KPNB1 - Википедия - KPNB1

KPNB1
Protein KPNB1 PDB 1f59.png
Қол жетімді құрылымдар
PDBОртологиялық іздеу: PDBe RCSB
Идентификаторлар
Бүркеншік аттарKPNB1, IMB1, IPO1, IPOB, Impnb, NTF97, кариоферин суббірлік бета 1
Сыртқы жеке куәліктерOMIM: 602738 MGI: 107532 HomoloGene: 1707 Ген-карталар: KPNB1
Геннің орналасуы (адам)
17-хромосома (адам)
Хр.17-хромосома (адам)[1]
17-хромосома (адам)
Genomic location for KPNB1
Genomic location for KPNB1
Топ17q21.32Бастау47,649,476 bp[1]
Соңы47,685,505 bp[1]
РНҚ экспрессиясы өрнек
PBB GE KPNB1 208975 s at fs.png

PBB GE KPNB1 208974 x at fs.png

PBB GE KPNB1 213803 at fs.png
Қосымша сілтеме өрнегі туралы деректер
Ортологтар
ТүрлерАдамТышқан
Энтрез
Ансамбль
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_002265
NM_001276453

NM_008379

RefSeq (ақуыз)

NP_001263382
NP_002256

NP_032405

Орналасқан жері (UCSC)Хр 17: 47.65 - 47.69 MbChr 11: 97.16 - 97.19 Mb
PubMed іздеу[3][4]
Уикидеректер
Адамды қарау / өңдеуТінтуірді қарау / өңдеу

Бета-1 импортын суббірлік Бұл ақуыз адамдарда кодталған KPNB1 ген.[5][6]

Функция

Нуклеоцитоплазмалық тасымалдау, сигналға және энергияға тәуелді процесс, ядролық қабыққа салынған ядролық кеуек кешендері арқылы жүзеге асады. Классикалық ақуыздардың импорты ядролық локализация сигналы (NLS) NLS импорт рецепторын, импортин альфа және бета суббірліктерінің гетеродимерін қажет етеді. Осы бөлімшелердің әрқайсысы кариоферин белоктар отбасы. Импорт альфа құрамында NLS бар жүкті байланыстырады цитоплазма және импортин бета-ядролық кеуектер кешенінің цитоплазмалық жағында орналасқан кешен. Нуклеозидті трифосфаттар мен RAN байланысатын ақуыз Ran болған кезде кешен ядролық кеуектер кешеніне ауысады және импортин суббірліктері диссоциацияланады. Импортин альфа кіреді нуклеоплазма оның жолаушы ақуызымен және импортинмен бета порамен қалады. Кеуектер кешені арқылы транслокация кезінде импортин-бета мен нуклеопориндердің FG қайталануы арасындағы өзара әрекеттесу маңызды. Бұл генмен кодталған ақуыз импортиндік бета отбасының мүшесі болып табылады.[7]

Өзара әрекеттесу

KPNB1 көрсетілген өзара әрекеттесу бірге:

