Марианна Фроммер - Marianne Frommer

Марианна Фроммер - австралиялық генетик. Ол дүниеге келді Гонконг және білім алған Сидней университеті - 1969 жылы BSc (Hons) және PhD докторы. Ол картаға хаттама жасаумен танымал ДНҚ метилденуі арқылы бисульфиттің геномдық реттілігі.

Мансап

Өз мансабының басында Фроммер адам геномындағы «спутниктік ДНҚ» молекулалық биологиясын зерттеді. Ол және оның әріптесі Джейн Проссер классикалық жерсеріктердің барлығы A + T бай қарапайым қайталанатын тізбектер екенін көрсетті.[1] Тағы бір маңызды нәтиже 1 спутниктегі қайталанатын блоктың бөлігі ретінде Alu (SINE) дәйектілігін анықтау болды, осылайша SINE центромерлі гетерохроматиннің өте көп қайталанатын компоненті бола алады.[2]

Содан кейін Фоммер бромдеоксюридинді бір тізбекті зондтарға қосуға негізделген радиоактивті емес таңбалаудың жаңа әдісін ойлап табу арқылы негізгі қарапайым тізбектегі қайталанулардың хромосомалық орналасуын анықтады.[3] Әдіс спутниктік қайталануларды локализациялау үшін өте дәл қолданылды. Бұл зерттеу тізбектелген геномдық қайталанатын ДНҚ-да CpG динуклеотидтеріндегі метилдену заңдылықтарын байқауға әкелді.[дәйексөз қажет ]

1984 жылы Фроммер Адриан Берд зертханасында оқу демалысын өткізіп, сүтқоректілер геномындағы ХТФ (HpaII Tiny Fragments) аралдарын сипаттауға қатысты.[4] Ол және оның PhD докторанты Маргарет Гардинер-Гарден осы геномдық компоненттерді метилдену күйін алдын-ала білмей, ДНҚ тізбегінің сипаттамалары бойынша ғана анықтай алды және оларға «CpG аралдары.[5] Олар CpG аралдарының омыртқалылар геномының айрықша белгісі екендігін және CpG аралдарының гендермен байланысты екендігін көрсетті. Олар жүйке және нейроэндокринді гендердің көпшілігінің CpG аралдарымен байланысты екенін көрсетті, сондықтан CpG аралдары жүйке прекурсорларынан реттелетін транскрипцияны жеңілдетеді және ерте эмбрионның жүйке тінін дамытады.[6]

1998 жылы Фроммер ДНҚ-ны дезаминдендіру реакциясының өнімдерін көбейтуге және метилденген және метилденбеген молекулаларды дидекси-секвенирлеу арқылы ажыратуға болатынын түсінді.[7] Фоммердің протоколы метилцитозин қалдықтарының айқын оң көрінісін берді. Бисульфитті реакциялардың ПТР өнімі ДНҚ молекулаларының популяциясындағы кез-келген CpG учаскесіндегі метилдену дәрежесін өлшеу үшін тікелей реттелуі мүмкін. Әдістің ерекше күші - ПТР өнімдерін клондау және тізбектеу метилдену заңдылықтарын немесе жалғыз ДНҚ молекулаларының «карталарын» шығарды.[8][9]

Фроммер және оның әріптестері жергілікті австралиялық жеміс шыбындарының көмегімен мінез-құлық сипаттамалары мен эволюциялық процестердің молекулалық биологиясын зерттейтін қуатты модель жүйесін жасады.[10][11]

Марапаттар

Фоммер ретінде сайланды Австралия ғылым академиясының мүшесі Ол мансабының екі кезеңінде толық емес жұмыс істеді.

Әдебиеттер тізімі

  1. ^ Фроммер, М., Просзер, Дж., Ткачук, Д., Рейснер, А.Х. және Винсент, П. (1982). Адамның серігі ДНҚ-да қайталанатын қарапайым тізбектер. Нуклеин қышқылдары 10: 547-563.
  2. ^ Фроммер, М., Просзер, Дж. Және Винсент, П.К. (1984). I спутниктік серияға ерлерге тән 2,47 килобремдік тандемиялық қайталанатын қондырғы кіреді, бұл қайталануына Алу отбасының бір мүшесі кіреді. Нуклеин қышқылдары 12: 2887-2900.
  3. ^ Фоммер, М., Пол, К. және Винсент, П.К. (1988). Бромодеоксюридинмен белгіленген зондтардың көмегімен адамның метафазалық хромосомаларында спутниктік ДНҚ тізбегін локализациялау. Хромосома 97: 11-18.
  4. ^ Берд, А., Таггарт, М., Фроммер, М., Миллер, О.Дж. және Macleod, D. (1985). Метилденбеген, CpG-ге бай ДНҚ аралдарынан алынған тышқан геномының бөлігі. 40-ұяшық: 91-99.
  5. ^ Гардинер-Гарден, М. және Фоммер, М. (1987). Омыртқалы геномдардағы CpG аралдары. Дж.Мол. Биол. 196: 261-282.
  6. ^ Гардинер-Гарден, М. және Фроммер, М. (1994). Пропиомеланокортин генімен және басқа жүйкелік экспрессияланған гендермен байланысты транскрипциялар мен CpG аралдары. Дж.Мол. Эндокринол. 12: 365-382.
  7. ^ Фроммер, М., Макдональд, Л.Е., Миллар, Д.С., Коллис, К.М., Уатт, Ф., Григ, Г.В., Моллой, П.Л. және Пол, К.Л. (1992). Жеке ДНҚ тізбегінде 5-метилцитозин қалдықтарының оң көрінісін беретін геномдық секвенция хаттамасы. Proc. Натл. Акад. Ғылыми. АҚШ 89: 1827-1831.
  8. ^ Кларк, СЖ, Харрисон, Дж., Пол, CL. және Фоммер, М. (1994). Метилденген цитозиндердің жоғары сезімталдық картасы. Нуклеин қышқылдары 22: 2990-2997.
  9. ^ Кларк, С.Ж., Стэтхэм, А., Стирзакер, С., Моллой, П.Л. және Фроммер, М. (2006). ДНҚ метилденуі: бисульфиттің модификациясы және анализі. Табиғат хаттамалары 1: 2353-2364.
  10. ^ Ан, X., Уилкс, К., Бастиан, Ю., Морроу, Дж.Л., Фроммер, М. және Рафаэль, К.А. (2002). Тефритидті жемістердің екі түріндегі периодтық ген жұптасу мінез-құлқымен ерекшеленеді. Мол молекуласы Биол. 11: 419-430.
  11. ^ Гилкрист, А.С., Ширман, DC, Фроммер, М., Рафаэль, К.А., Дешпанд, Н.П., Уилкинс, М.Р., Шервин, В.Б. және Свед, Дж.А. (ұсынылған). Bactrocera tryoni зиянкестерінің зиянкестерінің тефритті жемістерінің геномының жобасы: будандастырушы түрлердің геномдық анализі үшін ресурстар.