ITK-SNAP - ITK-SNAP

ITK-SNAP
Itksnaplogo.png
ITK-SNAP
ITK-SNAP
ӘзірлеушілерUPenn және UNC зерттеушілері
Бастапқы шығарылым2004
ЖазылғанC ++
ПлатформаКросс-платформа
Қол жетімдіАғылшын
ТүріДенсаулық сақтау бағдарламалық жасақтамасы
ЛицензияGNU жалпыға ортақ лицензиясы
Веб-сайтhttp://www.itksnap.org

ITK-SNAP - бұл интерактивті бағдарламалық жасақтама, бұл пайдаланушыларға үш өлшемді медициналық кескіндерді шарлауға, қызығушылық тудыратын анатомиялық аймақтарды қолмен бөлуге және автоматты түрде орындауға мүмкіндік береді. кескінді сегментациялау. Бағдарламалық жасақтама клиникалық және негізгі ғылыми зерттеушілердің аудиториясын ескере отырып жасалған және пайдаланушыға ыңғайлы интерфейске және алдын-алу үшін шектеулі функцияны сақтауға баса назар аударылды. ерекшеліктер. ITK-SNAP көбінесе магниттік-резонанстық томография (МРТ), конустық-сәулелік компьютерлік томография (CBCT) және компьютерлік томография (CT) деректер жиынтығымен жұмыс істеу үшін қолданылады.

Ерекшеліктер

Құралдың мақсаты - зерттеушілерге анатомиялық құрылымдар мен бейнелерді бейнелеуге қызығушылық тудыратын аймақтарды бөлуді жеңілдету. Функциялар жиынтығы минималды деңгейде сақталады. Бағдарламаның негізгі ерекшеліктері

Кескін навигациясы
Кескіннің көлемі арқылы үш ортогональды кесілген жазықтық әр уақытта көрсетіледі. Кесілген жазықтықтарды жалпы курсор байланыстырады, осылайша курсорды бір кесілген жазықтықта жылжыту басқа кесілген жазықтықтарды жаңартады. Тінтуірді кесілген жазықтыққа сүйреп апарып, жылжу біртектес болады. Байланыстырылған курсор ITK-SNAP сеанстарында жұмыс істейді, бұл мультимодальды бейнелеу деректерін шарлауға мүмкіндік береді (мысалы, бір сеанстан тақырыпты екі рет МРТ қарау).
Қолмен сегментациялау
ITK-SNAP суреттердегі анатомиялық құрылымдарды қолмен анықтауға арналған құралдарды ұсынады. Таңбалау үш ортогональды кесілген жазықтықта да орын алуы мүмкін және нәтижелер үш өлшемді көрініс ретінде көрінуі мүмкін. Бұл сегменттеудің 3D пішімінде ақылға қонымды пішінін қамтамасыз етуді жеңілдетеді.
Автоматты сегментация
ITK-SNAP автоматты функционалдылықты қамтамасыз етеді сегменттеу пайдаланып деңгей белгілеу әдісі. Бұл медициналық суреттерде біртектес көрінетін құрылымдарды адамның өте аз өзара әрекеттесуін пайдаланып сегменттеуге мүмкіндік береді. Мысалы, МРТ-дағы бүйір қарыншаларын сенімді түрде сегменттеуге болады, сонымен қатар КТ және МРТ-дағы ісіктердің кейбір түрлері.

ITK-SNAP болып табылады ашық бастапқы бағдарламалық жасақтама астында таратылады GNU жалпыға ортақ лицензиясы. Бұл жазылған C ++ және ол Инсайтты сегментациялау және тіркеу құралдары (ITK) кітапханасы. ITK-SNAP әртүрлі медициналық кескіндерді оқи алады және жаза алады, соның ішінде DICOM, NIfTI және Mayo Талдау. Ол сондай-ақ көп компонентті шектеулі қолдауды ұсынады (мысалы, диффузиялық тензорлық бейнелеу ) және көп вариациялық бейнелеу деректері.

