CPSF4 - CPSF4

CPSF4
Қол жетімді құрылымдар
PDB	Ортологиялық іздеу: PDBe RCSB
PDB идентификатор кодтарының тізімі
	2D9N, 2RHK
Идентификаторлар
Бүркеншік аттар	CPSF4, CPSF30, NAR, NEB1, NEB-1, бөлшектеу және полиаденилденудің спецификалық факторы 4
Сыртқы жеке куәліктер	OMIM: 603052 MGI: 1861602 HomoloGene: 38216 Ген-карталар: CPSF4
Геннің орналасуы (адам)
Хр.	7-хромосома (адам)
Соңы	99,457,373 bp
Геннің орналасуы (тышқан)
Хр.	5-хромосома (тышқан)
Соңы	145,182,041 bp
РНҚ экспрессиясы өрнек
	Қосымша сілтеме өрнегі туралы деректер
Гендік онтология
Молекулалық функция	• нуклеин қышқылымен байланысуы; • мырыш ионымен байланыстыру; • GO: 0001948 ақуыздармен байланысуы; • металл ионымен байланыстыру; • эндорибонуклеаза белсенділігі; • РНҚ байланысы;
Ұялы компонент	• mRNA бөлінуі және полиаденилдену ерекшелігі факторы кешені; • жасуша ядросы; • нуклеоплазма; • жасушаішілік мембранамен шектелген органоид;
Биологиялық процесс	• мРНҚ өңдеу; • mRNA иесінің өңделуінің вирустың өзгеруі; • GO: 0022415 вирустық процесс; • tRNA сплайсинг, эндонуклеолитикалық бөліну және байлау арқылы; • мРНҚ-ны бөлу, сплитеосома арқылы; • РНҚ полимераза II транскрипциясының аяқталуы; • mRNA полиаденилденуі; • ядродан мРНҚ экспорты; • mRNA 3'соңындағы өңдеу; • РНҚ фосфодиэфирлі байланыс гидролизі, эндонуклеолитикалық; • полиаденилдену үшін қажет мРНК-ға дейінгі бөліну;
	Дереккөздер:Амиго / QuickGO
Ортологтар
	10898
	54188
	ENSG00000160917
	ENSMUSG00000029625
	O95639
	Q8BQZ5
	NM_001081559; NM_006693; NM_001318160; NM_001318161; NM_001318162
	NM_001291248; NM_001291249; NM_178576; NM_001374716
	NP_001075028; NP_001305089; NP_001305090; NP_001305091; NP_006684
	NP_001278177; NP_001278178; NP_848671; NP_001361645
	Уикидеректер
Адамды қарау / өңдеу	Тінтуірді қарау / өңдеу

4-бөлімше Бұл ақуыз адамдарда кодталған CPSF4 ген.^[5]^[6]^[7]

Құрамындағы поли (А) ядролық экспортын тежеу мРНҚ себеп болған тұмау вирусы NS1 ақуызы оның эффекторлық аймағын қажет етеді. NS1 эффекторлық домені функционалды түрде 30 кДа ұяшықтың бөлінуімен және ішкі бөлімімен өзара әрекеттеседі полиаденилдеу арнайы фактор 4, жасушалық мРНҚ-ның 3 'соңғы өңдеу машиналарының маңызды компоненті.

Тұмау вирусын жұқтырған жасушаларда NS1 ақуызы физикалық түрде бөлшектелуімен және полиаденилденуімен байланысты фактор 4, 30кД суббірлікпен байланысты. NS1 ақуызының 30 кДа протеинмен in vitro байланысуы алдын алады CPSF РНҚ субстратымен байланысады және 3 'соңғы бөлінуін және иесінің алдын-ала мРНҚ-ның полиаденилденуін тежейді.

Осылайша, NS1 ақуызы вирустық емес, мРНҚ жасушаларының ядролық экспортын тежейді. Әр түрлі кодтайтын бірнеше баламалы транскрипт нұсқалары изоформалар осы ген үшін сипатталған.^[7]

Әдебиеттер тізімі

^ ^а ^б ^c GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000160917 - Ансамбль, Мамыр 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000029625 - Ансамбль, Мамыр 2017
^ «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
^ «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
^ Nemeroff ME, Barabino SM, Li Y, Keller W, Krug RM (шілде 1998). «Тұмау вирусы NS1 ақуызы ҚҚСФ жасушалық 30 кДа суббірлігімен өзара әрекеттеседі және жасушадан алдын-ала мРНҚ түзілуін тежейді». Mol Cell. 1 (7): 991–1000. дои:10.1016 / S1097-2765 (00) 80099-4. PMID 9651582.
^ Барабино С.М., Хабнер В, Дженни А, Минвиелле-Себастия Л, Келлер В (тамыз 1997). «Сүтқоректілердің бөлінуі мен полиаденилдену ерекшелігінің 30-кД суббірлігі және оның ашытқы гомологы - РНҚ байланыстыратын мырыш саусақ ақуыздары». Genes Dev. 11 (13): 1703–16. дои:10.1101 / gad.11.13.1703. PMID 9224719.
^ ^а ^б «Entrez Gene: CPSF4 бөлінуі және полиаденилденудің арнайы факторы 4, 30кДа».

