Изохора (генетика) - Isochore (genetics)

Генетикада ан изохора болып табылады ДНҚ (300-ден жоғары) кб ) гуаниннің (G) және цитозиннің (C) жоғары біркелкілігі: G-C және C-G (жиынтықта) GC мазмұны ).

Бернарди және оның әріптестері алдымен термиялық балқыту және тығыздық градиентті центрифугалау көмегімен омыртқалы жануарлардың геномындағы композициялық біркелкіліктің жоқтығын анықтады.[1] [2] [3] Градиентті центрифугалау арқылы алынған ДНҚ фрагменттері кейінірек «изохоралар» деп аталды,[4] ол кейіннен «өте ұзын (200 КБ-дан көп) ДНҚ сегменттері» ретінде анықталды, олар «базалық құрамы бойынша едәуір біртектес және гуанин-цитозиннің (GC) құрамындағы айырмашылықтармен ерекшеленетін аздаған негізгі кластарға жатады».[3] Кейіннен изохоралар «өсті» және олардың өлшемі «> 300 кб» болатынын мәлімдеді.[5] [6] Теория изохораның құрамы «жылы қанды» (гомеотермді) омыртқалылар мен «суық қанды» (пойкилотермді) омыртқалылар арасында айтарлықтай өзгеріп отырды деген болжам жасады.[3] кейінірек изохоралық теория ретінде белгілі болды.

Термодинамикалық тұрақтылық гипотезасы

Изохора теориясы «жылы қанды» омыртқалы жануарлардың (сүтқоректілер мен құстардың) геномы «суық қанды» омыртқалылардың (балықтардың) геномына қарағанда, ауыспалы GC-кедей және GC-ге бай құрамының ұзын изохоралық аймақтарының мозайкалары болып табылады деген болжам жасады. ГК-ге бай изохоралар болмауы керек болатын).[3][7] [8] [9] [10] [11] Бұл нәтижелер геномдық құрылымды дене температурасына жатқызып, термодинамикалық тұрақтылық гипотезасымен түсіндірілді. GC-ге бай изохоралар қоршаған орта қысымына бейімделудің бір түрі болып саналды, өйткені геномдық GC-мөлшерінің жоғарылауы ДНҚ, РНҚ және ақуыздарды жылу әсерінен ыдыратудан сақтай алады. [3][4]

Өзінің тартымды қарапайымдылығына қарамастан, термодинамикалық тұрақтылық гипотезасы қателіктермен бірнеше рет дәлелденді [12] [13] [14] .[15] [16] [17] [18] [19] Көптеген авторлар омыртқалыларда температура мен GC-мазмұнының арасында тәуелділіктің жоқтығын көрсетті,[17][18] ал басқалары қолтырауын, амфибия және балық сияқты «суық қанды» омыртқалыларда GC-ге бай домендердің бар екендігін көрсетті.[14][20] [21]

Изохора теориясының принциптері

Изохоралық теория бірінші болып омыртқалы геномдардағы нуклеотидтік құрамның біркелкі еместігін анықтап, сүтқоректілер мен құстар сияқты «жылы қанды» омыртқалы жануарлардың геномы изохоралар мозайкасы деп болжады (Бернарди және басқалар. 1985). Мысалы, адам геномы LC, L1, L2, H1, H2, H3, бес композициялық отбасыларға жататын төмен және жоғары GC құрамындағы изохоралардың ауыспалы мозайкасы ретінде сипатталды, олардың сәйкесінше GC мазмұны <38% , Тиісінше 38% -42%, 42% -47%, 47% -52% және> 52%.[22]

Изохора теориясының негізгі болжамдары:

  • Ақуызды кодтайтын гендердің үшінші кодондық позициясының (GC3) GC мазмұны сәйкес гендерді ендіретін изохоралардың GC құрамымен байланысты.[22]
  • Жылы қанды омыртқалы жануарлардың геномдық ұйымы көбінесе ГК-ға бай изохоралардан тұратын мозаика болып табылады.[23]

[24]

  • Суық қанды омыртқалы жануарлардың геномдық ұйымы GC құрамының төмен болуымен және жылы қанды омыртқалыларға қарағанда композициялық гетерогендігімен сипатталады. Біртекті домендер жылы қанды омыртқалылардың геномдары қол жеткізген жоғары GC деңгейіне жете бермейді.[23][24]

