Үстемдік (генетика) - Википедия - Dominance (genetics)

Автосомды-доминантты және аутосомды-рецессивті тұқым қуалау, ең кең таралған екеуі Мендельдік мұрагерлік өрнектер. Ан автосома а-дан басқа кез-келген хромосома болып табылады жыныстық хромосома.

Жылы генетика, үстемдік бір нұсқадағы құбылыс (аллель ) а ген үстінде хромосома масканы жасыру немесе жоққа шығару әсер бір геннің басқа нұсқасының хромосоманың басқа көшірмесі.[1][2] Бірінші нұсқа деп аталады басым және екінші рецессивті. Бұл жағдай екі түрлі нұсқа әр хромосомада бір геннің пайда болуы бастапқыда а мутация гендердің бірінде немесе жаңа (де ново) немесе мұрагерлік. Шарттары аутосомды доминант немесе аутосомды-рецессивті жыныстық емес хромосомалардың гендік нұсқаларын сипаттау үшін қолданылады (аутосомалар ) және соларға байланысты белгілер жыныстық хромосомалар (аллосомалар) деп аталады Х-байланысты доминант, Х-байланысты рецессивті немесе Y байланысты; бұларда ата-ананың да, баланың да жынысына байланысты мұрагерлік пен презентация үлгісі бар (қараңыз) Жыныстық байланыс ). Тек бір данасы болғандықтан Y хромосома, Y байланысты белгілер доминантты және рецессивті бола алмайды. Сонымен қатар, үстемдіктің басқа формалары бар толық емес үстемдік, онда геннің нұсқасы екі хромосомада болған кездегіге қарағанда ішінара әсер етеді, және тең үстемдік, онда әр хромосоманың әр түрлі нұсқалары байланысты белгілерді көрсетеді.

Үстемдік аллельге немесе оның белгілеріне тән емес (фенотип ). Бұл кез-келген функционалды берілген геннің екі аллелі арасындағы қатаң салыстырмалы әсер; бір аллель сол геннің екінші аллелінде үстем бола алады, үшіншіге және рецессивті тең басым төртіншісімен. Сонымен қатар, бір аллель бір қасиет үшін басым болуы мүмкін, ал басқалары емес.

Үстемдік - бұл негізгі ұғым Мендельдік мұрагерлік және классикалық генетика. Хаттар және Пуннетт квадраттары оқытудағы үстемдік принциптерін көрсету үшін қолданылады, ал доминантты аллельдер үшін бас әріптерді және рецессивті аллельдер үшін кіші әріптерді қолдану кең таралған конвенция болып табылады. Үстемдіктің классикалық мысалы - мұрагерлік тұқым пішіні бұршақ. Бұршақ дөңгелек, аллельмен байланысты болуы мүмкін Rнемесе мыжылған, аллельмен байланысты р. Бұл жағдайда аллельдердің үш комбинациясы (генотиптер) мүмкін: RR, Rr, және rr. The RR (гомозиготалы ) жеке адамдарда дөңгелек бұршақ болады, ал rr (гомозиготалы) дараларда мыжылған бұршақ болады. Жылы Rr (гетерозиготалы ) жеке тұлғалар R аллельдің болуы маска р аллель, сондықтан бұл адамдарда дөңгелек бұршақ болады. Осылайша, аллель R аллельдің үстінен басым болады р, және аллель р аллельге рецессивті болып табылады R.

Үстемдіктің айырмашылығы эпистаз, а аллельдерінің әсерін бүркейтін бір геннің аллелінің құбылысы әр түрлі ген.[3]

Фон

Жүгеріде ергежейліліктің мұрагері. Екі ата-аналық вариациядан өсімдіктердің биіктігін және олардың F1 гетерозиготалы гибридін (ортасында) көрсету

Үстемдік ұғымы енгізілді Грегор Иоганн Мендель. Мендель, «Генетиканың әкесі», бұл терминді алғаш рет 1860 ж.ж. қолданғанымен, ХХ ғасырдың басына дейін ол кең танымал болған жоқ. Мендель бақша бұршақтарының тұқымдардың, тұқым бүршіктерінің және өсімдіктердің пайда болуына байланысты алуан түрлі белгілері үшін екі дискретті фенотиптер болғанын байқады, мысалы, әжімді тұқымдарға қарсы сары, жасыл тұқымдарға, қызылға қарсы ақ гүлдерге немесе ұзын және қысқа өсімдіктерге қарсы. Бөлек өсіргенде өсімдіктер әрдайым бір фенотипті ұрпақтан ұрпаққа шығарды. Алайда, әр түрлі фенотиптері бар сызықтарды қиып өткенде (аралықта) ата-аналық фенотиптердің біреуі және біреуі ғана ұрпақтарында пайда болды (жасыл, немесе дөңгелек, немесе қызыл немесе биік). Алайда, бұл кезде гибридті өсімдіктер кесіп өтті, ұрпақтары екі фенотипті көрсетті, оларға тән 3: 1 қатынасында, көбінесе фенотип ата-аналық гибридті өсімдіктерге жатады. Мендель бірінші кресттегі әрбір ата-ана әр түрлі аллельдер үшін гомозигота болды (бір ата-анасы АА, ал екіншісі ата-анасы аа), әрқайсысы ұрпағына бір аллель берді деп қорытындылады, нәтижесінде бұл будандардың барлығы гетерозиготалар (Аа) және гибридті кресттегі екі аллельдің біреуі екіншісінің экспрессиясына басым болатындығы: маскаланған а. Екі гетерозиготалар (Aa X Aa) арасындағы соңғы айқаспа AA, Aa және aa ұрпақтарын 1: 2: 1 генотиптік қатынаста шығарады, алғашқы екі класта (A) фенотип, ал соңғысында (а) фенотип көрсетілген , осылайша фенотиптің 3: 1 қатынасын шығарады.

Мендель ген, аллель, фенотип, генотип, гомозигота және гетерозигота терминдерін қолданбаған, олардың барлығы кейінірек енгізілген. Ол доминантты және рецессивті аллельдерге арналған бас әріптер мен кіші әріптердің белгілерін енгізді, олар осы күнге дейін қолданыста.