Пайдаланылған әдебиеттер

  1. ^ а б c GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000108424 - Ансамбль, Мамыр 2017
  2. ^ а б c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000001440 - Ансамбль, Мамыр 2017
  3. ^ «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
  4. ^ «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
  5. ^ Chi NC, Adam EJ, Adam SA (тамыз 1995). «Цитоплазмалық ядролық ақуыз импорты факторының р97 реттілігі мен сипаттамасы». Дж. Жасуша Биол. 130 (2): 265–74. дои:10.1083 / jcb.130.2.265. PMC  2199936. PMID  7615630.
  6. ^ Görlich D, Kostka S, Kraft R, Dingwall C, Laskey RA, Hartmann E, Prehn S (қыркүйек 1995). «Импортиннің екі түрлі бөлімшелері ядролық оқшаулау сигналдарын тану және оларды ядролық қабықпен байланыстыру үшін ынтымақтастық жасайды». Curr. Биол. 5 (4): 383–92. дои:10.1016 / S0960-9822 (95) 00079-0. hdl:11858 / 00-001M-0000-002D-1CBD-2. PMID  7627554. S2CID  6055941.
  7. ^ «Entrez Gene: KPNB1 кариоферин (импортин) бета 1».
  8. ^ а б c Köhler M, Speck C, Christianen M, Bischoff FR, Prehn S, Haller H, Görlich D, Hartmann E (қараша 1999). «Ядролық ақуызды импорттауда альфа отбасы мүшелерінің импортинінің субстрат ерекшеліктерінің дәлелі». Мол. Ұяшық. Биол. 19 (11): 7782–91. дои:10.1128 / mcb.19.11.7782. PMC  84838. PMID  10523667.
  9. ^ Nachury MV, Ryder UW, Lamond AI, Weis K (қаңтар 1998). «HSRP1 гаммасын клондау және сипаттамасы, тіндік ядролық көлік факторы». Proc. Натл. Акад. Ғылыми. АҚШ. 95 (2): 582–7. дои:10.1073 / pnas.95.2.582. PMC  18463. PMID  9435235.
  10. ^ а б c Percipalle P, Clarkson WD, Kent HM, Rhodes D, Stewart M (наурыз 1997). «Импортин альфа / бета гетеродимері мен омыртқалылардың ядролық белок импортына қатысатын белоктар арасындағы молекулалық өзара әрекеттесулер». Дж.Мол. Биол. 266 (4): 722–32. дои:10.1006 / jmbi.1996.0801. PMID  9102465.
  11. ^ Нагоши Е, Йонеда Ю (сәуір, 2001). «Спираль-цикл-спираль-лейцин найзағай домені арқылы стеролды реттеуші элемент-байланыстыратын ақуыздың 2 димеризациясы оның импортин-бета арқылы жүретін ядролық оқшаулауының алғышарты болып табылады». Мол. Ұяшық. Биол. 21 (8): 2779–89. дои:10.1128 / MCB.21.8.2779-2789.2001. PMC  86908. PMID  11283257.
  12. ^ Ullman KS, Powers MA, Forbes DJ (қыркүйек 1997). «Ядролық экспорт рецепторлары: импортиннен экспортинге». Ұяшық. 90 (6): 967–70. дои:10.1016 / s0092-8674 (00) 80361-x. PMID  9323123. S2CID  577884.
  13. ^ Xiao Z, Liu X, Lodish HF (тамыз 2000). «Импортин-бета Smad 3 ядролық транслокациясына делдал болады». Дж.Биол. Хим. 275 (31): 23425–8. дои:10.1074 / jbc.C000345200. PMID  10846168.
  14. ^ а б c Бен-Эфраим I, Жерас Л (қаңтар 2001). «Ядролық импорт жолымен импортин бета-ның нуклеопориндерге жақындығының жоғарылау градиенті». Дж. Жасуша Биол. 152 (2): 411–7. дои:10.1083 / jcb.152.2.411. PMC  2199621. PMID  11266456.
  15. ^ Nakielny S, Shaikh S, Burke B, Dreyfuss G (сәуір 1999). «Nup153 - құрамында R9 байланыстыратын жаңа домені бар құрамында M9 бар қозғалмалы нуклеопорин». EMBO J. 18 (7): 1982–95. дои:10.1093 / emboj / 18.7.1982 ж. PMC  1171283. PMID  10202161.
