Аргининдік репрессор ArgR - Arginine repressor ArgR
| Аргининдік репрессор, C-терминал домені | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 c-escherichia coli аргининді репрессоры / l-аргинин кешенінің терминалдық домені; PB туындысы | |||||||||
| Идентификаторлар | |||||||||
| Таңба | Arg_repressor_C | ||||||||
| Pfam | PF02863 | ||||||||
| InterPro | IPR020899 | ||||||||
| SCOP2 | 1aoy / Ауқымы / SUPFAM | ||||||||
| |||||||||
| Аргининдік репрессор, ДНҚ-мен байланысатын домен | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторлар | |||||||||
| Таңба | Arg_repressor | ||||||||
| Pfam | PF01316 | ||||||||
| SCOP2 | 1aoy / Ауқымы / SUPFAM | ||||||||
| |||||||||
Молекулалық биологияда аргининдік репрессор (ArgR) репрессоры болып табылады прокариоттық аргинин деиминаза жолдары.
The аргинин дигидролаза (AD) жолы көптеген адамдарда кездеседі прокариоттар және кейбір эукариоттар, соңғысының мысалы Giardia lamblia (Giardia intestinalis).[1] Үш ферментті анаэробты жол L-аргининді ыдыратып, 1 түзеді моль ATP, Көмір қышқыл газы және аммиак. Кейбір бактерияларда бірінші фермент, аргинин дейминаза, жалпы санының 10% құрайды ұяшық ақуыз.[1]
Көпшілігі прокариоттық аргинин дейминаза жолдары а бақылауында репрессор ген, ArgR деп аталады.[2] Бұл теріс реттегіш және аргинин дейминазасын ғана босатады оперон үшін өрнек аргининнің қатысуымен.[3] The кристалдық құрылым -дан apo-ArgR Bacillus stearothermophilus арқылы 2.5А-ға теңестірілген Рентгендік кристаллография.[4] Ақуыз бірдей суббірліктердің гексамерасы ретінде кездеседі және ДНҚ-мен байланысатын алты домендері бар, олар аргининмен байланысқан кезде орталық олигомерлі ядро айналасында шоғырланған. Бұл басым өзара әрекеттеседі бірге А.Т. қалдықтар ARG қораптарында. Бұл гексамерикалық ақуыз байланыстырады Аргинин биосинтезін басу немесе аргининді активтендіру үшін N терминалындағы ДНҚ катаболизм. Кейбіреулер түрлері бірнеше ArgR бар параллельдер. Көршімен қосылатын ағашта бұлардың кейбіреулері параллель тізбектер ұзын тармақтарды көрсетіп, жақсы сақталған C-терминал аймағынан айтарлықтай ерекшеленеді.
Әдебиеттер тізімі
- ^ а б Қоңыр Д.М., Апкрофт Дж.А., Эдвардс М.Р., Апкрофт П (қаңтар 1998). «Ежелгі эукариоттағы анаэробты бактериалды метаболизм Giardia duodenalis". Int. Дж. Паразитол. 28 (1): 149–64. дои:10.1016 / S0020-7519 (97) 00172-0. PMID 9504342.
- ^ Lu CD, Houghton JE, Abdelal AT (мамыр 1992). «Salmonella typhimurium-дан аргининдік репрессордың сипаттамасы және оның карАБ операторымен өзара әрекеттесуі». Дж.Мол. Биол. 225 (1): 11–24. дои:10.1016 / 0022-2836 (92) 91022-H. PMID 1583685.
- ^ Maghnouj A, de Sousa Cabral TF, Stalon V, Vander Wauven C (желтоқсан 1998). «Bacillus licheniformis аргинин деиминаза жолын кодтайтын arcABDC гендер кластері және оны argRG аргининдік репрессоры активациялайды». Бактериол. 180 (24): 6468–75. дои:10.1128 / JB.180.24.6468-6475.1998. PMC 107747. PMID 9851988.
- ^ Ни Дж, Саканян V, Честерен Д, Глансдорф Н, Ван Дюйн Г.Д. (мамыр 1999). «Bacillus stearothermophilus-тан шыққан аргинин репрессорының құрылымы». Нат. Құрылым. Биол. 6 (5): 427–32. дои:10.1038/8229. PMID 10331868. S2CID 24763624.