Қақпақшадан тәуелсіз аударма элементі - Cap-independent translation element
Молекулалық биологияда а тәуелсіз аударма элементі (CITE немесе 3'CITE) болып табылады РНҚ жүйелі табылған 3'UTR көптеген РНҚ өсімдік вирустар.
Эукариоттық мРНҚ құрамында а 5 'қалпақ құрылымы тиімді байланыстыру үшін қажет аударма бастамашылық факторлары. Көптеген вирустық мРНҚ-да 5 'қақпағы болмайды, жануарлар вирусының мРНҚ-ларында көбінесе ан ішкі рибосомаларға ену орны аударманы бастау кезіндегі функциялар. Көптеген өсімдік вирустық мРНҚ-ларында қақпақтан тәуелсіз трансляция элементі бар.[1] Бұл элементтер бастамашылықты жүзеге асырады аударма туралы белоктар мРНҚ-да аударма бастамасының факторларын жалдау арқылы немесе 60S рибосомалық суббірлік вирустық РНҚ-ға.[2] РНҚ-да 2 Қызыл беде некрозды мозаика вирусы (RCNMV) РНҚ теріс тізбегі синтезі үшін қақпақтан тәуелсіз аударма элементі қажет.[3]
Ашық аударма элементінің құрылымдық кластары өте көп, олардың құрылымдық немесе дәйектілік ұқсастығы жоқ:[1][2]
| Құрылым | Мысал түрлері |
|---|---|
| TED (аударманы жақсартатын домен) | Спутниктік темекі некрозының вирусы (STNV) |
| BTE (BYDV тәрізді аударма элементі) | Арпа сары ергежейлі вирус (BYDV) |
| PTE (PMV тәрізді аударма элементі) | Panicum әшекей вирусы (PMV) |
| TSS (T-тәрізді құрылым) | Репа қыртысының вирусы (TCV) |
| Y-тәрізді | Қызанақ бұталы трюк вирусы (TBSV) |
| I-тәрізді | Жүгерінің некротикалық жолақ вирусы (MNeSV) |
Сондай-ақ қараңыз
Әрі қарай оқу
- Николсон, БЛ; Заславер, О; Мейберри, ЛК; Браунинг, KS; Ақ, KA (ақпан 2013). «Tombusvirus Y-пішінді трансляциялық күшейткіш eIF4F бар кешен құрайды және оны гетерологиялық трансляциялық күшейткіштермен функционалды түрде ауыстыруға болады». Вирусология журналы. 87 (3): 1872–1883. дои:10.1128 / JVI.02711-12. PMC 3554133. PMID 23192876.
Әдебиеттер тізімі
- ^ а б Миллер, АҚШ; Ванг, З; Treder, K (желтоқсан 2007). «Өсімдіктің вирустық РНҚ-ның 3'-аударылмайтын аймақтарындағы қақпақтан тәуелсіз аударма элементтерінің таңғажайып әртүрлілігі». Биохимиялық қоғаммен операциялар. 35 (Pt 6): 1629–1633. дои:10.1042 / BST0351629. PMC 3081161. PMID 18031280.
- ^ а б Николсон, БЛ; White, KA (қараша 2011). «3 'РНҚ өсімдік вирусының позитивті тізбектегі трансляциясының күшейткіштері». Вирологиядағы қазіргі пікір. 1 (5): 373–380. дои:10.1016 / j.coviro.2011.10.002. PMID 22440838.
- ^ Ан, М; Ивакава, ХО; Mine, A; Кайдо, М; Мис, К; Окуно, Т (15 қыркүйек, 2010). «3 'тәржімеленбеген аймақтағы Y-тәрізді РНҚ құрылымы транс-активатормен және қызыл клевердің некротикалық мозаикалық вирусының РНА2 ядросының промоторымен бірге оның теріс тізбекті РНҚ синтезі үшін қажет» (PDF). Вирусология. 405 (1): 100–109. дои:10.1016 / j.virol.2010.05.022. PMID 20561661.