1928 жылы британдық генетик Рональд Фишер үлесі арқылы табиғи сұрыптауға негізделген үстемдік әрекет етті деп ұсынды модификатор гендері. 1929 жылы американдық генетик Райт үстемдік жай метаболизм жолдарының физиологиялық салдары және қатысатын геннің салыстырмалы қажеттілігі деп жауап берді. Райттың түсіндіруі генетикада қалыптасқан факт болды және пікірталастар негізінен аяқталды. Алайда кейбір белгілер эволюциялық тетіктердің ықпалында болуы мүмкін.[4][5][6]

Хромосомалар, гендер және аллельдер

Көптеген жануарлар мен кейбір өсімдіктер жұптасқан хромосомалар, және диплоидты ретінде сипатталады. Оларда әр хромосоманың екі нұсқасы бар, біреуі анасының қосқан үлесі ұрық жұмыртқасы, ал екіншісі әкесінің қолында сперматозоидтар ретінде белгілі гаметалар, гаплоидты ретінде сипатталған және арқылы жасалған мейоз. Содан кейін бұл гаметалар бір-біріне қосылады ұрықтандыру кезінде жыныстық көбею, жаңа бір жасушаға зигота, бұл бірнеше рет бөлінеді, нәтижесінде әр организмде (гаметалық емес) жасушада хромосомалардың жұп саны бар жаңа организм пайда болады.

Сәйкес келетін (гомологты) жұптың әрбір хромосомасы құрылымы жағынан екіншісіне ұқсас және өте ұқсас ДНҚ жүйелі (локустар, жалғыз локус). Әр хромосомадағы ДНҚ бірқатар дискретті ретінде жұмыс істейді гендер әр түрлі қасиеттерге әсер ететін. Сонымен, әр геннің сәйкес гомологы болады, олар әртүрлі нұсқаларда болуы мүмкін аллельдер. Екі гомологиялық хромосомадағы бір локустағы аллельдер бірдей немесе әр түрлі болуы мүмкін.

The қан тобы адамның генін ген анықтайды A, B, AB немесе O қан тобы және тоғыз хромосоманың ұзын қолында орналасқан. Бұл локуста болуы мүмкін үш түрлі аллельдер бар, бірақ кез-келген индивидте тек екеуі ғана болуы мүмкін, олардың бірі анасынан, екіншісі әкесінен қалған.[7]

Егер берілген геннің екі аллелі бірдей болса, организм гомозигота деп аталады және сол генге қатысты гомозиготалы болады; егер оның орнына екі аллель әр түрлі болса, организм гетерозигота болып табылады және гетерозиготалы болады. Организмнің генетикалық құрамы бір локуста немесе оның барлық гендерінде жиынтықта оның деп аталады генотип. Организмнің генотипі тікелей және жанама түрде оның жеке немесе жиынтық деп аталатын молекулалық, физикалық және басқа белгілеріне әсер етеді. фенотип. Гетерозиготалы гендік локустарда екі аллель өзара әрекеттесіп, фенотип түзеді.

Үстемдік

Толық үстемдік

Толық үстемдік жағдайында гетерозиготалы генотиптегі бір аллельдің әсері екіншісінің әсерін бүркемелейді. Басқа масканы жасыратын аллель дейді басым соңғысына, ал бүркенген аллель деп айтылады рецессивті біріншісіне.[8] Толық үстемдік, демек, гетерозиготаның фенотипі доминантты гомозиготамен ерекшеленбейтіндігін білдіреді.

Доминанттылықтың классикалық мысалы - бұршақтағы тұқым формасының (бұршақ формасының) мұрагері. Бұршақ дөңгелек пішінді болуы мүмкін (аллельмен байланысты R) немесе мыжылған (аллельмен байланысты) р). Бұл жағдайда аллельдердің үш комбинациясы (генотиптер ) мүмкін: RR және rr гомозиготалы және Rr гетерозиготалы. The RR жеке адамдарда дөңгелек бұршақ және rr жеке адамдарда мыжылған бұршақ бар. Жылы Rr жеке тұлғалар R аллельдің болуы маска р аллель, сондықтан бұл адамдарда дөңгелек бұршақ болады. Осылайша, аллель R аллельге толығымен басым р, және аллель р аллельге рецессивті болып табылады R.

Жартылай үстемдік

Бұл Пуннетт алаңы толық емес үстемдікті бейнелейді. Бұл мысалда R-мен байланысты қызыл лепесток сипаты аллель r аллелінің ақ лепесткасымен ерекшеленеді. Өсімдік Rr генотипі бар өсімдіктердің қызыл реңктері аз қызыл пигментпен гүл шығаруына әкеп соқтыратын үстемдік белгісін (R) толық көрсетпейді. Түстер бір-бірімен үйлеспейді, доминантты сипат аз ғана көрінеді.

Толық емес үстемдік (деп те аталады) жартылай үстемдік, жартылай үстемдік немесе аралық мұрагерлік) гетерозиготалы генотиптің фенотипі гомозиготалы генотиптің фенотиптерінен ерекше және көбінесе аралық болған кезде пайда болады. Мысалы, снапдрагон гүлдің түсі қызылға да, аққа да гомозиготалы. Қызыл гомозиготалы гүлді ақ гомозиготалы гүлмен жұптастырғанда, нәтиже қызғылт снапдрагон гүлін береді. Қызғылт снапдрагон - бұл толық емес басымдықтың нәтижесі. Толық емес үстемдіктің ұқсас түрі сағат төрт мұнда ақ және қызыл гүлдердің нағыз тұқымды ата-аналары қиылған кезде қызғылт түс пайда болады. Жылы сандық генетика, мұнда фенотиптер өлшенеді және сандық өңделеді, егер гетерозиготаның фенотипі екі гомозиготаның дәл арасында (сандық түрде) болса, онда фенотип көрсетеді үстемдік жоқ гетерозиготаның фенотиптік өлшемі бір гомозиготаға басқасына қарағанда жақын болған кезде ғана доминант болады.

Ф өсімдіктері болған кезде1 ұрпақ өзін-өзі тозаңдандырады, F-нің фенотиптік және генотиптік қатынасы2 ұрпақ 1: 2: 1 (қызыл: қызғылт: ақ) болады.[9]

Қараңыз ішінара үстемдік гипотезасы.