Қолданбалар

ITK-SNAP келесі салаларда қолданылды

Әдебиеттер тізімі

  1. ^ Кауке, Мартин Кауке және Али-Фарид Сафи (2019 ж. Қаңтар). «Кескінді сегментациялау негізінде көлемді жуықтау - остеолитикалық жақ зақымдануын клиникалық басқару факторы ретінде көлем». Бет-жақ сүйек рентгенологиясы. 48: 20180113. Бибкод:2007SPIE.6512E.120S. дои:10.1259 / dmfr.20180113. PMC  6398913. PMID  30216090.
  2. ^ Кауке, Мартин (ақпан 2018). «Кератоцистозды одонтогенді ісіктер мен жақтың неопластикалық емес кисталарына көлемдік талдау жасау - салыстыру және оның клиникалық маңыздылығы». Бет-жақ сүйектеріне хирургия журналы. 46 (2): 257–263. дои:10.1016 / j.jcms.2017.11.012. PMID  29233700.
  3. ^ Сафи, Али-Фарид (2018). «Көлемді өлшеу амелобластоманың ісік агрессивтілігін бейнелеу биомаркері бола ма?». Ауызша онкология. 78 (Наурыз 2018): 16-24. дои:10.1016 / ж.оралонкология.2018.01.002. PMID  29496045.
  4. ^ Шпанглер, Л .; Браун, С .; Робертс, Дж. А .; Чапман, Б.Э. (2007). «Ішкі ұйқы артериясын сегменттеуді InsightSNAP арқылы бағалау». SPIE туралы материалдар. 6512 (5): 65123F. Бибкод:2007SPIE.6512E.120S. дои:10.1117/12.709954. Алынған 2007-11-08.[тұрақты өлі сілтеме ]
  5. ^ Коруж, I .; Флетчер, Т .; Джоши, С .; Гоуттард, С .; Гериг, Г. (қазан 2006). «Сандық диффузиялық тензор МРТ анализі үшін талшық жолына бағытталған статистика». Медициналық бейнені талдау. 10 (5): 786–798. CiteSeerX  10.1.1.101.8505. дои:10.1016 / j.media.2006.07.003. ISSN  1361-8415. PMID  16926104.
  6. ^ Сяо, Ю .; Вернер-Васик, М .; Карран, В .; Гальвин, Дж. (2006). «SU-EE-A2-03: Өкпенің қатерлі ісігін емдеудің мақсатты анықтамасы үшін автоматты сегментация құралдарын бағалау». Медициналық физика. 33 (6): 1992. Бибкод:2006 MedPh..33.1992X. дои:10.1118/1.2240194. Архивтелген түпнұсқа 2013-02-23. Алынған 2007-11-08.
  7. ^ Д'аддарио, V .; Пинто, V .; Пинтучи, А .; Ди Кагно, Л. (2007). «OP13. 04: омыртқаның пренатальды дигозозындағы алты сонографиялық белгінің дәлдігі». Акушерлік және гинекологиядағы ультрадыбыстық. 30 (4): 498. дои:10.1002 / uog.4534.
  8. ^ Рицци, С.Х .; Банерджи, П. П .; Luciano, C. J. (2007). «Виртуалды шындық пен жылдамдықты модельдеу үшін медициналық суреттерден 3D модельдерін шығаруды автоматтандыру». Автоматтандыру ғылымы және инжиниринг, 2007. CASE 2007. IEEE Халықаралық конференциясы. 152-157 бет. дои:10.1109 / COASE.2007.4341748.
  9. ^ Кавиданес, Л. Х .; Штайнер, М .; Proffit, W. R. (2006). «3 өлшемді конустық-сәулелік компьютерлік томография модельдерінің бейнесін талдау және орналастыру». Американдық Ортодонтия және Дентофасальды ортопедия журналы. 129 (5): 611–618. дои:10.1016 / j.ajodo.2005.12.008. PMC  3586191. PMID  16679201.
  10. ^ MacHado, A. M. C .; Саймон, Т. Дж .; Нгуен, V .; Макдональд-Макгинн, Д.М .; Закай, Е. Х .; Gee, J. C. (2007). «22q11.2 жою синдромы хромосомасындағы корпустық каллозум морфологиясы және қарыншаның мөлшері». Миды зерттеу. 1131 (1): 197–210. дои:10.1016 / j.brainres.2006.10.082. PMC  1802103. PMID  17169351.
  11. ^ Апостолова, Л.Г .; Томпсон, П.М. (2007). «Мидың картографиясы нейродегенерацияны зерттеу құралы ретінде». Нейротерапевтика. 4 (3): 387–400. дои:10.1016 / j.nurt.2007.05.009. PMC  2634605. PMID  17599704.
  12. ^ Кришнан, С .; Славин, М. Дж .; Тран, Т. Т .; Дорайсвами, П.М .; Petrella, J. R. (2006). «Гиппокампаның кеңістіктік қалыпқа келуінің дәлдігі: есте сақтаудың бұзылуындағы фМРТ зерттеулерінің салдары». NeuroImage. 31 (2): 560–571. дои:10.1016 / j.neuroimage.2005.12.061. PMID  16513371.
  13. ^ https://journals.lww.com/jcraniofacialsurgery/Fulltext/2019/12000/Does_Meningioma_Volume_Correlate_With_Clinical.144.aspx

Сыртқы сілтемелер