BigBrain - BigBrain

BigBrain еркін қол жетімді жоғары ажыратымдылықты 3D цифры атлас туралы адамның миы, 2013 жылдың маусым айында зерттеушілер тобы шығарды Монреаль неврологиялық институты және неміс Forschungszentrum Jülich және еуропалықтардың бөлігі болып табылады Адам миы жобасы.[1] BigBrain атласының изотропты 3D кеңістіктік ажыратымдылығы 20 құрайдымкм, адам миының басқа қолданыстағы 3D модельдерінің 1 мм әдеттегі ажыратымдылығынан әлдеқайда жұқа Аллен Брейн Атласы. 2014 жылы BigBrain алғашқы ондыққа кірді MIT Technology шолуы.[2]

Сатып алу

Атлас мидың патологиясынсыз қайтыс болған белгісіз 65 жастағы ер адамның миынан жасалған. Оның миын бас сүйегінен алып тастағаннан кейін алдымен ан көмегімен сканерледі МРТ машина, содан кейін ендірілген парафин және қалың масштабты пайдаланып қалыңдығы 7404 20 мкм кесінділерге кесілген микротом. Әр бөлім жойылғаннан кейін, бұрмалануды жою туралы қосымша анықтама беру үшін кесілмеген бет суретке түсірілді. Ми бөліктері үлкен шыны слайдтарға орналастырылды, содан кейін боялған Меркер әдісін қолданатын жасуша денелері үшін,[3] себеп болатын процесс сұр зат миынан кету кезінде қара дақпен боялған болуы керек ақ зат түссіз. Боялған бөлімдер сканерленіп, a көмегімен цифрландырылды планшетті сканер 2400н / д жылдамдықпен, бір терабайт шикі жазбасын жасай алады.[4] Сатып алу процесі шамамен 1000 сағат еңбек етті.[5]

Кескінді өңдеу

Алынған цифрлық кескіндерді адам операторлары жою үшін өңдеді артефактілер және бағдарламалық жасақтама арқылы оларды анықтамалық кескіндермен және көршілес бөлімдермен сәйкестендіру, сол арқылы пайда болатын бұрмалануларды түзету гистологиялық өңдеу. Содан кейін түзетілген мәліметтер кеңістіктегі изотропты 3D ажыратымдылығы 20 мкм болатын үш өлшемді компьютерлік модельге жинақталды.[4] Атласты аяқтауға бес жыл уақыт кетті.[6] Атласқа арналған мәліметтер қорына веб-сайтта қол жетімді bigbrainproject.org. Жарияланған жоспарларға қосымша мидың картасын жасау және медициналық науқастардың миын сканерлеуді BigBrain құрылымына сәйкестендіруге мүмкіндік беретін құралдар ұсынылған.

Сондай-ақ қараңыз

Ескертпелер мен сілтемелер

  1. ^ Amunts K, Lepage C, Borgeat L және т.б. (2013). «BigBrain: өте жоғары ажыратымдылықтағы 3D миының моделі». Ғылым. 340 (6139): 1472–1475. дои:10.1126 / ғылым.1235381. PMID  23788795. S2CID  14122170.
  2. ^ «www.technologyreview.com/featuredstory/526501/brain-mapping».
  3. ^ Б.Меркер (1983). «Физикалық даму арқылы жасуша денелерін күміспен бояу». Дж.Нейросчи. Әдістер. 9 (3): 235–241. дои:10.1016/0165-0270(83)90086-9. PMID  6198563.
  4. ^ а б «Ғылыми подкаст стенограммасы» (PDF). 2013 жылғы 21 маусым. Алынған 21 маусым, 2013.
  5. ^ Таня Льюис (20.06.2013). «3D картасы адамның миын барлық уақытта ашады». LiveScience.com. Алынған 19 шілде, 2013.
  6. ^ Хили, Мелисса. (2013 ж., 20 маусым) 'Ғалымдар адам миының толық 3D моделін жасайды', Los Angeles Times http://articles.latimes.com/2013/jun/20/science/la-sci-big-brain-20130621 Тексерілді, 19 қазан 2013 ж.

Сыртқы сілтемелер