Бірлескен басымдық

А Камелия сорт
А және В қан тобы адамдарда қосалқы басымдық байқалады, бірақ О типі А және В рецессивті болып табылады.
Бұл Пуннетт квадраты тең басымдықты көрсетеді. Бұл мысалда ақ бұқа (WW) қызыл сиырмен (RR) жұптасады және олардың ұрпақтары ақ және қызыл түктерді білдіретін бірлескен басымдықты көрсетеді.

Бірлескен басымдық екі аллельдің үлестері фенотипте көрінген кезде пайда болады.

Мысалы, ABO қан тобы жүйесі, химиялық модификация а гликопротеин (H антигені) қан жасушаларының беттерінде үш аллель бақыланады, олардың екеуі бір-біріне ко-доминантты (МенA, МенB) және рецессивтіге үстем мен кезінде ABO локус. The МенA және МенB аллельдер әртүрлі модификацияларды шығарады. Кодталған фермент МенA мембранамен байланысқан H антигеніне N-ацетилгалактозамин қосады. The МенB фермент галактозаны қосады. The мен аллель ешқандай модификация жасамайды. Осылайша МенA және МенB аллельдердің әрқайсысы доминант болып табылады мен (МенAМенA және МенAмен жеке адамдарда А тобындағы қан бар, және МенBМенB және МенBмен жеке адамдарда В типті қан бар), бірақ МенAМенB индивидтердің қан жасушаларында екі модификациясы бар, демек, АВ типті қан бар, сондықтан МенA және МенB аллельдер қосалқы доминант деп аталады.

Тағы бір мысал бета-глобин компоненті гемоглобин, мұндағы үш молекулалық фенотиптер HbA/ HbA, HbA/ HbS, және HbS/ HbS барлығы ерекшеленеді ақуыз электрофорезі. (Гетерозиготалы генотиппен жасалатын медициналық жағдай деп аталады орақ-жасушалық қасиет және ерекшеленетін жұмсақ жағдай орақ тәрізді жасушалы анемия, осылайша аллельдер көрсетеді толық емес үстемдік анемияға қатысты жоғарыдан қараңыз). Молекулалық деңгейдегі көптеген гендік локустар үшін екі аллель тең дәрежеде көрінеді, өйткені екеуі де транскрипцияланған ішіне РНҚ.

Аллелді өнімдер фенотипте бірге өмір сүретін ко-доминанттылық, аллель өнімдерінің сандық өзара әрекеттесуі аралық фенотип түзетін толық емес доминанттылықтан өзгеше. Мысалы, бірлескен үстемдікте қызыл гомозиготалы гүл мен ақ гомозиготалы гүлде қызыл және ақ дақтары бар ұрпақ пайда болады. F1 ұрпағындағы өсімдіктер өздігінен тозаңданған кезде, F2 ұрпағының фенотиптік және генотиптік қатынасы 1: 2: 1 болады (Қызыл: Дақты: Ақ). Бұл коэффициенттер толық емес үстемдікке тең. Тағы да, бұл классикалық терминология орынсыз - шын мәнінде мұндай жағдайлар үстемдік көрсетеді деп айтуға болмайды.

Жалпы қате түсініктерді жою

Әдетте а туралы сөйлесу ыңғайлы болғанымен рецессивті аллель немесе а басым қасиет, үстемдік аллельге де, оның фенотипіне де тән емес. Доминант дегеніміз геннің екі аллелі мен олардың байланысты фенотиптері арасындағы қатынас. «Доминантты» аллель контексттен қорытынды шығаруға болатын сол геннің белгілі бір аллеліне басым, бірақ ол үшінші аллель үшін рецессивті, ал төртіншісі кодоминантты болуы мүмкін. Сол сияқты, «рецессивті» белгі дегеніміз - бұл белгілі бір рецессивті аллельмен байланысты, бұл контекст арқылы меңзелген, бірақ ол басқа геннің және доминантты аллелдің әсерінен болатын басқа контекстте болуы мүмкін.

Доминанттылық фенотиптің табиғатымен байланысты емес, яғни ол «қалыпты» немесе «қалыптан тыс», «стандартты» немесе «стандартты емес», «сау» немесе «ауру», «күшті» немесе «әлсіз», «немесе азды-көпті экстремалды. Доминантты немесе рецессивті аллель осы белгілердің кез келген түрін есепке ала алады.

Үстемдік аллельдің зиянды, бейтарап немесе пайдалы екенін анықтамайды. Алайда, таңдау фенотиптер арқылы жанама түрде гендерде жұмыс істеуі керек, ал доминанттылық фенотиптердегі аллельдердің әсеріне әсер етеді, демек, аллель жиіліктерінің өзгеру жылдамдығына байланысты. Зиянды рецессивті аллельдер төмен жиіліктегі популяцияда сақталуы мүмкін, олардың көп даналары гетерозиготалармен тасымалданады, бұл адамдар үшін ешқандай шығынсыз. Бұл сирек кездесетін рецессивтер көптеген тұқым қуалайтындардың негізі болып табылады генетикалық бұзылулар.

Үстемдік сонымен қатар популяцияда аллельдердің таралуымен байланысты емес. Доминантты және рецессивті аллельдер өте таралған немесе өте сирек болуы мүмкін.

Номенклатура

Генетикада белгілер алгебралық толтырғыш ретінде басталды. Бір аллель екінші аллельге доминант болған кезде, ең көне шарт - доминант аллельді бас әріппен бейнелеу. Рецессивті аллельге бірдей әріп кіші әріппен беріледі. Бұршақ мысалында екі аллельдің арасындағы доминанттық қатынас белгілі болғаннан кейін, дөңгелек пішінді бас әріппен таңбамен шығаратын доминантты аллельді белгілеуге болады. R, және кіші шартты белгімен мыжылған пішінді шығаратын рецессивті аллель р. Содан кейін гомозиготалы доминантты, гетерозиготалы және гомозиготалы рецессивті генотиптер жазылады RR, Rr, және rrсәйкесінше. Сондай-ақ, екі аллельді тағайындауға болады W және wжәне үш генотип WW, Ww, және ww, оның алғашқы екеуі дөңгелек бұршақ, ал үшіншісі мыжылған бұршақ шығарды. «ТаңдауR«немесе»W«доминантты аллельдің символы ретінде гомозиготалы» домалақ «немесе» мыжылған «фенотипті тудыратын аллельдің доминант екеніне алдын-ала баға бермейді.

