетіспеушілігі көбіне жаққа қарай жылжуын растайтын дәлелдер бар Ty3 элемент.[5] Метавирус сәйкес келеді Ogre / Tat гендік тегі.[6]

Морфология

Түрлері Метавирус бір тізбекті РНҚ ретротранспозондары болып табылады. Оларда икосаэдрлік және сызықтық конформация бар және конвертке салынбаған.[7] Олардың диаметрі шамамен 50 нм, ал олардың ұзындығы 42 мен 52 нм аралығында болады.[7] Бұл генетикалық элементтерде ядро ​​мен капсид бар.

Түрлер

Келесі түрлер танылады:[8]

Эволюция

Олардың мутациясы мен рекомбинация жылдамдығы және өткізгіштік қабілеті жоғары болғандықтан геннің көлденең трансферті, көптеген ретроэлементтердің эволюциялық тарихы іздеуді қиындатуы мүмкін (Benachenhou және басқалар, 2013).[9] Ғалымдар көбінесе геномдарын қарастырады Метавирус нуклеин қышқылының тізбегін басқа вирустардың тізбегімен салыстыру, шығу тегі құру және жалпы ата-баба ұсыну.

Бірнеше таксондар Метавирус Metaviridae басқа тұқымдастарына гомологты болатын геномдық дәйектілікке ие және жалпы ата-баба және / немесе коэволюцияны ұсынады.[10] Ғалымдар дәлелдеу үшін капсид ақуыздарын жиі қарастырады Метавирус эволюция.[11] Тұқымдарының көп бөлігі Метавирус шешілмеген болып қалады және қазіргі уақытта зерттелуде.

Зерттеулер

Маскагни және басқалар. (2017) гомологтарды табу және күнбағыс түрлерінің жіптерін анықтау бойынша зерттеулер жүргізді. Экспериментте ДНҚ әртүрлі алынған гелиантус ретротранспозондардың түрлері мен геномдары анықталды BLASTX талдау. Филогенетикалық ағаштар көршілерді біріктіру кластерлеу әдісі бойынша салынды және геномдық талдауға мүмкіндік беретін биоинформатикалық құбыр салынды. Екі элемент, ӘРИНЕ және Helicopia, анықталды және орналастырылды Сыған және Копия сәйкесінше суперфамилиялар.[12] Осылайша, ӘРИНЕ элементі Сыған тобы Ogre / Tat тұқымдас Метавирус.[12] Бұдан әрі талдау Mascagni et al. (2017) мутацияны анықтау және Метавирус тегі бұрын дамыды Сиревирус. Маскагни және басқалар. (2017 ж.) Сонымен қатар ӘРИНЕ элементтері және Helicopia элементтер будандастырылған, жаңа тектік потенциал.

Нефедова және Ким (2009), зерттеу жүргізді Дрозофила меланогастері одан әрі шығу тегтерін анықтау Метавирус. Гомологтар ретротранспозондардың және бұрын алынған ДНҚ-дан анықталды Дрозофила меланогастері және филогенетикалық ағаштар салынды.[13] Метавирустар enf генін иемденіп, олардың инфекциялық болуына мүмкіндік береді, бұл Нефедова мен Ким (2009 ж.) бакуловирустардан геннің көлденең берілуінен алынған деп тұжырымдады.[13] Метавирус геннің ауысуынан алынған деп саналатын roo элементін қамтиды Эррантивирус, немесе, бәлкім, екі тұқымдас а ортақ ата.[13]

Әдебиеттер тізімі

  1. ^ Зиберт, С (2006). «Интеллектуалды дизайн» (PDF). Ашу.
  2. ^ Сингх, Р; Финни, Р (қыркүйек 1973). «Метавирус картоп шпинделі түйнегінің тұқымының Scopolia sinensis жұмыртқасы арқылы берілуі». Канадалық өсімдік аурулары журналы. 53: 153–154.
  3. ^ Нефедова, Лидия; Ким, Александр. «ЛТР-Ретроэлементтің транспозициясының механизмдері: дрозофилия меланогастерінен сабақ». Вирустар. 9: 1–10.
  4. ^ Леви, Камилл; т.б. (2013). «Вирус тәрізді бөлшектерге қарсы вакцина тышқандардағы адамның метапневмовирустық инфекцияларынан айқаспалы қорғанысты тудырады». Вакцина. 31 (25): 2778–2785. дои:10.1016 / j.vaccine.2013.03.051. PMID  23583815.
  5. ^ Turkel, Sezai (маусым 2016). «Аминқышқылдық аштық Saccharomyces cerevisiae Metavirus Ty3-те бағдарламаланған рибосомалық фреймді күшейтеді». Биологияның жетістіктері. 2016: 1–6. дои:10.1155/2016/1840782.
  6. ^ Нейман, П; Позаркова, Д; Macas, J (2003). «LTR ретротранспозондық бұршақ өте көп мөлшерде консервативті түрде транскрипцияланған және жартылай біріктірілген». Өсімдіктердің молекулалық биологиясы. 53 (3): 399–410. дои:10.1023 / B: ЖОСПАР.0000006945.77043.ce. PMID  14750527.
  7. ^ а б Menees, Thomas (2018). Вирустардың Springer индексі. Springer Nature. 843–849 беттер.
  8. ^ «Вирус таксономиясы: 2019 жылғы шығарылым». talk.ictvonline.org. Вирустардың таксономиясы бойынша халықаралық комитет. Алынған 30 сәуір 2020.
  9. ^ Бенахенхоу, Фарид; Спербер, Горан О .; Бонгкам-Рудлофф, Эрик; Андерссон, Горан; Буке, Джеф Д .; Бломберг, Джонас (2013). «Ұзақ терминалды қайталаулардың сақталған құрылымы және эволюциялық тарихы» (LTR) «. Мобильді ДНҚ. 4 (1): 5. дои:10.1186/1759-8753-4-5. PMC  3601003. PMID  23369192.
  10. ^ Коунин, М; Доля, V; Крупович, М (2015). «Эукариоттар вирустарының шығу тегі және эволюциясы: максималды модульдік». Вирусология. дои:10.1016 / j.virol.2015.02.039.
  11. ^ Гонг, З; Хан, Г (2018). «Жәндіктер ретроэлементтері гепатит В вирустары туралы жаңа түсінік береді». Молекулалық биология және эволюция. 35 (9): 2254–2259. дои:10.1093 / molbev / msy129. PMID  29924338.
  12. ^ а б Масканье, Фарид (2017). «Күнбағыс түрлеріндегі екі өте өзгермелі LTR ретротранспозондарының әртүрлі тарихы» (PDF). Джин. 634: 5–14. дои:10.1016 / j.gene.2017.08.014. hdl:11568/885451. PMID  28867564.
  13. ^ а б c Нефедов, Л (2009). «Дрософила ретротрранспозондары мен ретровирустарының молекулярлық филогениясы және систематикасы». Молекулалық биология. 43 (5): 747–756. дои:10.1134 / S0026893309050069.

Сыртқы сілтемелер