Бейтарапшы-селекционистік дау

Изохоралардың түзілуін түсіндіруге тырысқан екі қарама-қарсы түсініктеме бейтарап-селекционистік даудың бір бөлігі ретінде қызу талқыланды. Бірінші көзқарас изохоралар геномды аймақтар арасындағы бейтарап модельге сәйкес келетін өзгермелі мутациялық процестерді көрсетеді.[25] [26] Сонымен қатар, изохоралар белгілі гендер талап ететін белгілі бір композициялық орта үшін табиғи сұрыпталу нәтижесінде пайда болды.[27] Термодинамикалық тұрақтылық гипотезасы сияқты бірнеше гипотезалар селекционистік көзқарастан шығады [6][28] және геннің конверсиясының біржақты гипотезасы.[26] Осы уақытқа дейін бірде-бір теория геном құрылымына жан-жақты түсіндірме бермейді және тақырып әлі де болса талқылануда.

Изохора теориясының өрлеуі мен құлдырауы

Изохора теориясы ең пайдалы теориялардың бірі болды молекулалық эволюция көптеген жылдар бойы. Бұл эволюциялық шеңберде омыртқалылар геномдарының ұзақ мерзімді композициялық гетерогенділігін түсіндіруге бағытталған алғашқы және жан-жақты әрекет болды. Алғашқы жылдардағы изохоралық модельге деген қызығушылыққа қарамастан, соңғы жылдары теорияның әдіснамасы, терминологиясы мен болжамдары сынға алынды.

Бұл теория 20-шы ғасырда толық геномдар тізбектелместен бұрын ұсынылғандықтан, оны шамамен 30 жыл бойы толық тексеруден өткізу мүмкін болмады. ХХІ ғасырдың басында алғашқы геномдар пайда болған кезде адам геномында изохоралар жоқ екендігі анық болды[29] және басқа сүтқоректілердің геномдарында болмайды.[30] Изохоралар табылмаған кезде, көпшілік изохоралардың өмір сүруіне шабуыл жасады.[29][31] [32] [33] [34] Изохоралардың ең маңызды болжаушысы GC3-тің болжамды күші жоқ екендігі көрсетілген [35] [36] көптеген изохоралық зерттеулерге негіз болған 30 жылдан астам зерттеулердің нәтижелерін жоққа шығаратын жақын геномикрегиондардың GC мазмұнына. Изохораның бастамашылары бұл термин дұрыс түсіндірілмеген деп жауап берді [22][37] [38] өйткені изохоралар «біртекті» емес, керісінше біртекті аймақтар бірге 5 кб шкала бойынша ГК-ге бай аймақтардың гетерогенді табиғаты (әсіресе),[39] бұл тек онсыз да өсіп келе жатқан шатасуды толықтырды. Осы тұрақты күйзелістің себебі ретінде изохоралардың анық емес анықтамасы болды ұзақ және біртекті, кейбір зерттеушілерге «изохораларды» ашуға, ал басқаларына оларды жіберуге мүмкіндік берді, дегенмен екі лагерь бірдей деректерді қолданды.

Бұл даудың жағымсыз жанама әсері «қарулану жарысы» болды, онда изохоралар жиі өзгертіліп, «изохоралар мозайкасын» анықтай алмаған қарама-қайшы тұжырымдардан кейін қайта аталатын болды. [22][31][33] Бұл дау-дамайдың және келесі терминологиялық-әдістемелік балшықтың өкінішті нәтижелері ғылыми қауымдастықтың изохораларға деген қызығушылығын жоғалту болды. Изохоралық әдебиеттегі ең маңызды ядро-тұжырымдама - термодинамикалық тұрақтылық гипотезасы қабылданбаған кезде, теория өзінің тартымдылығын жоғалтты. Қазіргі кезде де изохораларға нақты анықтама берілмеген және изохораларды анықтайтын алгоритм де жоқ.[40] Изохоралар GC мазмұнының қисықтарын визуалды тексеру арқылы қолмен анықталады,[41] дегенмен, бұл тәсіл ғылыми тұрғыдан жетіспейтіндіктен және оны тәуелсіз топтар қайталай алмайтындықтан, тұжырымдар даулы болып қала береді.