Геннің бірнеше аллелі болуы мүмкін. Әрбір аллель локус белгісімен, содан кейін ерекше үстіңгі жазумен бейнеленеді. Көптеген түрлерде жабайы популяцияда ең көп кездесетін аллель жабайы типтегі аллель болып табылады. Ол жоғарғы таңба ретінде + таңбасымен бейнеленген. Басқа аллельдер жабайы типтегі аллельге басым немесе рецессивті. Рецессивті аллельдер үшін локус белгісі кіші әріптермен берілген. Жабайы типтегі аллельге кез-келген үстемдігі бар аллельдер үшін локус символының бірінші әрпі үлкен әріппен жазылған. Мысалы, мына жерде орналасқан аллельдердің бірнешеуі а зертханалық тышқанның орналасуы, Бұлшықет бұлшықеті: Aж, басым сары; а+, жабайы түрі; және аbt, қара және сарғыш. The аbt аллель жабайы аллельге рецессивті, ал Aж аллель жабайы типтегі аллельге кодоминантты. The Aж аллель сонымен қатар кодоминант болып табылады аbt аллель, бірақ бұл қатынас тінтуірдің генетикалық номенклатурасы ережелерінің шегінен тыс екенін көрсету.

Генетикалық номенклатура ережелері дамыды, өйткені генетика күрделене түсті. Комитеттер кейбір түрлер үшін ережелерді стандарттады, бірақ бәріне бірдей емес. Бір түрге қатысты ережелер басқа түрдегі ережелерден біршама ерекшеленуі мүмкін.[10][11]

Басқа генетикалық түсініктермен байланысы

Бірнеше аллельдер

Диплоидты организмнің кез-келген жеке адамында кез-келген локуста ең көп дегенде екі түрлі аллель болады (барринг) анеуплоидиялар ), гендердің көпшілігі жалпы популяцияда аллельді нұсқалардың көп мөлшерінде кездеседі. Егер аллельдер фенотипке әр түрлі әсер етсе, кейде олардың доминанттық қатынастарын қатар ретінде сипаттауға болады.

Мысалы, мысықтардың пальто түсіне бірқатар аллельдер әсер етеді TYR ген (ферментті кодтайтын) тирозиназа ). Аллельдер C, cб, cс, және cа (толық түсті, Бирма, Сиам, және альбинос сәйкесінше) әр түрлі деңгейдегі пигмент шығарады, демек әр түрлі деңгейдегі сұйылту. The C аллель (толық түсті) соңғы үште толығымен басым болады cа аллель (альбино) алғашқы үшеуіне толықтай рецессивті.[12][13][14]

Автозомдық қарсы жыныстық байланысты үстемдік

Адамдарда және басқаларында сүтқоректілер түрлері, жынысы анықталады деп аталатын екі жыныстық хромосомалармен Х хромосома және Y хромосома. Адамның әйелдері әдетте ХХ; ер адамдар әдетте XY. Қалған жұп хромосома екі жыныста да кездеседі және олар деп аталады аутосомалар; осы хромосомалардағы локустарға байланысты генетикалық белгілер аутосомды сипатталады және доминантты немесе рецессивті болуы мүмкін. Генетикалық белгілер X және Y хромосомалар жыныстық байланысты деп аталады, өйткені олар бір немесе басқа жынысқа тән болғандықтан емес, жыныстық хромосомалармен байланысты. Іс жүзінде бұл термин әрдайым дерлік қолданылады Xбайланысты белгілер және көптеген осындай белгілер (мысалы, қызыл-жасыл түс көру қабілетінің жетіспеушілігі) жыныстық қатынасқа әсер етпейді. Әйелдерде Х-хромосомада кездесетін әрбір гендік локустың екі данасы бар, оларда аутосомалар сияқты, және сол басымдық қатынастар қолданылады. Алайда еркектерде әрбір Х хромосома гендерінің локусының тек бір данасы бар және олар ретінде сипатталады гемизиготалы осы гендер үшін. Y хромосомасы қарағанда әлдеқайда аз Xжәне гендердің біршама кіші жиынтығын қамтиды, сонымен қатар, олар «еркектікке» әсер ететіндерді қоса алады, бірақ SRY гені үшін тестис анықтау факторы. Ген-локустың жыныстық байланыстарының үстемдік ережелері олардың әйелдегі мінез-құлқымен анықталады: өйткені еркекте тек бір аллель болады (Y хромосоманың кейбір түрлерін қоспағанда) анеуплоидия ), бұл аллель әрқашан оның доминантты немесе рецессивті екендігіне қарамастан көрсетіледі. Құстарда қарама-қарсы жыныстық хромосомалар бар: ер құстарда ZZ және аналық құстарда ZW хромосомалары бар. Алайда, белгілердің тұқым қуалауы XY-жүйесін басқаша еске салады; аталық зебралықтардың екі Z хромосомасының бірінде ақ түсті ген болуы мүмкін, бірақ әйелдерде ақ түс әрқашан дамиды. Шегірткелерде XO жүйесі бар. Әйелдерде ХХ, тек еркектерде X. бар, оларда Y хромосома мүлдем жоқ.

Эпистаз

Эпистаз ["epi + тоқырау = to sit on «] - бұл аллельдердің екіге әсер етуі әр түрлі кейде екеуінің арасындағы доминанттық өзара әрекеттесуге ұқсайтын бір белгіге әсер ететін гендік локустар әр түрлі аллельдер бірдей локус. Эпистаз сипаттаманы өзгертеді 9:3:3:1 эпистатикалық емес гендер үшін күтілетін қатынас. Екі локус үшін эпистатикалық өзара әрекеттесудің 14 класы танылады. Мысал ретінде рецессивті эпистаз, бір гендік локус гүл пигментінің сары-сары екендігін анықтай алады (АА немесе Аа) немесе жасыл (аа), ал басқа локус пигменттің өндірілуін анықтайды (BB немесе Bb) әлде жоқ па (bb). Ішінде bb өсімдік, гүлдер басқа локустың генотипіне қарамастан ақ болады АА, Аа, немесе аа. The bb тіркесім болып табылады емес доминантты A аллель: дәлірек айтқанда B ген шоу рецессивті эпистаз дейін A ген, өйткені B гомозиготалы болған кезде локус рецессивті аллель (bb) фенотиптік өрнегін басады A локус. Екі аралықта AaBb өсімдіктер, бұл сипаттама береді 9:3:4 коэффициент, бұл жағдайда сары: жасыл: ақ гүлдер.

