Липойл синтазы - Википедия - Lipoyl synthase

Липойл синтазы
Идентификаторлар
EC нөмірі2.8.1.8
CAS нөмірі189398-80-9
Мәліметтер базасы
IntEnzIntEnz көрінісі
БРЕНДАBRENDA жазбасы
ExPASyNiceZyme көрінісі
KEGGKEGG кірісі
MetaCycметаболизм жолы
PRIAMпрофиль
PDB құрылымдарRCSB PDB PDBe PDBsum
Ген онтологиясыAmiGO / QuickGO

Липойл синтазы - фермент радикалды SAM (S-аденозилметионин) тұқымдасы. SAM радикалды семьясының ішінде липойл синтазы күкірт енгізу реакцияларын катализдейтін ферменттердің кіші тобында болады. Бұл отбасындағы ферменттердің құрамында екі 4Fe-4S кластерлері, олардан олар тиісті субстраттарға ауысатын күкірт топтарын алады.[1] Бұл ерекше фермент липой қышқылының метаболизміне қатысады, сондықтан ол өзінің 4Fe-4S кластерінен екі күкіртті N ақуызға ауыстырады.6- (октанойл) лизин радикалды генерация арқылы. Бұл фермент әдетте митохондрияға локализацияланған. Осы ферментке қатысты жан-жақты зерттелген екі организм Ішек таяқшасы және Туберкулез микобактериясы. Ол басқа организмдерде, мысалы, ашытқы мен өсімдіктерде кездеседі.

Номенклатура

The жүйелік атауы осы ферменттер класына N6- (октанойл) лизин ақуызы жатады: күкірт күкіртрансферферазы. Жалпы қолданыстағы басқа атауларға мыналар жатады:

  • LS,
  • LipA,
  • липоат синтазы және
  • ақуыз 6-N- (октанойл) лизин: күкірт күкіртрансферфераза.

Липойл синтазасының механизмі

Липойл синтазы оның екі [4Fe-4S] кластерінің бірінен екі күкіртті пайдаланады және оларды N6- (липойл) лизин ақуызына айналдыру үшін оларды N6- (октанойл) лизин субстратының 6 және 8 көміртегіне бекітеді. Басқа [4Fe-4S] кластері ферменттің SAM радикалды мотивімен (CxxxCxxC) үйлестіріледі және келесі күкіртті енгізу үшін субстратты белсендіру үшін SAM радикалды сипаттамалық химиясына қатысады.[2] Төменде осы ферменттің жалпы реакциясы келтірілген:

Барлығы, 3 субстраттар осы ферменттің ішінен белок N6- (октанойл) лизин, күкірт, және S-аденозил-L-метионин оның 3 өнімдер ақуыз N6- (липойл) лизин, L-метионин, және 5'-дезоксиаденозин.

Липойл синтазасының маңызы

Бұл фермент қатысады липой қышқылы метаболизм, ол липой қышқылы биосинтезінің соңғы сатысын орындайды. Липой қышқылы - бұл әр организмде әр түрлі қызмет атқаратын кофактор.[3] The липой қышқылы ашытқы жасушаларында генерация жасушаларда бөліну санын көбейтеді, сонымен қатар ашытқы жасушаларын сутегі асқын тотығынан қорғайды.[4] Липой қышқылы көптеген ферменттік жүйелердегі маңызды ко-фактор болып табылады және олардың бірі пируват дегидрогеназа кешені.[5] Арабидопсис талиана дәндеріндегі липойл синтаза қызметін репрессиялаған зерттеулер оның тұқымның өсуіне және салмағына кері әсерін тигізбейтіндігін, бірақ өсу уақытын, сондай-ақ өсімдіктердің гүлдену уақытын қысқартқанын көрсетті. Репрессия гүлденудің ерте кезеңдеріне алып келді және тұқымдардың пайда болу уақытын 10% -ға азайтты.[6]

Мүмкін болатын жанама әсерлер

Күнбағыс өсімдіктерінде бұл ферменттің шамадан тыс экспрессиясы ақырында оның мөлшерін секвестрлейтіні анықталды SAM трансгенді арабидопсис өсімдіктерінде бар. SAM - бұл өсімдікте кездесетін басқа ферментативті кешендерде, сондай-ақ өсімдіктің жалпы құрылымында қажет болатын молекула, сондықтан бұл секвестр Арабидопсис тұқымындағы май қышқылы биосинтезінің төмендеуіне әкелуі мүмкін.[7]

Әдебиеттер тізімі

  1. ^ Маклафлин, Мартин I .; Ланц, Николас Д .; Голдман, Питер Дж.; Ли, Кын-Хун; Букер, Сквайр Дж .; Дреннан, Кэтрин Л. (2016-08-23). «Липойл синтазы арқылы күкіртті енгізудің кристаллографиялық суреттері». Ұлттық ғылым академиясының материалдары. 113 (34): 9446–9450. дои:10.1073 / pnas.1602486113. ISSN  0027-8424. PMC  5003258. PMID  27506792.
  2. ^ Джарретт, Джозеф Т. (2015-02-13). «Құрамында радикалды S-Аденосилметионин ферменттері катализдейтін тиол және тиоэфиритті кофакторлар мен екінші метаболиттердің биосинтезі». Биологиялық химия журналы. 290 (7): 3972–3979. дои:10.1074 / jbc.R114.599308. ISSN  0021-9258. PMC  4326807. PMID  25477512.
  3. ^ «ИнтерПро». www.ebi.ac.uk. Алынған 2020-04-20.
  4. ^ Croce, C. Della; Бронзетти, Г .; Цини, М .; Калтавутуро, Л .; Пой, Г. (2003-10-01). «Ашытқы жасушаларында сутегі асқын тотығынан липой қышқылының қорғаныс әсері». Витродағы токсикология. In vitro токсикология бойынша он екінші халықаралық семинар. 17 (5): 753–759. дои:10.1016 / j.tiv.2003.06.001. ISSN  0887-2333. PMID  14599473.
  5. ^ «Липой қышқылы». Линус Полинг институты. 2014-04-28. Алынған 2020-04-20.
  6. ^ Зоу, Джитао Ци, К. Катавич, В. Мариллиа, Элизабет Тейлор, Дэвид (1999). «Арабидопсис талиана пируваты дегидрогеназа киназа кДНҚ-ның антисензиялық репрессиясының өсімдіктердің дамуына әсері». Өсімдіктердің молекулалық биологиясы. 41 (6): 837–49. дои:10.1023 / а: 1006393726018. OCLC  672002645. PMID  10737148.CS1 maint: бірнеше есімдер: авторлар тізімі (сілтеме)
  7. ^ Мартинс-Ногуэрол, Ракель; Морено-Перес, Антонио Хавьер; Себастиен, Акет; Тронкозо-Понсе, Мануэль Адриан; Гарсе, Рафаэль; Томассет, Брижит; Салас, Хоакин Дж .; Мартинес-Форс, Энрике (2020-02-28). «Күнбағыс (Helianthus annuus L.) пластидиалды липойлдың трансгенді арабидопсис өсімдіктерінің глицеролипидтер құрамындағы гендердің экспрессиясын синтездеуі». Ғылыми баяндамалар. 10 (1): 3749. Бибкод:2020NATSR..10.3749M. дои:10.1038 / s41598-020-60686-z. ISSN  2045-2322. PMC  7048873. PMID  32111914.