  16. ^ Келенбах RH, Gerace L (маусым 2000). «Ядролық көлік техникасының фосфорлануы in vitro жағдайында ядролық белок импортын төмендетеді». Дж.Биол. Хим. 275 (23): 17848–56. дои:10.1074 / jbc.M001455200. PMID  10749866.
  17. ^ Линдсей М.Е., Плафкер К, Смит А.Е., Клурман Б.Е., Макара И.Г. (тамыз 2002). «Npap60 / Nup50 - импортин-альфа: бета-делдалдық ядролық ақуыздың импортын ынталандыратын үш тұрақты қосқыш». Ұяшық. 110 (3): 349–60. дои:10.1016 / s0092-8674 (02) 00836-x. PMID  12176322. S2CID  15515037.
  18. ^ Moroianu J, Blobel G, Radu A (қыркүйек 1997). «RanGTP-дің көмегімен кариоферфа альфасының ядролық экспорты оның Nup153 нуклеопоринімен өзара әрекеттесуін қамтиды». Proc. Натл. Акад. Ғылыми. АҚШ. 94 (18): 9699–704. дои:10.1073 / pnas.94.18.9699. PMC  23253. PMID  9275187.
  19. ^ Bonifaci N, Moroianu J, Radu A, Blobel G (мамыр 1997). «Karyopherin beta2 мРНҚ байланыстыратын ақуыздың ядролық импортына делдалдық етеді». Proc. Натл. Акад. Ғылыми. АҚШ. 94 (10): 5055–60. дои:10.1073 / pnas.94.10.5055. PMC  24630. PMID  9144189.
  20. ^ Акакура С, Йошида М, Йонеда Ю, Хоринучи С (мамыр 2001). «H570 температураға сезімтал р53-тің нуклеоцитоплазмалық тасымалын реттеудегі рөлі (p53Val-135)». Дж.Биол. Хим. 276 (18): 14649–57. дои:10.1074 / jbc.M100200200. PMID  11297531.
  21. ^ Cingolani G, Bednenko J, Gillespie MT, Gerace L (желтоқсан 2002). «Классикалық емес ядролық локализация сигналын импортин-бета арқылы танудың молекулалық негізі». Мол. Ұяшық. 10 (6): 1345–53. дои:10.1016 / s1097-2765 (02) 00727-x. PMID  12504010.
  22. ^ Лам МХ, Ху В, Сяо CY, Джилеспи МТ, Джанс ДА (наурыз 2001). «Паратгормонмен байланысты ақуыздың импортин бета1-танылған ядролық бағдарлау сигналының молекулалық диссекциясы». Биохимия. Биофиз. Res. Коммун. 282 (2): 629–34. дои:10.1006 / bbrc.2001.4607. PMID  11401507.
  23. ^ а б Ясин Н.Р., Blobel G (қыркүйек 1999). «GTP гидролизі nup358 нуклеопориніне ядролық импорттың басталуы мен тоқтатылуын байланыстырады». Дж.Биол. Хим. 274 (37): 26493–502. дои:10.1074 / jbc.274.37.26493. PMID  10473610.
  24. ^ а б Плафкер К, Макара IG (мамыр 2000). «Ран байланыстыратын ақуыз RanBP1-тің нуклеоцитоплазмалық жылжуын жеңілдету». Мол. Ұяшық. Биол. 20 (10): 3510–21. дои:10.1128 / mcb.20.10.3510-3521.2000. PMC  85643. PMID  10779340.
  25. ^ Delphin C, Guan T, Melchior F, Gerace L (желтоқсан 1997). «RanGTP ядролық кеуектер кешенінің цитоплазмалық перифериясында оқшауланған жіп тәрізді ақуызға - RanBP2-ге p97-ге бағытталған». Мол. Биол. Ұяшық. 8 (12): 2379–90. дои:10.1091 / mbc.8.12.2379 ж. PMC  25714. PMID  9398662.
  26. ^ Kutay U, Izaurralde E, Bischoff FR, Mattaj IW, Görlich D (наурыз 1997). «Импортин-бета-доминант-теріс мутанттары ядролық кеуектер кешені арқылы импорт пен экспорттың көптеген жолдарын жауып тастайды». EMBO J. 16 (6): 1153–63. дои:10.1093 / emboj / 16.6.1153. PMC  1169714. PMID  9135132.
  27. ^ Нараянан У, Оспина Дж.К., Фрей М.Р., Хебер МД, Матера АГ (шілде 2002). «SMN, жұлын бұлшықетінің атрофиясы протеині иммунитеттің бетіне snurportin1 және импортин бетасы бар snRNP кешенін құрайды». Хум. Мол. Генет. 11 (15): 1785–95. дои:10.1093 / hmg / 11.15.1785. PMC  1630493. PMID  12095920.

Әрі қарай оқу