Джозеф ДеРиси - Википедия - Joseph DeRisi

Джозеф ДеРиси
ҰлтыАмерикандық
Алма матерСтэнфорд университеті, Калифорния университеті, Санта-Круз
БелгіліViroChip, анықтау бойынша жұмыс ЖРВИ вирус, геннің экспрессиясы Plasmodium falciparum
Ғылыми мансап
ӨрістерБиология
МекемелерКалифорния университеті, Сан-Франциско Ховард Хьюз атындағы медициналық институт
Докторантура кеңесшісіПатрик О.Браун

Джозеф ДеРиси болып табылады Американдық биохимик, мамандандырылған молекулалық биология, паразитология, геномика, вирусология, және есептеу биологиясы.

Өмір

Ол Б.А. биохимия және молекулалық биология (1992 ж.) бастап Калифорния университеті, Санта-Круз және Ph.D. Биохимияда (1999) бастап Стэнфорд университеті.

Джозеф ДеРиси қазіргі уақытта Ховард Хьюз атындағы медициналық институт (HHMI) тергеушісі және профессор және кафедра төрағасы Биохимия және Биофизика кезінде Калифорния университеті, Сан-Франциско (UCSF) Калифорниядағы сандық биологиялық ғылымдар институты (QB3).

DeRisi-дің ең танымал жетістіктері - бұл тұтастығын басып шығару геномдық өрнек жиымы (DeRisi, JL; Айер, VR; Браун, ПО (1997). «Геномдық шкала бойынша гендердің экспрессиясының метаболикалық және генетикалық бақылауын зерттеу». Ғылым. 278 (5338): 680–6. Бибкод:1997Sci ... 278..680D. CiteSeerX  10.1.1.335.7937. дои:10.1126 / ғылым.278.5338.680. PMID  9381177.), рак клеткаларындағы дифференциалды ген экспрессиясының алғашқы кең талдауын жасау (ДеРиси, Дж; Пенландия, Л; Браун, ПО; Bittner, ML; Meltzer, PS; Рэй, М; Чен, У; Су, Я; Trent, JM (1996). «Адамның қатерлі ісігі кезінде гендердің экспрессиясының заңдылықтарын талдау үшін cDNA микроарресін қолдану». Nat Genet. 14 (4): 457–60. дои:10.1038 / ng1296-457. PMID  8944026. S2CID  23091561.), геннің экспрессиясын бүкіл өмірлік циклында профильдеу безгек - протозойды тудырады Plasmodium falciparum,[1] оның ашылуы ЖРВИ вирус,[2] және гендерді будандастыру массивін және ДНҚ-ны тізбектеу технологияларын қолдана отырып, вирустың ашылуын бастау (Ванг, Д; Коской, Л; Цилберберг, М; Авила, ДК; Буши, Х.А; Ганем, Д; DeRisi, JL (2002). «Микроаррея негізінде вирустық қоздырғыштарды анықтау және генотиптеу». Proc Natl Acad Sci U S A. 99 (24): 15687–92. Бибкод:2002 PNAS ... 9915687W. дои:10.1073 / pnas.242579699. PMC  137777. PMID  12429852.). Джо сонымен қатар кез-келген «салқын мәселені» шешумен танымал, ол, әдетте, жаңа хаттамалар мен тәсілдерді ойлап таппай шешілмейтін кедергілермен күрделі биологиялық сұрақтар түрінде туындайды.

DeRisi қолданады микроаралар өзінің жұмысында кең ауқымды және микроарналуға арналған аппараттық және бағдарламалық жасақтаманы құрастырды және құрастырды. Ол жақтаушысы ашық қол жетімділік микроарра технологиясына,[дәйексөз қажет ] бағдарламалық қамтамасыздандырумен және микроарряд операцияларына арналған хаттамалармен веб-сайтты жүргізеді.[дәйексөз қажет ] Ол сонымен қатар ашық қол жетімді жариялау,[дәйексөз қажет ] және басылымдары бар Ғылымның көпшілік кітапханасы журналдар.[3]

DeRisi адамдарда ауруды тудыратын болжамды вирустарды анықтады (қатерлі ісік, ЖРВИ, басқа да тыныс жолдарының инфекциясы және т.б.), жануарлар попугаялар мен коктейлдерден аралар мен боа констрикторларына дейін. Ол және ғылыми серіктес, Дон Ганем паразитті анықтады, Nosema ceranae, бұл аралар арасындағы колонияның құлдырауына жауапты көрінеді.[4] Ол сонымен қатар вирустың адам қатерлі ісігінің кейбір ішкі топтарына қатыстылығын тоқтатты.

