DRAP1 - DRAP1

DRAP1
Қол жетімді құрылымдар
PDB	Ортологиялық іздеу: PDBe RCSB
PDB идентификатор кодтарының тізімі
	1JFI
Идентификаторлар
Бүркеншік аттар	DRAP1, NC2-альфа, DR1 байланысты протеин 1
Сыртқы жеке куәліктер	OMIM: 602289 MGI: 1913806 HomoloGene: 4703 Ген-карталар: DRAP1
Геннің орналасуы (адам)
Хр.	11-хромосома (адам)
Соңы	65,921,563 bp
Геннің орналасуы (тышқан)
Хр.	19-хромосома (тышқан)
Соңы	5,424,979 bp
РНҚ экспрессиясы өрнек
	Қосымша сілтеме өрнегі туралы деректер
Гендік онтология
Молекулалық функция	• ақуызды гетеродимерлеу белсенділігі; • GO: 0001948 ақуыздармен байланысуы; • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 ДНҚ байланыстыратын транскрипция факторының белсенділігі; • GO: 0001106 транскрипциясының корепрессорлық белсенділігі; • ДНҚ байланыстыру; • бірдей ақуыздармен байланысуы; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 ДНҚ-мен байланысатын транскрипция факторының белсенділігі, II-РНҚ-полимераза; • хроматинді байланыстыру; • GO: 0001105 транскрипция коактиваторының қызметі; • транскрипция коэффициентін байланыстыру; • GO: 0001104 транскрипциясының негізгі циркуляторының қызметі;
Ұялы компонент	• жасуша ядросы;
Биологиялық процесс	• транскрипция, ДНҚ-шаблонмен; • РНҚ полимераза II промоторынан транскрипцияның теріс реттелуі; • транскрипцияны реттеу, ДНҚ-шаблонмен; • РНҚ-полимераза II промоторынан транскрипцияның оң реттелуі; • РНҚ-полимераз II транскрипциялық алдын-ала иницитациялау кешені;
	Дереккөздер:Амиго / QuickGO
Ортологтар
	10589
	66556
	ENSG00000175550
	ENSMUSG00000024914
	Q14919
	Q9D6N5
	NM_006442
	NM_001291080; NM_024176
	NP_006433
	NP_001278009; NP_077138
	Уикидеректер
Адамды қарау / өңдеу	Тінтуірді қарау / өңдеу

Dr1-мен байланысты корепрессор Бұл ақуыз адамдарда кодталған DRAP1 ген.^[5]^[6]

Транскрипциялық репрессия - бұл ашытқыдан адамға дейінгі организмдердегі транскрипциялық инициацияны реттейтін жалпы механизм. Эукариотты ақуызды кодтайтын гендерден транскрипцияны дәл бастау үшін РНҚ-полимераза II мен TFIIA, TFIIB және TFIID сияқты жалпы транскрипция факторларынан тұратын үлкен мульти протеинді кешен құрастыру қажет. DR1 - TFIID-дің TATA-байланыстыратын ақуызымен (TBP) өзара әрекеттесетін және TFIIA және / немесе TFIIB-ді алдын-ала бастау кешеніне енуді болдырмайтын белсенді транскрипция кешенінің түзілуіне жол бермейтін репрессор. Бұл генмен кодталған ақуыз - DR1-мен қозғалатын репрессияны күшейту үшін DR1-мен өзара әрекеттесетін транскрипцияның корепрессоры. Бұл корепрессор мен DR1 арасындағы өзара байланыс корепрессор функциясы үшін қажет және TBP-DR1-ДНҚ кешенін тұрақтандыратын көрінеді.^[6]

Өзара әрекеттесу

DRAP1 көрсетілген өзара әрекеттесу бірге FOXH1^[7] және DR1.^[8]^[9]

Әдебиеттер тізімі

^ ^а ^б ^c GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000175550 - Ансамбль, Мамыр 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000024914 - Ансамбль, Мамыр 2017
^ «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
^ «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
^ Mermelstein F, Yeung K, Cao J, Inostroza JA, Erdjument-Bromage H, Eagelson K және т.б. (Сәуір 1996). «Транскрипцияның Dr1-делдалды репрессиясына арналған корепрессордың талабы». Гендер және даму. 10 (8): 1033–48. дои:10.1101 / gad.10.8.1033. PMID 8608938.
^ ^а ^б «Entrez Gene: DRAP1 DR1-ақуыз 1 (теріс кофактор 2 альфа)».
^ Iratni R, Yan YT, Chen C, Ding J, Zhang Y, Price SM және басқалар. (Желтоқсан 2002). «DRAP1 транскрипциялық корепрессоры арқылы тышқанның гаструляциясы кезінде артық түйіндік сигнал берудің тежелуі». Ғылым. 298 (5600): 1996–9. Бибкод:2002Sci ... 298.1996I. дои:10.1126 / ғылым.1073405. PMID 12471260. S2CID 22923124.
^ Mermelstein F, Yeung K, Cao J, Inostroza JA, Erdjument-Bromage H, Eagelson K және т.б. (Сәуір 1996). «Транскрипцияның Dr1-делдалды репрессиясына арналған корепрессордың талабы». Гендер және даму. 10 (8): 1033–48. дои:10.1101 / gad.10.8.1033. PMID 8608938.
^ Yeung K, Kim S, Reinberg D (қаңтар 1997). «Адамның Dr1-DRAP1 репрессорлық кешенін функционалды түрде бөлшектеу». Молекулалық және жасушалық биология. 17 (1): 36–45. дои:10.1128 / MCB.17.1.36. PMC 231727. PMID 8972183.