Композициялық домен моделі

Негізгі мақала: Композициялық домен моделі

Изохораларды зерттеу қалай болды іс жүзінде көптеген ғалымдар тастап кеткен геномдық зерттеулерге сәйкес геномдардың композициялық ұйымдастырылуын сипаттайтын балама теория ұсынылды. Композициялық домен моделі геномдарды қысқа және ұзын гомогенді және біртекті емес домендер ретінде бейнелейді.[34] Теория «композициялық домендерді» есептеу сегменттеу алгоритмімен анықталған GC мазмұны айқын геномдық аймақтар ретінде анықтайды.[34] Композициялық домендердің біртектілігін олар F-тестінің көмегімен орналасқан хромосомамен салыстырады, бұл оларды тестілеу нәтижелері бойынша композициялық біртекті домендерге және композициялық біртекті емес домендерге бөлді. Композициялық жағынан біртекті домендер жеткілікті ұзақ (≥ 300 кб) изохоралар немесе изохоралық домендер деп аталады. Бұл терминдер әдебиеттерге сәйкес келеді, өйткені олар изохоралық және изисохорикалық емес домендердің арасындағы айырмашылықты анықтайды.

Адам геномын жан-жақты зерттеу геномның үштен екісі көптеген қысқа композициялық біртекті домендердің және салыстырмалы түрде ұзын домендердің қоспасы болатын геномдық ұйымды ашты. Геномның қалған бөлігі біртекті емес домендерден тұрады. Қамту тұрғысынан композициялық біртекті домендердің жалпы санының тек 1% -ы геномның 20% -дан азын қамтыған «изохоралар» деп санауға болатын еді.[34]

Өзінің пайда болуынан бастап теорияға көп көңіл бөлінді және оннан астам жаңа геномды тізбектеу зерттеулерінің нәтижелерін түсіндіру үшін кеңінен қолданылды.[30][42] [43] [44] [45] [46] [47] [48] [49] көптеген маңызды сұрақтар ашық күйінде қалып отыр, мысалы, қандай эволюциялық күштер композициялық домен құрылымын қалыптастырды және олар әр түрлі түрлерімен қалай ерекшеленеді?