Мүмкін, қазіргі заманғы жаһандық денсаулық үшін ең маңызды болып табылады, оның сипаттамасына негізделген безгек -қоздырғышы, Plasmodium falciparum, DeRisi тобы безгекті емдеуге арналған үміткерге арналған дәрі-дәрмектерді және безгектің алдын алу үшін вакцина моделін жасады.

2004 жылы DeRisi а Макартур («Genius» сыйлығы), 2008 жылы 14-ші жылдық марапатталды Хайнц сыйлығы Технология, экономика және жұмыспен қамту саласы бойынша және 2014 жылы Джон Дж.Карти атындағы Ұлттық ғылым академиясының ғылымды өркендету үшін сыйлығын алды. 2016 жылы ол сайланды Ұлттық ғылым академиясы.[5]

Оның дамуына қатысқан ViroChip, ол дене сұйықтықтарындағы вирустарды жылдам анықтау үшін қолданылады. Бұл анықтауға көмектесу үшін қолданылды Ауыр жедел респираторлық синдром Ол 2003 жылы вирусты шығарды. Ол сонымен қатар деп аталатын онлайн платформаны жасауға қатысқан IDseq,[6] қолдауымен Чан Цукербергтің бастамасы вирустарды анықтау үшін қолданылады метагеномиялық реттілік деректер.[7]

Марапаттар

Әдебиеттер тізімі

  1. ^ Ллинас, Мануэль; Боздеч, Збынек; Вонг, Эдит Д .; Адай, Алекс Т .; Дериси, Джозеф Л. (2006), «Үш плазмодиум фальципарум штамдарының геномдық транскриптомдық салыстырмалы анализі», Нуклеин қышқылдарын зерттеу, 34 (4): 1166, дои:10.1093 / nar / gkj517, PMC  1380255, PMID  16493140
  2. ^ Рота, Пол А .; Оберсте, М.Стивен; Монро, Стефан С .; Никс, В.Аллан; Кампаноли, Рэй; Icenogle, Джозеф П .; Пенаранда, Сильвия; Банкамп, Беттина; Махер, Кайджа; Беллини, Уильям Дж. (2003), «Ауыр өткір респираторлық синдроммен байланысты коронавирустың романының сипаттамасы», Ғылым, 300 (5624): 1394, Бибкод:2003Sci ... 300.1394R, дои:10.1126 / ғылым.1085952, PMID  12730500
  3. ^ Боздеч, Збынек; Ллинас, Мануэль; Пулям, Брайан Ли; Вонг, Эдит Д .; Чжу, Цзинчун; Дериси, Джозеф Л. (2003), «Плазмодий фальципарумының интраэритроциттік даму циклінің транскриптомы», PLOS биологиясы, 1 (1): e5, дои:10.1371 / journal.pbio.0000005, PMC  176545, PMID  12929205 ашық қол жетімділік
  4. ^ «UCSF ақсүйектері жоғалып бара жатқан аралар құпиясына күдіктілерді анықтайды».
  5. ^ Ұлттық ғылым академиясының мүшелері және шетелдік қауымдастырушылар сайланды, Ұлттық ғылым академиясының жаңалықтары, Ұлттық ғылым академиясы, 3 мамыр 2016 жыл, мұрағатталған түпнұсқа 2016 жылғы 6 мамырда, алынды 2016-05-14.
  6. ^ Калантар, Катрина Л; Карвальо, Тиаго; де Бурси, Чарльз Ф А; Димитров, Борис; Дингл, Грег; Эггер, Ребекка; Хан, Джули; Холмс, Оливия Б; Хуан, Юн-Фанг; Король, Райан; Кислюк, Андрей (қазан 2020). «IDseq - метагеномдық қоздырғышты анықтау және бақылау үшін ашық бұлтқа негізделген құбыр желісі және талдау қызметі». GigaScience. 9 (10). дои:10.1093 / gigascience / giaa111. ISSN  2047-217X.
  7. ^ «Кедей елдердегі жұмбақ аурулардың түбіне жетудің қарапайым тәсілі». Атлант. 16 қазан 2018. Алынған 27 қараша 2018.

Сыртқы сілтемелер