Әрі қарай оқу

Дженни А, Хаури HP, Келлер W (1994). «Жіктелу және полиаденилдену ерекшелігінің коэффициентін сипаттау және оның 100 килодальтонды суббірлігін клондау». Мол. Ұяшық. Биол. 14 (12): 8183–90. дои:10.1128 / MCB.14.12.8183. PMC 359357. PMID 7969155.
Thuresson AC, Aström J, Aström A және т.б. (1994). «Адам жасушасындағы поли (А) полимеразалардың бірнеше формасы». Proc. Натл. Акад. Ғылыми. АҚШ. 91 (3): 979–83. дои:10.1073 / pnas.91.3.979. PMC 521437. PMID 8302877.
Хиллиер Л.Д., Леннон Г, Беккер М және т.б. (1997). «280 000 адам білдіретін дәйектілік белгілерін құру және талдау». Genome Res. 6 (9): 807–28. дои:10.1101 / гр.6.9.807. PMID 8889549.
МакКрекен С, Фонг Н, Янкулов К және т.б. (1997). «РНҚ-полимераза II жұптарының С-терминалды домені транскрипцияға дейін mRNA өңдейді». Табиғат. 385 (6614): 357–61. дои:10.1038 / 385357a0. PMID 9002523. S2CID 4307073.
де Фриз Х, Рюгсеггер У, Хюбнер В., және т.б. (2000). «Адамның мРНҚ-ға дейінгі бөліну факторы II (m) құрамында ашытқы протеиндерінің гомологтары және тағы екі бөліну факторы бар». EMBO J. 19 (21): 5895–904. дои:10.1093 / emboj / 19.21.5895. PMC 305781. PMID 11060040.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH және т.б. (2003). «Адам мен тышқанның 15000-нан астам толық ұзындықтағы кДНҚ тізбектерінің генерациясы және алғашқы талдауы». Proc. Натл. Акад. Ғылыми. АҚШ. 99 (26): 16899–903. дои:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Scherer SW, Cheung J, MacDonald JR және т.б. (2003). «Адам хромосомасы 7: ДНҚ тізбегі және биология». Ғылым. 300 (5620): 767–72. дои:10.1126 / ғылым.1083423. PMC 2882961. PMID 12690205.
Кауфман I, Мартин Г, Фридлейн А және т.б. (2005). «Human Fip1 - UF-ге бай РНҚ элементтерімен байланысатын және поли (А) полимеразаны ынталандыратын ҚҚСФ бірлігі». EMBO J. 23 (3): 616–26. дои:10.1038 / sj.emboj.7600070. PMC 1271804. PMID 14749727.
Герхард Д.С., Вагнер Л, Фейнголд Е.А. және т.б. (2004). «NIH толық ұзындықтағы cDNA жобасының мәртебесі, сапасы және кеңеюі: Сүтқоректілер гендерінің коллекциясы (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121-7. дои:10.1101 / гр.2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Rual JF, Венкатесан К, Хао Т және т.б. (2005). «Адамның протеин-протеинмен өзара әрекеттесу желісінің протеомды масштабты картасына қарай». Табиғат. 437 (7062): 1173–8. дои:10.1038 / табиғат04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Ох Дж.Х., Янг Дж.О., Хан Ю, және т.б. (2006). «Адамның асқазан ісігін транскриптоматикалық талдау». Мамм. Геном. 16 (12): 942–54. дои:10.1007 / s00335-005-0075-2. PMID 16341674. S2CID 69278.
Twu KY, Kuo RL, Marklund J, Krug RM (2007). «1998 жылдан кейін таңдалған H5N1 тұмау вирусының NS гендері сүтқоректілер жасушаларында вирустың репликациясын күшейтеді». Дж. Вирол. 81 (15): 8112–21. дои:10.1128 / JVI.00006-07. PMC 1951328. PMID 17522219.

Сыртқы сілтемелер

Адам CPSF4 геномның орналасуы және CPSF4 геннің егжей-тегжейлі беті UCSC Genome Browser.
Сайтында қол жетімді барлық құрылымдық ақпаратқа шолу PDB үшін UniProt: O95639 (4-бөлімше) PDBe-KB.

Бұл мақала а ген қосулы адамның хромосомасы 7 Бұл бұта. Сіз Уикипедияға көмектесе аласыз оны кеңейту.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000160917 - Ансамбль, Мамыр 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000029625 - Ансамбль, Мамыр 2017

[3] «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.

[4] «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.

[pmid9651582-5] Nemeroff ME, Barabino SM, Li Y, Keller W, Krug RM (шілде 1998). «Тұмау вирусы NS1 ақуызы ҚҚСФ жасушалық 30 кДа суббірлігімен өзара әрекеттеседі және жасушадан алдын-ала мРНҚ түзілуін тежейді». Mol Cell. 1 (7): 991–1000. дои:10.1016 / S1097-2765 (00) 80099-4. PMID 9651582.

[pmid9224719-6] Барабино С.М., Хабнер В, Дженни А, Минвиелле-Себастия Л, Келлер В (тамыз 1997). «Сүтқоректілердің бөлінуі мен полиаденилдену ерекшелігінің 30-кД суббірлігі және оның ашытқы гомологы - РНҚ байланыстыратын мырыш саусақ ақуыздары». Genes Dev. 11 (13): 1703–16. дои:10.1101 / gad.11.13.1703. PMID 9224719.

[entrez-7] а ^б «Entrez Gene: CPSF4 бөлінуі және полиаденилденудің арнайы факторы 4, 30кДа».

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]