Гликозидті гидролаза отбасы 29 - Glycoside hydrolase family 29

Альфа-Л-фукозидаза
PDB 1hl8 EBI.jpg
термотога маритимасы альфа-фукозидазаның кристалдық құрылымы
Идентификаторлар
ТаңбаAlpha_L_fucos
PfamPF01120
Pfam руCL0058
InterProIPR000933
PROSITEPDOC00324
SCOP21hl9 / Ауқымы / SUPFAM
CAZyGH29

Молекулалық биологияда, гликозидті гидролаза отбасы 29 Бұл отбасы туралы гликозидті гидролазалар.

Гликозид гидролазалары EC 3.2.1. кең таралған ферменттер тобы болып табылады гидролиз The гликозидті байланыс екі немесе одан да көп көмірсулар арасында немесе көмірсулар мен көмірсутектер емес бөлік арасында. Гликозидті гидролазалардың жүйелілік ұқсастығына негізделген жіктеу жүйесі> 100 түрлі отбасын анықтауға әкелді.[1][2][3] Бұл классификация келесіде қол жетімді: CAZy веб-сайт,[4][5] және CAZypedia-да, көмірсулардың белсенді ферменттерінің онлайн-энциклопедиясында талқыланды.[6][7]

Гликозидті гидролаза отбасына 29 кіреді альфа-L-фукозидазалар,[8] Олар лизосомалық альфа-1,6 байланысқан фукозаны гидролиздеуге жауапты ферменттер, көмірсутектің тотықсыздандырғыш N-ацетилглюкозаминімен біріктірілген бөліктер туралы гликопротеидтер. Альфа-Л-фукозидаза көмірсу бөліктерінің тотықсыздандырғыш N-ацетилглюкозаминге қосылған альфа-1,6 байланысқан фукозаны гидролиздеуге жауапты. гликопротеидтер.

Фукозилденген гликоконьюгаттар көп мөлшерде қатысады биологиялық альфа-л-фукозидаза түзетін оқиғалар, ферменттер оларды өңдеуге жауапты, өте маңызды. Альфа-л-фукозидаза белсенділігінің жетіспеушілігі фукозидозбен байланысты, лизосомалық сақтау бұзылысы, тез нейродегенерациямен сипатталады, нәтижесінде психикалық және моторлы нашарлау.[9] Фермент гексамера және а-дан тұратын екі доменді қатпарды көрсетеді каталитикалық (бета / альфа) (8) тәрізді домен және C-терминал бета-сэндвич домен.[9]

Дрозофила меланогастер сперматозоидтар құрамында альфа-л-фукозидаза болуы мүмкін ұрықтандыру жұмыртқа қабығының микрофиласындағы альфа-л-фукозаның қалдықтарымен әрекеттесу арқылы.[10] Жылы адам сперматозоидтар, мембранаға байланысты альфа-л-фукозидаза ұзақ уақыт бойы тұрақты, бұл мүмкін мембрана домендер және бөлу. Бұлар ақуыздың тұтастығын сақтауға көмектеседі.[11]

Әдебиеттер тізімі

  1. ^ Henrissat B, Callebaut I, Fabrega S, Lehn P, Mornon JP, Davies G (шілде 1995). «Консервіленген каталитикалық техника және гликозил гидролазаларының бірнеше тұқымдастарына ортақ қатпарды болжау». Америка Құрама Штаттарының Ұлттық Ғылым Академиясының еңбектері. 92 (15): 7090–4. Бибкод:1995 PNAS ... 92.7090H. дои:10.1073 / pnas.92.15.7090. PMC  41477. PMID  7624375.
  2. ^ Дэвис Г, Хенриссат Б (қыркүйек 1995). «Гликозил гидролазаларының құрылымдары мен механизмдері». Құрылым. 3 (9): 853–9. дои:10.1016 / S0969-2126 (01) 00220-9. PMID  8535779.
  3. ^ Henrissat B, Bairoch A (маусым 1996). «Гликозилгидролазалардың дәйектілікке негізделген классификациясын жаңарту». Биохимиялық журнал. 316 (Pt 2): 695-6. дои:10.1042 / bj3160695. PMC  1217404. PMID  8687420.
  4. ^ «Үй». CAZy.org. Алынған 2018-03-06.
  5. ^ Lombard V, Golaconda Ramulu H, Drula E, Coutinho PM, Henrissat B (қаңтар 2014). «Көмірсулармен белсенді ферменттер туралы мәліметтер базасы (CAZy) 2013 ж.». Нуклеин қышқылдарын зерттеу. 42 (Деректер базасы мәселесі): D490-5. дои:10.1093 / nar / gkt1178. PMC  3965031. PMID  24270786.
  6. ^ «Гликозидті гидролаза отбасы 29». CAZypedia.org. Алынған 2018-03-06.
  7. ^ «CAZypedia-дің он жылы: көмірсулар-белсенді ферменттердің тірі энциклопедиясы» (PDF). Гликобиология. 28 (1): 3-8. Желтоқсан 2018. дои:10.1093 / гликоб / cwx089. PMID  29040563.
  8. ^ Фишер К.Дж., Аронсон Н.Н. (желтоқсан 1989). «Егеуқұйрықтардың альфа-L-фукозидазасын кодтайтын кДНҚ-ны оқшаулау және дәйектілікке талдау». Биохимиялық журнал. 264 (3): 695–701. дои:10.1042 / bj2640695. PMC  1133642. PMID  2482732.
  9. ^ а б Sulzenbacher G, Bignon C, Nishimura T, Tarling CA, Withers SG, Henrissat B, Bourne Y (наурыз 2004). «Thermotoga maritima альфа-L-фукозидазаның кристалдық құрылымы. Фукозидоздың каталитикалық механизмі мен молекулалық негіздері туралы түсініктер». Биологиялық химия журналы. 279 (13): 13119–28. дои:10.1074 / jbc.M313783200. PMID  14715651.
  10. ^ Pasini ME, Intra J, Pavesi G (тамыз 2008). «Drosophilidae тұқымдасының альфа-л-фукозидаза генін экспрессиялық зерттеу». Джин. 420 (1): 23–33. дои:10.1016 / j.gene.2008.04.021. PMID  18556148.
  11. ^ Venditti JJ, Bean BS (қазан 2009). «Мембранаға байланысты альфа-L-фукозидазаны сперматозоидтардың экваторлық сегменті арқылы тұрақтандыру». Халықаралық андрология журналы. 32 (5): 556–62. дои:10.1111 / j.1365-2605.2008.00897.x. PMID  18522672.
Бұл мақалада көпшілікке арналған мәтін енгізілген Pfam және InterPro: IPR000933