Әдебиеттер тізімі

  1. ^ Макая, Тиери және Бернарди (1976). «Эукариоттық геномдарды макромолекулалық деңгейде ұйымдастыруға көзқарас». Молекулалық биология журналы. 108 (1): 237–254. дои:10.1016 / S0022-2836 (76) 80105-2. PMID  826644.CS1 maint: бірнеше есімдер: авторлар тізімі (сілтеме)
  2. ^ Тиери, Макая және Бернарди (1976). «Эукариоттық геномдарды тығыздық градиентті центрифугалау арқылы талдау». Молекулалық биология журналы. 108 (1): 219–235. дои:10.1016 / S0022-2836 (76) 80104-0. PMID  826643.CS1 maint: бірнеше есімдер: авторлар тізімі (сілтеме)
  3. ^ а б c г. e Бернарди; Олофссон, Биргитта; Филиппски, қаңтар; Зериал, Марино; Салинас, Хулио; Куни, Жерар; Meunier-Rotival, Michele; Родье, Фрэнсис; т.б. (1985). «Жылы қанды омыртқалы жануарлардың мозаикалық геномы». Ғылым. 228 (4702): 953–958. Бибкод:1985Sci ... 228..953B. дои:10.1126 / ғылым.4001930. PMID  4001930.
  4. ^ а б Куни; Сориано, П; MacAya, G; Бернарди, Дж; т.б. (1981). «Тышқанның және адам геномының негізгі компоненттері: дайындық, негізгі қасиеттері және композициялық гетерогендігі». Еуропалық биохимия журналы. 115 (2): 227–233. дои:10.1111 / j.1432-1033.1981.tb05227.x. PMID  7238506.
  5. ^ Салиналар; Зериал, М; Филиппски, Дж; Крепин, М; Бернарди, Дж; т.б. (1987). «Тышқан геномындағы MMTV провиральды тізбегінің кездейсоқ таралуы». Нуклеин қышқылдары. 15 (7): 3009–3022. дои:10.1093 / нар / 15.7.3009. PMC  340712. PMID  3031617.
  6. ^ а б Бернарди (1993). «Омыртқалы геном: изохоралар және эволюция». Молекулалық биология және эволюция. 10 (1): 186–204. дои:10.1093 / oxfordjournals.molbev.a039994. PMID  8450755.
  7. ^ Бернарди (1995). «Адам геномы: ұйым және эволюциялық тарих». Жыл сайынғы генетикаға шолу. 29: 445–476. дои:10.1146 / annurev.ge.29.120195.002305. PMID  8825483.
  8. ^ Бернарди, Хьюз және Мучиро (1997). «Омыртқалы геномдағы негізгі композициялық ауысулар». Молекулалық эволюция журналы. 44 Қосымша 1 (S1): S44-51. Бибкод:1997JMolE..44S..44B. дои:10.1007 / PL00000051. PMID  9071011.CS1 maint: бірнеше есімдер: авторлар тізімі (сілтеме)
  9. ^ Робинзон, Готье және Муширо (1997). «Кеміргіштердегі изохоралар эволюциясы». Молекулалық биология және эволюция. 14 (8): 823–828. дои:10.1093 / oxfordjournals.molbev.a025823. PMID  9254920.CS1 maint: бірнеше есімдер: авторлар тізімі (сілтеме)
  10. ^ Гальтье мен Муширо; Mouchiroud, D (1998). «Сүтқоректілердегі изохоралық эволюция: адамға ұқсас тектік құрылым». Генетика. 150 (4): 1577–1584. PMC  1460440. PMID  9832533.
  11. ^ Оливер; Бернаола-Галван, П; Карпена, П; Роман-Ролдан, Р; т.б. (2001). «Эукариоттық геномдардың изохоралық хромосомалық карталары». Джин. 276 (1–2): 47–56. CiteSeerX  10.1.1.14.1712. дои:10.1016 / S0378-1119 (01) 00641-2. PMID  11591471.
  12. ^ Aota және Ikemura; Икемура, Т (1986). «Омыртқалы гендердегі кодондардың үшінші позициясындағы G + C құрамындағы әртүрлілік және оның себебі». Нуклеин қышқылдары. 14 (16): 6345–6355. дои:10.1093 / nar / 14.16.6345. PMC  311650. PMID  3748815.
  13. ^ Гальтье мен Лобри; Lobry, JR (1997). «G + C геномдық құрамы, РНҚ екінші құрылымдары және прокариоттардағы оңтайлы өсу температурасы арасындағы қатынастар». Молекулалық эволюция журналы. 44 (6): 632–636. Бибкод:1997JMolE..44..632G. дои:10.1007 / PL00006186. PMID  9169555.