Жылы басым эпистаз, бір гендік локус алдыңғы мысалдағыдай сары немесе жасыл пигментті анықтай алады: АА және Аа сары, және аа жасыл. Екінші локус пигментті ізашардың өндірілуін анықтайды (dd) әлде жоқ па (ДД немесе Dd). Мұнда, а ДД немесе Dd өсімдік, гүлдер генотипіне қарамастан түссіз болады A локус, доминанттың эпистатикалық әсеріне байланысты Д. аллель. Осылайша, екеуінің арасындағы айқасуда AaDd өсімдіктер, өсімдіктердің 3/4 бөлігі түссіз болады, ал сары және жасыл фенотиптер тек құрамында көрінеді dd өсімдіктер. Бұл сипаттаманы тудырады 12:3:1 ақтың қатынасы: сары: жасыл өсімдіктер.

Қосымша эпистаз екі локус бір фенотипке әсер еткенде пайда болады. Мысалы, егер пигментті түс өндіретін болса CC немесе Көшірме бірақ жоқ cc, және ДД немесе Dd бірақ жоқ dd, содан кейін пигмент кез-келген генотиптік комбинацияда жасалмайды cc немесе dd. Бұл, екеуі де локустарда фенотипті қалыптастыру үшін кем дегенде бір доминантты аллель болуы керек. Бұл сипаттаманы тудырады 9:7 пигменттелген және пигменттелмеген өсімдіктердің арақатынасы. Қосымша эпистаз керісінше, егер генотип болған жағдайда ғана пигменттелмеген өсімдік шығарады cc және dd, және сипаттамалық қатынас - бұл 15:1 пигменттелген және пигменттелмеген өсімдіктер арасында.[15]

Классикалық генетика бір уақытта екі геннің эпистатикалық өзара әрекеттесуін қарастырды. Қазір молекулалық генетикадан анықталғандай, барлық гендік локустар көптеген басқа гендермен күрделі әрекеттесуге қатысады (мысалы, метаболизм жолдары көптеген гендерді қамтуы мүмкін) және бұл классикалық екі локустық модельдерге қарағанда анағұрлым күрделі эпистатикалық өзара әрекеттесуді тудырады. .

Харди-Вайнберг принципі (тасымалдаушының жиілігін бағалау)

Гетерозиготалық күйдің жиілігін (бұл рецессивтік белгінің тасымалдаушы күйі болып табылады) Харди-Вайнберг формуласы:

Бұл формула тура екі аллелі бар генге қатысты және үлкен популяциядағы сол аллельдердің жиілігін олардың осы популяциядағы үш генотип жиілігімен байланыстырады.

Мысалы, егер б бұл аллельдің жиілігі A, және q бұл аллельдің жиілігі а содан кейін шарттар б2, 2pq, және q2 генотиптердің жиілігі АА, Аа және аа сәйкесінше. Генде тек екі аллель болғандықтан, барлық аллельдер де болуы керек A немесе а және б + q = 1. Енді, егер A толығымен басым а онда тасымалдаушы генотиптің жиілігі Аа тікелей байқауға болмайды (өйткені оның гомозиготалы генотип сияқты белгілері бар) АА), алайда оны популяциядағы рецессивтік белгінің жиілігі бойынша бағалауға болады, өйткені бұл гомозиготалы генотиптегідей аа. яғни жеке аллель жиіліктерін бағалауға болады: q = f(аа), б = 1 − q, және осыдан генотиптің тасымалдаушысының жиілігін алуға болады: f(Aa) = 2pq.

Бұл формула бірқатарға негізделген жорамалдар және рецессивті белгінің жиілігін дәл бағалау. Жалпы алғанда, кез-келген нақты жағдай бұл болжамдардан белгілі бір дәрежеде ауытқып, бағалауға сәйкессіздіктерді енгізеді. Егер рецессивті белгі сирек болса, онда оның жиілігін дәл бағалау қиынға соғады, өйткені өте үлкен үлгі өлшемі қажет болады.

Артықшылыққа қарсы доминант

«Доминанттың» қасиеті кейде артықшылық ұғымымен, ал «рецессивтік» қасиеті кейде зиянды ұғымымен шатастырылады, бірақ құбылыстар ерекше болады. Доминант гетерозиготалардың фенотипін гомозиготалардың фенотиптеріне қатысты және әр түрлі фенотиптердің пайдалы немесе зиянды болуы дәрежесіне қарамай сипаттайды. Көптеген генетикалық аурулардың аллельдері рецессивті болғандықтан және доминанттылық сөзінің оң мағынасы бар болғандықтан, фенотиптің фитнеске қарағанда басым екендігі туралы болжам жиі айтылады. Алайда бұл сенімді емес; Төменде келтірілгендей, генетикалық аурулардың аллельдерінің көпшілігі зиянды және рецессивті болғанымен, барлық генетикалық аурулар рецессивті емес.

Соған қарамастан, бұл шатасу генетика тарихында кең таралған және бүгінгі күнге дейін сақталып келеді. Бұл шатасуды жою басылымның басты мотивтерінің бірі болды Харди-Вайнберг принципі.