Әрі қарай оқу

Goppelt A, Stelzer G, Lottspeich F, Meisterernst M (маусым 1996). «Гетеродимерлі гистонды қатпарлы домендер арқылы TB2-промоторлық кешендермен NC2 спецификалық байланыстыру арқылы II класындағы транскрипцияның репрессия механизмі». EMBO журналы. 15 (12): 3105–16. дои:10.1002 / j.1460-2075.1996.tb00673.x. PMC 450253. PMID 8670811.
Yeung K, Kim S, Reinberg D (қаңтар 1997). «Адамның Dr1-DRAP1 репрессорлық кешенін функционалды түрде бөлшектеу». Молекулалық және жасушалық биология. 17 (1): 36–45. дои:10.1128 / MCB.17.1.36. PMC 231727. PMID 8972183.
Ikeda K, Halle JP, Stelzer G, Meisterernst M, Kawakami K (қаңтар 1998). «AREB6 мырыш саусақ-гомеодоменді транскрипциялау коэффициентімен белсенді репрессияға NC2 теріс коакторының қатысуы». Молекулалық және жасушалық биология. 18 (1): 10–8. дои:10.1128 / mcb.18.1.10. PMC 121442. PMID 9418848.
Castaño E, Gross P, Wang Z, Roeder RG, Oelgeschläger T (маусым 2000). «РНҚ-полимераза II-нің C-терминалды домен-фосфорланған IIO формасы транскрипциялық репрессор NC2 (Dr1 / DRAP1) -мен байланысты және адамның ядролық сығындыларындағы транскрипцияны активтендіру үшін қажет». Америка Құрама Штаттарының Ұлттық Ғылым Академиясының еңбектері. 97 (13): 7184–9. Бибкод:2000PNAS ... 97.7184C. дои:10.1073 / pnas.140202297. PMC 16520. PMID 10852970.
Камада К, Шу Ф, Чен Х, Малик С, Стелцер Г, Родер Р.Г. және т.б. (Шілде 2001). «TBP-ДНҚ транскрипциясы кешенін танитын теріс 2 кофактордың кристалдық құрылымы». Ұяшық. 106 (1): 71–81. дои:10.1016 / S0092-8674 (01) 00417-2. PMID 11461703. S2CID 11064090.
Iratni R, Yan YT, Chen C, Ding J, Zhang Y, Price SM және басқалар. (Желтоқсан 2002). «DRAP1 транскрипциялық корепрессоры арқылы тышқанның гаструляциясы кезінде артық түйіндік сигнал берудің тежелуі». Ғылым. 298 (5600): 1996–9. Бибкод:2002Sci ... 298.1996I. дои:10.1126 / ғылым.1073405. PMID 12471260. S2CID 22923124.
Denko N, Wernke-Dollries K, Johnson AB, Hammond E, Chiang CM, Barton MC (ақпан 2003). «Гипоксия теріс кофактор 2 (Dr1 / DrAP1) индукциясы және алдын-ала дайындық кешенінің блокталуы арқылы транскрипцияны белсенді түрде басады». Биологиялық химия журналы. 278 (8): 5744–9. дои:10.1074 / jbc.M212534200. PMID 12477712.
Леонард Д, Аджух П, Лаймонд А.И., Легерски РЖ (қыркүйек 2003). «hLodestar / HuF2 CDC5L-мен өзара әрекеттеседі және mRNA-ға дейінгі сплайсингке қатысады». Биохимиялық және биофизикалық зерттеулер. 308 (4): 793–801. CiteSeerX 10.1.1.539.8359. дои:10.1016 / S0006-291X (03) 01486-4. PMID 12927788.
Klejman MP, Pereira LA, van Zeeburg HJ, Gilfillan S, Meisterernst M, Timmers HT (қараша 2004). «NC2alpha BTAF1-мен өзара әрекеттеседі және оның TATA-байланыстыратын ақуызбен ATP-тәуелді байланысын ынталандырады». Молекулалық және жасушалық биология. 24 (22): 10072–82. дои:10.1128 / MCB.24.22.10072-10082.2004. PMC 525489. PMID 15509807.
Льюис BA, Sims RJ, Lane WS, Reinberg D (мамыр 2005). «Негізгі промотор элементтерінің функционалды сипаттамасы: DPE спецификалық транскрипциясы үшін протеин киназасы CK2 және PC4 коактиваторы қажет». Молекулалық жасуша. 18 (4): 471–81. дои:10.1016 / j.molcel.2005.04.005. PMID 15893730.
Stelzl U, Worm U, Lalowski M, Haenig C, Brembeck FH, Goler H және т.б. (Қыркүйек 2005). «Адамның ақуыз бен ақуыздың өзара әрекеттесу желісі: протеомды аннотациялауға арналған қор». Ұяшық. 122 (6): 957–68. дои:10.1016 / j.cell.2005.08.029. hdl:11858 / 00-001M-0000-0010-8592-0. PMID 16169070. S2CID 8235923.
Rual JF, Венкатесан К, Хао Т, Хирозане-Кишикава Т, Дрикот А, Ли Н және т.б. (Қазан 2005). «Адамның протеин-протеинмен өзара әрекеттесу желісінің протеома-масштабты картасына қарай». Табиғат. 437 (7062): 1173–8. Бибкод:2005 ж.437.1173R. дои:10.1038 / табиғат04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Assmann EM, Alborghetti MR, Camargo ME, Kobarg J (сәуір 2006). «FEZ1 димеризациясы және транскрипциялық реттеуші ақуыздармен өзара әрекеттесу оның ширатылған катушкалы аймағын қамтиды». Биологиялық химия журналы. 281 (15): 9869–81. дои:10.1074 / jbc.M513280200. PMID 16484223.
Lim J, Hao T, Shaw C, Patel AJ, Szabó G, Rual JF және т.б. (Мамыр 2006). «Адамның тұқым қуалайтын атаксиялары мен Пуркинье жасушаларының деградациясының бұзылыстары үшін ақуыз-ақуыздың өзара әрекеттесуі». Ұяшық. 125 (4): 801–14. дои:10.1016 / j.cell.2006.03.032. PMID 16713569. S2CID 13709685.
Альберт Т.К., Гроте К, Боинг S, Stelzer G, Schepers A, Meisterernst M (маусым 2007). «Адамның промоутерлеріне жағымсыз кофактор 2 суббірлік-альфаның ғаламдық таралуы». Америка Құрама Штаттарының Ұлттық Ғылым Академиясының еңбектері. 104 (24): 10000–5. Бибкод:2007PNAS..10410000A. дои:10.1073 / pnas.0703490104. PMC 1891239. PMID 17548813.