  14. ^ а б Хьюз, Зелус және Мучиро (1999). «Ніл крокодилі мен тасбақасындағы жылы қанды изохор құрылымы». Молекулалық биология және эволюция. 16 (11): 1521–1527. дои:10.1093 / oxfordjournals.molbev.a026064. PMID  10555283.CS1 maint: бірнеше есімдер: авторлар тізімі (сілтеме)
  15. ^ Эйр-Уокер және Херст; Херст, LD (2001). «Изохоралардың эволюциясы». Nat Rev Genet. 2 (7): 549–555. дои:10.1038/35080577. PMID  11433361.
  16. ^ Херст және саудагер; Merchant, AR (2001). «Жоғары гуанин-цитозин мөлшері жоғары температураға бейімделу емес: прокариоттар арасындағы салыстырмалы талдау». Корольдік қоғамның еңбектері B. 268 (1466): 493–497. дои:10.1098 / rspb.2000.1397. PMC  1088632. PMID  11296861.
  17. ^ а б Belle, Smith және Eyre-Walker (2002). «Омыртқалыларда изохоралардың филогенетикалық таралуын талдау және термиялық тұрақтылық гипотезасын тексеру». Молекулалық эволюция журналы. 55 (3): 356–363. Бибкод:2002JMolE..55..356B. дои:10.1007 / s00239-002-2333-1. PMID  12187388.CS1 maint: бірнеше есімдер: авторлар тізімі (сілтеме)
  18. ^ а б Рим, Джонс және Сомеро (2003). «Әртүрлі бейімделген омыртқалылардан {альфа--Актин мен лактатдегидрогеназа-А кодтайтын гендердің негізгі құрамы температура көрсетпейді - G + C мазмұны бойынша адаптивті өзгеріс». Молекулалық биология және эволюция. 20 (1): 105–110. дои:10.1093 / molbev / msg008. PMID  12519912.CS1 maint: бірнеше есімдер: авторлар тізімі (сілтеме)
  19. ^ Belle; Дюрет, Л; Гальтье, Н; Эйр-Уокер, А; т.б. (2004). «Сүтқоректілердегі изохоралардың төмендеуі: сүтқоректілер филогенезі бойынша GC құрамының өзгеруін бағалау». Молекулалық эволюция журналы. 58 (6): 653–660. Бибкод:2004JMolE..58..653B. CiteSeerX  10.1.1.333.2159. дои:10.1007 / s00239-004-2587-x. PMID  15461422.
  20. ^ Хьюз, Фридман және Мюррей (2002). «Микобактерия туберкулезінің екі толық геномындағы синонимдік нуклеотидтің орнын басудың геномевидтік үлгісі». Пайда болып жатқан инфекциялық аурулар. 8 (11): 1342–1346. дои:10.3201 / eid0811.020064. PMC  2738538. PMID  12453367.CS1 maint: бірнеше есімдер: авторлар тізімі (сілтеме)
  21. ^ Костантини, Аулетта және Бернарди (2007). «Балық геномдарындағы изохоралық заңдылықтар және гендердің таралуы». Геномика. 90 (3): 364–371. дои:10.1016 / j.ygeno.2007.05.006. PMID  17590311.CS1 maint: бірнеше есімдер: авторлар тізімі (сілтеме)
  22. ^ а б c г. Бернарди (2001). «Изохоралар туралы түсінбеушіліктер. 1 бөлім». Джин. 276 (1–2): 3–13. дои:10.1016 / S0378-1119 (01) 00644-8. PMID  11591466.
  23. ^ а б Бернарди (2000). «Изохоралар және омыртқалылардың эволюциялық геномикасы». Джин. 241 (1): 3–17. дои:10.1016 / S0378-1119 (99) 00485-0. PMID  10607893.
  24. ^ а б Бернарди (2000). «Омыртқалы геномдардың композициялық эволюциясы». Джин. 259 (1–2): 31–43. дои:10.1016 / S0378-1119 (00) 00441-8. PMID  11163959.
  25. ^ Вулфе, Шарп және Ли; Өткір; Ли (1989). «Мутация жылдамдығы сүтқоректілер геномының аймақтарында ерекшеленеді». Табиғат. 337 (6204): 283–285. Бибкод:1989 ж.337..283W. дои:10.1038 / 337283a0. PMID  2911369.CS1 maint: бірнеше есімдер: авторлар тізімі (сілтеме)
  26. ^ а б Гальтье; Пигано, Дж; Мучиро, Д; Дюрет, Л; т.б. (2001). «Сүтқоректілер геномындағы GC- мазмұн эволюциясы: гендердің конверсиялануының біржақты гипотезасы». Генетика. 159 (2): 907–911. PMC  1461818. PMID  11693127.
  27. ^ Матасси, Шарп және Готье (1999). «Сүтқоректілердегі гендердің реттілігі эволюциясына хромосомалық орналасу әсері». Қазіргі биология. 9 (15): 786–791. дои:10.1016 / S0960-9822 (99) 80361-3. PMID  10469563.CS1 maint: бірнеше есімдер: авторлар тізімі (сілтеме)