Молекулалық механизмдер

Үстемдіктің молекулалық негізі Мендельге белгісіз болды. Қазір ген локусы ұзын қатарды (жүзден мыңға дейін) қамтитыны белгілі болды негіздер немесе нуклеотидтер туралы дезоксирибонуклеин қышқылы (ДНҚ) хромосоманың белгілі бір нүктесінде. The молекулалық биологияның орталық догмасы «дейдіДНҚ жасайды РНҚ жасайды ақуыз «, яғни ДНҚ-ны білдіреді транскрипцияланған РНҚ көшірмесін жасау үшін, ал РНҚ - бұл аударылған ақуыз жасау. Бұл процесте локустағы әр түрлі аллельдер транскрипциялануы мүмкін немесе транскрипцияланбайды, егер транскрипцияланған болса, сол белоктың сәл өзгеше нұсқаларына аударылуы мүмкін (деп аталады) изоформалар ). Ақуыздар көбінесе жұмыс істейді ферменттер тікелей немесе жанама түрде фенотиптер шығаратын жасушадағы химиялық реакцияларды катализдейді. Кез-келген диплоидты организмде кез-келген гендік локуста болатын екі аллельдің ДНҚ тізбегі бірдей (гомозиготалы) немесе әр түрлі (гетерозиготалы) болуы мүмкін. Егер ген локусы ДНҚ тізбегі деңгейінде гетерозиготалы болса да, әр аллель жасаған ақуыздар бірдей болуы мүмкін. Ақуыз өнімдері арасында ешқандай айырмашылық болмаған жағдайда, аллель де басым деп айтуға болмайды (қараңыз) тең үстемдік, жоғарыда). Екі ақуыз өнімі біршама өзгеше болса да (аллозимдер ), олар ферменттер әсеріне қатысты бірдей фенотип шығаруы ықтимал, және тағы да аллельді доминант деп айтуға болмайды.

Функцияның жоғалуы және гаплопрофия

Доминант әдетте екі аллельдің біреуі молекулалық деңгейде жұмыс істемейтін кезде пайда болады, яғни транскрипцияланбайды немесе әйтпесе функционалды ақуыз өнімін шығармайды. Бұл а нәтижесі болуы мүмкін мутация аллельдің ДНҚ тізбегін өзгертеді.[дәйексөз қажет ] Функционалды емес аллель үшін гомозиготалы организм, әдетте, ақуыз өнімінің болмауына байланысты ерекше фенотип көрсетеді. Мысалы, адамдарда және басқа организмдерде пигменттелмеген тері альбинос фенотип[16] жеке адам терінің пигментін шығаруға қажетті ферменттің функционалды емес нұсқасын кодтайтын аллельге гомозиготалы болған кезде пайда болады меланин. Аллельді рецессивті деп сипаттауға мүмкіндік беретін функцияның жетіспеушілігі емес екенін түсіну маңызды: бұл гетерозиготадағы альтернативті аллельмен өзара әрекеттесу. Өзара әрекеттесудің үш жалпы түрі мүмкін:

  1. Әдеттегі жағдайда, бір функционалды аллель гомозиготаға ұқсас фенотип алу үшін жеткілікті ақуыз жасайды: бұл деп аталады гаплосфетика. Мысалы, функционалды гомозигота түзілетін ферменттердің стандартты мөлшері 100% құрайды делік, екі функционалды аллель әрқайсысы 50% үлес қосады. Гетерозиготаның құрамындағы бір функционалды аллель стандартты фенотипті алуға жеткілікті мөлшерде болатын ферменттердің стандартты мөлшерінің 50% құрайды. Егер гетерозигота мен функционалды-аллельді гомозигота бірдей фенотиптерге ие болса, онда функционалдық аллель жұмыс істемейтін аллельге басым болады. Бұл альбино генінің локусында орын алады: гетерозигота пигменттің ізашарын меланинге айналдыру үшін жеткілікті фермент шығарады, ал жеке адамда стандартты пигментация бар.
  2. Әдетте, бір функционалды аллелдің болуы қалыпты емес, бірақ жұмыс істемейтін гомозиготаға қарағанда онша ауыр емес фенотип береді. Бұл функционалды аллель гапло жеткіліксіз болған кезде пайда болады. Әдетте бұл жағдайларға гапло-жеткіліксіздік және толық емес үстемдік терминдері қолданылады. Аралық өзара әрекеттесу гетерозиготалы генотип екі гомозиготалар арасында фенотиптік аралық түзетін жерде жүреді. Гетерозиготаның екі гомозиготаның қайсысы көбірек ұқсайтындығына байланысты, бір аллель көрсетеді дейді толық емес үстемдік басқасына қарағанда. Мысалы, адамдарда Hb гендік локус бета-тізбекті ақуызға жауап береді (HBB ) бұл екінің бірі глобин қан пигментін құрайтын белоктар гемоглобин.[16] Көптеген адамдар деп аталатын аллель үшін гомозиготалы HbA; кейбір адамдар баламалы аллель деп аталады HbS, не гомозиготалар, не гетерозиготалар түрінде. Гемоглобин молекулалары HbS/HbS гомозиготалар пішіні өзгеріп, морфологиясын бұзады қызыл қан жасушалары, және өмірдің қауіпті түрін тудырады анемия деп аталады орақ тәрізді жасушалы анемия. Гетерозиготалы адамдар HbA/HbS бұл аллельде анемияның анағұрлым ауыр түрі бар орақ-жасушалық қасиет. Себебі аурудың фенотипі HbA/HbS гетерозиготалар ұқсас келеді, бірақ ұқсас емес HbA/HbA гомозигота, HbA аллель деп айтылады толық емес басым дейін HbS аллель.
  3. Сирек жағдайда, гетерозиготадағы бір функционалды аллель геннің кез-келген функциясы үшін жеткіліксіз ген өнімін шығаруы мүмкін, ал фенотип функционалды емес аллель үшін гомозиготаға ұқсайды. Бұл толық гаплотенфицит өте ерекше. Бұл жағдайларда функционалды емес аллель функционалды аллельге доминантты болады деп айтуға болады. Мұндай жағдай функционалды емес аллельде стандартты аллель шығаратын ақуыздың дұрыс жұмысына кедергі келтіретін ақаулы ақуыз пайда болған кезде пайда болуы мүмкін. Ақаулы ақуыздың болуы стандартты ақуызға «үстемдік етеді», ал гетерозиготаның ауру фенотипі екі ақаулы аллельге арналған гомозиготаға ұқсас. Гомозиготалы фенотип зерттелмеген, бірақ қалыпты аллельмен гетерозиготалы болған кезде ерекше фенотип тудыратын ақаулы аллельдерге «доминант» термині жиі дұрыс қолданылмайды. Бұл құбылыс бірқатарда кездеседі тринуклеотидтің қайталануы бір мысал Хантингтон ауруы.[17]

Доминантты-теріс мутациялар

Көптеген ақуыздар әдетте мультиметр түрінде, бір ақуыздың бірнеше көшірмелерінің жиынтығы түрінде белсенді болады, әйтпесе а деп аталады гомомультимерлі ақуыз немесе гомолигомерлі ақуыз. Шындығында, BRENDA ферменттер базасындағы 9800 түрлі организмнен алынған 83000 түрлі ферменттердің көпшілігі[18] гомолигомерлерді білдіреді.[19] Белоктың жабайы типтегі нұсқасы мутантпен бірге болған кезде аралас мультимер түзілуі мүмкін. Мультиметрдегі жабайы типтегі ақуыздың белсенділігін бұзатын мутантты ақуызға әкелетін мутация доминант-теріс мутация болып табылады.