Бұл мақала а ген қосулы адамның хромосомасы 11 Бұл бұта. Сіз Уикипедияға көмектесе аласыз оны кеңейту.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000175550 - Ансамбль, Мамыр 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000024914 - Ансамбль, Мамыр 2017

[3] «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.

[4] «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.

[pmid8608938-5] Mermelstein F, Yeung K, Cao J, Inostroza JA, Erdjument-Bromage H, Eagelson K және т.б. (Сәуір 1996). «Транскрипцияның Dr1-делдалды репрессиясына арналған корепрессордың талабы». Гендер және даму. 10 (8): 1033–48. дои:10.1101 / gad.10.8.1033. PMID 8608938.

[entrez-6] а ^б «Entrez Gene: DRAP1 DR1-ақуыз 1 (теріс кофактор 2 альфа)».

[pmid12471260-7] Iratni R, Yan YT, Chen C, Ding J, Zhang Y, Price SM және басқалар. (Желтоқсан 2002). «DRAP1 транскрипциялық корепрессоры арқылы тышқанның гаструляциясы кезінде артық түйіндік сигнал берудің тежелуі». Ғылым. 298 (5600): 1996–9. Бибкод:2002Sci ... 298.1996I. дои:10.1126 / ғылым.1073405. PMID 12471260. S2CID 22923124.

[autogenerated1-8] Mermelstein F, Yeung K, Cao J, Inostroza JA, Erdjument-Bromage H, Eagelson K және т.б. (Сәуір 1996). «Транскрипцияның Dr1-делдалды репрессиясына арналған корепрессордың талабы». Гендер және даму. 10 (8): 1033–48. дои:10.1101 / gad.10.8.1033. PMID 8608938.

[pmid8972183-9] Yeung K, Kim S, Reinberg D (қаңтар 1997). «Адамның Dr1-DRAP1 репрессорлық кешенін функционалды түрде бөлшектеу». Молекулалық және жасушалық биология. 17 (1): 36–45. дои:10.1128 / MCB.17.1.36. PMC 231727. PMID 8972183.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]