Бета-дефенсин 2 - Википедия - Beta-defensin 2

DEFB4B
Қол жетімді құрылымдар
PDBАдам UniProt іздеу: PDBe RCSB
Идентификаторлар
Бүркеншік аттарDEFB4B, DEFB4P, дефенсин бета 4B
Сыртқы жеке куәліктерHomoloGene: 122147 Ген-карталар: DEFB4B
Геннің орналасуы (адам)
8-хромосома (адам)
Хр.8-хромосома (адам)[1]
8-хромосома (адам)
DEFB4B үшін геномдық орналасу
DEFB4B үшін геномдық орналасу
Топ8p23.1Бастау7,414,855 bp[1]
Соңы7,416,863 bp[1]
Ортологтар
ТүрлерАдамТышқан
Энтрез
Ансамбль
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_001205266

жоқ

RefSeq (ақуыз)

NP_001192195
NP_004933

жоқ

Орналасқан жері (UCSC)Хр 8: 7.41 - 7.42 Мбжоқ
PubMed іздеу[2]жоқ
Уикидеректер
Адамды қарау / өңдеу

Бета-дефенсин 2 (BD-2) ретінде белгілі тері-микробқа қарсы пептид 1 (SAP1) - бұл пептид адамдарда кодталған DEFB4 (дефенсин, бета 4) ген.[3]

Адамның бета-дефенсин-2 (hBD-2) - бұл цистеинге бай катионды, төменгі молекулалық антимикробтық пептид, зақымданған теріде жақында табылған.

Құрылым

hBD-2 - ақуыз, оның негізгі құрылымы 64 аминқышқылынан тұрады. ≤2,4 мМ концентрациясында hBD-2 мономерлі болады.[4] Құрылымы амфифилді оң зарядтың біркелкі емес беттік үлестірілуімен және үш құрылымды, антипараллельді қоса, бірнеше құрылымдық элементтерден тұрады бета парағы а және 2 жіптерімен бета шпилька конформация. Басқа құрылымдық элементтерді анықтау қолданылатын әдіске байланысты. Рентгендік кристаллография қолданылған кезде альфа-спираль кезінде байқауға болады N-терминал ақуыздың соңы (PDB кодтары: 1фд3​,1fd4, Және 6 дана). NMR қолданған кезде бұл альфа-спираль пайда болмайды (PDB коды: 1e4q), Бірақ бұл құрылым бастапқы 4 аминқышқылдары жоқ hBD-2 кесілген нұсқасы арқылы анықталды және сәйкессіздікке себеп болуы мүмкін.

Функция

Дефенсиндер микробицидтік және цитотоксикалық жасалған пептидтер нейтрофилдер. Дефенсиндер тұқымдасының мүшелері ақуыздар дәйектілігі бойынша өте ұқсас. Бета-дефенсин 2 - антибиотик пептиді, ол жергілікті реттеледі қабыну.[5]

Адамның бета-дефенсин-2 саны шығарылады эпителий жасушалар мен қарсы белсенді микробқа қарсы белсенділікті көрсетеді Грамоң бактериялар және Candida, бірақ грам-позитивті емес S. aureus. Бета-дефенсин 2 терінің және өкпе тіндерінің грамтеріс инфекцияларының сирек болуына ықпал етуі мүмкін деген болжам жасалды.[6]

hBD-2 эпителий жасушаларын ынталандырудан кейін микроорганизмдермен байланыста пайда болатын алғашқы адамның дефенсинін білдіреді. P. aeruginosa немесе TNF-альфа және IL-1 бета сияқты цитокиндер. HBD-2 гені мен ақуыз жергілікті деңгейде көрсетілген кератиноциттер терінің қабыну зақымдалуымен байланысты. HBD-2 терінің және тыныс алу жолдарының эпителиалды қорғаныс жүйесінің динамикалық компоненті болып табылады және беттерді инфекциядан қорғауда маңызды рөл атқарады және терінің және өкпенің грамтеріс бактериялармен инфекциясының себебі болып табылады деген болжам қызықты. сирек кездеседі.[6]

Бұл ақуыздың грам-позитивті бактерияларға қарсы бактерияға қарсы белсенділігі болмаса да, hBD-2 және басқа ақуыздар арасында синергия бар екенін көрсететін зерттеу бар.[7] Бұл синергетикалық әсердің бір мысалы - эпим, кейбір штамдарымен бөлінген ақуыз S. epidermidis. hBD2, epiP-мен қол ұстасып, өлтіруге қабілетті S. aureus, адам ауруларына жауап беретін грам-позитивті бактериялар.

Әдебиеттер тізімі

  1. ^ а б c ENSG00000275444, ENSG00000285433 GRCh38: Ансамбль шығарылымы 89: ENSG00000177257, ENSG00000275444, ENSG00000285433 - Ансамбль, Мамыр 2017
  2. ^ «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
  3. ^ Harder J, Bartels J, Christophers E, Schröder JM (маусым 1997). «Адам терісінің пептидті антибиотик». Табиғат. 387 (6636): 861. дои:10.1038/43088. PMID  9202117. S2CID  4354862.
  4. ^ Sawai MV, Jia HP, Liu L, Aseyev V, Wiencek JM, McCray PB, Ganz T, Kearney WR, Tack BF (сәуір, 2001). «Адамның бета-дефенсин-2 NMR құрылымы жаңа альфа-спираль сегментін ашады». Биохимия. 40 (13): 3810–3816. дои:10.1021 / bi002519д. PMID  11300761.
  5. ^ «Entrez Gene: DEFB4 defensin, бета 4».
  6. ^ а б Schröder JM, Harder J (маусым 1999). «Адам бета-дефенсин-2». Халықаралық биохимия және жасуша биология журналы. 31 (6): 645–651. дои:10.1016 / S1357-2725 (99) 00013-8. PMID  10404637.
  7. ^ Iwase T, Uehara Y, Shinji H, Tajima A, Seo H, Takada K, Agata T, Mizunoe Y (мамыр 2010). «Staphylococcus epidermidis Esp Staphylococcus aureus biofilm қалыптастыру мен мұрын колонизациясын тежейді». Табиғат. 465 (7296): 346–349. дои:10.1038 / табиғат09074. PMID  20485435. S2CID  4392908.

Сыртқы сілтемелер

Әрі қарай оқу