Доминантты теріс мутация адамның соматикалық жасушасында пайда болуы мүмкін және мутант жасушасына пролиферативті артықшылық беріп, оның клональды кеңеюіне әкеледі. Мысалы, бағдарламаланған жасуша өлімінің қалыпты процесі үшін қажет гендегі доминантты-теріс мутация (Апоптоз ) ДНҚ-ның зақымдануына жауап ретінде жасушаны апоптозға төзімді етуі мүмкін. Бұл ДНҚ-ның шамадан тыс зақымдануы болған кезде де клонның көбеюіне мүмкіндік береді. Мұндай доминантты-теріс мутациялар ісік супрессоры генінде болады p53.[20][21] Жабайы типтегі P53 ақуыз әдетте төрт ақуызды мультиметр (олиготетрамер) түрінде болады. Доминант-негатив p53 мутациялар қатерлі ісік пен қатерлі ісік алдындағы зақымданулардың бірқатар түрлерінде болады (мысалы, ми ісіктері, сүт безі қатерлі ісігі, қатерлі ісік алды ішектің зақымдануы және ауыз қуысы қатерлі ісігі).[20]

Доминантты-теріс мутациялар ісіктің басқа супрессор гендерінде де болады. Мысалы, ұрық желісінің екі басым-теріс мутациясы анықталды Атаксиялық телангиэктазия мутацияға ұшыраған (Банкомат) гені, бұл сүт безі қатерлі ісігіне бейімділікті арттырады[22] Транскрипция факторының басым теріс мутациясы C / EBPα жедел миелоидты лейкемияны тудыруы мүмкін.[23] Тұқым қуалайтын басым теріс мутациялар қатерлі ісік ауруынан басқа аурулардың қаупін арттыруы мүмкін. Доминантты теріс мутациялар Пероксисома пролифераторымен белсенділенетін рецепторлық гамма (PPARγ) ауыр инсулинге төзімділікпен, қант диабетімен және гипертониямен байланысты.[24]

Доминантты теріс мутациялар адамнан басқа организмдерде де сипатталған. Іс жүзінде, алғашқы есеп беру а мутантты ақуыз Аралас мультиметрдегі жабайы типтегі ақуыздың қалыпты жұмысын тежейтін GP37 бактериофаг T4 құйрықты талшық ақуызы болды.[25] Толық ұзындықтағы мутантты протеиннен гөрі кесілген протеин түзетін мутациялар P53, ATM, C / EBPα және бактериофаг T4 GP37 зерттеулерінде ең күшті басым-теріс әсерге ие болып көрінеді.

Адамдардағы басым және рецессивті генетикалық аурулар

Адамдарда көптеген генетикалық белгілер немесе аурулар жай «доминантты» немесе «рецессивті» болып жіктеледі. Әсіресе рецессивті гендердің факторы болып табылатын, бірақ негізгі молекулалық негізді жеңілдетіп, үстемдік табиғатын дұрыс түсінбеуге әкелетін рецессивті аурулар деп аталатындармен. Мысалы, рецессивті генетикалық ауру фенилкетонурия (PKU)[26] Ферменттің гендік локусындағы аллельдердің кез-келген көп санынан (> 60) алынады фенилаланин гидроксилазы (PAH).[27] Бұл аллельдердің көпшілігі аз немесе мүлдем болмайды PAH, нәтижесінде субстрат фенилаланин (Phe) және оның метаболикалық қосалқы өнімі орталық жүйке жүйесі және қатты әсер етуі мүмкін ақыл-ой кемістігі егер емделмеген болса.

Осы нюанстарды көрсету үшін PAH үш гипотетикалық аллелінің өзара әрекеттесуінің генотиптері мен фенотиптік салдары келесі кестеде көрсетілген:[28]

ГенотипPAH белсенділік[Phe] тұжырымПҚУ?
АА100%60 мкмЖоқ
AB30%120 мкмЖоқ
CC5%200 ~ 300 μMГиперфенилаланинемия
BB0.3%600 ~ 2400 мкмИә

Стандартты функционалды аллельге гомозиготалы әсер етпейтін адамдарда (АА), PAH activity is standard (100%), and the concentration of phenylalanine in the blood [Phe] is about 60 μM (= μmol/L ). In untreated persons homozygous for one of the PKU alleles (BB), PAH activity is close to zero, [Phe] ten to forty times standard, and the individual manifests PKU.

Ішінде AB heterozygote, PAH activity is only 30% (not 50%) of standard, blood [Phe] is elevated two-fold, and the person does not manifest PKU. Thus, the A allele is dominant to the B allele with respect to PKU, but the B allele is incompletely dominant to the A allele with respect to its molecular effect, determination of PAH activity level (0.3% < 30% << 100%). Соңында A allele is an incomplete dominant to B with respect to [Phe], as 60 μM < 120 μM << 600 μM. Note once more that it is irrelevant to the question of dominance that the recessive allele produces a more extreme [Phe] phenotype.

For a third allele C, а CC homozygote produces a very small amount of PAH enzyme, which results in a somewhat elevated level of [Phe] in the blood, a condition called гиперфенилаланинемия, which does not result in intellectual disability.

That is, the dominance relationships of any two alleles may vary according to which aspect of the phenotype is under consideration. It is typically more useful to talk about the phenotypic consequences of the allelic interactions involved in any genotype, rather than to try to force them into dominant and recessive categories.