  28. ^ Бернарди мен Бернарди; Бернарди, Г (1986). «Композициялық шектеулер және геном эволюциясы». Молекулалық эволюция журналы. 24 (1–2): 1–11. Бибкод:1986JMolE..24 .... 1B. дои:10.1007 / BF02099946. PMID  3104608.
  29. ^ а б Жан; Линтон, ЛМ; Биррен, Б; Нусбаум, С; Зоди, MC; Болдуин, Дж; Девон, К; Девар, К; т.б. (2001). «Адам геномының алғашқы реттілігі және талдауы» (PDF). Табиғат. 409 (6822): 860–921. Бибкод:2001 ж.409..860L. дои:10.1038/35057062. PMID  11237011.
  30. ^ а б Элсик; Элсик, Кристин Дж.; Теллам, Росс Л .; Уорли, Ким С .; Гиббс, Ричард А .; Элсик, Кристин Дж.; Теллам, Росс Л .; Гиббс, Ричард А .; Музный, Донна М .; т.б. (2009). «Тауринді малдың геномдық тізбегі: күйіс қайыратын биология мен эволюцияға жол». Ғылым. 324 (5926): 522–528. Бибкод:2009Sci ... 324..522A. дои:10.1126 / ғылым.1169588. PMC  2943200. PMID  19390049.
  31. ^ а б Некрутенко және Ли; Ли, WH (2000). «Эукариоттық геномдар арасындағы және арасындағы композициялық гетерогенділікті бағалау». Геномды зерттеу. 10 (12): 1986–1995. дои:10.1101 / гр.10.12.1986 ж. PMC  313050. PMID  11116093.
  32. ^ Харинг және Кипр; Kypr, J (2001). «Адамның 21 және 22 хромосомаларында изохоралар жоқ па?». Биохимиялық және биофизикалық зерттеулер. 280 (2): 567–573. дои:10.1006 / bbrc.2000.4162. PMID  11162557.
  33. ^ а б Коэн; Даган, Т; Тас, L; Граур, Д; т.б. (2005). «Адам геномының МК құрамы: изохораларды іздеуде». Молекулалық биология және эволюция. 22 (5): 1260–1272. дои:10.1093 / molbev / msi115. PMID  15728737.
  34. ^ а б c г. Эльхайк; Граур, Д; Йошич, К; Ландан, Г; т.б. (2010). «Сегменттеудің жаңа алгоритмін қолдана отырып, адам геномындағы композициялық біртекті және біртекті емес домендерді анықтау». Нуклеин қышқылдары. 38 (15): e158. дои:10.1093 / nar / gkq532. PMC  2926622. PMID  20571085.
  35. ^ Эльхайк, Ландан және Граур (2009). «Үшінші кодон жағдайындағы GC мазмұнын изохораның құрамы үшін прокси ретінде пайдалануға бола ма?». Молекулалық биология және эволюция. 26 (8): 1829–1833. дои:10.1093 / molbev / msp100. PMID  19443854.CS1 maint: бірнеше есімдер: авторлар тізімі (сілтеме)
  36. ^ Татаринова; Александров, Н.Н. Бук, Дж.Б; Фельдманн, Калифорния; т.б. (2010). «Жүгері, күріш, сорго және басқа шөптердегі GC3 биологиясы». BMC Genomics. 11: 308. дои:10.1186/1471-2164-11-308. PMC  2895627. PMID  20470436.
  37. ^ Ли; Бернаола-Гальван, Педро; Карпена, Педро; Оливер, Хосе Л; т.б. (2003). «Isochores 'iso префиксіне лайық'". Есептеу биологиясы және химия. 27 (1): 5–10. arXiv:физика / 0209080. Бибкод:2002 физика ... 9080L. дои:10.1016 / S1476-9271 (02) 00090-7. PMID  12798034.
  38. ^ Клей мен Бернарди (2005). «Изохораларды қалай іздемеуге болады: Коэнге және басқаларға жауап». Молекулалық биология және эволюция. 22 (12): 2315–2317. дои:10.1093 / molbev / msi231. PMID  16093569.
  39. ^ Ромигуье; Ранвез, V; Douzery, EJ; Гальтье, Н; т.б. (2010). «33 сүтқоректілер геномындағы GC-мазмұнының қарама-қарсы динамикасы: өмір тарихының белгілерімен және хромосомалардың өлшемдерімен байланыс». Геномды зерттеу. 20 (8): 1001–1009. дои:10.1101 / гр.104372.109. PMC  2909565. PMID  20530252.
  40. ^ Elhaik, Graur, and Josic (2010). «Эталондық модельдеуді қолдану арқылы ДНҚ сегменттеу алгоритмдерін салыстырмалы тестілеу». Молекулалық биология және эволюция. 27 (5): 1015–1024. дои:10.1093 / molbev / msp307. PMID  20018981.CS1 maint: бірнеше есімдер: авторлар тізімі (сілтеме)