Сондай-ақ қараңыз

Әдебиеттер тізімі

  1. ^ "dominance". Онлайндағы сөздіктер. Оксфорд университетінің баспасы. Алынған 14 мамыр 2014.
  2. ^ "express". Онлайндағы сөздіктер. Оксфорд университетінің баспасы. Алынған 14 мамыр 2014.
  3. ^ Griffiths AJF; Gelbart WM; Miller JH; т.б. (1999). "Gene Interaction Leads to Modified Dihybrid Ratios". Қазіргі заманғы генетикалық талдау. New York: W. H. Freeman & Company. ISBN  978-0-7167-3118-4.
  4. ^ Mayo, O. and Bürger, R. 1997. The evolution of dominance: A theory whose time has passed? "Biological Reviews", Volume 72, Issue 1, pp. 97–110
  5. ^ Bourguet, D. 1999. The evolution of dominance Тұқымқуалаушылық, Volume 83, Number 1, pp. 1–4
  6. ^ Bagheri, H.C. 2006 ж. Unresolved boundaries of evolutionary theory and the question of how inheritance systems evolve: 75 years of debate on the evolution of dominance "Journal of Experimental Zoology Part B: Molecular and Developmental Evolution", Volume 306B, Issue 4, pp. 329–359
  7. ^ Ridley, Matt (1999). «Ауру». Genome: The Autobiography of a Species in 23 Chapters. Харпер Коллинз. pp. 136–146. ISBN  978-0-06-089408-5.
  8. ^ King, RC; т.б. (2006). A Dictionary of Genetics (7-ші басылым). Оксфорд университетінің баспасы. б. 129. ISBN  978-0-19-530761-0. Dominance [refers] to alleles that fully manifest their phenotype when present in the гетерозиготалы ... state.
  9. ^ Pennington, Sandra (1999). 11th Hour: Introduction to Genetics. Wiley. б. 43. ISBN  978-0-632-04438-2.
  10. ^ [1], Online 'Guidelines for nomenclature of genes, genetic markers, alleles, and mutations in mouse and rat'
  11. ^ [2], Online 'A standard for maize genetic nomenclature'
  12. ^ "Cat Coat Color". Veterinary Genetics Laboratory, University of California. Алынған 2011-11-02.
  13. ^ Imes, D. L.; Geary, L. A.; Grahn, R. A.; Lyons, L. A. (April 2006). «Үй мысығындағы альбинизм (Felis catus) а-мен байланысты тирозиназа (TYRмутация «. Жануарлар генетикасы. 37 (2): 175–8. дои:10.1111 / j.1365-2052.2005.01409.x. PMC  1464423. PMID  16573534.
  14. ^ Schmidt-Küntzel, A.; Эйзирик, Е .; O'Brien, S. J.; Menotti-Raymond, M. (April 2005). "Tyrosinase and tyrosinase related protein 1 alleles specify domestic cat coat color phenotypes of the albino and brown loci". Тұқым қуалаушылық журналы. 96 (4): 289–301. дои:10.1093/jhered/esi066. PMID  15858157.
  15. ^ Carr, Steven M. "Extensions to Mendelian Analysis". Ньюфаундленд мемориалды университеті.
  16. ^ а б Адамдағы онлайн менделік мұра (OMIM): Albinism, oculocutaneous, type IA - 203100
  17. ^ Адамдағы онлайн менделік мұра (OMIM): Huntington disease - 143100
  18. ^ Schomburg I; Chang A; Ebeling C; т.б. (2004 ж. Қаңтар). "BRENDA, the enzyme database: updates and major new developments". Nucleic Acids Res. 32 (Database issue): D431–3. дои:10.1093/nar/gkh081. PMC  308815. PMID  14681450.
  19. ^ Hashimoto K; Nishi H; Bryant S; Panchenko AR (June 2011). "Caught in self-interaction: evolutionary and functional mechanisms of protein homooligomerization". Phys Biol. 8 (3): 035007. Бибкод:2011PhBio...8c5007H. дои:10.1088/1478-3975/8/3/035007. PMC  3148176. PMID  21572178.
  20. ^ а б Marutani M; Tonoki H; Tada M; т.б. (Қазан 1999). "Dominant-negative mutations of the tumor suppressor p53 relating to early onset of glioblastoma multiforme". Қатерлі ісік ауруы. 59 (19): 4765–9. PMID  10519380.
  21. ^ Goh AM; Coffill CR; Lane DP (January 2011). "The role of mutant p53 in human cancer". Дж. Патол. 223 (2): 116–26. дои:10.1002/path.2784. PMID  21125670. S2CID  23998813.
  22. ^ Chenevix-Trench G; Spurdle AB; Gatei M; т.б. (Ақпан 2002). "Dominant negative ATM mutations in breast cancer families". Дж. Натл. Қатерлі ісік ауруы. 94 (3): 205–15. дои:10.1093/jnci/94.3.205. PMID  11830610.
  23. ^ Pabst T; Mueller BU; Zhang P; т.б. (Наурыз 2001). "Dominant-negative mutations of CEBPA, encoding CCAAT/enhancer binding protein-alpha (C/EBPalpha), in acute myeloid leukemia". Нат. Генет. 27 (3): 263–70. дои:10.1038/85820. PMID  11242107. S2CID  33788907.
  24. ^ Barroso I; Gurnell M; Crowley VE; т.б. (1999). "Dominant negative mutations in human PPARgamma associated with severe insulin resistance, diabetes mellitus and hypertension". Табиғат. 402 (6764): 880–3. Бибкод:1999Natur.402..880B. дои:10.1038/47254. PMID  10622252. S2CID  4423555.
  25. ^ Bernstein H; Fisher KM (March 1968). "Dominance in bacteriophage T4D". Генетика. 58 (3): 307–18. PMC  1211863. PMID  5662621.
  26. ^ Адамдағы онлайн менделік мұра (OMIM): Hyperphenylalaninemia, non-PKU mild - 261600
  27. ^ Адамдағы онлайн менделік мұра (OMIM): Phenylalanine Hydroxylase; PAH - 612349
  28. ^ Carr, Steven M. "One Gene, One Enzyme". Ньюфаундленд мемориалды университеті.

Сыртқы сілтемелер