  41. ^ Костантини; Саз, O; Auletta, F; Бернарди, Дж; т.б. (2006). «Адамның хромосомаларының изохоралық картасы». Геномды зерттеу. 16 (4): 536–541. дои:10.1101 / гр.4910606. PMC  1457033. PMID  16597586.
  42. ^ Жалпы,.; Робинсон, Джин Е .; Гиббс, Ричард А .; Вайнсток, Джордж М .; Вайнсток, Джордж М .; Робинсон, Джин Е .; Уорли, Ким С .; Эванс, Джей Д .; т.б. (2006). «Apis mellifera арасы геномынан алынған әлеуметтік жәндіктер туралы түсінік». Табиғат. 443 (7114): 931–949. Бибкод:2006 ж. Табиғат.443..931Т. дои:10.1038 / табиғат05260. PMC  2048586. PMID  17073008.CS1 maint: сандық атаулар: авторлар тізімі (сілтеме)
  43. ^ Содергрен; Вайнсток, Джордж М .; Дэвидсон, Эрик Х .; Кэмерон, Р. Эндрю; Гиббс, Ричард А .; Вайнсток, Джордж М .; Анжер, Роберт С .; Анжер, Линн М .; Арноне, Мария Ина; т.б. (2006). «Strongylocentrotus purpuratus теңіз кірпі геномы». Ғылым. 314 (5801): 941–952. Бибкод:2006Sci ... 314..941S. дои:10.1126 / ғылым.1133609. PMC  3159423. PMID  17095691.
  44. ^ Ричардс, С .; Гиббс, Ричард А .; Вайнсток, Джордж М .; Браун, Сьюзан Дж .; Денелл, Робин; Биман, Ричард В.; Гиббс, Ричард; Биман, Ричард В.; т.б. (2008). «Tribolium castaneum қоңызы мен зиянкестерінің геномы». Табиғат. 452 (7190): 949–955. Бибкод:2008 ж. Табиғат. 452..949R. дои:10.1038 / nature06784. PMID  18362917.
  45. ^ Ізгілік; Хаас, BJ; Sun, W; Брейг, HR; Перотти, MA; Кларк, ДжМ; Ли, SH; Робертсон, ХМ; Кеннеди, RC; т.б. (2010). «Адам ағзасының геномдық тізбегі және оның эндосимбионты тұрақты паразиттік өмір салты туралы түсінік береді». Америка Құрама Штаттарының Ұлттық Ғылым Академиясының еңбектері. 107 (27): 12168–12173. Бибкод:2010PNAS..10712168K. дои:10.1073 / pnas.1003379107. PMC  2901460. PMID  20566863.
  46. ^ Веррен; Ричардс, С; Дежардин, Калифорния; Нихуис, О; Гадау, Дж; Колбурн, Дж .; Nasonia Genome Working, тобы; Веррен, Дж.Х; Ричардс, С; т.б. (2010). «Үш паразитоидтық Насония түрінің геномынан функционалды және эволюциялық түсініктер». Ғылым. 327 (5963): 343–348. Бибкод:2010Sci ... 327..343.. дои:10.1126 / ғылым.1178028. PMC  2849982. PMID  20075255.
  47. ^ Смит; Зимин, А .; Холт, С .; Абухейф, Е .; Бентон, Р .; Қолма-қол ақша, Е .; Кросет, V .; Карри, К.Р .; Эльхайк, Е .; т.б. (2011). «Әлемде кең таралған және инвазиялық аргентиналық құмырсқаның геномының жобасы (Linepithema humile)». Америка Құрама Штаттарының Ұлттық Ғылым Академиясының еңбектері. 108 (14): 5673–5678. Бибкод:2011PNAS..108.5673S. дои:10.1073 / pnas.1008617108. PMC  3078359. PMID  21282631.
  48. ^ Смит; Смит, Д .; Робертсон, Х.М .; Гельмкампф, М .; Зимин, А .; Янделл, М .; Холт, С .; Ху, Х .; Абухейф, Е .; т.б. (2011). «Қызыл комбайн құмырсқасы Pogonomyrmex barbatus геномының жобасы». Америка Құрама Штаттарының Ұлттық Ғылым Академиясының еңбектері. 108 (14): 5667–5672. Бибкод:2011PNAS..108.5667S. дои:10.1073 / pnas.1007901108. PMC  3078412. PMID  21282651.
  49. ^ Суен; Тігу, C; Ли, Л; Холт, С; Абухейф, Е; Борнберг-Бауэр, Е; Bouffard, P; Кальдера, Э.Дж.; Қолма-қол ақша, E; т.б. (2011). Копенгавер, Григорий (ред.) «Atta cephalotes жапырағын кесетін құмырсқаның геномдық реттілігі оның міндетті симбиотикалық өмір салты туралы түсінік береді». PLOS генетикасы. 7 (2): e1002007. дои:10.1371 / journal.pgen.1002007. PMC  3037820. PMID  21347285.